data_5NY8 # _model_server_result.job_id PaUckj-nBuOFzzZ7EdJhvg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-12 20:58:23' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5ny8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":101}' # _entry.id 5NY8 # _exptl.entry_id 5NY8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 5NY8 _cell.length_a 83.39 _cell.length_b 83.39 _cell.length_c 66.33 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5NY8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 152 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 31 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,E,F,H 1 1 B,G,I 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 D N N ? 3 E N N ? 3 G N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A O3' G 38 A G 38 1_555 A P CBV 39 A CBV 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.627 ? covale ? covale2 A O3' CBV 39 A CBV 39 1_555 A P G 40 A G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.596 ? covale ? covale3 B O3' G 38 B G 38 1_555 B P CBV 39 B CBV 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.603 ? covale ? covale4 B O3' CBV 39 B CBV 39 1_555 B P G 40 B G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.589 ? metalc ? metalc1 A O6 G 12 A G 12 1_555 F NA NA . A NA 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.809 ? metalc ? metalc2 A OP2 A 30 A A 30 1_555 D MG MG . A MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? metalc ? metalc3 A OP2 C 31 A C 31 1_555 D MG MG . A MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.847 ? metalc ? metalc4 D MG MG . A MG 102 1_555 H O HOH . A HOH 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? metalc ? metalc5 D MG MG . A MG 102 1_555 H O HOH . A HOH 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? metalc ? metalc6 E MG MG . A MG 103 1_555 H O HOH . A HOH 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.804 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N3 C 1 A C 1 1_555 A N1 G 24 A G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N4 C 1 A C 1 1_555 A O6 G 24 A G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O2 C 1 A C 1 1_555 A N2 G 24 A G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N3 C 2 A C 2 1_555 A N1 G 23 A G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N4 C 2 A C 2 1_555 A O6 G 23 A G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O2 C 2 A C 2 1_555 A N2 G 23 A G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N1 G 3 A G 3 1_555 A N3 C 22 A C 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N2 G 3 A G 3 1_555 A O2 C 22 A C 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O6 G 3 A G 3 1_555 A N4 C 22 A C 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N1 G 4 A G 4 1_555 A N3 C 21 A C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N2 G 4 A G 4 1_555 A O2 C 21 A C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A O6 G 4 A G 4 1_555 A N4 C 21 A C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_5_PAIR hydrog13 A N1 A 5 A A 5 1_555 A N6 A 19 A A 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_5_PAIR hydrog14 A N6 A 5 A A 5 1_555 A N7 A 19 A A 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-U MISPAIR' hydrog15 A N4 C 6 A C 6 1_555 A O4 U 18 A U 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog16 A N3 C 6 A C 6 1_555 A N2 G 34 A G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog17 A O2 C 6 A C 6 1_555 A N1 G 34 A G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_9_PAIR hydrog18 A N1 G 7 A G 7 1_555 A N7 A 35 A A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_9_PAIR hydrog19 A O6 G 7 A G 7 1_555 A N6 A 35 A A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog20 A N1 A 8 A A 8 1_555 A N4 C 36 A C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog21 A O6 G 9 A G 9 1_555 A N4 C 16 A C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog22 A N1 G 9 A G 9 1_555 A O6 G 37 A G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog23 A N2 G 9 A G 9 1_555 A N7 G 37 A G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog24 A O6 G 10 A G 10 1_555 A N4 C 15 A C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog25 A N1 G 10 A G 10 1_555 A O6 G 38 A G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog26 A N2 G 10 A G 10 1_555 A N7 G 38 A G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-G MISPAIR' hydrog27 A N3 U 11 A U 11 1_555 A O6 G 14 A G 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-CBV MISPAIR' hydrog28 A O4 U 11 A U 11 1_555 A N4 CBV 39 A CBV 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A N1 G 12 A G 12 1_555 A N3 C 41 A C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N2 G 12 A G 12 1_555 A O2 C 41 A C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A O6 G 12 A G 12 1_555 A N4 C 41 A C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N3 C 13 A C 13 1_555 A N1 G 40 A G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A N4 C 13 A C 13 1_555 A O6 G 40 A G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A O2 C 13 A C 13 1_555 A N2 G 40 A G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 A N1 G 14 A G 14 1_555 A N3 CBV 39 A CBV 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 A N2 G 14 A G 14 1_555 A O2 CBV 39 A CBV 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 A O6 G 14 A G 14 1_555 A N4 CBV 39 A CBV 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A N3 C 15 A C 15 1_555 A N1 G 38 A G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 A N4 C 15 A C 15 1_555 A O6 G 38 A G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 A O2 C 15 A C 15 1_555 A N2 G 38 A G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 A N3 C 16 A C 16 1_555 A N1 G 37 A G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 A N4 C 16 A C 16 1_555 A O6 G 37 A G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 A O2 C 16 A C 16 1_555 A N2 G 37 A G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 A N1 G 17 A G 17 1_555 A N3 C 36 A C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 A N2 G 17 A G 17 1_555 A O2 C 36 A C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 A O6 G 17 A G 17 1_555 A N4 C 36 A C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-G MISPAIR' hydrog47 A O4 U 18 A U 18 1_555 A N2 G 34 A G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 A N3 U 18 A U 18 1_555 A N1 A 35 A A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 A O4 U 18 A U 18 1_555 A N6 A 35 A A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog50 A N6 A 19 A A 19 1_555 A N3 G 34 A G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 A N3 C 20 A C 20 1_555 A N1 G 29 A G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 A N4 C 20 A C 20 1_555 A O6 G 29 A G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 A O2 C 20 A C 20 1_555 A N2 G 29 A G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog54 A N2 G 23 A G 23 1_555 A N3 A 27 A A 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog55 A N2 G 29 A G 29 1_555 A N1 A 32 A A 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog56 A N3 G 29 A G 29 1_555 A N6 A 32 A A 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 B N3 C 1 B C 1 1_555 B N1 G 24 B G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 B N4 C 1 B C 1 1_555 B O6 G 24 B G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 B O2 C 1 B C 1 1_555 B N2 G 24 B G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 B N3 C 2 B C 2 1_555 B N1 G 23 B G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 B N4 C 2 B C 2 1_555 B O6 G 23 B G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 B O2 C 2 B C 2 1_555 B N2 G 23 B G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 B N1 G 3 B G 3 1_555 B N3 C 22 B C 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 B N2 G 3 B G 3 1_555 B O2 C 22 B C 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 B O6 G 3 B G 3 1_555 B N4 C 22 B C 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 B N1 G 4 B G 4 1_555 B N3 C 21 B C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 B N2 G 4 B G 4 1_555 B O2 C 21 B C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 B O6 G 4 B G 4 1_555 B N4 C 21 B C 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_5_PAIR hydrog69 B N1 A 5 B A 5 1_555 B N6 A 19 B A 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_5_PAIR hydrog70 B N6 A 5 B A 5 1_555 B N7 A 19 B A 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-U MISPAIR' hydrog71 B N4 C 6 B C 6 1_555 B O4 U 18 B U 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog72 B N3 C 6 B C 6 1_555 B N2 G 34 B G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog73 B O2 C 6 B C 6 1_555 B N1 G 34 B G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_9_PAIR hydrog74 B N1 G 7 B G 7 1_555 B N7 A 35 B A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_9_PAIR hydrog75 B O6 G 7 B G 7 1_555 B N6 A 35 B A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog76 B N1 A 8 B A 8 1_555 B N4 C 36 B C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog77 B O6 G 9 B G 9 1_555 B N4 C 16 B C 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog78 B N1 G 9 B G 9 1_555 B O6 G 37 B G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog79 B N2 G 9 B G 9 1_555 B N7 G 37 B G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog80 B O6 G 10 B G 10 1_555 B N4 C 15 B C 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog81 B N1 G 10 B G 10 1_555 B O6 G 38 B G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog82 B N2 G 10 B G 10 1_555 B N7 G 38 B G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-G MISPAIR' hydrog83 B N3 U 11 B U 11 1_555 B O6 G 14 B G 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-CBV MISPAIR' hydrog84 B O4 U 11 B U 11 1_555 B N4 CBV 39 B CBV 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog85 B N1 G 12 B G 12 1_555 B N3 C 41 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog86 B N2 G 12 B G 12 1_555 B O2 C 41 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog87 B O6 G 12 B G 12 1_555 B N4 C 41 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 B N3 C 13 B C 13 1_555 B N1 G 40 B G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 B N4 C 13 B C 13 1_555 B O6 G 40 B G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog90 B O2 C 13 B C 13 1_555 B N2 G 40 B G 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog91 B N1 G 14 B G 14 1_555 B N3 CBV 39 B CBV 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog92 B N2 G 14 B G 14 1_555 B O2 CBV 39 B CBV 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog93 B O6 G 14 B G 14 1_555 B N4 CBV 39 B CBV 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog94 B N3 C 15 B C 15 1_555 B N1 G 38 B G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog95 B N4 C 15 B C 15 1_555 B O6 G 38 B G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog96 B O2 C 15 B C 15 1_555 B N2 G 38 B G 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog97 B N3 C 16 B C 16 1_555 B N1 G 37 B G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog98 B N4 C 16 B C 16 1_555 B O6 G 37 B G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog99 B O2 C 16 B C 16 1_555 B N2 G 37 B G 37 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog100 B N1 G 17 B G 17 1_555 B N3 C 36 B C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog101 B N2 G 17 B G 17 1_555 B O2 C 36 B C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog102 B O6 G 17 B G 17 1_555 B N4 C 36 B C 36 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog103 B N3 U 18 B U 18 1_555 B N1 A 35 B A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog104 B O4 U 18 B U 18 1_555 B N6 A 35 B A 35 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-G MISPAIR' hydrog105 B N6 A 19 B A 19 1_555 B N3 G 34 B G 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog106 B N3 C 20 B C 20 1_555 B N1 G 29 B G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog107 B N4 C 20 B C 20 1_555 B O6 G 29 B G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog108 B O2 C 20 B C 20 1_555 B N2 G 29 B G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-A MISPAIR' hydrog109 B N2 G 23 B G 23 1_555 B N3 A 27 B A 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog110 B N2 G 29 B G 29 1_555 B N1 A 32 B A 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_10_PAIR hydrog111 B N3 G 29 B G 29 1_555 B N6 A 32 B A 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 5NY8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011992 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.006923 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.013847 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.015076 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 AGU A 1 101 1 AGU AGU . D 3 MG A 1 102 1 MG MG . E 3 MG A 1 103 2 MG MG . F 4 NA A 1 104 1 NA NA . G 3 MG B 1 101 3 MG MG . H 5 HOH A 1 201 15 HOH HOH . H 5 HOH A 2 202 1 HOH HOH . H 5 HOH A 3 203 17 HOH HOH . H 5 HOH A 4 204 12 HOH HOH . H 5 HOH A 5 205 19 HOH HOH . H 5 HOH A 6 206 4 HOH HOH . H 5 HOH A 7 207 5 HOH HOH . H 5 HOH A 8 208 7 HOH HOH . H 5 HOH A 9 209 3 HOH HOH . H 5 HOH A 10 210 10 HOH HOH . H 5 HOH A 11 211 14 HOH HOH . H 5 HOH A 12 212 2 HOH HOH . H 5 HOH A 13 213 6 HOH HOH . H 5 HOH A 14 214 9 HOH HOH . H 5 HOH A 15 215 8 HOH HOH . H 5 HOH A 16 216 13 HOH HOH . H 5 HOH A 17 217 16 HOH HOH . H 5 HOH A 18 218 11 HOH HOH . H 5 HOH A 19 219 18 HOH HOH . I 5 HOH B 1 201 20 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id G _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 23.299 _atom_site.Cartn_y -53.761 _atom_site.Cartn_z -9.043 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 138.52 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 101 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 31 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 187 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #