data_5OBA # _model_server_result.job_id f3G9MBKPJdH8SqmY7po5QA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-15 17:22:12' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5oba # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"PA","auth_seq_id":202}' # _entry.id 5OBA # _exptl.entry_id 5OBA _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 55.845 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'FE (III) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 32 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5OBA _cell.length_a 237.306 _cell.length_b 237.468 _cell.length_c 237.527 _cell.Z_PDB 192 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5OBA _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 23 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'I 2 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 24-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 24 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 Y N N ? 2 Z N N ? 2 AA N N ? 2 BA N N ? 2 CA N N ? 2 DA N N ? 2 EA N N ? 2 FA N N ? 2 GA N N ? 2 HA N N ? 2 IA N N ? 2 JA N N ? 2 KA N N ? 2 LA N N ? 2 MA N N ? 2 NA N N ? 2 OA N N ? 2 PA N N ? 2 QA N N ? 2 RA N N ? 2 SA N N ? 2 TA N N ? 2 UA N N ? 2 VA N N ? 2 WA N N ? 2 XA N N ? 2 YA N N ? 2 ZA N N ? 2 AB N N ? 2 BB N N ? 2 CB N N ? 2 DB N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE2 GLU 28 A GLU 27 1_555 Z FE FE . A FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 63 A GLU 62 1_555 Z FE FE . A FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc3 A OE1 GLU 135 A GLU 134 1_555 Y FE FE . A FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc4 Y FE FE . A FE 201 1_555 B OE1 GLU 135 B GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? metalc ? metalc5 Y FE FE . A FE 201 1_555 C OE1 GLU 135 C GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.78 ? metalc ? metalc6 B OE2 GLU 28 B GLU 27 1_555 AA FE FE . B FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.17 ? metalc ? metalc7 B OE2 GLU 63 B GLU 62 1_555 AA FE FE . B FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? metalc ? metalc8 C OE2 GLU 28 C GLU 27 1_555 BA FE FE . C FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? metalc ? metalc9 D OE2 GLU 28 D GLU 27 1_555 CA FE FE . D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc10 D OE2 GLU 63 D GLU 62 1_555 CA FE FE . D FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? metalc ? metalc11 E OE2 GLU 28 E GLU 27 1_555 EA FE FE . E FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc12 E OE2 GLU 63 E GLU 62 1_555 EA FE FE . E FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.63 ? metalc ? metalc13 E OE2 GLU 135 E GLU 134 1_555 DA FE FE . E FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? metalc ? metalc14 F OE2 GLU 28 F GLU 27 1_555 FA FE FE . F FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc15 F OE2 GLU 63 F GLU 62 1_555 FA FE FE . F FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? metalc ? metalc16 G OE2 GLU 28 G GLU 27 1_555 HA FE FE . G FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc17 G OE2 GLU 63 G GLU 62 1_555 HA FE FE . G FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc18 G OE1 GLU 135 G GLU 134 1_555 GA FE FE . G FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? metalc ? metalc19 GA FE FE . G FE 201 1_555 H OE1 GLU 135 H GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc20 GA FE FE . G FE 201 1_555 I OE1 GLU 135 I GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? metalc ? metalc21 H OE2 GLU 28 H GLU 27 1_555 IA FE FE . H FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? metalc ? metalc22 H OE2 GLU 63 H GLU 62 1_555 IA FE FE . H FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? metalc ? metalc23 I OE2 GLU 28 I GLU 27 1_555 JA FE FE . I FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? metalc ? metalc24 J OE2 GLU 28 J GLU 27 1_555 KA FE FE . J FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc25 J OE1 GLU 63 J GLU 62 1_555 KA FE FE . J FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? metalc ? metalc26 J OE2 GLU 63 J GLU 62 1_555 KA FE FE . J FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? metalc ? metalc27 KA FE FE . J FE 201 1_555 JB O HOH . J HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? metalc ? metalc28 K OE2 GLU 28 K GLU 27 1_555 LA FE FE . K FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? metalc ? metalc29 K OE2 GLU 63 K GLU 62 1_555 LA FE FE . K FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc30 K OE1 GLU 135 K GLU 134 1_555 MA FE FE . K FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc31 MA FE FE . K FE 202 1_555 L OE1 GLU 135 L GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc32 L OE2 GLU 28 L GLU 27 1_555 NA FE FE . L FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc33 L OE2 GLU 63 L GLU 62 1_555 NA FE FE . L FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? metalc ? metalc34 M OE2 GLU 28 M GLU 27 1_555 OA FE FE . M FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? metalc ? metalc35 M OE1 GLU 63 M GLU 62 1_555 OA FE FE . M FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc36 M OE2 GLU 63 M GLU 62 1_555 OA FE FE . M FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc37 M OE1 GLU 135 M GLU 134 1_555 PA FE FE . M FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? metalc ? metalc38 PA FE FE . M FE 202 1_555 O OE1 GLU 135 O GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? metalc ? metalc39 PA FE FE . M FE 202 1_555 O OE2 GLU 135 O GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.747 ? metalc ? metalc40 N OE2 GLU 28 N GLU 27 1_555 QA FE FE . N FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc41 N OE2 GLU 63 N GLU 62 1_555 QA FE FE . N FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? metalc ? metalc42 O OE2 GLU 28 O GLU 27 1_555 RA FE FE . O FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? metalc ? metalc43 O OE2 GLU 63 O GLU 62 1_555 RA FE FE . O FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc44 P OE2 GLU 28 P GLU 27 1_555 SA FE FE . P FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.564 ? metalc ? metalc45 P OE2 GLU 63 P GLU 62 1_555 SA FE FE . P FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? metalc ? metalc46 P OE1 GLU 135 P GLU 134 1_555 TA FE FE . P FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? metalc ? metalc47 TA FE FE . P FE 202 1_555 Q OE1 GLU 135 Q GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc48 TA FE FE . P FE 202 1_555 R OE1 GLU 135 R GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc49 Q OE2 GLU 28 Q GLU 27 1_555 UA FE FE . Q FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc50 Q OE2 GLU 63 Q GLU 62 1_555 UA FE FE . Q FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc51 R OE2 GLU 28 R GLU 27 1_555 VA FE FE . R FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.479 ? metalc ? metalc52 R OE2 GLU 63 R GLU 62 1_555 VA FE FE . R FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? metalc ? metalc53 S OE2 GLU 28 S GLU 27 1_555 WA FE FE . S FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? metalc ? metalc54 S OE2 GLU 63 S GLU 62 1_555 WA FE FE . S FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? metalc ? metalc55 T OE2 GLU 28 T GLU 27 1_555 YA FE FE . T FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? metalc ? metalc56 T OE1 GLU 63 T GLU 62 1_555 YA FE FE . T FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc57 T OE2 GLU 63 T GLU 62 1_555 YA FE FE . T FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? metalc ? metalc58 T OE1 GLU 135 T GLU 134 1_555 XA FE FE . T FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? metalc ? metalc59 T OE1 GLN 142 T GLN 141 1_555 YA FE FE . T FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.747 ? metalc ? metalc60 XA FE FE . T FE 201 1_555 U OE1 GLU 135 U GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? metalc ? metalc61 U OE2 GLU 28 U GLU 27 1_555 ZA FE FE . U FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc62 U OE1 GLU 63 U GLU 62 1_555 ZA FE FE . U FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.711 ? metalc ? metalc63 U OE2 GLU 63 U GLU 62 1_555 ZA FE FE . U FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? metalc ? metalc64 U OE1 GLN 142 U GLN 141 1_555 ZA FE FE . U FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? metalc ? metalc65 V OE2 GLU 28 V GLU 27 1_555 AB FE FE . V FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc66 V OE2 GLU 63 V GLU 62 1_555 AB FE FE . V FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc67 V OE1 GLU 135 V GLU 134 1_555 BB FE FE . V FE 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? metalc ? metalc68 BB FE FE . V FE 202 1_555 X OE1 GLU 135 X GLU 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.756 ? metalc ? metalc69 W OE2 GLU 28 W GLU 27 1_555 CB FE FE . W FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? metalc ? metalc70 W OE2 GLU 63 W GLU 62 1_555 CB FE FE . W FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? metalc ? metalc71 X OE2 GLU 28 X GLU 27 1_555 DB FE FE . X FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? metalc ? metalc72 X OE2 GLU 63 X GLU 62 1_555 DB FE FE . X FE 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? # _chem_comp.formula 'Fe 3' _chem_comp.formula_weight 55.845 _chem_comp.id FE _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'FE (III) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 5OBA _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.004214 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004211 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00421 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Y 2 FE A 1 201 11 FE FE . Z 2 FE A 1 202 24 FE FE . AA 2 FE B 1 201 9 FE FE . BA 2 FE C 1 201 23 FE FE . CA 2 FE D 1 201 14 FE FE . DA 2 FE E 1 201 13 FE FE . EA 2 FE E 1 202 25 FE FE . FA 2 FE F 1 201 8 FE FE . GA 2 FE G 1 201 7 FE FE . HA 2 FE G 1 202 20 FE FE . IA 2 FE H 1 201 30 FE FE . JA 2 FE I 1 201 6 FE FE . KA 2 FE J 1 201 1 FE FE . LA 2 FE K 1 201 3 FE FE . MA 2 FE K 1 202 12 FE FE . NA 2 FE L 1 201 31 FE FE . OA 2 FE M 1 201 4 FE FE . PA 2 FE M 1 202 22 FE FE . QA 2 FE N 1 201 27 FE FE . RA 2 FE O 1 201 17 FE FE . SA 2 FE P 1 201 21 FE FE . TA 2 FE P 1 202 2 FE FE . UA 2 FE Q 1 201 15 FE FE . VA 2 FE R 1 201 32 FE FE . WA 2 FE S 1 201 5 FE FE . XA 2 FE T 1 201 26 FE FE . YA 2 FE T 1 202 29 FE FE . ZA 2 FE U 1 201 19 FE FE . AB 2 FE V 1 201 10 FE FE . BB 2 FE V 1 202 18 FE FE . CB 2 FE W 1 201 28 FE FE . DB 2 FE X 1 201 16 FE FE . EB 3 HOH A 1 301 1 HOH HOH . FB 3 HOH C 1 301 6 HOH HOH . GB 3 HOH D 1 301 10 HOH HOH . HB 3 HOH G 1 301 12 HOH HOH . IB 3 HOH H 1 301 11 HOH HOH . IB 3 HOH H 2 302 7 HOH HOH . JB 3 HOH J 1 301 2 HOH HOH . JB 3 HOH J 2 302 4 HOH HOH . KB 3 HOH M 1 301 3 HOH HOH . LB 3 HOH N 1 301 5 HOH HOH . MB 3 HOH O 1 301 8 HOH HOH . NB 3 HOH Q 1 301 9 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol FE _atom_site.label_atom_id FE _atom_site.label_comp_id FE _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id PA _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 76.259 _atom_site.Cartn_y 97.615 _atom_site.Cartn_z 269.584 _atom_site.occupancy 0.8 _atom_site.B_iso_or_equiv 91.59 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id FE _atom_site.auth_comp_id FE _atom_site.auth_seq_id 202 _atom_site.auth_asym_id M _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 20 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 35 _model_server_stats.query_time_ms 269 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #