data_5ON2 # _model_server_result.job_id kusRbqy4WQo1PF1lArjcFA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-02 08:28:38' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5on2 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":901}' # _entry.id 5ON2 # _exptl.entry_id 5ON2 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 459.477 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "5'-O-(L-leucylsulfamoyl)adenosine" _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 104.52 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5ON2 _cell.length_a 159.65 _cell.length_b 70.62 _cell.length_c 230.34 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5ON2 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,E,F,G,H 1 1 C,D,I,J,K,L 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 F N N ? 4 J N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A SG CYS 179 A CYS 159 1_555 E ZN ZN . A ZN 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 196 A CYS 176 1_555 E ZN ZN . A ZN 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? metalc ? metalc3 A SG CYS 199 A CYS 179 1_555 E ZN ZN . A ZN 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? metalc ? metalc4 B OP1 U 8 B U 8 1_555 H MG MG . B MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? metalc ? metalc5 B OP2 G 9 B G 9 1_555 H MG MG . B MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc6 C SG CYS 179 D CYS 159 1_555 I ZN ZN . D ZN 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? metalc ? metalc7 C SG CYS 196 D CYS 176 1_555 I ZN ZN . D ZN 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc8 C SG CYS 199 D CYS 179 1_555 I ZN ZN . D ZN 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc9 D OP1 U 8 E U 8 1_555 L MG MG . E MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.819 ? metalc ? metalc10 D OP2 G 9 E G 9 1_555 L MG MG . E MG 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog1 B N1 G 1 B G 1 1_555 B O2 U 83 B U 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog2 B O6 G 1 B G 1 1_555 B N3 U 83 B U 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B N3 C 2 B C 2 1_555 B N1 G 82 B G 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N4 C 2 B C 2 1_555 B O6 G 82 B G 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B O2 C 2 B C 2 1_555 B N2 G 82 B G 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B N3 C 3 B C 3 1_555 B N1 G 81 B G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N4 C 3 B C 3 1_555 B O6 G 81 B G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B O2 C 3 B C 3 1_555 B N2 G 81 B G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B N3 C 4 B C 4 1_555 B N1 G 80 B G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B N4 C 4 B C 4 1_555 B O6 G 80 B G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 B O2 C 4 B C 4 1_555 B N2 G 80 B G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B N1 G 5 B G 5 1_555 B N3 C 79 B C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B N2 G 5 B G 5 1_555 B O2 C 79 B C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B O6 G 5 B G 5 1_555 B N4 C 79 B C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B N1 G 6 B G 6 1_555 B N3 C 78 B C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B N2 G 6 B G 6 1_555 B O2 C 78 B C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B O6 G 6 B G 6 1_555 B N4 C 78 B C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B N1 A 7 B A 7 1_555 B N3 U 77 B U 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N6 A 7 B A 7 1_555 B O4 U 77 B U 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog20 B N3 U 8 B U 8 1_555 B N7 A 14 B A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog21 B O2 U 8 B U 8 1_555 B N6 A 14 B A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog22 B N1 G 9 B G 9 1_555 B O6 G 12 B G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog23 B N2 G 9 B G 9 1_555 B N7 G 12 B G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog24 B O6 G 9 B G 9 1_555 B N4 C 24 B C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B N1 G 10 B G 10 1_555 B N3 C 26 B C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B N2 G 10 B G 10 1_555 B O2 C 26 B C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B O6 G 10 B G 10 1_555 B N4 C 26 B C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B N3 U 11 B U 11 1_555 B N1 A 25 B A 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B O4 U 11 B U 11 1_555 B N6 A 25 B A 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B N1 G 12 B G 12 1_555 B N3 C 24 B C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 B N2 G 12 B G 12 1_555 B O2 C 24 B C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 B O6 G 12 B G 12 1_555 B N4 C 24 B C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-G MISPAIR' hydrog33 B O6 G 13 B G 13 1_555 B N2 G 22 B G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog34 B N2 G 13 B G 13 1_555 B N7 A 23 B A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog35 B N3 G 13 B G 13 1_555 B N6 A 23 B A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-A MISPAIR' hydrog36 B N6 A 14 B A 14 1_555 B N3 A 21 B A 20 1_555 ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog37 B N1 A 15 B A 15 1_555 B N3 U 59 B U 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog38 B N6 A 15 B A 15 1_555 B O2 U 59 B U 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog39 B N1 G 18 B G 18 1_555 B O2 U 66 B U 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog40 B N2 G 19 B G 19 1_555 B O2 C 67 B C 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-G MISPAIR' hydrog41 B N7 G 22 B G 21 1_555 B N2 G 58 B G 47 1_555 ? ? ? J ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog42 B N6 A 27 B A 26 1_555 B O2 C 45 B C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 B N1 A 28 B A 27 1_555 B N3 U 44 B U 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 B N6 A 28 B A 27 1_555 B O4 U 44 B U 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 B N1 G 29 B G 28 1_555 B N3 C 43 B C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 B N2 G 29 B G 28 1_555 B O2 C 43 B C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 B O6 G 29 B G 28 1_555 B N4 C 43 B C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog48 B N1 G 30 B G 29 1_555 B N3 C 42 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog49 B N2 G 30 B G 29 1_555 B O2 C 42 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog50 B O6 G 30 B G 29 1_555 B N4 C 42 B C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog51 B N1 G 31 B G 30 1_555 B N3 C 41 B C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog52 B N2 G 31 B G 30 1_555 B O2 C 41 B C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog53 B O6 G 31 B G 30 1_555 B N4 C 41 B C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog54 B N1 A 32 B A 31 1_555 B N3 U 40 B U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog55 B N6 A 32 B A 31 1_555 B O4 U 40 B U 39 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog56 B N3 U 33 B U 32 1_555 B N1 A 39 B A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog57 B O4 U 33 B U 32 1_555 B N6 A 39 B A 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog58 B N1 G 46 B G 45 1_555 B O2 U 57 B U 47 1_555 ? ? ? I ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog59 B O6 G 46 B G 45 1_555 B N3 U 57 B U 47 1_555 ? ? ? I ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 B N1 G 47 B G 46 1_555 B N3 C 56 B C 47 1_555 ? ? ? H ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog61 B N2 G 47 B G 46 1_555 B O2 C 56 B C 47 1_555 ? ? ? H ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog62 B O6 G 47 B G 46 1_555 B N4 C 56 B C 47 1_555 ? ? ? H ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog63 B N3 C 48 B C 47 1_555 B N1 G 55 B G 47 1_555 ? ? ? G ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog64 B N4 C 48 B C 47 1_555 B O6 G 55 B G 47 1_555 ? ? ? G ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog65 B O2 C 48 B C 47 1_555 B N2 G 55 B G 47 1_555 ? ? ? G ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog66 B N1 G 49 B G 47 1_555 B N3 C 54 B C 47 1_555 A ? ? F ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog67 B N2 G 49 B G 47 1_555 B O2 C 54 B C 47 1_555 A ? ? F ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog68 B O6 G 49 B G 47 1_555 B N4 C 54 B C 47 1_555 A ? ? F ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog69 B N1 G 60 B G 49 1_555 B N3 C 76 B C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog70 B N2 G 60 B G 49 1_555 B O2 C 76 B C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog71 B O6 G 60 B G 49 1_555 B N4 C 76 B C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog72 B N3 C 61 B C 50 1_555 B N1 G 75 B G 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog73 B N4 C 61 B C 50 1_555 B O6 G 75 B G 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog74 B O2 C 61 B C 50 1_555 B N2 G 75 B G 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog75 B N1 G 62 B G 51 1_555 B N3 C 74 B C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog76 B N2 G 62 B G 51 1_555 B O2 C 74 B C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog77 B O6 G 62 B G 51 1_555 B N4 C 74 B C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog78 B N1 G 63 B G 52 1_555 B N3 C 73 B C 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog79 B N2 G 63 B G 52 1_555 B O2 C 73 B C 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog80 B O6 G 63 B G 52 1_555 B N4 C 73 B C 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog81 B N1 G 64 B G 53 1_555 B N3 C 72 B C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog82 B N2 G 64 B G 53 1_555 B O2 C 72 B C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog83 B O6 G 64 B G 53 1_555 B N4 C 72 B C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog84 B N3 U 65 B U 54 1_555 B N7 A 69 B A 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog85 B O2 U 65 B U 54 1_555 B N6 A 69 B A 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog86 D N1 G 1 E G 1 1_555 D O2 U 83 E U 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog87 D O6 G 1 E G 1 1_555 D N3 U 83 E U 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog88 D N3 C 2 E C 2 1_555 D N1 G 82 E G 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog89 D N4 C 2 E C 2 1_555 D O6 G 82 E G 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog90 D O2 C 2 E C 2 1_555 D N2 G 82 E G 71 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog91 D N3 C 3 E C 3 1_555 D N1 G 81 E G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog92 D N4 C 3 E C 3 1_555 D O6 G 81 E G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog93 D O2 C 3 E C 3 1_555 D N2 G 81 E G 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog94 D N3 C 4 E C 4 1_555 D N1 G 80 E G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog95 D N4 C 4 E C 4 1_555 D O6 G 80 E G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog96 D O2 C 4 E C 4 1_555 D N2 G 80 E G 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog97 D N1 G 5 E G 5 1_555 D N3 C 79 E C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog98 D N2 G 5 E G 5 1_555 D O2 C 79 E C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog99 D O6 G 5 E G 5 1_555 D N4 C 79 E C 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog100 D N1 G 6 E G 6 1_555 D N3 C 78 E C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog101 D N2 G 6 E G 6 1_555 D O2 C 78 E C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog102 D O6 G 6 E G 6 1_555 D N4 C 78 E C 67 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog103 D N1 A 7 E A 7 1_555 D N3 U 77 E U 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog104 D N6 A 7 E A 7 1_555 D O4 U 77 E U 66 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog105 D N3 U 8 E U 8 1_555 D N7 A 14 E A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog106 D O2 U 8 E U 8 1_555 D N6 A 14 E A 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog107 D N1 G 9 E G 9 1_555 D O6 G 12 E G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_6_PAIR hydrog108 D N2 G 9 E G 9 1_555 D N7 G 12 E G 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog109 D O6 G 9 E G 9 1_555 D N4 C 24 E C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog110 D N1 G 10 E G 10 1_555 D N3 C 26 E C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog111 D N2 G 10 E G 10 1_555 D O2 C 26 E C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog112 D O6 G 10 E G 10 1_555 D N4 C 26 E C 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog113 D N3 U 11 E U 11 1_555 D N1 A 25 E A 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog114 D O4 U 11 E U 11 1_555 D N6 A 25 E A 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog115 D N1 G 12 E G 12 1_555 D N3 C 24 E C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog116 D N2 G 12 E G 12 1_555 D O2 C 24 E C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog117 D O6 G 12 E G 12 1_555 D N4 C 24 E C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-G MISPAIR' hydrog118 D O6 G 13 E G 13 1_555 D N2 G 22 E G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog119 D N2 G 13 E G 13 1_555 D N7 A 23 E A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog120 D N3 G 13 E G 13 1_555 D N6 A 23 E A 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-A MISPAIR' hydrog121 D N6 A 14 E A 14 1_555 D N3 A 21 E A 20 1_555 ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog122 D N1 A 15 E A 15 1_555 D N3 U 59 E U 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog123 D N6 A 15 E A 15 1_555 D O2 U 59 E U 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog124 D N2 G 18 E G 18 1_555 D O2 U 66 E U 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog125 D N1 G 19 E G 19 1_555 D N3 C 67 E C 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog126 D N2 G 19 E G 19 1_555 D O2 C 67 E C 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog127 D O6 G 19 E G 19 1_555 D N4 C 67 E C 56 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-G MISPAIR' hydrog128 D N7 G 22 E G 21 1_555 D N2 G 58 E G 47 1_555 ? ? ? J ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'A-C MISPAIR' hydrog129 D N6 A 27 E A 26 1_555 D O2 C 45 E C 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog130 D N1 A 28 E A 27 1_555 D N3 U 44 E U 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog131 D N6 A 28 E A 27 1_555 D O4 U 44 E U 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog132 D N1 G 29 E G 28 1_555 D N3 C 43 E C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog133 D N2 G 29 E G 28 1_555 D O2 C 43 E C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog134 D O6 G 29 E G 28 1_555 D N4 C 43 E C 42 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog135 D N1 G 30 E G 29 1_555 D N3 C 42 E C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog136 D N2 G 30 E G 29 1_555 D O2 C 42 E C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog137 D O6 G 30 E G 29 1_555 D N4 C 42 E C 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog138 D N2 G 31 E G 30 1_555 D O2 C 41 E C 40 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog139 D N1 G 46 E G 45 1_555 D O2 U 57 E U 47 1_555 ? ? ? I ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_28_PAIR hydrog140 D O6 G 46 E G 45 1_555 D N3 U 57 E U 47 1_555 ? ? ? I ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog141 D N1 G 47 E G 46 1_555 D N3 C 56 E C 47 1_555 ? ? ? H ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog142 D N2 G 47 E G 46 1_555 D O2 C 56 E C 47 1_555 ? ? ? H ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog143 D O6 G 47 E G 46 1_555 D N4 C 56 E C 47 1_555 ? ? ? H ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog144 D N3 C 48 E C 47 1_555 D N1 G 55 E G 47 1_555 ? ? ? G ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog145 D N4 C 48 E C 47 1_555 D O6 G 55 E G 47 1_555 ? ? ? G ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog146 D O2 C 48 E C 47 1_555 D N2 G 55 E G 47 1_555 ? ? ? G ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog147 D N1 G 49 E G 47 1_555 D N3 C 54 E C 47 1_555 A ? ? F ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog148 D N2 G 49 E G 47 1_555 D O2 C 54 E C 47 1_555 A ? ? F ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog149 D O6 G 49 E G 47 1_555 D N4 C 54 E C 47 1_555 A ? ? F ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog150 D N1 G 60 E G 49 1_555 D N3 C 76 E C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog151 D N2 G 60 E G 49 1_555 D O2 C 76 E C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog152 D O6 G 60 E G 49 1_555 D N4 C 76 E C 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog153 D N3 C 61 E C 50 1_555 D N1 G 75 E G 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog154 D N4 C 61 E C 50 1_555 D O6 G 75 E G 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog155 D O2 C 61 E C 50 1_555 D N2 G 75 E G 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog156 D N1 G 62 E G 51 1_555 D N3 C 74 E C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog157 D N2 G 62 E G 51 1_555 D O2 C 74 E C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog158 D O6 G 62 E G 51 1_555 D N4 C 74 E C 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-C PAIR' hydrog159 D O6 G 63 E G 52 1_555 D N4 C 73 E C 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog160 D N1 G 64 E G 53 1_555 D N3 C 72 E C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog161 D N2 G 64 E G 53 1_555 D O2 C 72 E C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog162 D O6 G 64 E G 53 1_555 D N4 C 72 E C 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog163 D N3 U 65 E U 54 1_555 D N7 A 69 E A 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog164 D O2 U 65 E U 54 1_555 D N6 A 69 E A 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C16 H25 N7 O7 S' _chem_comp.formula_weight 459.477 _chem_comp.id LSS _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "5'-O-(L-leucylsulfamoyl)adenosine" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 5-O-N-LEUCYL-SULFAMOYLADENOSINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 LSS doub 307 n n C1 N2 LSS sing 308 n n C1 CA LSS sing 309 n n N1 C2 LSS doub 310 n y N1 C6 LSS sing 311 n y S1 N2 LSS sing 312 n n S1 O5 LSS sing 313 n n S1 O1A LSS doub 314 n n S1 O2A LSS doub 315 n n C2 N3 LSS sing 316 n y O2 C22 LSS sing 317 n n N3 C4 LSS doub 318 n y O3 C23 LSS sing 319 n n C4 C5 LSS sing 320 n y C4 N9 LSS sing 321 n y N4 CA LSS sing 322 n n O4 C21 LSS sing 323 n n O4 C24 LSS sing 324 n n C5 C6 LSS doub 325 n y C5 N7 LSS sing 326 n y O5 C25 LSS sing 327 n n C6 N6 LSS sing 328 n n C7 C9 LSS sing 329 n n C7 C10 LSS sing 330 n n C7 C11 LSS sing 331 n n N7 C8 LSS doub 332 n y C8 N9 LSS sing 333 n y C9 CA LSS sing 334 n n N9 C21 LSS sing 335 n n C21 C22 LSS sing 336 n n C22 C23 LSS sing 337 n n C23 C24 LSS sing 338 n n C24 C25 LSS sing 339 n n C2 H2 LSS sing 340 n n N2 HN2 LSS sing 341 n n O2 HO2 LSS sing 342 n n O3 HO3 LSS sing 343 n n N4 HN4 LSS sing 344 n n N4 HN4A LSS sing 345 n n N6 HN6 LSS sing 346 n n N6 HN6A LSS sing 347 n n C7 H7 LSS sing 348 n n C8 H8 LSS sing 349 n n C9 H9 LSS sing 350 n n C9 H9A LSS sing 351 n n CA HA LSS sing 352 n n C10 H10 LSS sing 353 n n C10 H10A LSS sing 354 n n C10 H10B LSS sing 355 n n C11 H11 LSS sing 356 n n C11 H11A LSS sing 357 n n C11 H11B LSS sing 358 n n C21 H21 LSS sing 359 n n C22 H22 LSS sing 360 n n C23 H23 LSS sing 361 n n C24 H24 LSS sing 362 n n C25 H25 LSS sing 363 n n C25 H25A LSS sing 364 n n # _atom_sites.entry_id 5ON2 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006264 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001622 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.01416 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004485 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 ZN A 1 900 900 ZN ZN . F 4 LSS A 1 901 901 LSS LSS . G 5 VRT A 1 902 902 VRT 728 . H 6 MG B 1 101 1077 MG MG . I 3 ZN D 1 900 900 ZN ZN . J 4 LSS D 1 901 901 LSS LSS . K 5 VRT D 1 902 902 VRT 728 . L 6 MG E 1 101 1077 MG MG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 LSS . . . J 4 1.929 35.197 73.061 1 70.5 ? C1 LSS 901 D 1 HETATM 2 N N1 LSS . . . J 4 -4.574 27.589 72.735 1 69.76 ? N1 LSS 901 D 1 HETATM 3 O O1 LSS . . . J 4 1.485 34.323 73.794 1 70.51 ? O1 LSS 901 D 1 HETATM 4 S S1 LSS . . . J 4 1.158 34.031 70.955 1 71.37 ? S1 LSS 901 D 1 HETATM 5 C C2 LSS . . . J 4 -5.137 28.699 73.253 1 69.79 ? C2 LSS 901 D 1 HETATM 6 N N2 LSS . . . J 4 1.839 35.156 71.726 1 71.3 ? N2 LSS 901 D 1 HETATM 7 O O2 LSS . . . J 4 -2.033 32.451 75.23 1 71.41 ? O2 LSS 901 D 1 HETATM 8 N N3 LSS . . . J 4 -4.517 29.891 73.202 1 69.48 ? N3 LSS 901 D 1 HETATM 9 O O3 LSS . . . J 4 -3.141 34.8 74.654 1 73.65 ? O3 LSS 901 D 1 HETATM 10 C C4 LSS . . . J 4 -3.294 30.033 72.625 1 69.48 ? C4 LSS 901 D 1 HETATM 11 N N4 LSS . . . J 4 3.071 37.308 72.614 1 68.82 ? N4 LSS 901 D 1 HETATM 12 O O4 LSS . . . J 4 -2.895 33.409 71.869 1 72.55 ? O4 LSS 901 D 1 HETATM 13 C C5 LSS . . . J 4 -2.656 28.94 72.072 1 69.27 ? C5 LSS 901 D 1 HETATM 14 O O5 LSS . . . J 4 -0.33 33.946 71.321 1 71.5 ? O5 LSS 901 D 1 HETATM 15 C C6 LSS . . . J 4 -3.356 27.634 72.142 1 69.36 ? C6 LSS 901 D 1 HETATM 16 N N6 LSS . . . J 4 -2.807 26.513 71.625 1 69.64 ? N6 LSS 901 D 1 HETATM 17 C C7 LSS . . . J 4 2.503 38.202 75.45 1 69.47 ? C7 LSS 901 D 1 HETATM 18 N N7 LSS . . . J 4 -1.477 29.358 71.579 1 69.88 ? N7 LSS 901 D 1 HETATM 19 C C8 LSS . . . J 4 -1.39 30.687 71.819 1 70.06 ? C8 LSS 901 D 1 HETATM 20 C C9 LSS . . . J 4 1.757 37.114 74.667 1 69.88 ? C9 LSS 901 D 1 HETATM 21 N N9 LSS . . . J 4 -2.502 31.086 72.456 1 70.2 ? N9 LSS 901 D 1 HETATM 22 C CA LSS . . . J 4 2.648 36.386 73.656 1 69.86 ? CA LSS 901 D 1 HETATM 23 C C10 LSS . . . J 4 1.504 39.148 76.127 1 69.4 ? C10 LSS 901 D 1 HETATM 24 C C11 LSS . . . J 4 3.516 37.598 76.431 1 69.09 ? C11 LSS 901 D 1 HETATM 25 O O1A LSS . . . J 4 1.785 32.78 71.277 1 70.97 ? O1A LSS 901 D 1 HETATM 26 C C21 LSS . . . J 4 -2.844 32.448 72.927 1 71.31 ? C21 LSS 901 D 1 HETATM 27 C C22 LSS . . . J 4 -1.814 32.964 73.915 1 72.09 ? C22 LSS 901 D 1 HETATM 28 C C23 LSS . . . J 4 -2.041 34.453 73.811 1 73.17 ? C23 LSS 901 D 1 HETATM 29 C C24 LSS . . . J 4 -2.387 34.664 72.342 1 73.07 ? C24 LSS 901 D 1 HETATM 30 C C25 LSS . . . J 4 -1.18 35.083 71.505 1 72.28 ? C25 LSS 901 D 1 HETATM 31 O O2A LSS . . . J 4 1.287 34.26 69.544 1 71.09 ? O2A LSS 901 D 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 18 _model_server_stats.create_model_time_ms 26 _model_server_stats.query_time_ms 308 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 31 #