data_5S4T
#
_model_server_result.job_id            YYuNVUwf3pUpH-sSBRoXdg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-25 02:09:32' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          5s4t 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"R","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    5S4T 
#
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              443.201 
_entity.id                          8 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
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_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            5S4T 
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_cell.length_c            179.05 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5S4T 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    hexameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      6 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 8 J N N 
? 8 R N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 39 A ASP 39 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 39 A ASP 39 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? 
metalc ? metalc3 A O THR 41 A THR 41 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? 
metalc ? metalc4 A OG1 THR 41 A THR 41 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.536 ? 
metalc ? metalc5 A O GLY 44 A GLY 44 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? 
metalc ? metalc6 A OE1 GLU 55 A GLU 55 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? 
metalc ? metalc7 A OE2 GLU 55 A GLU 55 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? 
metalc ? metalc8 G O1G GTP . A GTP 501 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? 
metalc ? metalc9 G O1B GTP . A GTP 501 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? 
metalc ? metalc10 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? 
metalc ? metalc11 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.99 ? 
metalc ? metalc12 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? 
metalc ? metalc13 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 639 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? 
metalc ? metalc14 I CA CA . A CA 503 1_555 W O HOH . A HOH 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? 
metalc ? metalc15 W O HOH . A HOH 644 1_555 T CA CA . E CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc16 W O HOH . A HOH 653 1_555 T CA CA . E CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.141 ? 
metalc ? metalc17 B OE1 GLN 11 B GLN 11 1_555 K MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? 
metalc ? metalc18 B OE1 GLU 111 B GLU 113 1_555 L CA CA . B CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? 
metalc ? metalc19 J O1A GDP . B GDP 501 1_555 K MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? 
metalc ? metalc20 K MG MG . B MG 502 1_555 X O HOH . B HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.881 ? 
metalc ? metalc21 K MG MG . B MG 502 1_555 X O HOH . B HOH 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.97 ? 
metalc ? metalc22 K MG MG . B MG 502 1_555 X O HOH . B HOH 638 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? 
metalc ? metalc23 K MG MG . B MG 502 1_555 X O HOH . B HOH 664 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc24 K MG MG . B MG 502 1_555 Y O HOH . C HOH 664 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? 
metalc ? metalc25 L CA CA . B CA 503 4_455 C OE1 GLU 284 C GLU 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.924 ? 
metalc ? metalc26 C OD1 ASP 39 C ASP 39 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
metalc ? metalc27 C OD2 ASP 39 C ASP 39 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc28 C O THR 41 C THR 41 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? 
metalc ? metalc29 C OG1 THR 41 C THR 41 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? 
metalc ? metalc30 C O GLY 44 C GLY 44 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc31 C OE1 GLU 55 C GLU 55 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? 
metalc ? metalc32 C OE2 GLU 55 C GLU 55 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? 
metalc ? metalc33 O O1G GTP . C GTP 501 1_555 P MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? 
metalc ? metalc34 O O1B GTP . C GTP 501 1_555 P MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? 
metalc ? metalc35 P MG MG . C MG 502 1_555 Y O HOH . C HOH 629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
metalc ? metalc36 P MG MG . C MG 502 1_555 Y O HOH . C HOH 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc37 P MG MG . C MG 502 1_555 Y O HOH . C HOH 650 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? 
metalc ? metalc38 P MG MG . C MG 502 1_555 Y O HOH . C HOH 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? 
metalc ? metalc39 Q CA CA . C CA 503 1_555 Y O HOH . C HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.5 ? 
metalc ? metalc40 D OE1 GLN 11 D GLN 11 1_555 S MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.948 ? 
metalc ? metalc41 R O1A GDP . D GDP 501 1_555 S MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? 
metalc ? metalc42 S MG MG . D MG 502 1_555 Z O HOH . D HOH 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? 
metalc ? metalc43 F OE2 GLU 331 F GLU 331 1_555 V MG MG . F MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? 
metalc ? metalc44 F OD1 ASN 333 F ASN 333 1_555 V MG MG . F MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? 
metalc ? metalc45 U O3G ACP . F ACP 401 1_555 V MG MG . F MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.151 ? 
metalc ? metalc46 U O1B ACP . F ACP 401 1_555 V MG MG . F MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H15 N5 O11 P2' 
_chem_comp.formula_weight    443.201 
_chem_comp.id                GDP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              'rna linking' 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PB O1B GDP doub 134 n n 
PB O2B GDP sing 135 n n 
PB O3B GDP sing 136 n n 
PB O3A GDP sing 137 n n 
O2B HOB2 GDP sing 138 n n 
O3B HOB3 GDP sing 139 n n 
O3A PA GDP sing 140 n n 
PA O1A GDP doub 141 n n 
PA O2A GDP sing 142 n n 
PA O5' GDP sing 143 n n 
O2A HOA2 GDP sing 144 n n 
O5' C5' GDP sing 145 n n 
C5' C4' GDP sing 146 n n 
C5' H5' GDP sing 147 n n 
C5' "H5''" GDP sing 148 n n 
C4' O4' GDP sing 149 n n 
C4' C3' GDP sing 150 n n 
C4' H4' GDP sing 151 n n 
O4' C1' GDP sing 152 n n 
C3' O3' GDP sing 153 n n 
C3' C2' GDP sing 154 n n 
C3' H3' GDP sing 155 n n 
O3' HO3' GDP sing 156 n n 
C2' O2' GDP sing 157 n n 
C2' C1' GDP sing 158 n n 
C2' H2' GDP sing 159 n n 
O2' HO2' GDP sing 160 n n 
C1' N9 GDP sing 161 n n 
C1' H1' GDP sing 162 n n 
N9 C8 GDP sing 163 n y 
N9 C4 GDP sing 164 n y 
C8 N7 GDP doub 165 n y 
C8 H8 GDP sing 166 n n 
N7 C5 GDP sing 167 n y 
C5 C6 GDP sing 168 n n 
C5 C4 GDP doub 169 n y 
C6 O6 GDP doub 170 n n 
C6 N1 GDP sing 171 n n 
N1 C2 GDP sing 172 n n 
N1 HN1 GDP sing 173 n n 
C2 N2 GDP sing 174 n n 
C2 N3 GDP doub 175 n n 
N2 HN21 GDP sing 176 n n 
N2 HN22 GDP sing 177 n n 
N3 C4 GDP sing 178 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     5S4T 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.009545 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006312 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005585 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 5 GTP A 1 501 501 GTP GTP . 
H 6 MG A 1 502 502 MG MG . 
I 7 CA A 1 503 503 CA CA . 
J 8 GDP B 1 501 501 GDP GDP . 
K 6 MG B 1 502 502 MG MG . 
L 7 CA B 1 503 503 CA CA . 
M 9 MES B 1 504 504 MES MES . 
N 10 K1G B 1 505 601 K1G DRG . 
O 5 GTP C 1 501 501 GTP GTP . 
P 6 MG C 1 502 502 MG MG . 
Q 7 CA C 1 503 503 CA CA . 
R 8 GDP D 1 501 501 GDP GDP . 
S 6 MG D 1 502 502 MG MG . 
T 7 CA E 1 201 504 CA CA . 
U 11 ACP F 1 401 401 ACP ACP . 
V 6 MG F 1 402 402 MG MG . 
W 12 HOH A 1 601 79 HOH HOH . 
W 12 HOH A 2 602 47 HOH HOH . 
W 12 HOH A 3 603 25 HOH HOH . 
W 12 HOH A 4 604 60 HOH HOH . 
W 12 HOH A 5 605 22 HOH HOH . 
W 12 HOH A 6 606 164 HOH HOH . 
W 12 HOH A 7 607 35 HOH HOH . 
W 12 HOH A 8 608 52 HOH HOH . 
W 12 HOH A 9 609 1555 HOH HOH . 
W 12 HOH A 10 610 9 HOH HOH . 
W 12 HOH A 11 611 126 HOH HOH . 
W 12 HOH A 12 612 135 HOH HOH . 
W 12 HOH A 13 613 1340 HOH HOH . 
W 12 HOH A 14 614 29 HOH HOH . 
W 12 HOH A 15 615 83 HOH HOH . 
W 12 HOH A 16 616 152 HOH HOH . 
W 12 HOH A 17 617 257 HOH HOH . 
W 12 HOH A 18 618 40 HOH HOH . 
W 12 HOH A 19 619 106 HOH HOH . 
W 12 HOH A 20 620 434 HOH HOH . 
W 12 HOH A 21 621 87 HOH HOH . 
W 12 HOH A 22 622 65 HOH HOH . 
W 12 HOH A 23 623 109 HOH HOH . 
W 12 HOH A 24 624 104 HOH HOH . 
W 12 HOH A 25 625 94 HOH HOH . 
W 12 HOH A 26 626 78 HOH HOH . 
W 12 HOH A 27 627 88 HOH HOH . 
W 12 HOH A 28 628 93 HOH HOH . 
W 12 HOH A 29 629 108 HOH HOH . 
W 12 HOH A 30 630 198 HOH HOH . 
W 12 HOH A 31 631 123 HOH HOH . 
W 12 HOH A 32 632 107 HOH HOH . 
W 12 HOH A 33 633 161 HOH HOH . 
W 12 HOH A 34 634 118 HOH HOH . 
W 12 HOH A 35 635 97 HOH HOH . 
W 12 HOH A 36 636 81 HOH HOH . 
W 12 HOH A 37 637 191 HOH HOH . 
W 12 HOH A 38 638 140 HOH HOH . 
W 12 HOH A 39 639 180 HOH HOH . 
W 12 HOH A 40 640 201 HOH HOH . 
W 12 HOH A 41 641 174 HOH HOH . 
W 12 HOH A 42 642 167 HOH HOH . 
W 12 HOH A 43 643 125 HOH HOH . 
W 12 HOH A 44 644 250 HOH HOH . 
W 12 HOH A 45 645 258 HOH HOH . 
W 12 HOH A 46 646 24 HOH HOH . 
W 12 HOH A 47 647 56 HOH HOH . 
W 12 HOH A 48 648 156 HOH HOH . 
W 12 HOH A 49 649 203 HOH HOH . 
W 12 HOH A 50 650 263 HOH HOH . 
W 12 HOH A 51 651 57 HOH HOH . 
W 12 HOH A 52 652 273 HOH HOH . 
W 12 HOH A 53 653 213 HOH HOH . 
W 12 HOH A 54 654 195 HOH HOH . 
W 12 HOH A 55 655 95 HOH HOH . 
W 12 HOH A 56 656 141 HOH HOH . 
W 12 HOH A 57 657 295 HOH HOH . 
W 12 HOH A 58 658 291 HOH HOH . 
W 12 HOH A 59 659 297 HOH HOH . 
X 12 HOH B 1 601 347 HOH HOH . 
X 12 HOH B 2 602 331 HOH HOH . 
X 12 HOH B 3 603 505 HOH HOH . 
X 12 HOH B 4 604 333 HOH HOH . 
X 12 HOH B 5 605 335 HOH HOH . 
X 12 HOH B 6 606 387 HOH HOH . 
X 12 HOH B 7 607 383 HOH HOH . 
X 12 HOH B 8 608 386 HOH HOH . 
X 12 HOH B 9 609 362 HOH HOH . 
X 12 HOH B 10 610 1554 HOH HOH . 
X 12 HOH B 11 611 385 HOH HOH . 
X 12 HOH B 12 612 451 HOH HOH . 
X 12 HOH B 13 613 378 HOH HOH . 
X 12 HOH B 14 614 550 HOH HOH . 
X 12 HOH B 15 615 316 HOH HOH . 
X 12 HOH B 16 616 487 HOH HOH . 
X 12 HOH B 17 617 526 HOH HOH . 
X 12 HOH B 18 618 361 HOH HOH . 
X 12 HOH B 19 619 428 HOH HOH . 
X 12 HOH B 20 620 440 HOH HOH . 
X 12 HOH B 21 621 516 HOH HOH . 
X 12 HOH B 22 622 318 HOH HOH . 
X 12 HOH B 23 623 423 HOH HOH . 
X 12 HOH B 24 624 422 HOH HOH . 
X 12 HOH B 25 625 358 HOH HOH . 
X 12 HOH B 26 626 438 HOH HOH . 
X 12 HOH B 27 627 372 HOH HOH . 
X 12 HOH B 28 628 351 HOH HOH . 
X 12 HOH B 29 629 390 HOH HOH . 
X 12 HOH B 30 630 349 HOH HOH . 
X 12 HOH B 31 631 442 HOH HOH . 
X 12 HOH B 32 632 326 HOH HOH . 
X 12 HOH B 33 633 412 HOH HOH . 
X 12 HOH B 34 634 377 HOH HOH . 
X 12 HOH B 35 635 459 HOH HOH . 
X 12 HOH B 36 636 469 HOH HOH . 
X 12 HOH B 37 637 375 HOH HOH . 
X 12 HOH B 38 638 1556 HOH HOH . 
X 12 HOH B 39 639 443 HOH HOH . 
X 12 HOH B 40 640 448 HOH HOH . 
X 12 HOH B 41 641 461 HOH HOH . 
X 12 HOH B 42 642 817 HOH HOH . 
X 12 HOH B 43 643 529 HOH HOH . 
X 12 HOH B 44 644 547 HOH HOH . 
X 12 HOH B 45 645 430 HOH HOH . 
X 12 HOH B 46 646 416 HOH HOH . 
X 12 HOH B 47 647 509 HOH HOH . 
X 12 HOH B 48 648 432 HOH HOH . 
X 12 HOH B 49 649 407 HOH HOH . 
X 12 HOH B 50 650 503 HOH HOH . 
X 12 HOH B 51 651 454 HOH HOH . 
X 12 HOH B 52 652 460 HOH HOH . 
X 12 HOH B 53 653 453 HOH HOH . 
X 12 HOH B 54 654 470 HOH HOH . 
X 12 HOH B 55 655 1362 HOH HOH . 
X 12 HOH B 56 656 345 HOH HOH . 
X 12 HOH B 57 657 481 HOH HOH . 
X 12 HOH B 58 658 474 HOH HOH . 
X 12 HOH B 59 659 382 HOH HOH . 
X 12 HOH B 60 660 479 HOH HOH . 
X 12 HOH B 61 661 436 HOH HOH . 
X 12 HOH B 62 662 495 HOH HOH . 
X 12 HOH B 63 663 540 HOH HOH . 
X 12 HOH B 64 664 1557 HOH HOH . 
X 12 HOH B 65 665 551 HOH HOH . 
X 12 HOH B 66 666 484 HOH HOH . 
X 12 HOH B 67 667 573 HOH HOH . 
X 12 HOH B 68 668 528 HOH HOH . 
X 12 HOH B 69 669 617 HOH HOH . 
X 12 HOH B 70 670 564 HOH HOH . 
X 12 HOH B 71 671 493 HOH HOH . 
X 12 HOH B 72 672 534 HOH HOH . 
X 12 HOH B 73 673 586 HOH HOH . 
X 12 HOH B 74 674 577 HOH HOH . 
X 12 HOH B 75 675 560 HOH HOH . 
X 12 HOH B 76 676 596 HOH HOH . 
X 12 HOH B 77 677 290 HOH HOH . 
X 12 HOH B 78 678 327 HOH HOH . 
X 12 HOH B 79 679 597 HOH HOH . 
X 12 HOH B 80 680 605 HOH HOH . 
X 12 HOH B 81 681 610 HOH HOH . 
X 12 HOH B 82 682 619 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 1 601 629 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 2 602 641 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 3 603 643 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 4 604 660 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 5 605 664 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 6 606 645 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 7 607 655 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 8 608 623 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 9 609 784 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 10 610 792 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 11 611 739 HOH HOH . 
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Y 12 HOH C 15 615 647 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 16 616 796 HOH HOH . 
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Y 12 HOH C 19 619 687 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 20 620 752 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 21 621 725 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 22 622 753 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 23 623 782 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 24 624 659 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 25 625 746 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 26 626 742 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 27 627 761 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 28 628 786 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 29 629 732 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 30 630 677 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 31 631 698 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 32 632 769 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 33 633 710 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 34 634 692 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 35 635 931 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 36 636 735 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 37 637 714 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 38 638 819 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 39 639 679 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 40 640 694 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 41 641 705 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 42 642 789 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 43 643 748 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 44 644 859 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 45 645 810 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 46 646 701 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 47 647 803 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 48 648 716 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 49 649 757 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 50 650 744 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 51 651 740 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 52 652 848 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 53 653 738 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 54 654 777 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 55 655 670 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 56 656 800 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 57 657 747 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 58 658 889 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 59 659 765 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 60 660 663 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 61 661 737 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 62 662 972 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 63 663 915 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 64 664 721 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 65 665 835 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 66 666 872 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 67 667 773 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 68 668 763 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 69 669 880 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 70 670 971 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 71 671 723 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 72 672 910 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 73 673 914 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 74 674 741 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 75 675 750 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 76 676 813 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 77 677 873 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 78 678 811 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 79 679 730 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 80 680 468 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 81 681 818 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 82 682 834 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 83 683 764 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 84 684 840 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 85 685 829 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 86 686 808 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 87 687 876 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 88 688 791 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 89 689 825 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 90 690 776 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 91 691 733 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 92 692 801 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 93 693 719 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 94 694 858 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 95 695 875 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 96 696 667 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 97 697 837 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 98 698 830 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 99 699 893 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 100 700 955 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 101 701 887 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 102 702 909 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 103 703 839 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 104 704 888 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 105 705 751 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 106 706 877 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 107 707 843 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 108 708 807 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 109 709 991 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 110 710 797 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 111 711 787 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 112 712 809 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 113 713 771 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 114 714 894 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 115 715 689 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 116 716 906 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 117 717 913 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 118 718 868 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 119 719 901 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 120 720 902 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 121 721 847 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 122 722 998 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 123 723 979 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 124 724 775 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 125 725 806 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 126 726 924 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 127 727 822 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 128 728 885 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 129 729 833 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 130 730 717 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 131 731 923 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 132 732 1016 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 133 733 956 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 134 734 953 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 135 735 31 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 136 736 874 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 137 737 1024 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 138 738 928 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 139 739 883 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 140 740 862 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 141 741 762 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 142 742 1002 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 143 743 882 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 144 744 1027 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 145 745 995 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 146 746 851 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 147 747 898 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 148 748 903 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 149 749 986 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 150 750 976 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 151 751 938 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 152 752 1048 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 153 753 999 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 154 754 937 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 155 755 1000 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 156 756 1001 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 157 757 1007 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 158 758 1019 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 159 759 864 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 160 760 973 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 161 761 954 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 162 762 1041 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 163 763 943 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 164 764 1025 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 165 765 900 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 166 766 1012 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 167 767 977 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 168 768 683 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 169 769 1023 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 170 770 226 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 171 771 936 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 172 772 1044 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 173 773 1054 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 174 774 1065 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 175 775 1053 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 176 776 1064 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 177 777 1090 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 178 778 1076 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 179 779 1082 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 180 780 1094 HOH HOH . 
Y 12 HOH C 181 781 1095 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 1 601 1099 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 2 602 1200 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 3 603 1211 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 4 604 1101 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 5 605 1178 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 6 606 1172 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 7 607 696 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 8 608 1144 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 9 609 1232 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 10 610 713 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 11 611 1165 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 12 612 1166 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 13 613 1145 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 14 614 1191 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 15 615 1162 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 16 616 1193 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 17 617 1177 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 18 618 1188 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 19 619 1212 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 20 620 1142 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 21 621 1217 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 22 622 1258 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 23 623 1220 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 24 624 1234 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 25 625 1274 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 26 626 1222 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 27 627 1237 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 28 628 1257 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 29 629 1250 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 30 630 1180 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 31 631 1296 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 32 632 1277 HOH HOH . 
Z 12 HOH D 33 633 1304 HOH HOH . 
AA 12 HOH E 1 301 379 HOH HOH . 
AA 12 HOH E 2 302 1391 HOH HOH . 
AA 12 HOH E 3 303 816 HOH HOH . 
AA 12 HOH E 4 304 393 HOH HOH . 
AA 12 HOH E 5 305 1376 HOH HOH . 
AA 12 HOH E 6 306 1365 HOH HOH . 
AA 12 HOH E 7 307 1383 HOH HOH . 
AA 12 HOH E 8 308 1406 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 1 501 1485 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 2 502 1475 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 3 503 1506 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 4 504 1462 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 5 505 1484 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 6 506 1473 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 7 507 1503 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 8 508 1133 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 9 509 1486 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 10 510 173 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 11 511 1537 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 12 512 1458 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 13 513 1536 HOH HOH . 
BA 12 HOH F 14 514 4 HOH HOH . 
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BA 12 HOH F 16 516 1542 HOH HOH . 
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HETATM 2 O O1B GDP . . . R 8 24.941 -8.896 -44.87 1 71.22 ? O1B GDP 501 D 1 
HETATM 3 O O2B GDP . . . R 8 26.486 -8.463 -42.998 1 81.3 ? O2B GDP 501 D 1 
HETATM 4 O O3B GDP . . . R 8 26.648 -10.588 -44.207 1 81.56 ? O3B GDP 501 D 1 
HETATM 5 O O3A GDP . . . R 8 24.67 -10.183 -42.671 1 82.8 ? O3A GDP 501 D 1 
HETATM 6 P PA GDP . . . R 8 23.204 -10.714 -43.064 1 75.28 ? PA GDP 501 D 1 
HETATM 7 O O1A GDP . . . R 8 23.244 -11.67 -44.231 1 90.38 ? O1A GDP 501 D 1 
HETATM 8 O O2A GDP . . . R 8 22.271 -9.56 -43.339 1 72.69 ? O2A GDP 501 D 1 
HETATM 9 O O5' GDP . . . R 8 22.797 -11.466 -41.701 1 79.73 ? O5' GDP 501 D 1 
HETATM 10 C C5' GDP . . . R 8 22.094 -12.702 -41.714 1 77.01 ? C5' GDP 501 D 1 
HETATM 11 C C4' GDP . . . R 8 21.072 -12.666 -40.592 1 75.77 ? C4' GDP 501 D 1 
HETATM 12 O O4' GDP . . . R 8 20.383 -11.42 -40.686 1 72.98 ? O4' GDP 501 D 1 
HETATM 13 C C3' GDP . . . R 8 20.037 -13.76 -40.767 1 81.02 ? C3' GDP 501 D 1 
HETATM 14 O O3' GDP . . . R 8 19.791 -14.367 -39.497 1 80.18 ? O3' GDP 501 D 1 
HETATM 15 C C2' GDP . . . R 8 18.792 -13.057 -41.272 1 75.33 ? C2' GDP 501 D 1 
HETATM 16 O O2' GDP . . . R 8 17.615 -13.631 -40.702 1 81.45 ? O2' GDP 501 D 1 
HETATM 17 C C1' GDP . . . R 8 18.974 -11.622 -40.814 1 70.83 ? C1' GDP 501 D 1 
HETATM 18 N N9 GDP . . . R 8 18.433 -10.637 -41.778 1 71.14 ? N9 GDP 501 D 1 
HETATM 19 C C8 GDP . . . R 8 18.942 -10.342 -42.988 1 74.02 ? C8 GDP 501 D 1 
HETATM 20 N N7 GDP . . . R 8 18.211 -9.376 -43.602 1 70.62 ? N7 GDP 501 D 1 
HETATM 21 C C5 GDP . . . R 8 17.214 -9.031 -42.769 1 67.67 ? C5 GDP 501 D 1 
HETATM 22 C C6 GDP . . . R 8 16.085 -8.076 -42.788 1 71.55 ? C6 GDP 501 D 1 
HETATM 23 O O6 GDP . . . R 8 15.884 -7.333 -43.772 1 68.3 ? O6 GDP 501 D 1 
HETATM 24 N N1 GDP . . . R 8 15.284 -8.03 -41.716 1 75.27 ? N1 GDP 501 D 1 
HETATM 25 C C2 GDP . . . R 8 15.474 -8.816 -40.637 1 72.69 ? C2 GDP 501 D 1 
HETATM 26 N N2 GDP . . . R 8 14.616 -8.708 -39.594 1 67.65 ? N2 GDP 501 D 1 
HETATM 27 N N3 GDP . . . R 8 16.488 -9.713 -40.552 1 71.19 ? N3 GDP 501 D 1 
HETATM 28 C C4 GDP . . . R 8 17.37 -9.861 -41.567 1 72.71 ? C4 GDP 501 D 1 
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