data_5S5O # _model_server_result.job_id 8WaweKWy8o8C41VI8SMsSw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 15:17:13' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5s5o # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":501}' # _entry.id 5S5O # _exptl.entry_id 5S5O _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 443.201 _entity.id 8 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5S5O _cell.length_a 105.25 _cell.length_b 159.67 _cell.length_c 179.23 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5S5O _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 K N N ? 8 S N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 39 A ASP 39 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 39 A ASP 39 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc ? metalc3 A O THR 41 A THR 41 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? metalc ? metalc4 A OG1 THR 41 A THR 41 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc5 A O GLY 44 A GLY 44 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 55 A GLU 55 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.761 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 55 A GLU 55 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc8 G O1G GTP . A GTP 501 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? metalc ? metalc9 G O1B GTP . A GTP 501 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc10 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? metalc ? metalc11 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc12 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.148 ? metalc ? metalc13 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? metalc ? metalc14 I CA CA . A CA 503 1_555 W O HOH . A HOH 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? metalc ? metalc15 J CA CA . A CA 504 1_555 W O HOH . A HOH 656 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.025 ? metalc ? metalc16 J CA CA . A CA 504 1_555 AA O HOH . E HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc ? metalc17 B OE1 GLN 11 B GLN 11 1_555 L MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc18 B OE1 GLU 111 B GLU 113 1_555 M CA CA . B CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.887 ? metalc ? metalc19 K O1A GDP . B GDP 501 1_555 L MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc20 L MG MG . B MG 502 1_555 X O HOH . B HOH 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc21 L MG MG . B MG 502 1_555 X O HOH . B HOH 643 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.988 ? metalc ? metalc22 L MG MG . B MG 502 1_555 X O HOH . B HOH 651 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? metalc ? metalc23 L MG MG . B MG 502 1_555 Y O HOH . C HOH 778 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? metalc ? metalc24 M CA CA . B CA 503 4_455 C OE1 GLU 284 C GLU 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? metalc ? metalc25 C OD1 ASP 39 C ASP 39 1_555 R CA CA . C CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? metalc ? metalc26 C OD2 ASP 39 C ASP 39 1_555 R CA CA . C CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? metalc ? metalc27 C O THR 41 C THR 41 1_555 R CA CA . C CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc28 C OG1 THR 41 C THR 41 1_555 R CA CA . C CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc29 C O GLY 44 C GLY 44 1_555 R CA CA . C CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc30 C OE1 GLU 55 C GLU 55 1_555 R CA CA . C CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc31 C OE2 GLU 55 C GLU 55 1_555 R CA CA . C CA 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc32 P O1G GTP . C GTP 602 1_555 Q MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? metalc ? metalc33 P O1B GTP . C GTP 602 1_555 Q MG MG . C MG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? metalc ? metalc34 Q MG MG . C MG 603 1_555 Y O HOH . C HOH 722 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc35 Q MG MG . C MG 603 1_555 Y O HOH . C HOH 733 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? metalc ? metalc36 Q MG MG . C MG 603 1_555 Y O HOH . C HOH 772 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc37 Q MG MG . C MG 603 1_555 Y O HOH . C HOH 776 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? metalc ? metalc38 R CA CA . C CA 604 1_555 Y O HOH . C HOH 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? metalc ? metalc39 D OE1 GLN 11 D GLN 11 1_555 T MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.955 ? metalc ? metalc40 S O1A GDP . D GDP 501 1_555 T MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? metalc ? metalc41 T MG MG . D MG 502 1_555 Z O HOH . D HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.923 ? metalc ? metalc42 F OE2 GLU 331 F GLU 331 1_555 V MG MG . F MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.669 ? metalc ? metalc43 U O3G ACP . F ACP 401 1_555 V MG MG . F MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc ? metalc44 U O1B ACP . F ACP 401 1_555 V MG MG . F MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? # _chem_comp.formula 'C10 H15 N5 O11 P2' _chem_comp.formula_weight 443.201 _chem_comp.id GDP _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _chem_comp.type 'rna linking' _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PB O1B GDP doub 134 n n PB O2B GDP sing 135 n n PB O3B GDP sing 136 n n PB O3A GDP sing 137 n n O2B HOB2 GDP sing 138 n n O3B HOB3 GDP sing 139 n n O3A PA GDP sing 140 n n PA O1A GDP doub 141 n n PA O2A GDP sing 142 n n PA O5' GDP sing 143 n n O2A HOA2 GDP sing 144 n n O5' C5' GDP sing 145 n n C5' C4' GDP sing 146 n n C5' H5' GDP sing 147 n n C5' "H5''" GDP sing 148 n n C4' O4' GDP sing 149 n n C4' C3' GDP sing 150 n n C4' H4' GDP sing 151 n n O4' C1' GDP sing 152 n n C3' O3' GDP sing 153 n n C3' C2' GDP sing 154 n n C3' H3' GDP sing 155 n n O3' HO3' GDP sing 156 n n C2' O2' GDP sing 157 n n C2' C1' GDP sing 158 n n C2' H2' GDP sing 159 n n O2' HO2' GDP sing 160 n n C1' N9 GDP sing 161 n n C1' H1' GDP sing 162 n n N9 C8 GDP sing 163 n y N9 C4 GDP sing 164 n y C8 N7 GDP doub 165 n y C8 H8 GDP sing 166 n n N7 C5 GDP sing 167 n y C5 C6 GDP sing 168 n n C5 C4 GDP doub 169 n y C6 O6 GDP doub 170 n n C6 N1 GDP sing 171 n n N1 C2 GDP sing 172 n n N1 HN1 GDP sing 173 n n C2 N2 GDP sing 174 n n C2 N3 GDP doub 175 n n N2 HN21 GDP sing 176 n n N2 HN22 GDP sing 177 n n N3 C4 GDP sing 178 n n # _atom_sites.entry_id 5S5O _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009501 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006263 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005579 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 5 GTP A 1 501 501 GTP GTP . H 6 MG A 1 502 502 MG MG . I 7 CA A 1 503 503 CA CA . J 7 CA A 1 504 504 CA CA . K 8 GDP B 1 501 501 GDP GDP . L 6 MG B 1 502 502 MG MG . M 7 CA B 1 503 503 CA CA . N 9 MES B 1 504 504 MES MES . O 10 WGY C 1 601 601 WGY DRG . P 5 GTP C 1 602 501 GTP GTP . Q 6 MG C 1 603 502 MG MG . R 7 CA C 1 604 503 CA CA . S 8 GDP D 1 501 501 GDP GDP . T 6 MG D 1 502 502 MG MG . U 11 ACP F 1 401 401 ACP ACP . V 6 MG F 1 402 402 MG MG . W 12 HOH A 1 601 126 HOH HOH . W 12 HOH A 2 602 9 HOH HOH . W 12 HOH A 3 603 25 HOH HOH . W 12 HOH A 4 604 137 HOH HOH . W 12 HOH A 5 605 81 HOH HOH . W 12 HOH A 6 606 87 HOH HOH . W 12 HOH A 7 607 152 HOH HOH . W 12 HOH A 8 608 1340 HOH HOH . W 12 HOH A 9 609 79 HOH HOH . W 12 HOH A 10 610 47 HOH HOH . W 12 HOH A 11 611 83 HOH HOH . W 12 HOH A 12 612 191 HOH HOH . W 12 HOH A 13 613 94 HOH HOH . W 12 HOH A 14 614 29 HOH HOH . W 12 HOH A 15 615 52 HOH HOH . W 12 HOH A 16 616 65 HOH HOH . W 12 HOH A 17 617 40 HOH HOH . W 12 HOH A 18 618 106 HOH HOH . W 12 HOH A 19 619 161 HOH HOH . W 12 HOH A 20 620 78 HOH HOH . W 12 HOH A 21 621 1557 HOH HOH . W 12 HOH A 22 622 60 HOH HOH . W 12 HOH A 23 623 140 HOH HOH . W 12 HOH A 24 624 88 HOH HOH . W 12 HOH A 25 625 93 HOH HOH . W 12 HOH A 26 626 174 HOH HOH . W 12 HOH A 27 627 164 HOH HOH . W 12 HOH A 28 628 180 HOH HOH . W 12 HOH A 29 629 202 HOH HOH . W 12 HOH A 30 630 22 HOH HOH . W 12 HOH A 31 631 109 HOH HOH . W 12 HOH A 32 632 123 HOH HOH . W 12 HOH A 33 633 108 HOH HOH . W 12 HOH A 34 634 198 HOH HOH . W 12 HOH A 35 635 97 HOH HOH . W 12 HOH A 36 636 135 HOH HOH . W 12 HOH A 37 637 55 HOH HOH . W 12 HOH A 38 638 24 HOH HOH . W 12 HOH A 39 639 36 HOH HOH . W 12 HOH A 40 640 208 HOH HOH . W 12 HOH A 41 641 156 HOH HOH . W 12 HOH A 42 642 172 HOH HOH . W 12 HOH A 43 643 104 HOH HOH . W 12 HOH A 44 644 220 HOH HOH . W 12 HOH A 45 645 118 HOH HOH . W 12 HOH A 46 646 125 HOH HOH . W 12 HOH A 47 647 57 HOH HOH . W 12 HOH A 48 648 194 HOH HOH . W 12 HOH A 49 649 107 HOH HOH . W 12 HOH A 50 650 175 HOH HOH . W 12 HOH A 51 651 258 HOH HOH . W 12 HOH A 52 652 228 HOH HOH . W 12 HOH A 53 653 195 HOH HOH . W 12 HOH A 54 654 203 HOH HOH . W 12 HOH A 55 655 102 HOH HOH . W 12 HOH A 56 656 213 HOH HOH . W 12 HOH A 57 657 263 HOH HOH . W 12 HOH A 58 658 141 HOH HOH . W 12 HOH A 59 659 249 HOH HOH . W 12 HOH A 60 660 291 HOH HOH . X 12 HOH B 1 601 335 HOH HOH . X 12 HOH B 2 602 331 HOH HOH . X 12 HOH B 3 603 330 HOH HOH . X 12 HOH B 4 604 316 HOH HOH . X 12 HOH B 5 605 319 HOH HOH . X 12 HOH B 6 606 318 HOH HOH . X 12 HOH B 7 607 443 HOH HOH . X 12 HOH B 8 608 326 HOH HOH . X 12 HOH B 9 609 333 HOH HOH . X 12 HOH B 10 610 383 HOH HOH . X 12 HOH B 11 611 351 HOH HOH . X 12 HOH B 12 612 349 HOH HOH . X 12 HOH B 13 613 505 HOH HOH . X 12 HOH B 14 614 361 HOH HOH . X 12 HOH B 15 615 461 HOH HOH . X 12 HOH B 16 616 428 HOH HOH . X 12 HOH B 17 617 362 HOH HOH . X 12 HOH B 18 618 386 HOH HOH . X 12 HOH B 19 619 451 HOH HOH . X 12 HOH B 20 620 201 HOH HOH . X 12 HOH B 21 621 378 HOH HOH . X 12 HOH B 22 622 434 HOH HOH . X 12 HOH B 23 623 423 HOH HOH . X 12 HOH B 24 624 337 HOH HOH . X 12 HOH B 25 625 382 HOH HOH . X 12 HOH B 26 626 448 HOH HOH . X 12 HOH B 27 627 432 HOH HOH . X 12 HOH B 28 628 377 HOH HOH . X 12 HOH B 29 629 438 HOH HOH . X 12 HOH B 30 630 442 HOH HOH . X 12 HOH B 31 631 508 HOH HOH . X 12 HOH B 32 632 460 HOH HOH . X 12 HOH B 33 633 412 HOH HOH . X 12 HOH B 34 634 817 HOH HOH . X 12 HOH B 35 635 526 HOH HOH . X 12 HOH B 36 636 430 HOH HOH . X 12 HOH B 37 637 407 HOH HOH . X 12 HOH B 38 638 416 HOH HOH . X 12 HOH B 39 639 375 HOH HOH . X 12 HOH B 40 640 372 HOH HOH . X 12 HOH B 41 641 469 HOH HOH . X 12 HOH B 42 642 387 HOH HOH . X 12 HOH B 43 643 440 HOH HOH . X 12 HOH B 44 644 422 HOH HOH . X 12 HOH B 45 645 474 HOH HOH . X 12 HOH B 46 646 487 HOH HOH . X 12 HOH B 47 647 517 HOH HOH . X 12 HOH B 48 648 481 HOH HOH . X 12 HOH B 49 649 509 HOH HOH . X 12 HOH B 50 650 358 HOH HOH . X 12 HOH B 51 651 405 HOH HOH . X 12 HOH B 52 652 503 HOH HOH . X 12 HOH B 53 653 470 HOH HOH . X 12 HOH B 54 654 495 HOH HOH . X 12 HOH B 55 655 453 HOH HOH . X 12 HOH B 56 656 414 HOH HOH . X 12 HOH B 57 657 484 HOH HOH . X 12 HOH B 58 658 385 HOH HOH . X 12 HOH B 59 659 529 HOH HOH . X 12 HOH B 60 660 297 HOH HOH . X 12 HOH B 61 661 479 HOH HOH . X 12 HOH B 62 662 540 HOH HOH . X 12 HOH B 63 663 436 HOH HOH . X 12 HOH B 64 664 586 HOH HOH . X 12 HOH B 65 665 557 HOH HOH . X 12 HOH B 66 666 534 HOH HOH . X 12 HOH B 67 667 345 HOH HOH . X 12 HOH B 68 668 560 HOH HOH . X 12 HOH B 69 669 551 HOH HOH . X 12 HOH B 70 670 573 HOH HOH . X 12 HOH B 71 671 528 HOH HOH . X 12 HOH B 72 672 617 HOH HOH . X 12 HOH B 73 673 327 HOH HOH . X 12 HOH B 74 674 1064 HOH HOH . X 12 HOH B 75 675 597 HOH HOH . X 12 HOH B 76 676 603 HOH HOH . X 12 HOH B 77 677 614 HOH HOH . X 12 HOH B 78 678 520 HOH HOH . X 12 HOH B 79 679 610 HOH HOH . X 12 HOH B 80 680 619 HOH HOH . Y 12 HOH C 1 701 641 HOH HOH . Y 12 HOH C 2 702 647 HOH HOH . Y 12 HOH C 3 703 660 HOH HOH . Y 12 HOH C 4 704 623 HOH HOH . Y 12 HOH C 5 705 622 HOH HOH . Y 12 HOH C 6 706 664 HOH HOH . Y 12 HOH C 7 707 692 HOH HOH . Y 12 HOH C 8 708 730 HOH HOH . Y 12 HOH C 9 709 886 HOH HOH . Y 12 HOH C 10 710 735 HOH HOH . Y 12 HOH C 11 711 796 HOH HOH . Y 12 HOH C 12 712 645 HOH HOH . Y 12 HOH C 13 713 739 HOH HOH . Y 12 HOH C 14 714 800 HOH HOH . Y 12 HOH C 15 715 1101 HOH HOH . Y 12 HOH C 16 716 683 HOH HOH . Y 12 HOH C 17 717 694 HOH HOH . Y 12 HOH C 18 718 792 HOH HOH . Y 12 HOH C 19 719 655 HOH HOH . Y 12 HOH C 20 720 803 HOH HOH . Y 12 HOH C 21 721 658 HOH HOH . Y 12 HOH C 22 722 732 HOH HOH . Y 12 HOH C 23 723 848 HOH HOH . Y 12 HOH C 24 724 784 HOH HOH . Y 12 HOH C 25 725 669 HOH HOH . Y 12 HOH C 26 726 770 HOH HOH . Y 12 HOH C 27 727 725 HOH HOH . Y 12 HOH C 28 728 753 HOH HOH . Y 12 HOH C 29 729 761 HOH HOH . Y 12 HOH C 30 730 659 HOH HOH . Y 12 HOH C 31 731 676 HOH HOH . Y 12 HOH C 32 732 738 HOH HOH . Y 12 HOH C 33 733 677 HOH HOH . Y 12 HOH C 34 734 765 HOH HOH . Y 12 HOH C 35 735 810 HOH HOH . Y 12 HOH C 36 736 710 HOH HOH . Y 12 HOH C 37 737 750 HOH HOH . Y 12 HOH C 38 738 705 HOH HOH . Y 12 HOH C 39 739 713 HOH HOH . Y 12 HOH C 40 740 789 HOH HOH . Y 12 HOH C 41 741 723 HOH HOH . Y 12 HOH C 42 742 698 HOH HOH . Y 12 HOH C 43 743 752 HOH HOH . Y 12 HOH C 44 744 746 HOH HOH . Y 12 HOH C 45 745 714 HOH HOH . Y 12 HOH C 46 746 763 HOH HOH . Y 12 HOH C 47 747 747 HOH HOH . Y 12 HOH C 48 748 799 HOH HOH . Y 12 HOH C 49 749 687 HOH HOH . Y 12 HOH C 50 750 913 HOH HOH . Y 12 HOH C 51 751 859 HOH HOH . Y 12 HOH C 52 752 757 HOH HOH . Y 12 HOH C 53 753 716 HOH HOH . Y 12 HOH C 54 754 786 HOH HOH . Y 12 HOH C 55 755 910 HOH HOH . Y 12 HOH C 56 756 740 HOH HOH . Y 12 HOH C 57 757 819 HOH HOH . Y 12 HOH C 58 758 773 HOH HOH . Y 12 HOH C 59 759 663 HOH HOH . Y 12 HOH C 60 760 741 HOH HOH . Y 12 HOH C 61 761 801 HOH HOH . Y 12 HOH C 62 762 748 HOH HOH . Y 12 HOH C 63 763 818 HOH HOH . Y 12 HOH C 64 764 843 HOH HOH . Y 12 HOH C 65 765 742 HOH HOH . Y 12 HOH C 66 766 813 HOH HOH . Y 12 HOH C 67 767 882 HOH HOH . Y 12 HOH C 68 768 829 HOH HOH . Y 12 HOH C 69 769 782 HOH HOH . Y 12 HOH C 70 770 679 HOH HOH . Y 12 HOH C 71 771 873 HOH HOH . Y 12 HOH C 72 772 744 HOH HOH . Y 12 HOH C 73 773 840 HOH HOH . Y 12 HOH C 74 774 808 HOH HOH . Y 12 HOH C 75 775 775 HOH HOH . Y 12 HOH C 76 776 888 HOH HOH . Y 12 HOH C 77 777 893 HOH HOH . Y 12 HOH C 78 778 721 HOH HOH . Y 12 HOH C 79 779 894 HOH HOH . Y 12 HOH C 80 780 868 HOH HOH . Y 12 HOH C 81 781 701 HOH HOH . Y 12 HOH C 82 782 852 HOH HOH . Y 12 HOH C 83 783 825 HOH HOH . Y 12 HOH C 84 784 749 HOH HOH . Y 12 HOH C 85 785 807 HOH HOH . Y 12 HOH C 86 786 955 HOH HOH . Y 12 HOH C 87 787 634 HOH HOH . Y 12 HOH C 88 788 733 HOH HOH . Y 12 HOH C 89 789 931 HOH HOH . Y 12 HOH C 90 790 797 HOH HOH . Y 12 HOH C 91 791 719 HOH HOH . Y 12 HOH C 92 792 833 HOH HOH . Y 12 HOH C 93 793 764 HOH HOH . Y 12 HOH C 94 794 914 HOH HOH . Y 12 HOH C 95 795 877 HOH HOH . Y 12 HOH C 96 796 837 HOH HOH . Y 12 HOH C 97 797 876 HOH HOH . Y 12 HOH C 98 798 751 HOH HOH . Y 12 HOH C 99 799 811 HOH HOH . Y 12 HOH C 100 800 670 HOH HOH . Y 12 HOH C 101 801 809 HOH HOH . Y 12 HOH C 102 802 875 HOH HOH . Y 12 HOH C 103 803 915 HOH HOH . Y 12 HOH C 104 804 839 HOH HOH . Y 12 HOH C 105 805 902 HOH HOH . Y 12 HOH C 106 806 885 HOH HOH . Y 12 HOH C 107 807 906 HOH HOH . Y 12 HOH C 108 808 830 HOH HOH . Y 12 HOH C 109 809 862 HOH HOH . Y 12 HOH C 110 810 834 HOH HOH . Y 12 HOH C 111 811 889 HOH HOH . Y 12 HOH C 112 812 847 HOH HOH . Y 12 HOH C 113 813 689 HOH HOH . Y 12 HOH C 114 814 822 HOH HOH . Y 12 HOH C 115 815 971 HOH HOH . Y 12 HOH C 116 816 737 HOH HOH . Y 12 HOH C 117 817 953 HOH HOH . Y 12 HOH C 118 818 858 HOH HOH . Y 12 HOH C 119 819 806 HOH HOH . Y 12 HOH C 120 820 771 HOH HOH . Y 12 HOH C 121 821 936 HOH HOH . Y 12 HOH C 122 822 1555 HOH HOH . Y 12 HOH C 123 823 791 HOH HOH . Y 12 HOH C 124 824 776 HOH HOH . Y 12 HOH C 125 825 909 HOH HOH . Y 12 HOH C 126 826 851 HOH HOH . Y 12 HOH C 127 827 870 HOH HOH . Y 12 HOH C 128 828 900 HOH HOH . Y 12 HOH C 129 829 898 HOH HOH . Y 12 HOH C 130 830 874 HOH HOH . Y 12 HOH C 131 831 1016 HOH HOH . Y 12 HOH C 132 832 787 HOH HOH . Y 12 HOH C 133 833 979 HOH HOH . Y 12 HOH C 134 834 821 HOH HOH . Y 12 HOH C 135 835 901 HOH HOH . Y 12 HOH C 136 836 762 HOH HOH . Y 12 HOH C 137 837 980 HOH HOH . Y 12 HOH C 138 838 991 HOH HOH . Y 12 HOH C 139 839 972 HOH HOH . Y 12 HOH C 140 840 903 HOH HOH . Y 12 HOH C 141 841 995 HOH HOH . Y 12 HOH C 142 842 923 HOH HOH . Y 12 HOH C 143 843 650 HOH HOH . Y 12 HOH C 144 844 928 HOH HOH . Y 12 HOH C 145 845 956 HOH HOH . Y 12 HOH C 146 846 938 HOH HOH . Y 12 HOH C 147 847 1556 HOH HOH . Y 12 HOH C 148 848 1007 HOH HOH . Y 12 HOH C 149 849 1003 HOH HOH . Y 12 HOH C 150 850 785 HOH HOH . Y 12 HOH C 151 851 880 HOH HOH . Y 12 HOH C 152 852 954 HOH HOH . Y 12 HOH C 153 853 999 HOH HOH . Y 12 HOH C 154 854 717 HOH HOH . Y 12 HOH C 155 855 963 HOH HOH . Y 12 HOH C 156 856 864 HOH HOH . Y 12 HOH C 157 857 986 HOH HOH . Y 12 HOH C 158 858 943 HOH HOH . Y 12 HOH C 159 859 1001 HOH HOH . Y 12 HOH C 160 860 998 HOH HOH . Y 12 HOH C 161 861 1002 HOH HOH . Y 12 HOH C 162 862 1000 HOH HOH . Y 12 HOH C 163 863 1041 HOH HOH . Y 12 HOH C 164 864 924 HOH HOH . Y 12 HOH C 165 865 937 HOH HOH . Y 12 HOH C 166 866 883 HOH HOH . Y 12 HOH C 167 867 1024 HOH HOH . Y 12 HOH C 168 868 1019 HOH HOH . Y 12 HOH C 169 869 973 HOH HOH . Y 12 HOH C 170 870 1025 HOH HOH . Y 12 HOH C 171 871 976 HOH HOH . Y 12 HOH C 172 872 1006 HOH HOH . Y 12 HOH C 173 873 1023 HOH HOH . Y 12 HOH C 174 874 1044 HOH HOH . Y 12 HOH C 175 875 1065 HOH HOH . Y 12 HOH C 176 876 977 HOH HOH . Y 12 HOH C 177 877 1012 HOH HOH . Y 12 HOH C 178 878 1048 HOH HOH . Y 12 HOH C 179 879 1054 HOH HOH . Y 12 HOH C 180 880 1056 HOH HOH . Y 12 HOH C 181 881 1060 HOH HOH . Y 12 HOH C 182 882 1076 HOH HOH . Y 12 HOH C 183 883 1053 HOH HOH . Y 12 HOH C 184 884 1090 HOH HOH . Y 12 HOH C 185 885 1082 HOH HOH . Y 12 HOH C 186 886 1095 HOH HOH . Z 12 HOH D 1 601 1099 HOH HOH . Z 12 HOH D 2 602 1211 HOH HOH . Z 12 HOH D 3 603 1145 HOH HOH . Z 12 HOH D 4 604 1200 HOH HOH . Z 12 HOH D 5 605 1166 HOH HOH . Z 12 HOH D 6 606 696 HOH HOH . Z 12 HOH D 7 607 1212 HOH HOH . Z 12 HOH D 8 608 1217 HOH HOH . Z 12 HOH D 9 609 1186 HOH HOH . Z 12 HOH D 10 610 1144 HOH HOH . Z 12 HOH D 11 611 1162 HOH HOH . Z 12 HOH D 12 612 1202 HOH HOH . Z 12 HOH D 13 613 1237 HOH HOH . Z 12 HOH D 14 614 1172 HOH HOH . Z 12 HOH D 15 615 1177 HOH HOH . Z 12 HOH D 16 616 1188 HOH HOH . Z 12 HOH D 17 617 1484 HOH HOH . Z 12 HOH D 18 618 1165 HOH HOH . Z 12 HOH D 19 619 1247 HOH HOH . Z 12 HOH D 20 620 1142 HOH HOH . Z 12 HOH D 21 621 1222 HOH HOH . Z 12 HOH D 22 622 1191 HOH HOH . Z 12 HOH D 23 623 1193 HOH HOH . Z 12 HOH D 24 624 1220 HOH HOH . Z 12 HOH D 25 625 1234 HOH HOH . Z 12 HOH D 26 626 1257 HOH HOH . Z 12 HOH D 27 627 1274 HOH HOH . Z 12 HOH D 28 628 1245 HOH HOH . Z 12 HOH D 29 629 1296 HOH HOH . Z 12 HOH D 30 630 1277 HOH HOH . Z 12 HOH D 31 631 1304 HOH HOH . AA 12 HOH E 1 201 1334 HOH HOH . AA 12 HOH E 2 202 1391 HOH HOH . AA 12 HOH E 3 203 379 HOH HOH . AA 12 HOH E 4 204 393 HOH HOH . AA 12 HOH E 5 205 1378 HOH HOH . AA 12 HOH E 6 206 1365 HOH HOH . AA 12 HOH E 7 207 1383 HOH HOH . AA 12 HOH E 8 208 1376 HOH HOH . AA 12 HOH E 9 209 1373 HOH HOH . AA 12 HOH E 10 210 1392 HOH HOH . AA 12 HOH E 11 211 1406 HOH HOH . AA 12 HOH E 12 212 577 HOH HOH . BA 12 HOH F 1 501 1133 HOH HOH . BA 12 HOH F 2 502 1473 HOH HOH . BA 12 HOH F 3 503 1485 HOH HOH . BA 12 HOH F 4 504 1537 HOH HOH . BA 12 HOH F 5 505 1474 HOH HOH . BA 12 HOH F 6 506 1506 HOH HOH . BA 12 HOH F 7 507 1475 HOH HOH . BA 12 HOH F 8 508 1486 HOH HOH . BA 12 HOH F 9 509 1524 HOH HOH . BA 12 HOH F 10 510 1458 HOH HOH . BA 12 HOH F 11 511 1536 HOH HOH . BA 12 HOH F 12 512 1544 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PB GDP . . . K 8 18.987 50.001 15.941 1 48.04 ? PB GDP 501 B 1 HETATM 2 O O1B GDP . . . K 8 18.487 50.96 14.887 1 45.16 ? O1B GDP 501 B 1 HETATM 3 O O2B GDP . . . K 8 19.487 50.766 17.147 1 48.31 ? O2B GDP 501 B 1 HETATM 4 O O3B GDP . . . K 8 20.127 49.168 15.42 1 42.91 ? O3B GDP 501 B 1 HETATM 5 O O3A GDP . . . K 8 17.832 48.985 16.395 1 45.26 ? O3A GDP 501 B 1 HETATM 6 P PA GDP . . . K 8 16.426 49.468 17.003 1 45.66 ? PA GDP 501 B 1 HETATM 7 O O1A GDP . . . K 8 15.283 49.289 16.028 1 45.55 ? O1A GDP 501 B 1 HETATM 8 O O2A GDP . . . K 8 16.483 50.893 17.496 1 45.72 ? O2A GDP 501 B 1 HETATM 9 O O5' GDP . . . K 8 16.309 48.444 18.234 1 47.02 ? O5' GDP 501 B 1 HETATM 10 C C5' GDP . . . K 8 15.22 47.535 18.335 1 49.6 ? C5' GDP 501 B 1 HETATM 11 C C4' GDP . . . K 8 14.666 47.642 19.745 1 47.83 ? C4' GDP 501 B 1 HETATM 12 O O4' GDP . . . K 8 14.197 48.976 19.914 1 47.56 ? O4' GDP 501 B 1 HETATM 13 C C3' GDP . . . K 8 13.472 46.738 19.962 1 52.61 ? C3' GDP 501 B 1 HETATM 14 O O3' GDP . . . K 8 13.461 46.349 21.341 1 50.13 ? O3' GDP 501 B 1 HETATM 15 C C2' GDP . . . K 8 12.281 47.623 19.675 1 49.64 ? C2' GDP 501 B 1 HETATM 16 O O2' GDP . . . K 8 11.165 47.204 20.458 1 54.86 ? O2' GDP 501 B 1 HETATM 17 C C1' GDP . . . K 8 12.781 48.987 20.109 1 49.86 ? C1' GDP 501 B 1 HETATM 18 N N9 GDP . . . K 8 12.249 50.109 19.306 1 53.22 ? N9 GDP 501 B 1 HETATM 19 C C8 GDP . . . K 8 12.474 50.336 17.996 1 52.18 ? C8 GDP 501 B 1 HETATM 20 N N7 GDP . . . K 8 11.862 51.477 17.589 1 53.33 ? N7 GDP 501 B 1 HETATM 21 C C5 GDP . . . K 8 11.24 52.003 18.663 1 49.97 ? C5 GDP 501 B 1 HETATM 22 C C6 GDP . . . K 8 10.419 53.196 18.945 1 55.48 ? C6 GDP 501 B 1 HETATM 23 O O6 GDP . . . K 8 10.151 54.007 18.036 1 61.95 ? O6 GDP 501 B 1 HETATM 24 N N1 GDP . . . K 8 9.971 53.376 20.197 1 56.71 ? N1 GDP 501 B 1 HETATM 25 C C2 GDP . . . K 8 10.247 52.516 21.197 1 54.9 ? C2 GDP 501 B 1 HETATM 26 N N2 GDP . . . K 8 9.757 52.765 22.439 1 50.44 ? N2 GDP 501 B 1 HETATM 27 N N3 GDP . . . K 8 10.998 51.402 21.012 1 54.35 ? N3 GDP 501 B 1 HETATM 28 C C4 GDP . . . K 8 11.505 51.101 19.791 1 55.31 ? C4 GDP 501 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 31 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 170 _model_server_stats.query_time_ms 268 _model_server_stats.encode_time_ms 51 _model_server_stats.element_count 28 #