data_5S5Q # _model_server_result.job_id 7pz565bY6_eLkHlkQdebHg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 22:56:03' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5s5q # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":501}' # _entry.id 5S5Q # _exptl.entry_id 5S5Q _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 443.201 _entity.id 8 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5S5Q _cell.length_a 104.85 _cell.length_b 158.62 _cell.length_c 178.62 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5S5Q _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 8 K N N ? 8 S N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 39 A ASP 39 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 39 A ASP 39 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? metalc ? metalc3 A O THR 41 A THR 41 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? metalc ? metalc4 A OG1 THR 41 A THR 41 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.51 ? metalc ? metalc5 A O GLY 44 A GLY 44 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 55 A GLU 55 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 55 A GLU 55 1_555 I CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? metalc ? metalc8 G O1G GTP . A GTP 501 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.97 ? metalc ? metalc9 G O1B GTP . A GTP 501 1_555 H MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? metalc ? metalc10 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? metalc ? metalc11 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? metalc ? metalc12 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? metalc ? metalc13 H MG MG . A MG 502 1_555 W O HOH . A HOH 653 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc14 I CA CA . A CA 503 1_555 W O HOH . A HOH 625 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc15 J CA CA . A CA 504 1_555 W O HOH . A HOH 663 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.712 ? metalc ? metalc16 J CA CA . A CA 504 1_555 W O HOH . A HOH 676 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? metalc ? metalc17 J CA CA . A CA 504 1_555 AA O HOH . E HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? metalc ? metalc18 B OE1 GLN 11 B GLN 11 1_555 L MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? metalc ? metalc19 B OE1 GLU 111 B GLU 113 1_555 M CA CA . B CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? metalc ? metalc20 K O1A GDP . B GDP 501 1_555 L MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.229 ? metalc ? metalc21 L MG MG . B MG 502 1_555 X O HOH . B HOH 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc22 L MG MG . B MG 502 1_555 X O HOH . B HOH 648 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc23 L MG MG . B MG 502 1_555 X O HOH . B HOH 652 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? metalc ? metalc24 L MG MG . B MG 502 1_555 X O HOH . B HOH 673 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc25 L MG MG . B MG 502 1_555 Y O HOH . C HOH 692 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? metalc ? metalc26 M CA CA . B CA 503 4_455 C OE1 GLU 284 C GLU 284 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.922 ? metalc ? metalc27 C OD1 ASP 39 C ASP 39 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc28 C OD2 ASP 39 C ASP 39 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc29 C O THR 41 C THR 41 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc30 C OG1 THR 41 C THR 41 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? metalc ? metalc31 C O GLY 44 C GLY 44 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc32 C OE1 GLU 55 C GLU 55 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? metalc ? metalc33 C OE2 GLU 55 C GLU 55 1_555 Q CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc34 O O1G GTP . C GTP 501 1_555 P MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.974 ? metalc ? metalc35 O O1B GTP . C GTP 501 1_555 P MG MG . C MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc36 P MG MG . C MG 502 1_555 Y O HOH . C HOH 630 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? metalc ? metalc37 P MG MG . C MG 502 1_555 Y O HOH . C HOH 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? metalc ? metalc38 P MG MG . C MG 502 1_555 Y O HOH . C HOH 657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? metalc ? metalc39 P MG MG . C MG 502 1_555 Y O HOH . C HOH 695 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc40 Q CA CA . C CA 503 1_555 Y O HOH . C HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc41 D OE1 GLN 11 D GLN 11 1_555 T MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? metalc ? metalc42 S O1A GDP . D GDP 501 1_555 T MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.144 ? metalc ? metalc43 T MG MG . D MG 502 1_555 Z O HOH . D HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.853 ? metalc ? metalc44 F OE2 GLU 331 F GLU 331 1_555 V MG MG . F MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc45 F OD1 ASN 333 F ASN 333 1_555 V MG MG . F MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? metalc ? metalc46 U O3G ACP . F ACP 401 1_555 V MG MG . F MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? metalc ? metalc47 U O1B ACP . F ACP 401 1_555 V MG MG . F MG 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.576 ? # _chem_comp.formula 'C10 H15 N5 O11 P2' _chem_comp.formula_weight 443.201 _chem_comp.id GDP _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name "GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" _chem_comp.type 'rna linking' _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PB O1B GDP doub 134 n n PB O2B GDP sing 135 n n PB O3B GDP sing 136 n n PB O3A GDP sing 137 n n O2B HOB2 GDP sing 138 n n O3B HOB3 GDP sing 139 n n O3A PA GDP sing 140 n n PA O1A GDP doub 141 n n PA O2A GDP sing 142 n n PA O5' GDP sing 143 n n O2A HOA2 GDP sing 144 n n O5' C5' GDP sing 145 n n C5' C4' GDP sing 146 n n C5' H5' GDP sing 147 n n C5' "H5''" GDP sing 148 n n C4' O4' GDP sing 149 n n C4' C3' GDP sing 150 n n C4' H4' GDP sing 151 n n O4' C1' GDP sing 152 n n C3' O3' GDP sing 153 n n C3' C2' GDP sing 154 n n C3' H3' GDP sing 155 n n O3' HO3' GDP sing 156 n n C2' O2' GDP sing 157 n n C2' C1' GDP sing 158 n n C2' H2' GDP sing 159 n n O2' HO2' GDP sing 160 n n C1' N9 GDP sing 161 n n C1' H1' GDP sing 162 n n N9 C8 GDP sing 163 n y N9 C4 GDP sing 164 n y C8 N7 GDP doub 165 n y C8 H8 GDP sing 166 n n N7 C5 GDP sing 167 n y C5 C6 GDP sing 168 n n C5 C4 GDP doub 169 n y C6 O6 GDP doub 170 n n C6 N1 GDP sing 171 n n N1 C2 GDP sing 172 n n N1 HN1 GDP sing 173 n n C2 N2 GDP sing 174 n n C2 N3 GDP doub 175 n n N2 HN21 GDP sing 176 n n N2 HN22 GDP sing 177 n n N3 C4 GDP sing 178 n n # _atom_sites.entry_id 5S5Q _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009537 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.006304 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005598 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 5 GTP A 1 501 501 GTP GTP . H 6 MG A 1 502 502 MG MG . I 7 CA A 1 503 503 CA CA . J 7 CA A 1 504 504 CA CA . K 8 GDP B 1 501 501 GDP GDP . L 6 MG B 1 502 502 MG MG . M 7 CA B 1 503 503 CA CA . N 9 MES B 1 504 504 MES MES . O 5 GTP C 1 501 501 GTP GTP . P 6 MG C 1 502 502 MG MG . Q 7 CA C 1 503 503 CA CA . R 10 HR5 C 1 504 601 HR5 DRG . S 8 GDP D 1 501 501 GDP GDP . T 6 MG D 1 502 502 MG MG . U 11 ACP F 1 401 401 ACP ACP . V 6 MG F 1 402 402 MG MG . W 12 HOH A 1 601 9 HOH HOH . W 12 HOH A 2 602 79 HOH HOH . W 12 HOH A 3 603 35 HOH HOH . W 12 HOH A 4 604 25 HOH HOH . W 12 HOH A 5 605 65 HOH HOH . W 12 HOH A 6 606 47 HOH HOH . W 12 HOH A 7 607 116 HOH HOH . W 12 HOH A 8 608 137 HOH HOH . W 12 HOH A 9 609 88 HOH HOH . W 12 HOH A 10 610 52 HOH HOH . W 12 HOH A 11 611 60 HOH HOH . W 12 HOH A 12 612 164 HOH HOH . W 12 HOH A 13 613 29 HOH HOH . W 12 HOH A 14 614 104 HOH HOH . W 12 HOH A 15 615 42 HOH HOH . W 12 HOH A 16 616 157 HOH HOH . W 12 HOH A 17 617 1566 HOH HOH . W 12 HOH A 18 618 140 HOH HOH . W 12 HOH A 19 619 55 HOH HOH . W 12 HOH A 20 620 106 HOH HOH . W 12 HOH A 21 621 94 HOH HOH . W 12 HOH A 22 622 78 HOH HOH . W 12 HOH A 23 623 118 HOH HOH . W 12 HOH A 24 624 40 HOH HOH . W 12 HOH A 25 625 22 HOH HOH . W 12 HOH A 26 626 87 HOH HOH . W 12 HOH A 27 627 36 HOH HOH . W 12 HOH A 28 628 161 HOH HOH . W 12 HOH A 29 629 93 HOH HOH . W 12 HOH A 30 630 191 HOH HOH . W 12 HOH A 31 631 208 HOH HOH . W 12 HOH A 32 632 201 HOH HOH . W 12 HOH A 33 633 101 HOH HOH . W 12 HOH A 34 634 156 HOH HOH . W 12 HOH A 35 635 109 HOH HOH . W 12 HOH A 36 636 85 HOH HOH . W 12 HOH A 37 637 83 HOH HOH . W 12 HOH A 38 638 196 HOH HOH . W 12 HOH A 39 639 125 HOH HOH . W 12 HOH A 40 640 273 HOH HOH . W 12 HOH A 41 641 97 HOH HOH . W 12 HOH A 42 642 81 HOH HOH . W 12 HOH A 43 643 107 HOH HOH . W 12 HOH A 44 644 123 HOH HOH . W 12 HOH A 45 645 135 HOH HOH . W 12 HOH A 46 646 434 HOH HOH . W 12 HOH A 47 647 152 HOH HOH . W 12 HOH A 48 648 172 HOH HOH . W 12 HOH A 49 649 227 HOH HOH . W 12 HOH A 50 650 24 HOH HOH . W 12 HOH A 51 651 108 HOH HOH . W 12 HOH A 52 652 95 HOH HOH . W 12 HOH A 53 653 180 HOH HOH . W 12 HOH A 54 654 228 HOH HOH . W 12 HOH A 55 655 126 HOH HOH . W 12 HOH A 56 656 198 HOH HOH . W 12 HOH A 57 657 174 HOH HOH . W 12 HOH A 58 658 220 HOH HOH . W 12 HOH A 59 659 175 HOH HOH . W 12 HOH A 60 660 194 HOH HOH . W 12 HOH A 61 661 56 HOH HOH . W 12 HOH A 62 662 57 HOH HOH . W 12 HOH A 63 663 213 HOH HOH . W 12 HOH A 64 664 870 HOH HOH . W 12 HOH A 65 665 257 HOH HOH . W 12 HOH A 66 666 202 HOH HOH . W 12 HOH A 67 667 167 HOH HOH . W 12 HOH A 68 668 141 HOH HOH . W 12 HOH A 69 669 195 HOH HOH . W 12 HOH A 70 670 263 HOH HOH . W 12 HOH A 71 671 258 HOH HOH . W 12 HOH A 72 672 226 HOH HOH . W 12 HOH A 73 673 267 HOH HOH . W 12 HOH A 74 674 102 HOH HOH . W 12 HOH A 75 675 203 HOH HOH . W 12 HOH A 76 676 250 HOH HOH . W 12 HOH A 77 677 291 HOH HOH . W 12 HOH A 78 678 290 HOH HOH . W 12 HOH A 79 679 295 HOH HOH . X 12 HOH B 1 601 316 HOH HOH . X 12 HOH B 2 602 347 HOH HOH . X 12 HOH B 3 603 335 HOH HOH . X 12 HOH B 4 604 331 HOH HOH . X 12 HOH B 5 605 379 HOH HOH . X 12 HOH B 6 606 516 HOH HOH . X 12 HOH B 7 607 330 HOH HOH . X 12 HOH B 8 608 550 HOH HOH . X 12 HOH B 9 609 361 HOH HOH . X 12 HOH B 10 610 362 HOH HOH . X 12 HOH B 11 611 378 HOH HOH . X 12 HOH B 12 612 318 HOH HOH . X 12 HOH B 13 613 416 HOH HOH . X 12 HOH B 14 614 1555 HOH HOH . X 12 HOH B 15 615 451 HOH HOH . X 12 HOH B 16 616 428 HOH HOH . X 12 HOH B 17 617 469 HOH HOH . X 12 HOH B 18 618 382 HOH HOH . X 12 HOH B 19 619 423 HOH HOH . X 12 HOH B 20 620 457 HOH HOH . X 12 HOH B 21 621 351 HOH HOH . X 12 HOH B 22 622 375 HOH HOH . X 12 HOH B 23 623 383 HOH HOH . X 12 HOH B 24 624 333 HOH HOH . X 12 HOH B 25 625 393 HOH HOH . X 12 HOH B 26 626 459 HOH HOH . X 12 HOH B 27 627 443 HOH HOH . X 12 HOH B 28 628 503 HOH HOH . X 12 HOH B 29 629 422 HOH HOH . X 12 HOH B 30 630 526 HOH HOH . X 12 HOH B 31 631 487 HOH HOH . X 12 HOH B 32 632 517 HOH HOH . X 12 HOH B 33 633 461 HOH HOH . X 12 HOH B 34 634 407 HOH HOH . X 12 HOH B 35 635 448 HOH HOH . X 12 HOH B 36 636 386 HOH HOH . X 12 HOH B 37 637 432 HOH HOH . X 12 HOH B 38 638 345 HOH HOH . X 12 HOH B 39 639 421 HOH HOH . X 12 HOH B 40 640 349 HOH HOH . X 12 HOH B 41 641 502 HOH HOH . X 12 HOH B 42 642 430 HOH HOH . X 12 HOH B 43 643 377 HOH HOH . X 12 HOH B 44 644 505 HOH HOH . X 12 HOH B 45 645 442 HOH HOH . X 12 HOH B 46 646 460 HOH HOH . X 12 HOH B 47 647 326 HOH HOH . X 12 HOH B 48 648 1565 HOH HOH . X 12 HOH B 49 649 1558 HOH HOH . X 12 HOH B 50 650 337 HOH HOH . X 12 HOH B 51 651 412 HOH HOH . X 12 HOH B 52 652 405 HOH HOH . X 12 HOH B 53 653 438 HOH HOH . X 12 HOH B 54 654 454 HOH HOH . X 12 HOH B 55 655 453 HOH HOH . X 12 HOH B 56 656 387 HOH HOH . X 12 HOH B 57 657 427 HOH HOH . X 12 HOH B 58 658 458 HOH HOH . X 12 HOH B 59 659 484 HOH HOH . X 12 HOH B 60 660 372 HOH HOH . X 12 HOH B 61 661 1362 HOH HOH . X 12 HOH B 62 662 1554 HOH HOH . X 12 HOH B 63 663 519 HOH HOH . X 12 HOH B 64 664 436 HOH HOH . X 12 HOH B 65 665 495 HOH HOH . X 12 HOH B 66 666 1562 HOH HOH . X 12 HOH B 67 667 508 HOH HOH . X 12 HOH B 68 668 479 HOH HOH . X 12 HOH B 69 669 385 HOH HOH . X 12 HOH B 70 670 481 HOH HOH . X 12 HOH B 71 671 529 HOH HOH . X 12 HOH B 72 672 474 HOH HOH . X 12 HOH B 73 673 440 HOH HOH . X 12 HOH B 74 674 540 HOH HOH . X 12 HOH B 75 675 509 HOH HOH . X 12 HOH B 76 676 559 HOH HOH . X 12 HOH B 77 677 551 HOH HOH . X 12 HOH B 78 678 528 HOH HOH . X 12 HOH B 79 679 534 HOH HOH . X 12 HOH B 80 680 344 HOH HOH . X 12 HOH B 81 681 493 HOH HOH . X 12 HOH B 82 682 1557 HOH HOH . X 12 HOH B 83 683 586 HOH HOH . X 12 HOH B 84 684 564 HOH HOH . X 12 HOH B 85 685 560 HOH HOH . X 12 HOH B 86 686 557 HOH HOH . X 12 HOH B 87 687 297 HOH HOH . X 12 HOH B 88 688 577 HOH HOH . X 12 HOH B 89 689 597 HOH HOH . X 12 HOH B 90 690 1563 HOH HOH . X 12 HOH B 91 691 1064 HOH HOH . X 12 HOH B 92 692 596 HOH HOH . X 12 HOH B 93 693 327 HOH HOH . X 12 HOH B 94 694 520 HOH HOH . X 12 HOH B 95 695 610 HOH HOH . X 12 HOH B 96 696 619 HOH HOH . Y 12 HOH C 1 601 641 HOH HOH . Y 12 HOH C 2 602 664 HOH HOH . Y 12 HOH C 3 603 629 HOH HOH . Y 12 HOH C 4 604 634 HOH HOH . Y 12 HOH C 5 605 660 HOH HOH . Y 12 HOH C 6 606 623 HOH HOH . Y 12 HOH C 7 607 645 HOH HOH . Y 12 HOH C 8 608 647 HOH HOH . Y 12 HOH C 9 609 886 HOH HOH . Y 12 HOH C 10 610 655 HOH HOH . Y 12 HOH C 11 611 679 HOH HOH . Y 12 HOH C 12 612 692 HOH HOH . Y 12 HOH C 13 613 685 HOH HOH . Y 12 HOH C 14 614 803 HOH HOH . Y 12 HOH C 15 615 749 HOH HOH . Y 12 HOH C 16 616 910 HOH HOH . Y 12 HOH C 17 617 669 HOH HOH . Y 12 HOH C 18 618 792 HOH HOH . Y 12 HOH C 19 619 742 HOH HOH . Y 12 HOH C 20 620 694 HOH HOH . Y 12 HOH C 21 621 748 HOH HOH . Y 12 HOH C 22 622 687 HOH HOH . Y 12 HOH C 23 623 658 HOH HOH . Y 12 HOH C 24 624 468 HOH HOH . Y 12 HOH C 25 625 770 HOH HOH . Y 12 HOH C 26 626 789 HOH HOH . Y 12 HOH C 27 627 735 HOH HOH . Y 12 HOH C 28 628 773 HOH HOH . Y 12 HOH C 29 629 887 HOH HOH . Y 12 HOH C 30 630 732 HOH HOH . Y 12 HOH C 31 631 769 HOH HOH . Y 12 HOH C 32 632 757 HOH HOH . Y 12 HOH C 33 633 786 HOH HOH . Y 12 HOH C 34 634 746 HOH HOH . Y 12 HOH C 35 635 744 HOH HOH . Y 12 HOH C 36 636 763 HOH HOH . Y 12 HOH C 37 637 808 HOH HOH . Y 12 HOH C 38 638 739 HOH HOH . Y 12 HOH C 39 639 701 HOH HOH . Y 12 HOH C 40 640 882 HOH HOH . Y 12 HOH C 41 641 852 HOH HOH . Y 12 HOH C 42 642 705 HOH HOH . Y 12 HOH C 43 643 776 HOH HOH . Y 12 HOH C 44 644 714 HOH HOH . Y 12 HOH C 45 645 716 HOH HOH . Y 12 HOH C 46 646 784 HOH HOH . Y 12 HOH C 47 647 670 HOH HOH . Y 12 HOH C 48 648 799 HOH HOH . Y 12 HOH C 49 649 659 HOH HOH . Y 12 HOH C 50 650 737 HOH HOH . Y 12 HOH C 51 651 689 HOH HOH . Y 12 HOH C 52 652 810 HOH HOH . Y 12 HOH C 53 653 753 HOH HOH . Y 12 HOH C 54 654 663 HOH HOH . Y 12 HOH C 55 655 782 HOH HOH . Y 12 HOH C 56 656 796 HOH HOH . Y 12 HOH C 57 657 677 HOH HOH . Y 12 HOH C 58 658 1556 HOH HOH . Y 12 HOH C 59 659 893 HOH HOH . Y 12 HOH C 60 660 761 HOH HOH . Y 12 HOH C 61 661 848 HOH HOH . Y 12 HOH C 62 662 698 HOH HOH . Y 12 HOH C 63 663 787 HOH HOH . Y 12 HOH C 64 664 710 HOH HOH . Y 12 HOH C 65 665 750 HOH HOH . Y 12 HOH C 66 666 676 HOH HOH . Y 12 HOH C 67 667 719 HOH HOH . Y 12 HOH C 68 668 830 HOH HOH . Y 12 HOH C 69 669 821 HOH HOH . Y 12 HOH C 70 670 725 HOH HOH . Y 12 HOH C 71 671 738 HOH HOH . Y 12 HOH C 72 672 843 HOH HOH . Y 12 HOH C 73 673 809 HOH HOH . Y 12 HOH C 74 674 752 HOH HOH . Y 12 HOH C 75 675 765 HOH HOH . Y 12 HOH C 76 676 872 HOH HOH . Y 12 HOH C 77 677 1560 HOH HOH . Y 12 HOH C 78 678 876 HOH HOH . Y 12 HOH C 79 679 829 HOH HOH . Y 12 HOH C 80 680 859 HOH HOH . Y 12 HOH C 81 681 800 HOH HOH . Y 12 HOH C 82 682 813 HOH HOH . Y 12 HOH C 83 683 819 HOH HOH . Y 12 HOH C 84 684 747 HOH HOH . Y 12 HOH C 85 685 825 HOH HOH . Y 12 HOH C 86 686 537 HOH HOH . Y 12 HOH C 87 687 818 HOH HOH . Y 12 HOH C 88 688 740 HOH HOH . Y 12 HOH C 89 689 791 HOH HOH . Y 12 HOH C 90 690 741 HOH HOH . Y 12 HOH C 91 691 775 HOH HOH . Y 12 HOH C 92 692 721 HOH HOH . Y 12 HOH C 93 693 777 HOH HOH . Y 12 HOH C 94 694 858 HOH HOH . Y 12 HOH C 95 695 888 HOH HOH . Y 12 HOH C 96 696 971 HOH HOH . Y 12 HOH C 97 697 751 HOH HOH . Y 12 HOH C 98 698 837 HOH HOH . Y 12 HOH C 99 699 880 HOH HOH . Y 12 HOH C 100 700 650 HOH HOH . Y 12 HOH C 101 701 915 HOH HOH . Y 12 HOH C 102 702 811 HOH HOH . Y 12 HOH C 103 703 807 HOH HOH . Y 12 HOH C 104 704 817 HOH HOH . Y 12 HOH C 105 705 914 HOH HOH . Y 12 HOH C 106 706 733 HOH HOH . Y 12 HOH C 107 707 806 HOH HOH . Y 12 HOH C 108 708 963 HOH HOH . Y 12 HOH C 109 709 764 HOH HOH . Y 12 HOH C 110 710 723 HOH HOH . Y 12 HOH C 111 711 868 HOH HOH . Y 12 HOH C 112 712 889 HOH HOH . Y 12 HOH C 113 713 833 HOH HOH . Y 12 HOH C 114 714 834 HOH HOH . Y 12 HOH C 115 715 840 HOH HOH . Y 12 HOH C 116 716 839 HOH HOH . Y 12 HOH C 117 717 909 HOH HOH . Y 12 HOH C 118 718 797 HOH HOH . Y 12 HOH C 119 719 875 HOH HOH . Y 12 HOH C 120 720 862 HOH HOH . Y 12 HOH C 121 721 785 HOH HOH . Y 12 HOH C 122 722 923 HOH HOH . Y 12 HOH C 123 723 874 HOH HOH . Y 12 HOH C 124 724 873 HOH HOH . Y 12 HOH C 125 725 730 HOH HOH . Y 12 HOH C 126 726 877 HOH HOH . Y 12 HOH C 127 727 822 HOH HOH . Y 12 HOH C 128 728 801 HOH HOH . Y 12 HOH C 129 729 906 HOH HOH . Y 12 HOH C 130 730 931 HOH HOH . Y 12 HOH C 131 731 835 HOH HOH . Y 12 HOH C 132 732 953 HOH HOH . Y 12 HOH C 133 733 956 HOH HOH . Y 12 HOH C 134 734 894 HOH HOH . Y 12 HOH C 135 735 864 HOH HOH . Y 12 HOH C 136 736 913 HOH HOH . Y 12 HOH C 137 737 955 HOH HOH . Y 12 HOH C 138 738 903 HOH HOH . Y 12 HOH C 139 739 901 HOH HOH . Y 12 HOH C 140 740 883 HOH HOH . Y 12 HOH C 141 741 885 HOH HOH . Y 12 HOH C 142 742 979 HOH HOH . Y 12 HOH C 143 743 31 HOH HOH . Y 12 HOH C 144 744 683 HOH HOH . Y 12 HOH C 145 745 937 HOH HOH . Y 12 HOH C 146 746 847 HOH HOH . Y 12 HOH C 147 747 717 HOH HOH . Y 12 HOH C 148 748 902 HOH HOH . Y 12 HOH C 149 749 762 HOH HOH . Y 12 HOH C 150 750 928 HOH HOH . Y 12 HOH C 151 751 938 HOH HOH . Y 12 HOH C 152 752 900 HOH HOH . Y 12 HOH C 153 753 771 HOH HOH . Y 12 HOH C 154 754 924 HOH HOH . Y 12 HOH C 155 755 995 HOH HOH . Y 12 HOH C 156 756 1002 HOH HOH . Y 12 HOH C 157 757 1003 HOH HOH . Y 12 HOH C 158 758 898 HOH HOH . Y 12 HOH C 159 759 1016 HOH HOH . Y 12 HOH C 160 760 949 HOH HOH . Y 12 HOH C 161 761 998 HOH HOH . Y 12 HOH C 162 762 1007 HOH HOH . Y 12 HOH C 163 763 972 HOH HOH . Y 12 HOH C 164 764 1027 HOH HOH . Y 12 HOH C 165 765 943 HOH HOH . Y 12 HOH C 166 766 1000 HOH HOH . Y 12 HOH C 167 767 1012 HOH HOH . Y 12 HOH C 168 768 667 HOH HOH . Y 12 HOH C 169 769 1564 HOH HOH . Y 12 HOH C 170 770 999 HOH HOH . Y 12 HOH C 171 771 1024 HOH HOH . Y 12 HOH C 172 772 954 HOH HOH . Y 12 HOH C 173 773 1019 HOH HOH . Y 12 HOH C 174 774 991 HOH HOH . Y 12 HOH C 175 775 986 HOH HOH . Y 12 HOH C 176 776 980 HOH HOH . Y 12 HOH C 177 777 1001 HOH HOH . Y 12 HOH C 178 778 973 HOH HOH . Y 12 HOH C 179 779 1041 HOH HOH . Y 12 HOH C 180 780 1025 HOH HOH . Y 12 HOH C 181 781 1023 HOH HOH . Y 12 HOH C 182 782 1011 HOH HOH . Y 12 HOH C 183 783 1006 HOH HOH . Y 12 HOH C 184 784 1060 HOH HOH . Y 12 HOH C 185 785 976 HOH HOH . Y 12 HOH C 186 786 1054 HOH HOH . Y 12 HOH C 187 787 1076 HOH HOH . Y 12 HOH C 188 788 1065 HOH HOH . Y 12 HOH C 189 789 1056 HOH HOH . Y 12 HOH C 190 790 1304 HOH HOH . Y 12 HOH C 191 791 1053 HOH HOH . Y 12 HOH C 192 792 1048 HOH HOH . Y 12 HOH C 193 793 1082 HOH HOH . Y 12 HOH C 194 794 1070 HOH HOH . Y 12 HOH C 195 795 1044 HOH HOH . Y 12 HOH C 196 796 1090 HOH HOH . Y 12 HOH C 197 797 1095 HOH HOH . Y 12 HOH C 198 798 1094 HOH HOH . Z 12 HOH D 1 601 1099 HOH HOH . Z 12 HOH D 2 602 1114 HOH HOH . Z 12 HOH D 3 603 1178 HOH HOH . Z 12 HOH D 4 604 1200 HOH HOH . Z 12 HOH D 5 605 1101 HOH HOH . Z 12 HOH D 6 606 1120 HOH HOH . Z 12 HOH D 7 607 1145 HOH HOH . Z 12 HOH D 8 608 1211 HOH HOH . Z 12 HOH D 9 609 696 HOH HOH . Z 12 HOH D 10 610 1165 HOH HOH . Z 12 HOH D 11 611 1166 HOH HOH . Z 12 HOH D 12 612 713 HOH HOH . Z 12 HOH D 13 613 1162 HOH HOH . Z 12 HOH D 14 614 1144 HOH HOH . Z 12 HOH D 15 615 1177 HOH HOH . Z 12 HOH D 16 616 1172 HOH HOH . Z 12 HOH D 17 617 1217 HOH HOH . Z 12 HOH D 18 618 1188 HOH HOH . Z 12 HOH D 19 619 1212 HOH HOH . Z 12 HOH D 20 620 1202 HOH HOH . Z 12 HOH D 21 621 1186 HOH HOH . Z 12 HOH D 22 622 1247 HOH HOH . Z 12 HOH D 23 623 1191 HOH HOH . Z 12 HOH D 24 624 1193 HOH HOH . Z 12 HOH D 25 625 1232 HOH HOH . Z 12 HOH D 26 626 1220 HOH HOH . Z 12 HOH D 27 627 1237 HOH HOH . Z 12 HOH D 28 628 1257 HOH HOH . Z 12 HOH D 29 629 1142 HOH HOH . Z 12 HOH D 30 630 1245 HOH HOH . Z 12 HOH D 31 631 1222 HOH HOH . Z 12 HOH D 32 632 1180 HOH HOH . Z 12 HOH D 33 633 1250 HOH HOH . Z 12 HOH D 34 634 1288 HOH HOH . Z 12 HOH D 35 635 1234 HOH HOH . Z 12 HOH D 36 636 1258 HOH HOH . Z 12 HOH D 37 637 1274 HOH HOH . Z 12 HOH D 38 638 1296 HOH HOH . Z 12 HOH D 39 639 1059 HOH HOH . AA 12 HOH E 1 201 1334 HOH HOH . AA 12 HOH E 2 202 1391 HOH HOH . AA 12 HOH E 3 203 1340 HOH HOH . AA 12 HOH E 4 204 1378 HOH HOH . AA 12 HOH E 5 205 1353 HOH HOH . AA 12 HOH E 6 206 816 HOH HOH . AA 12 HOH E 7 207 1365 HOH HOH . AA 12 HOH E 8 208 1366 HOH HOH . AA 12 HOH E 9 209 1380 HOH HOH . AA 12 HOH E 10 210 1376 HOH HOH . AA 12 HOH E 11 211 1373 HOH HOH . AA 12 HOH E 12 212 1383 HOH HOH . AA 12 HOH E 13 213 1392 HOH HOH . BA 12 HOH F 1 501 1485 HOH HOH . BA 12 HOH F 2 502 1462 HOH HOH . BA 12 HOH F 3 503 1503 HOH HOH . BA 12 HOH F 4 504 1473 HOH HOH . BA 12 HOH F 5 505 1484 HOH HOH . BA 12 HOH F 6 506 1474 HOH HOH . BA 12 HOH F 7 507 1133 HOH HOH . BA 12 HOH F 8 508 1506 HOH HOH . BA 12 HOH F 9 509 173 HOH HOH . BA 12 HOH F 10 510 1475 HOH HOH . BA 12 HOH F 11 511 1537 HOH HOH . BA 12 HOH F 12 512 1486 HOH HOH . BA 12 HOH F 13 513 4 HOH HOH . BA 12 HOH F 14 514 1536 HOH HOH . BA 12 HOH F 15 515 1458 HOH HOH . BA 12 HOH F 16 516 1513 HOH HOH . BA 12 HOH F 17 517 1524 HOH HOH . BA 12 HOH F 18 518 1544 HOH HOH . BA 12 HOH F 19 519 1542 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PB GDP . . . K 8 18.967 49.565 15.986 1 37.11 ? PB GDP 501 B 1 HETATM 2 O O1B GDP . . . K 8 18.403 50.482 14.927 1 37.45 ? O1B GDP 501 B 1 HETATM 3 O O2B GDP . . . K 8 19.545 50.38 17.124 1 37.45 ? O2B GDP 501 B 1 HETATM 4 O O3B GDP . . . K 8 20.064 48.686 15.439 1 36.02 ? O3B GDP 501 B 1 HETATM 5 O O3A GDP . . . K 8 17.85 48.568 16.554 1 40.43 ? O3A GDP 501 B 1 HETATM 6 P PA GDP . . . K 8 16.431 49.036 17.146 1 36.69 ? PA GDP 501 B 1 HETATM 7 O O1A GDP . . . K 8 15.327 48.874 16.122 1 37.88 ? O1A GDP 501 B 1 HETATM 8 O O2A GDP . . . K 8 16.479 50.436 17.707 1 36.66 ? O2A GDP 501 B 1 HETATM 9 O O5' GDP . . . K 8 16.315 47.96 18.334 1 40.9 ? O5' GDP 501 B 1 HETATM 10 C C5' GDP . . . K 8 15.216 47.061 18.418 1 41.89 ? C5' GDP 501 B 1 HETATM 11 C C4' GDP . . . K 8 14.687 47.147 19.839 1 42.91 ? C4' GDP 501 B 1 HETATM 12 O O4' GDP . . . K 8 14.198 48.471 20.042 1 39.37 ? O4' GDP 501 B 1 HETATM 13 C C3' GDP . . . K 8 13.511 46.225 20.056 1 42.86 ? C3' GDP 501 B 1 HETATM 14 O O3' GDP . . . K 8 13.521 45.871 21.44 1 42.4 ? O3' GDP 501 B 1 HETATM 15 C C2' GDP . . . K 8 12.308 47.093 19.762 1 41.73 ? C2' GDP 501 B 1 HETATM 16 O O2' GDP . . . K 8 11.168 46.653 20.505 1 43.03 ? O2' GDP 501 B 1 HETATM 17 C C1' GDP . . . K 8 12.779 48.463 20.214 1 38.61 ? C1' GDP 501 B 1 HETATM 18 N N9 GDP . . . K 8 12.26 49.571 19.385 1 45.71 ? N9 GDP 501 B 1 HETATM 19 C C8 GDP . . . K 8 12.506 49.77 18.077 1 41.93 ? C8 GDP 501 B 1 HETATM 20 N N7 GDP . . . K 8 11.899 50.902 17.637 1 43.51 ? N7 GDP 501 B 1 HETATM 21 C C5 GDP . . . K 8 11.266 51.449 18.69 1 43.88 ? C5 GDP 501 B 1 HETATM 22 C C6 GDP . . . K 8 10.438 52.645 18.935 1 46.45 ? C6 GDP 501 B 1 HETATM 23 O O6 GDP . . . K 8 10.19 53.434 18.001 1 47.12 ? O6 GDP 501 B 1 HETATM 24 N N1 GDP . . . K 8 9.969 52.85 20.176 1 43.79 ? N1 GDP 501 B 1 HETATM 25 C C2 GDP . . . K 8 10.23 52.008 21.194 1 46.02 ? C2 GDP 501 B 1 HETATM 26 N N2 GDP . . . K 8 9.724 52.272 22.43 1 46.16 ? N2 GDP 501 B 1 HETATM 27 N N3 GDP . . . K 8 10.982 50.893 21.04 1 42.47 ? N3 GDP 501 B 1 HETATM 28 C C4 GDP . . . K 8 11.512 50.572 19.839 1 45.63 ? C4 GDP 501 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 40 _model_server_stats.parse_time_ms 34 _model_server_stats.create_model_time_ms 22 _model_server_stats.query_time_ms 284 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 28 #