data_5SGD
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_model_server_result.job_id            2Q0rI2-Le7zHtd_1unEcZg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-11 03:20:44' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          5sgd 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":802}' 
#
_entry.id    5SGD 
#
_exptl.entry_id    5SGD 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            5SGD 
_cell.length_a            135.391 
_cell.length_b            135.391 
_cell.length_c            236.173 
_cell.Z_PDB               36 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5SGD 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        146 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'H 3' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
? monomeric 1 author_defined_assembly 3 
? monomeric 1 author_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,F,G,Q 1 1 
B,H,I,J,R 2 1 
C,K,L,M,S 3 1 
D,N,O,P,T 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 F N N 
? 3 I N N 
? 3 L N N 
? 3 O N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 52 A CYS 498 1_555 A SG CYS 56 A CYS 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? 
disulf ? disulf2 B SG CYS 52 B CYS 498 1_555 B SG CYS 56 B CYS 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? 
disulf ? disulf3 C SG CYS 52 C CYS 498 1_555 C SG CYS 56 C CYS 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? 
disulf ? disulf4 D SG CYS 52 D CYS 498 1_555 D SG CYS 56 D CYS 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? 
covale ? covale1 A C LEU 62 A LEU 508 1_555 A N CME 63 A CME 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale2 A C CME 63 A CME 509 1_555 A N ARG 64 A ARG 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? 
covale ? covale3 B C LEU 62 B LEU 508 1_555 B N CME 63 B CME 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale4 B C CME 63 B CME 509 1_555 B N ARG 64 B ARG 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.303 ? 
covale ? covale5 C C LEU 62 C LEU 508 1_555 C N CME 63 C CME 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
covale ? covale6 C C CME 63 C CME 509 1_555 C N ARG 64 C ARG 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale7 D C LEU 62 D LEU 508 1_555 D N CME 63 D CME 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? 
covale ? covale8 D C CME 63 D CME 509 1_555 D N ARG 64 D ARG 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.338 ? 
metalc ? metalc1 A NE2 HIS 83 A HIS 529 1_555 E ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? 
metalc ? metalc2 A NE2 HIS 117 A HIS 563 1_555 E ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.119 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 118 A ASP 564 1_555 E ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
metalc ? metalc4 A OD1 ASP 118 A ASP 564 1_555 F MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? 
metalc ? metalc5 A OD1 ASP 228 A ASP 674 1_555 E ZN ZN . A ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? 
metalc ? metalc6 E ZN ZN . A ZN 801 1_555 Q O HOH . A HOH 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? 
metalc ? metalc7 E ZN ZN . A ZN 801 1_555 Q O HOH . A HOH 919 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? 
metalc ? metalc8 F MG MG . A MG 802 1_555 Q O HOH . A HOH 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? 
metalc ? metalc9 F MG MG . A MG 802 1_555 Q O HOH . A HOH 917 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? 
metalc ? metalc10 F MG MG . A MG 802 1_555 Q O HOH . A HOH 918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? 
metalc ? metalc11 F MG MG . A MG 802 1_555 Q O HOH . A HOH 919 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.947 ? 
metalc ? metalc12 F MG MG . A MG 802 1_555 Q O HOH . A HOH 931 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? 
metalc ? metalc13 B NE2 HIS 83 B HIS 529 1_555 H ZN ZN . B ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? 
metalc ? metalc14 B NE2 HIS 117 B HIS 563 1_555 H ZN ZN . B ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? 
metalc ? metalc15 B OD2 ASP 118 B ASP 564 1_555 H ZN ZN . B ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? 
metalc ? metalc16 B OD1 ASP 118 B ASP 564 1_555 I MG MG . B MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? 
metalc ? metalc17 B OD1 ASP 228 B ASP 674 1_555 H ZN ZN . B ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? 
metalc ? metalc18 H ZN ZN . B ZN 801 1_555 R O HOH . B HOH 919 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc19 H ZN ZN . B ZN 801 1_555 R O HOH . B HOH 922 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? 
metalc ? metalc20 I MG MG . B MG 802 1_555 R O HOH . B HOH 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.982 ? 
metalc ? metalc21 I MG MG . B MG 802 1_555 R O HOH . B HOH 913 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? 
metalc ? metalc22 I MG MG . B MG 802 1_555 R O HOH . B HOH 921 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.947 ? 
metalc ? metalc23 I MG MG . B MG 802 1_555 R O HOH . B HOH 922 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.79 ? 
metalc ? metalc24 I MG MG . B MG 802 1_555 R O HOH . B HOH 939 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.985 ? 
metalc ? metalc25 C NE2 HIS 83 C HIS 529 1_555 K ZN ZN . C ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.136 ? 
metalc ? metalc26 C NE2 HIS 117 C HIS 563 1_555 K ZN ZN . C ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? 
metalc ? metalc27 C OD2 ASP 118 C ASP 564 1_555 K ZN ZN . C ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? 
metalc ? metalc28 C OD1 ASP 118 C ASP 564 1_555 L MG MG . C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc29 C OD1 ASP 228 C ASP 674 1_555 K ZN ZN . C ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
metalc ? metalc30 K ZN ZN . C ZN 801 1_555 S O HOH . C HOH 913 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? 
metalc ? metalc31 K ZN ZN . C ZN 801 1_555 S O HOH . C HOH 918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
metalc ? metalc32 L MG MG . C MG 802 1_555 S O HOH . C HOH 909 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.932 ? 
metalc ? metalc33 L MG MG . C MG 802 1_555 S O HOH . C HOH 914 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? 
metalc ? metalc34 L MG MG . C MG 802 1_555 S O HOH . C HOH 918 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.945 ? 
metalc ? metalc35 L MG MG . C MG 802 1_555 S O HOH . C HOH 922 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? 
metalc ? metalc36 L MG MG . C MG 802 1_555 S O HOH . C HOH 935 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
metalc ? metalc37 D NE2 HIS 83 D HIS 529 1_555 N ZN ZN . D ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? 
metalc ? metalc38 D NE2 HIS 117 D HIS 563 1_555 N ZN ZN . D ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? 
metalc ? metalc39 D OD2 ASP 118 D ASP 564 1_555 N ZN ZN . D ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.992 ? 
metalc ? metalc40 D OD1 ASP 118 D ASP 564 1_555 O MG MG . D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.897 ? 
metalc ? metalc41 D OD1 ASP 228 D ASP 674 1_555 N ZN ZN . D ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? 
metalc ? metalc42 N ZN ZN . D ZN 801 1_555 T O HOH . D HOH 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? 
metalc ? metalc43 N ZN ZN . D ZN 801 1_555 T O HOH . D HOH 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? 
metalc ? metalc44 O MG MG . D MG 802 1_555 T O HOH . D HOH 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? 
metalc ? metalc45 O MG MG . D MG 802 1_555 T O HOH . D HOH 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? 
metalc ? metalc46 O MG MG . D MG 802 1_555 T O HOH . D HOH 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? 
metalc ? metalc47 O MG MG . D MG 802 1_555 T O HOH . D HOH 909 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.991 ? 
metalc ? metalc48 O MG MG . D MG 802 1_555 T O HOH . D HOH 911 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.986 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     5SGD 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007386 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.004264 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008529 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004234 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 ZN A 1 801 1 ZN ZN . 
F 3 MG A 1 802 1 MG MG . 
G 4 IWN A 1 803 1 IWN L0R . 
H 2 ZN B 1 801 2 ZN ZN . 
I 3 MG B 1 802 2 MG MG . 
J 4 IWN B 1 803 2 IWN L0R . 
K 2 ZN C 1 801 3 ZN ZN . 
L 3 MG C 1 802 3 MG MG . 
M 4 IWN C 1 803 3 IWN L0R . 
N 2 ZN D 1 801 4 ZN ZN . 
O 3 MG D 1 802 4 MG MG . 
P 4 IWN D 1 803 4 IWN L0R . 
Q 5 HOH A 1 901 182 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 2 902 46 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 3 903 5 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 4 904 34 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 5 905 79 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 6 906 27 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 7 907 126 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 8 908 6 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 9 909 42 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 10 910 70 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 11 911 49 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 12 912 88 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 13 913 38 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 14 914 89 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 15 915 213 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 16 916 62 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 17 917 3 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 18 918 4 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 19 919 1 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 20 920 61 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 21 921 68 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 22 922 33 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 23 923 51 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 24 924 104 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 25 925 189 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 26 926 96 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 27 927 53 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 28 928 86 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 29 929 174 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 30 930 210 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 31 931 2 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 32 932 191 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 33 933 143 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 34 934 130 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 35 935 125 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 36 936 187 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 37 937 219 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 38 938 117 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 39 939 87 HOH HOH . 
Q 5 HOH A 40 940 183 HOH HOH . 
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