data_5SZO # _model_server_result.job_id eHeh11WAPTDHAH147Q4SHg _model_server_result.datetime_utc '2025-07-31 04:22:56' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5szo # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":504}' # _entry.id 5SZO # _exptl.entry_id 5SZO _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 180.156 _entity.id 3 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description alpha-D-mannopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5SZO _cell.length_a 97.15 _cell.length_b 97.15 _cell.length_c 312.39 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5SZO _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 D N N ? 3 E N N ? 3 F N N ? 3 G N N ? 3 Q N N ? 3 R N N ? 3 S N N ? 3 T N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 2 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 FUC _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O6 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO6 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n C NAG 1 C 1 NAG B 505 NAG 2 n C FUC 2 C 2 FUC B 506 FUC # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 66 A CYS 66 1_555 A SG CYS 72 A CYS 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 66 B CYS 66 1_555 B SG CYS 72 B CYS 72 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? covale ? covale1 A OG1 THR 193 A THR 193 1_555 D C1 MAN . A MAN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale2 A OG1 THR 195 A THR 195 1_555 E C1 MAN . A MAN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale3 A OG SER 401 A SER 401 1_555 F C1 MAN . A MAN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale4 A OG SER 403 A SER 403 1_555 G C1 MAN . A MAN 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale5 B OG1 THR 193 B THR 193 1_555 Q C1 MAN . B MAN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale6 B OG1 THR 195 B THR 195 1_555 R C1 MAN . B MAN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale7 B ND2 ASN 387 B ASN 387 1_555 C C1 NAG . C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale8 B OG SER 401 B SER 401 1_555 S C1 MAN . B MAN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale9 B OG SER 403 B SER 403 1_555 T C1 MAN . B MAN 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale10 C O6 NAG . C NAG 1 1_555 C C1 FUC . C FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? metalc ? metalc1 A OE2 GLU 9 A GLU 9 1_555 I CA CA . A CA 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 10 A GLU 10 1_555 H CA CA . A CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.17 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 61 A ASP 61 1_555 H CA CA . A CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 63 A GLU 63 1_555 H CA CA . A CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.037 ? metalc ? metalc5 A OE1 GLU 63 A GLU 63 1_555 I CA CA . A CA 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.08 ? metalc ? metalc6 A OE2 GLU 63 A GLU 63 1_555 I CA CA . A CA 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 95 A ASP 95 1_555 I CA CA . A CA 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? metalc ? metalc8 A O VAL 96 A VAL 96 1_555 I CA CA . A CA 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASN 97 A ASN 97 1_555 J CA CA . A CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 98 A ASP 98 1_555 H CA CA . A CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc11 A OD1 ASP 98 A ASP 98 1_555 I CA CA . A CA 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc12 A O HIS 99 A HIS 99 1_555 J CA CA . A CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? metalc ? metalc13 A OE2 GLU 114 A GLU 114 1_555 K CA CA . A CA 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? metalc ? metalc14 A OE1 GLU 114 A GLU 114 1_555 L CA CA . A CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.811 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 129 A ASP 129 1_555 J CA CA . A CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc16 A OD2 ASP 129 A ASP 129 1_555 J CA CA . A CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? metalc ? metalc17 A OD1 ASP 131 A ASP 131 1_555 I CA CA . A CA 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? metalc ? metalc18 A OD2 ASP 131 A ASP 131 1_555 J CA CA . A CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc19 A O ASN 135 A ASN 135 1_555 J CA CA . A CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? metalc ? metalc20 A OD1 ASP 171 A ASP 171 1_555 K CA CA . A CA 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? metalc ? metalc21 A OE1 GLU 173 A GLU 173 1_555 K CA CA . A CA 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.66 ? metalc ? metalc22 A OE1 GLU 173 A GLU 173 1_555 L CA CA . A CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.99 ? metalc ? metalc23 A OE2 GLU 173 A GLU 173 1_555 L CA CA . A CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc24 A OD2 ASP 186 A ASP 186 1_555 J CA CA . A CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.76 ? metalc ? metalc25 A OD1 ASP 204 A ASP 204 1_555 L CA CA . A CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.61 ? metalc ? metalc26 A O ALA 205 A ALA 205 1_555 L CA CA . A CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.109 ? metalc ? metalc27 A OD1 ASN 206 A ASN 206 1_555 M CA CA . A CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc28 A OD2 ASP 207 A ASP 207 1_555 K CA CA . A CA 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.895 ? metalc ? metalc29 A OD1 ASP 207 A ASP 207 1_555 L CA CA . A CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc30 A OD1 ASN 208 A ASN 208 1_555 K CA CA . A CA 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.055 ? metalc ? metalc31 A O ASN 208 A ASN 208 1_555 M CA CA . A CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.478 ? metalc ? metalc32 A OE2 GLU 223 A GLU 223 1_555 O CA CA . A CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc33 A OD1 ASP 238 A ASP 238 1_555 M CA CA . A CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.075 ? metalc ? metalc34 A OD2 ASP 238 A ASP 238 1_555 M CA CA . A CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc35 A OD1 ASP 240 A ASP 240 1_555 L CA CA . A CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.494 ? metalc ? metalc36 A OD2 ASP 240 A ASP 240 1_555 M CA CA . A CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc ? metalc37 A O ASN 244 A ASN 244 1_555 M CA CA . A CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? metalc ? metalc38 A OD1 ASP 276 A ASP 276 1_555 N CA CA . A CA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc ? metalc39 A OE1 GLU 278 A GLU 278 1_555 N CA CA . A CA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? metalc ? metalc40 A OE2 GLU 278 A GLU 278 1_555 O CA CA . A CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc41 A OD2 ASP 291 A ASP 291 1_555 M CA CA . A CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc42 A OD1 ASP 307 A ASP 307 1_555 O CA CA . A CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? metalc ? metalc43 A O GLU 308 A GLU 308 1_555 O CA CA . A CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? metalc ? metalc44 A OD1 ASN 309 A ASN 309 1_555 P CA CA . A CA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.787 ? metalc ? metalc45 A OD1 ASP 310 A ASP 310 1_555 N CA CA . A CA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? metalc ? metalc46 A OD2 ASP 310 A ASP 310 1_555 N CA CA . A CA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? metalc ? metalc47 A OD1 ASP 310 A ASP 310 1_555 O CA CA . A CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? metalc ? metalc48 A O ASN 311 A ASN 311 1_555 P CA CA . A CA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? metalc ? metalc49 A OD1 ASP 341 A ASP 341 1_555 P CA CA . A CA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? metalc ? metalc50 A OD2 ASP 341 A ASP 341 1_555 P CA CA . A CA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.486 ? metalc ? metalc51 A OD1 ASP 343 A ASP 343 1_555 O CA CA . A CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.807 ? metalc ? metalc52 A OD2 ASP 343 A ASP 343 1_555 P CA CA . A CA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? metalc ? metalc53 A O ASN 347 A ASN 347 1_555 P CA CA . A CA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.959 ? metalc ? metalc54 A OD2 ASP 394 A ASP 394 1_555 P CA CA . A CA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc55 B OE1 GLU 9 B GLU 9 1_555 U CA CA . B CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? metalc ? metalc56 B OE2 GLU 9 B GLU 9 1_555 V CA CA . B CA 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? metalc ? metalc57 B OD1 ASP 61 B ASP 61 1_555 U CA CA . B CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? metalc ? metalc58 B OE1 GLU 63 B GLU 63 1_555 U CA CA . B CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? metalc ? metalc59 B OE2 GLU 63 B GLU 63 1_555 V CA CA . B CA 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? metalc ? metalc60 B OD1 ASP 95 B ASP 95 1_555 V CA CA . B CA 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? metalc ? metalc61 B O VAL 96 B VAL 96 1_555 V CA CA . B CA 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.42 ? metalc ? metalc62 B OD1 ASN 97 B ASN 97 1_555 W CA CA . B CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.723 ? metalc ? metalc63 B OD2 ASP 98 B ASP 98 1_555 U CA CA . B CA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? metalc ? metalc64 B OD1 ASP 98 B ASP 98 1_555 V CA CA . B CA 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc65 B O HIS 99 B HIS 99 1_555 W CA CA . B CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? metalc ? metalc66 B OE2 GLU 114 B GLU 114 1_555 X CA CA . B CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? metalc ? metalc67 B OE1 GLU 114 B GLU 114 1_555 Y CA CA . B CA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? metalc ? metalc68 B OD1 ASP 129 B ASP 129 1_555 W CA CA . B CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.91 ? metalc ? metalc69 B OD2 ASP 129 B ASP 129 1_555 W CA CA . B CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc70 B OD1 ASP 131 B ASP 131 1_555 V CA CA . B CA 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc71 B OD2 ASP 131 B ASP 131 1_555 W CA CA . B CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? metalc ? metalc72 B O ASN 135 B ASN 135 1_555 W CA CA . B CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.81 ? metalc ? metalc73 B OD1 ASP 171 B ASP 171 1_555 X CA CA . B CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? metalc ? metalc74 B OD2 ASP 171 B ASP 171 1_555 X CA CA . B CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.002 ? metalc ? metalc75 B OE1 GLU 173 B GLU 173 1_555 Y CA CA . B CA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.81 ? metalc ? metalc76 B OE2 GLU 173 B GLU 173 1_555 Y CA CA . B CA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? metalc ? metalc77 B OD2 ASP 186 B ASP 186 1_555 W CA CA . B CA 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc78 B OD1 ASP 204 B ASP 204 1_555 Y CA CA . B CA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? metalc ? metalc79 B OD1 ASN 206 B ASN 206 1_555 Z CA CA . B CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.716 ? metalc ? metalc80 B OD2 ASP 207 B ASP 207 1_555 X CA CA . B CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.793 ? metalc ? metalc81 B OD1 ASP 207 B ASP 207 1_555 Y CA CA . B CA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc ? metalc82 B OD1 ASN 208 B ASN 208 1_555 X CA CA . B CA 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.934 ? metalc ? metalc83 B O ASN 208 B ASN 208 1_555 Z CA CA . B CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? metalc ? metalc84 B OE1 GLU 223 B GLU 223 1_555 AA CA CA . B CA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? metalc ? metalc85 B OE2 GLU 223 B GLU 223 1_555 BA CA CA . B CA 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc86 B OD1 ASP 238 B ASP 238 1_555 Z CA CA . B CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.114 ? metalc ? metalc87 B OD2 ASP 238 B ASP 238 1_555 Z CA CA . B CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc88 B OD1 ASP 240 B ASP 240 1_555 Y CA CA . B CA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc ? metalc89 B OD2 ASP 240 B ASP 240 1_555 Z CA CA . B CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? metalc ? metalc90 B O ASN 244 B ASN 244 1_555 Z CA CA . B CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.497 ? metalc ? metalc91 B OD1 ASP 276 B ASP 276 1_555 AA CA CA . B CA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? metalc ? metalc92 B OE1 GLU 278 B GLU 278 1_555 BA CA CA . B CA 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.015 ? metalc ? metalc93 B OE2 GLU 278 B GLU 278 1_555 BA CA CA . B CA 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? metalc ? metalc94 B OD2 ASP 291 B ASP 291 1_555 Z CA CA . B CA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.737 ? metalc ? metalc95 B OD1 ASP 307 B ASP 307 1_555 BA CA CA . B CA 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc96 B O GLU 308 B GLU 308 1_555 BA CA CA . B CA 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.036 ? metalc ? metalc97 B OD1 ASN 309 B ASN 309 1_555 CA CA CA . B CA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.026 ? metalc ? metalc98 B OD2 ASP 310 B ASP 310 1_555 AA CA CA . B CA 513 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc ? metalc99 B OD1 ASP 310 B ASP 310 1_555 BA CA CA . B CA 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? metalc ? metalc100 B O ASN 311 B ASN 311 1_555 CA CA CA . B CA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc101 B OD1 ASP 341 B ASP 341 1_555 CA CA CA . B CA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.621 ? metalc ? metalc102 B OD2 ASP 341 B ASP 341 1_555 CA CA CA . B CA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? metalc ? metalc103 B OD1 ASP 343 B ASP 343 1_555 BA CA CA . B CA 514 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.019 ? metalc ? metalc104 B OD2 ASP 343 B ASP 343 1_555 CA CA CA . B CA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc105 B O ASN 347 B ASN 347 1_555 CA CA CA . B CA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.802 ? metalc ? metalc106 B OD2 ASP 394 B ASP 394 1_555 CA CA CA . B CA 515 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.564 ? # _chem_comp.formula 'C6 H12 O6' _chem_comp.formula_weight 180.156 _chem_comp.id MAN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name alpha-D-mannopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, alpha linking' _chem_comp.pdbx_synonyms alpha-D-mannose;D-mannose;mannose # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 MAN sing 239 n n C1 O1 MAN sing 240 n n C1 O5 MAN sing 241 n n C1 H1 MAN sing 242 n n C2 C3 MAN sing 243 n n C2 O2 MAN sing 244 n n C2 H2 MAN sing 245 n n C3 C4 MAN sing 246 n n C3 O3 MAN sing 247 n n C3 H3 MAN sing 248 n n C4 C5 MAN sing 249 n n C4 O4 MAN sing 250 n n C4 H4 MAN sing 251 n n C5 C6 MAN sing 252 n n C5 O5 MAN sing 253 n n C5 H5 MAN sing 254 n n C6 O6 MAN sing 255 n n C6 H61 MAN sing 256 n n C6 H62 MAN sing 257 n n O1 HO1 MAN sing 258 n n O2 HO2 MAN sing 259 n n O3 HO3 MAN sing 260 n n O4 HO4 MAN sing 261 n n O6 HO6 MAN sing 262 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version MAN DManpa 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 MAN a-D-mannopyranose 'COMMON NAME' GMML 1 MAN a-D-Manp 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 MAN Man 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 5SZO _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010293 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010293 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.003201 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 3 MAN A 1 501 501 MAN MAN . E 3 MAN A 1 502 502 MAN MAN . F 3 MAN A 1 503 503 MAN MAN . G 3 MAN A 1 504 504 MAN MAN . H 4 CA A 1 505 601 CA CA . I 4 CA A 1 506 602 CA CA . J 4 CA A 1 507 603 CA CA . K 4 CA A 1 508 604 CA CA . L 4 CA A 1 509 605 CA CA . M 4 CA A 1 510 606 CA CA . N 4 CA A 1 511 607 CA CA . O 4 CA A 1 512 608 CA CA . P 4 CA A 1 513 609 CA CA . Q 3 MAN B 1 501 501 MAN MAN . R 3 MAN B 1 502 502 MAN MAN . S 3 MAN B 1 503 503 MAN MAN . T 3 MAN B 1 504 504 MAN MAN . U 4 CA B 1 507 601 CA CA . V 4 CA B 1 508 602 CA CA . W 4 CA B 1 509 603 CA CA . X 4 CA B 1 510 604 CA CA . Y 4 CA B 1 511 605 CA CA . Z 4 CA B 1 512 606 CA CA . AA 4 CA B 1 513 607 CA CA . BA 4 CA B 1 514 608 CA CA . CA 4 CA B 1 515 609 CA CA . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 MAN . . . G 3 21.541 -54.64 33.481 1 262.35 ? C1 MAN 504 A 1 HETATM 2 C C2 MAN . . . G 3 22.101 -53.528 34.411 1 267.38 ? C2 MAN 504 A 1 HETATM 3 C C3 MAN . . . G 3 22.208 -52.171 33.679 1 269.1 ? C3 MAN 504 A 1 HETATM 4 C C4 MAN . . . G 3 22.873 -52.322 32.295 1 279.28 ? C4 MAN 504 A 1 HETATM 5 C C5 MAN . . . G 3 22.123 -53.388 31.48 1 270.3 ? C5 MAN 504 A 1 HETATM 6 C C6 MAN . . . G 3 22.75 -53.628 30.119 1 258.39 ? C6 MAN 504 A 1 HETATM 7 O O2 MAN . . . G 3 23.423 -53.837 34.859 1 276.17 ? O2 MAN 504 A 1 HETATM 8 O O3 MAN . . . G 3 22.892 -51.198 34.468 1 256.39 ? O3 MAN 504 A 1 HETATM 9 O O4 MAN . . . G 3 22.831 -51.087 31.593 1 275.16 ? O4 MAN 504 A 1 HETATM 10 O O5 MAN . . . G 3 22.14 -54.648 32.2 1 278.7 ? O5 MAN 504 A 1 HETATM 11 O O6 MAN . . . G 3 21.981 -54.614 29.439 1 258.64 ? O6 MAN 504 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 10 _model_server_stats.query_time_ms 293 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 11 #