data_5TYW # _model_server_result.job_id WRtZHGOtcF23kef1GfTJTA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 13:45:03' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5tyw # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":501}' # _entry.id 5TYW # _exptl.entry_id 5TYW _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 482.168 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5TYW _cell.length_a 59.983 _cell.length_b 68.718 _cell.length_c 109.871 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5TYW _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 5 _struct_asym.id E _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A NE2 HIS 93 A HIS 219 1_555 J MN MN . A MN 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc2 A O THR 115 A THR 241 1_555 K NA NA . A NA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc3 A O ILE 117 A ILE 243 1_555 K NA NA . A NA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc4 A O VAL 120 A VAL 246 1_555 K NA NA . A NA 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 204 A ASP 330 1_555 G MN MN . A MN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.903 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 204 A ASP 330 1_555 H MN MN . A MN 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 206 A ASP 332 1_555 G MN MN . A MN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? metalc ? metalc8 A OD2 ASP 206 A ASP 332 1_555 H MN MN . A MN 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? metalc ? metalc9 A OE1 GLU 260 A GLU 386 1_555 I MN MN . A MN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? metalc ? metalc10 A OE2 GLU 260 A GLU 386 1_555 I MN MN . A MN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 280 A ASP 418 1_555 G MN MN . A MN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? metalc ? metalc12 E O1A TTP . A TTP 501 1_555 G MN MN . A MN 503 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? metalc ? metalc13 E O1A TTP . A TTP 501 1_555 H MN MN . A MN 504 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.838 ? metalc ? metalc14 E O1B TTP . A TTP 501 1_555 H MN MN . A MN 504 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.157 ? metalc ? metalc15 E O1G TTP . A TTP 501 1_555 H MN MN . A MN 504 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? metalc ? metalc16 F O31 PPV . A PPV 502 1_555 H MN MN . A MN 504 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.31 ? metalc ? metalc17 F O12 PPV . A PPV 502 1_555 H MN MN . A MN 504 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? metalc ? metalc18 F O32 PPV . A PPV 502 1_555 R MN MN . P MN 101 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.253 ? metalc ? metalc19 G MN MN . A MN 503 1_555 C O3' DA 4 P DA 4 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? metalc ? metalc20 G MN MN . A MN 503 1_555 C O3' DA 4 P DA 4 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.704 ? metalc ? metalc21 G MN MN . A MN 503 1_555 C OP1 DT 5 P DT 5 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? metalc ? metalc22 G MN MN . A MN 503 1_555 V O HOH . P HOH 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? metalc ? metalc23 H MN MN . A MN 504 1_555 T O HOH . A HOH 683 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? metalc ? metalc24 H MN MN . A MN 504 1_555 C OP1 DT 5 P DT 5 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? metalc ? metalc25 I MN MN . A MN 505 1_555 T O HOH . A HOH 819 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? metalc ? metalc26 I MN MN . A MN 505 1_555 T O HOH . A HOH 856 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? metalc ? metalc27 I MN MN . A MN 505 1_555 U O HOH . T HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc ? metalc28 K NA NA . A NA 507 1_555 T O HOH . A HOH 835 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc29 K NA NA . A NA 507 1_555 C OP1 DT 3 P DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.681 ? metalc ? metalc30 K NA NA . A NA 507 1_555 V O HOH . P HOH 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc31 T O HOH . A HOH 603 1_555 R MN MN . P MN 101 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? metalc ? metalc32 T O HOH . A HOH 818 1_555 R MN MN . P MN 101 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc33 B N7 DG 2 T DG 2 1_555 Q MN MN . T MN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.782 ? metalc ? metalc34 Q MN MN . T MN 101 1_555 U O HOH . T HOH 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc35 C OP2 DT 5 P DT 5 1_555 R MN MN . P MN 101 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? metalc ? metalc36 R MN MN . P MN 101 1_555 V O HOH . P HOH 212 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N3 DC 1 T DC 1 1_555 D N1 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N3 DC 1 T DC 1 1_555 D N1 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B N4 DC 1 T DC 1 1_555 D O6 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N4 DC 1 T DC 1 1_555 D O6 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B O2 DC 1 T DC 1 1_555 D N2 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B O2 DC 1 T DC 1 1_555 D N2 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N1 DG 2 T DG 2 1_555 D N3 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B N1 DG 2 T DG 2 1_555 D N3 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B N2 DG 2 T DG 2 1_555 D O2 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B N2 DG 2 T DG 2 1_555 D O2 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 B O6 DG 2 T DG 2 1_555 D N4 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B O6 DG 2 T DG 2 1_555 D N4 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B N1 DG 3 T DG 3 1_555 D N3 DC 2 D DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N2 DG 3 T DG 3 1_555 D O2 DC 2 D DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B O6 DG 3 T DG 3 1_555 D N4 DC 2 D DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B N3 DC 4 T DC 4 1_555 D N1 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B N4 DC 4 T DC 4 1_555 D O6 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B O2 DC 4 T DC 4 1_555 D N2 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N1 DA 5 T DA 5 1_555 C N3 DT 5 P DT 5 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B N6 DA 5 T DA 5 1_555 C O4 DT 5 P DT 5 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B N3 DT 6 T DT 6 1_555 C N1 DA 4 P DA 4 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B N3 DT 6 T DT 6 1_555 C N1 DA 4 P DA 4 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B O4 DT 6 T DT 6 1_555 C N6 DA 4 P DA 4 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B O4 DT 6 T DT 6 1_555 C N6 DA 4 P DA 4 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B N1 DA 7 T DA 7 1_555 C N3 DT 3 P DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 B N6 DA 7 T DA 7 1_555 C O4 DT 3 P DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 B N3 DC 8 T DC 8 1_555 C N1 DG 2 P DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 B N4 DC 8 T DC 8 1_555 C O6 DG 2 P DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 B O2 DC 8 T DC 8 1_555 C N2 DG 2 P DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 B N1 DG 9 T DG 9 1_555 C N3 DC 1 P DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 B N2 DG 9 T DG 9 1_555 C O2 DC 1 P DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 B O6 DG 9 T DG 9 1_555 C N4 DC 1 P DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H17 N2 O14 P3' _chem_comp.formula_weight 482.168 _chem_comp.id TTP _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PA O1A TTP doub 554 n n PA O2A TTP sing 555 n n PA O3A TTP sing 556 n n PA O5' TTP sing 557 n n O2A HOA2 TTP sing 558 n n O3A PB TTP sing 559 n n PB O1B TTP doub 560 n n PB O2B TTP sing 561 n n PB O3B TTP sing 562 n n O2B HOB2 TTP sing 563 n n O3B PG TTP sing 564 n n PG O1G TTP doub 565 n n PG O2G TTP sing 566 n n PG O3G TTP sing 567 n n O2G HOG2 TTP sing 568 n n O3G HOG3 TTP sing 569 n n O5' C5' TTP sing 570 n n C5' C4' TTP sing 571 n n C5' "H5'1" TTP sing 572 n n C5' "H5'2" TTP sing 573 n n C4' O4' TTP sing 574 n n C4' C3' TTP sing 575 n n C4' H4' TTP sing 576 n n O4' C1' TTP sing 577 n n C3' O3' TTP sing 578 n n C3' C2' TTP sing 579 n n C3' H3' TTP sing 580 n n O3' HO3' TTP sing 581 n n C2' C1' TTP sing 582 n n C2' "H2'1" TTP sing 583 n n C2' "H2'2" TTP sing 584 n n C1' N1 TTP sing 585 n n C1' H1' TTP sing 586 n n N1 C2 TTP sing 587 n n N1 C6 TTP sing 588 n n C2 O2 TTP doub 589 n n C2 N3 TTP sing 590 n n N3 C4 TTP sing 591 n n N3 HN3 TTP sing 592 n n C4 O4 TTP doub 593 n n C4 C5 TTP sing 594 n n C5 C5M TTP sing 595 n n C5 C6 TTP doub 596 n n C5M HM51 TTP sing 597 n n C5M HM52 TTP sing 598 n n C5M HM53 TTP sing 599 n n C6 H6 TTP sing 600 n n # _atom_sites.entry_id 5TYW _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.016671 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014552 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009102 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 5 TTP A 1 501 703 TTP TTP . F 6 PPV A 1 502 701 PPV PPV . G 7 MN A 1 503 2 MN MN . H 7 MN A 1 504 3 MN MN . I 7 MN A 1 505 4 MN MN . J 7 MN A 1 506 5 MN MN . K 8 NA A 1 507 1 NA NA . L 9 DTT A 1 508 1 DTT DTT . M 10 EDO A 1 509 2 EDO EDO . N 10 EDO A 1 510 3 EDO EDO . O 10 EDO A 1 511 4 EDO EDO . P 11 EPE A 1 512 1 EPE EPE . Q 7 MN T 1 101 6 MN MN . R 7 MN P 1 101 1 MN MN . S 10 EDO P 1 102 1 EDO EDO . T 12 HOH A 1 601 168 HOH HOH . T 12 HOH A 2 602 270 HOH HOH . T 12 HOH A 3 603 311 HOH HOH . T 12 HOH A 4 604 226 HOH HOH . T 12 HOH A 5 605 228 HOH HOH . T 12 HOH A 6 606 117 HOH HOH . T 12 HOH A 7 607 399 HOH HOH . T 12 HOH A 8 608 215 HOH HOH . T 12 HOH A 9 609 384 HOH HOH . T 12 HOH A 10 610 61 HOH HOH . T 12 HOH A 11 611 247 HOH HOH . T 12 HOH A 12 612 386 HOH HOH . T 12 HOH A 13 613 18 HOH HOH . T 12 HOH A 14 614 283 HOH HOH . T 12 HOH A 15 615 67 HOH HOH . T 12 HOH A 16 616 5 HOH HOH . T 12 HOH A 17 617 199 HOH HOH . T 12 HOH A 18 618 360 HOH HOH . T 12 HOH A 19 619 12 HOH HOH . T 12 HOH A 20 620 409 HOH HOH . T 12 HOH A 21 621 142 HOH HOH . T 12 HOH A 22 622 106 HOH HOH . T 12 HOH A 23 623 47 HOH HOH . T 12 HOH A 24 624 340 HOH HOH . T 12 HOH A 25 625 146 HOH HOH . T 12 HOH A 26 626 49 HOH HOH . T 12 HOH A 27 627 105 HOH HOH . T 12 HOH A 28 628 151 HOH HOH . T 12 HOH A 29 629 59 HOH HOH . T 12 HOH A 30 630 64 HOH HOH . T 12 HOH A 31 631 148 HOH HOH . T 12 HOH A 32 632 138 HOH HOH . T 12 HOH A 33 633 304 HOH HOH . T 12 HOH A 34 634 406 HOH HOH . T 12 HOH A 35 635 202 HOH HOH . T 12 HOH A 36 636 177 HOH HOH . T 12 HOH A 37 637 103 HOH HOH . T 12 HOH A 38 638 28 HOH HOH . T 12 HOH A 39 639 150 HOH HOH . T 12 HOH A 40 640 32 HOH HOH . T 12 HOH A 41 641 323 HOH HOH . T 12 HOH A 42 642 356 HOH HOH . T 12 HOH A 43 643 321 HOH HOH . T 12 HOH A 44 644 155 HOH HOH . T 12 HOH A 45 645 118 HOH HOH . T 12 HOH A 46 646 413 HOH HOH . T 12 HOH A 47 647 53 HOH HOH . T 12 HOH A 48 648 96 HOH HOH . T 12 HOH A 49 649 378 HOH HOH . T 12 HOH A 50 650 123 HOH HOH . T 12 HOH A 51 651 342 HOH HOH . T 12 HOH A 52 652 280 HOH HOH . T 12 HOH A 53 653 75 HOH HOH . T 12 HOH A 54 654 149 HOH HOH . T 12 HOH A 55 655 16 HOH HOH . T 12 HOH A 56 656 338 HOH HOH . T 12 HOH A 57 657 198 HOH HOH . T 12 HOH A 58 658 9 HOH HOH . T 12 HOH A 59 659 260 HOH HOH . T 12 HOH A 60 660 231 HOH HOH . T 12 HOH A 61 661 132 HOH HOH . T 12 HOH A 62 662 211 HOH HOH . T 12 HOH A 63 663 2 HOH HOH . T 12 HOH A 64 664 45 HOH HOH . T 12 HOH A 65 665 110 HOH HOH . T 12 HOH A 66 666 69 HOH HOH . T 12 HOH A 67 667 44 HOH HOH . T 12 HOH A 68 668 6 HOH HOH . T 12 HOH A 69 669 37 HOH HOH . T 12 HOH A 70 670 73 HOH HOH . T 12 HOH A 71 671 131 HOH HOH . T 12 HOH A 72 672 314 HOH HOH . T 12 HOH A 73 673 38 HOH HOH . T 12 HOH A 74 674 7 HOH HOH . T 12 HOH A 75 675 175 HOH HOH . T 12 HOH A 76 676 31 HOH HOH . T 12 HOH A 77 677 140 HOH HOH . T 12 HOH A 78 678 26 HOH HOH . T 12 HOH A 79 679 167 HOH HOH . T 12 HOH A 80 680 230 HOH HOH . T 12 HOH A 81 681 41 HOH HOH . T 12 HOH A 82 682 14 HOH HOH . T 12 HOH A 83 683 1 HOH HOH . T 12 HOH A 84 684 129 HOH HOH . T 12 HOH A 85 685 68 HOH HOH . T 12 HOH A 86 686 70 HOH HOH . T 12 HOH A 87 687 72 HOH HOH . T 12 HOH A 88 688 111 HOH HOH . T 12 HOH A 89 689 217 HOH HOH . T 12 HOH A 90 690 58 HOH HOH . T 12 HOH A 91 691 158 HOH HOH . T 12 HOH A 92 692 13 HOH HOH . T 12 HOH A 93 693 300 HOH HOH . T 12 HOH A 94 694 194 HOH HOH . T 12 HOH A 95 695 94 HOH HOH . T 12 HOH A 96 696 126 HOH HOH . T 12 HOH A 97 697 55 HOH HOH . T 12 HOH A 98 698 8 HOH HOH . T 12 HOH A 99 699 337 HOH HOH . T 12 HOH A 100 700 101 HOH HOH . T 12 HOH A 101 701 23 HOH HOH . T 12 HOH A 102 702 15 HOH HOH . T 12 HOH A 103 703 186 HOH HOH . T 12 HOH A 104 704 219 HOH HOH . T 12 HOH A 105 705 367 HOH HOH . T 12 HOH A 106 706 87 HOH HOH . T 12 HOH A 107 707 162 HOH HOH . T 12 HOH A 108 708 267 HOH HOH . T 12 HOH A 109 709 407 HOH HOH . T 12 HOH A 110 710 195 HOH HOH . T 12 HOH A 111 711 34 HOH HOH . T 12 HOH A 112 712 92 HOH HOH . T 12 HOH A 113 713 235 HOH HOH . T 12 HOH A 114 714 57 HOH HOH . T 12 HOH A 115 715 39 HOH HOH . T 12 HOH A 116 716 262 HOH HOH . T 12 HOH A 117 717 165 HOH HOH . T 12 HOH A 118 718 82 HOH HOH . T 12 HOH A 119 719 43 HOH HOH . T 12 HOH A 120 720 3 HOH HOH . T 12 HOH A 121 721 223 HOH HOH . T 12 HOH A 122 722 52 HOH HOH . T 12 HOH A 123 723 93 HOH HOH . T 12 HOH A 124 724 63 HOH HOH . T 12 HOH A 125 725 90 HOH HOH . T 12 HOH A 126 726 30 HOH HOH . T 12 HOH A 127 727 4 HOH HOH . T 12 HOH A 128 728 302 HOH HOH . T 12 HOH A 129 729 307 HOH HOH . T 12 HOH A 130 730 291 HOH HOH . T 12 HOH A 131 731 29 HOH HOH . T 12 HOH A 132 732 263 HOH HOH . T 12 HOH A 133 733 354 HOH HOH . T 12 HOH A 134 734 84 HOH HOH . T 12 HOH A 135 735 200 HOH HOH . T 12 HOH A 136 736 21 HOH HOH . T 12 HOH A 137 737 48 HOH HOH . T 12 HOH A 138 738 173 HOH HOH . T 12 HOH A 139 739 222 HOH HOH . T 12 HOH A 140 740 152 HOH HOH . T 12 HOH A 141 741 54 HOH HOH . T 12 HOH A 142 742 60 HOH HOH . T 12 HOH A 143 743 214 HOH HOH . T 12 HOH A 144 744 203 HOH HOH . T 12 HOH A 145 745 190 HOH HOH . T 12 HOH A 146 746 24 HOH HOH . T 12 HOH A 147 747 316 HOH HOH . T 12 HOH A 148 748 395 HOH HOH . T 12 HOH A 149 749 128 HOH HOH . T 12 HOH A 150 750 51 HOH HOH . T 12 HOH A 151 751 102 HOH HOH . T 12 HOH A 152 752 265 HOH HOH . T 12 HOH A 153 753 35 HOH HOH . T 12 HOH A 154 754 40 HOH HOH . T 12 HOH A 155 755 225 HOH HOH . T 12 HOH A 156 756 113 HOH HOH . T 12 HOH A 157 757 125 HOH HOH . T 12 HOH A 158 758 36 HOH HOH . T 12 HOH A 159 759 353 HOH HOH . T 12 HOH A 160 760 80 HOH HOH . T 12 HOH A 161 761 139 HOH HOH . T 12 HOH A 162 762 83 HOH HOH . T 12 HOH A 163 763 88 HOH HOH . T 12 HOH A 164 764 276 HOH HOH . T 12 HOH A 165 765 104 HOH HOH . T 12 HOH A 166 766 281 HOH HOH . T 12 HOH A 167 767 259 HOH HOH . T 12 HOH A 168 768 133 HOH HOH . T 12 HOH A 169 769 163 HOH HOH . T 12 HOH A 170 770 166 HOH HOH . T 12 HOH A 171 771 17 HOH HOH . T 12 HOH A 172 772 412 HOH HOH . T 12 HOH A 173 773 279 HOH HOH . T 12 HOH A 174 774 349 HOH HOH . T 12 HOH A 175 775 135 HOH HOH . T 12 HOH A 176 776 229 HOH HOH . T 12 HOH A 177 777 98 HOH HOH . T 12 HOH A 178 778 121 HOH HOH . T 12 HOH A 179 779 77 HOH HOH . T 12 HOH A 180 780 212 HOH HOH . T 12 HOH A 181 781 376 HOH HOH . T 12 HOH A 182 782 22 HOH HOH . T 12 HOH A 183 783 56 HOH HOH . T 12 HOH A 184 784 127 HOH HOH . T 12 HOH A 185 785 184 HOH HOH . T 12 HOH A 186 786 91 HOH HOH . T 12 HOH A 187 787 115 HOH HOH . T 12 HOH A 188 788 403 HOH HOH . T 12 HOH A 189 789 154 HOH HOH . T 12 HOH A 190 790 78 HOH HOH . T 12 HOH A 191 791 382 HOH HOH . T 12 HOH A 192 792 183 HOH HOH . T 12 HOH A 193 793 99 HOH HOH . T 12 HOH A 194 794 108 HOH HOH . T 12 HOH A 195 795 191 HOH HOH . T 12 HOH A 196 796 174 HOH HOH . T 12 HOH A 197 797 204 HOH HOH . T 12 HOH A 198 798 220 HOH HOH . T 12 HOH A 199 799 236 HOH HOH . T 12 HOH A 200 800 295 HOH HOH . T 12 HOH A 201 801 208 HOH HOH . T 12 HOH A 202 802 405 HOH HOH . T 12 HOH A 203 803 308 HOH HOH . T 12 HOH A 204 804 351 HOH HOH . T 12 HOH A 205 805 79 HOH HOH . T 12 HOH A 206 806 50 HOH HOH . T 12 HOH A 207 807 400 HOH HOH . T 12 HOH A 208 808 343 HOH HOH . T 12 HOH A 209 809 169 HOH HOH . T 12 HOH A 210 810 410 HOH HOH . T 12 HOH A 211 811 136 HOH HOH . T 12 HOH A 212 812 11 HOH HOH . T 12 HOH A 213 813 344 HOH HOH . T 12 HOH A 214 814 65 HOH HOH . T 12 HOH A 215 815 171 HOH HOH . T 12 HOH A 216 816 206 HOH HOH . T 12 HOH A 217 817 254 HOH HOH . T 12 HOH A 218 818 210 HOH HOH . T 12 HOH A 219 819 197 HOH HOH . T 12 HOH A 220 820 264 HOH HOH . T 12 HOH A 221 821 411 HOH HOH . T 12 HOH A 222 822 157 HOH HOH . T 12 HOH A 223 823 71 HOH HOH . T 12 HOH A 224 824 375 HOH HOH . T 12 HOH A 225 825 365 HOH HOH . T 12 HOH A 226 826 161 HOH HOH . T 12 HOH A 227 827 255 HOH HOH . T 12 HOH A 228 828 242 HOH HOH . T 12 HOH A 229 829 396 HOH HOH . T 12 HOH A 230 830 241 HOH HOH . T 12 HOH A 231 831 282 HOH HOH . T 12 HOH A 232 832 383 HOH HOH . T 12 HOH A 233 833 289 HOH HOH . T 12 HOH A 234 834 363 HOH HOH . T 12 HOH A 235 835 42 HOH HOH . T 12 HOH A 236 836 130 HOH HOH . T 12 HOH A 237 837 284 HOH HOH . T 12 HOH A 238 838 164 HOH HOH . T 12 HOH A 239 839 85 HOH HOH . T 12 HOH A 240 840 95 HOH HOH . T 12 HOH A 241 841 256 HOH HOH . T 12 HOH A 242 842 144 HOH HOH . T 12 HOH A 243 843 244 HOH HOH . T 12 HOH A 244 844 209 HOH HOH . T 12 HOH A 245 845 361 HOH HOH . T 12 HOH A 246 846 272 HOH HOH . T 12 HOH A 247 847 252 HOH HOH . T 12 HOH A 248 848 134 HOH HOH . T 12 HOH A 249 849 193 HOH HOH . T 12 HOH A 250 850 319 HOH HOH . T 12 HOH A 251 851 261 HOH HOH . T 12 HOH A 252 852 374 HOH HOH . T 12 HOH A 253 853 251 HOH HOH . T 12 HOH A 254 854 293 HOH HOH . T 12 HOH A 255 855 397 HOH HOH . T 12 HOH A 256 856 156 HOH HOH . T 12 HOH A 257 857 317 HOH HOH . T 12 HOH A 258 858 334 HOH HOH . T 12 HOH A 259 859 313 HOH HOH . T 12 HOH A 260 860 238 HOH HOH . T 12 HOH A 261 861 192 HOH HOH . T 12 HOH A 262 862 124 HOH HOH . T 12 HOH A 263 863 266 HOH HOH . T 12 HOH A 264 864 294 HOH HOH . T 12 HOH A 265 865 213 HOH HOH . T 12 HOH A 266 866 221 HOH HOH . T 12 HOH A 267 867 245 HOH HOH . T 12 HOH A 268 868 392 HOH HOH . T 12 HOH A 269 869 347 HOH HOH . T 12 HOH A 270 870 287 HOH HOH . T 12 HOH A 271 871 76 HOH HOH . T 12 HOH A 272 872 385 HOH HOH . T 12 HOH A 273 873 358 HOH HOH . T 12 HOH A 274 874 335 HOH HOH . T 12 HOH A 275 875 277 HOH HOH . T 12 HOH A 276 876 141 HOH HOH . T 12 HOH A 277 877 301 HOH HOH . T 12 HOH A 278 878 207 HOH HOH . T 12 HOH A 279 879 357 HOH HOH . T 12 HOH A 280 880 416 HOH HOH . T 12 HOH A 281 881 205 HOH HOH . T 12 HOH A 282 882 368 HOH HOH . T 12 HOH A 283 883 188 HOH HOH . T 12 HOH A 284 884 303 HOH HOH . T 12 HOH A 285 885 292 HOH HOH . T 12 HOH A 286 886 246 HOH HOH . T 12 HOH A 287 887 327 HOH HOH . T 12 HOH A 288 888 352 HOH HOH . T 12 HOH A 289 889 159 HOH HOH . T 12 HOH A 290 890 153 HOH HOH . T 12 HOH A 291 891 306 HOH HOH . T 12 HOH A 292 892 181 HOH HOH . T 12 HOH A 293 893 299 HOH HOH . T 12 HOH A 294 894 176 HOH HOH . T 12 HOH A 295 895 389 HOH HOH . T 12 HOH A 296 896 333 HOH HOH . T 12 HOH A 297 897 331 HOH HOH . T 12 HOH A 298 898 187 HOH HOH . T 12 HOH A 299 899 371 HOH HOH . T 12 HOH A 300 900 390 HOH HOH . T 12 HOH A 301 901 370 HOH HOH . T 12 HOH A 302 902 196 HOH HOH . T 12 HOH A 303 903 269 HOH HOH . T 12 HOH A 304 904 336 HOH HOH . T 12 HOH A 305 905 373 HOH HOH . T 12 HOH A 306 906 330 HOH HOH . T 12 HOH A 307 907 348 HOH HOH . T 12 HOH A 308 908 243 HOH HOH . T 12 HOH A 309 909 372 HOH HOH . T 12 HOH A 310 910 310 HOH HOH . T 12 HOH A 311 911 380 HOH HOH . U 12 HOH T 1 201 189 HOH HOH . U 12 HOH T 2 202 97 HOH HOH . U 12 HOH T 3 203 366 HOH HOH . U 12 HOH T 4 204 318 HOH HOH . U 12 HOH T 5 205 143 HOH HOH . U 12 HOH T 6 206 253 HOH HOH . U 12 HOH T 7 207 233 HOH HOH . U 12 HOH T 8 208 401 HOH HOH . U 12 HOH T 9 209 46 HOH HOH . U 12 HOH T 10 210 100 HOH HOH . U 12 HOH T 11 211 122 HOH HOH . U 12 HOH T 12 212 33 HOH HOH . U 12 HOH T 13 213 147 HOH HOH . U 12 HOH T 14 214 170 HOH HOH . U 12 HOH T 15 215 298 HOH HOH . U 12 HOH T 16 216 10 HOH HOH . U 12 HOH T 17 217 218 HOH HOH . U 12 HOH T 18 218 137 HOH HOH . U 12 HOH T 19 219 182 HOH HOH . U 12 HOH T 20 220 89 HOH HOH . U 12 HOH T 21 221 290 HOH HOH . U 12 HOH T 22 222 237 HOH HOH . U 12 HOH T 23 223 145 HOH HOH . U 12 HOH T 24 224 273 HOH HOH . U 12 HOH T 25 225 402 HOH HOH . U 12 HOH T 26 226 257 HOH HOH . U 12 HOH T 27 227 415 HOH HOH . U 12 HOH T 28 228 305 HOH HOH . U 12 HOH T 29 229 286 HOH HOH . U 12 HOH T 30 230 414 HOH HOH . U 12 HOH T 31 231 274 HOH HOH . U 12 HOH T 32 232 364 HOH HOH . V 12 HOH P 1 201 160 HOH HOH . V 12 HOH P 2 202 25 HOH HOH . V 12 HOH P 3 203 312 HOH HOH . V 12 HOH P 4 204 86 HOH HOH . V 12 HOH P 5 205 62 HOH HOH . V 12 HOH P 6 206 119 HOH HOH . V 12 HOH P 7 207 258 HOH HOH . V 12 HOH P 8 208 109 HOH HOH . V 12 HOH P 9 209 172 HOH HOH . V 12 HOH P 10 210 114 HOH HOH . V 12 HOH P 11 211 249 HOH HOH . V 12 HOH P 12 212 234 HOH HOH . V 12 HOH P 13 213 20 HOH HOH . V 12 HOH P 14 214 325 HOH HOH . V 12 HOH P 15 215 224 HOH HOH . V 12 HOH P 16 216 250 HOH HOH . W 12 HOH D 1 101 341 HOH HOH . W 12 HOH D 2 102 379 HOH HOH . W 12 HOH D 3 103 66 HOH HOH . W 12 HOH D 4 104 315 HOH HOH . W 12 HOH D 5 105 248 HOH HOH . W 12 HOH D 6 106 268 HOH HOH . W 12 HOH D 7 107 201 HOH HOH . W 12 HOH D 8 108 296 HOH HOH . W 12 HOH D 9 109 120 HOH HOH . W 12 HOH D 10 110 240 HOH HOH . W 12 HOH D 11 111 227 HOH HOH . W 12 HOH D 12 112 178 HOH HOH . W 12 HOH D 13 113 404 HOH HOH . W 12 HOH D 14 114 297 HOH HOH . W 12 HOH D 15 115 112 HOH HOH . W 12 HOH D 16 116 322 HOH HOH . W 12 HOH D 17 117 320 HOH HOH . W 12 HOH D 18 118 285 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PA TTP . A . E 5 2.938 -0.847 -8.202 0.3 28.29 ? PA TTP 501 A 1 HETATM 2 O O1A TTP . A . E 5 2.864 0.007 -6.956 0.3 24.38 ? O1A TTP 501 A 1 HETATM 3 O O2A TTP . A . E 5 3.739 -0.135 -9.266 0.3 29.84 ? O2A TTP 501 A 1 HETATM 4 O O3A TTP . A . E 5 3.671 -2.236 -7.863 0.3 30.82 ? O3A TTP 501 A 1 HETATM 5 P PB TTP . A . E 5 3.342 -3.076 -6.533 0.3 26.16 ? PB TTP 501 A 1 HETATM 6 O O1B TTP . A . E 5 2.473 -2.262 -5.605 0.3 24.85 ? O1B TTP 501 A 1 HETATM 7 O O2B TTP . A . E 5 2.621 -4.345 -6.929 0.3 25.6 ? O2B TTP 501 A 1 HETATM 8 O O3B TTP . A . E 5 4.739 -3.424 -5.804 0.3 32.63 ? O3B TTP 501 A 1 HETATM 9 P PG TTP . A . E 5 5.884 -2.294 -5.632 0.3 42.29 ? PG TTP 501 A 1 HETATM 10 O O1G TTP . A . E 5 5.272 -0.918 -5.771 0.3 31.06 ? O1G TTP 501 A 1 HETATM 11 O O2G TTP . A . E 5 6.515 -2.426 -4.265 0.3 33.66 ? O2G TTP 501 A 1 HETATM 12 O O3G TTP . A . E 5 6.953 -2.464 -6.689 0.3 38.07 ? O3G TTP 501 A 1 HETATM 13 O O5' TTP . A . E 5 1.456 -1.138 -8.763 0.3 25.2 ? O5' TTP 501 A 1 HETATM 14 C C5' TTP . A . E 5 0.373 -1.386 -7.873 0.3 23.66 ? C5' TTP 501 A 1 HETATM 15 C C4' TTP . A . E 5 -0.521 -2.501 -8.392 0.3 23.33 ? C4' TTP 501 A 1 HETATM 16 O O4' TTP . A . E 5 -1.12 -2.12 -9.656 0.3 23.54 ? O4' TTP 501 A 1 HETATM 17 C C3' TTP . A . E 5 0.186 -3.81 -8.702 0.3 22.24 ? C3' TTP 501 A 1 HETATM 18 O O3' TTP . A . E 5 0.366 -4.544 -7.499 0.3 21.89 ? O3' TTP 501 A 1 HETATM 19 C C2' TTP . A . E 5 -0.821 -4.478 -9.633 0.3 21.95 ? C2' TTP 501 A 1 HETATM 20 C C1' TTP . A . E 5 -1.33 -3.282 -10.439 0.3 26.24 ? C1' TTP 501 A 1 HETATM 21 N N1 TTP . A . E 5 -0.612 -3.101 -11.73 0.3 24.33 ? N1 TTP 501 A 1 HETATM 22 C C2 TTP . A . E 5 -1.227 -3.487 -12.899 0.3 25.33 ? C2 TTP 501 A 1 HETATM 23 O O2 TTP . A . E 5 -2.343 -3.975 -12.934 0.3 24.55 ? O2 TTP 501 A 1 HETATM 24 N N3 TTP . A . E 5 -0.477 -3.28 -14.028 0.3 25.7 ? N3 TTP 501 A 1 HETATM 25 C C4 TTP . A . E 5 0.793 -2.733 -14.095 0.3 25.15 ? C4 TTP 501 A 1 HETATM 26 O O4 TTP . A . E 5 1.39 -2.586 -15.157 0.3 26.5 ? O4 TTP 501 A 1 HETATM 27 C C5 TTP . A . E 5 1.373 -2.353 -12.836 0.3 25.39 ? C5 TTP 501 A 1 HETATM 28 C C5M TTP . A . E 5 2.748 -1.753 -12.794 0.3 28.14 ? C5M TTP 501 A 1 HETATM 29 C C6 TTP . A . E 5 0.654 -2.554 -11.726 0.3 25.25 ? C6 TTP 501 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 314 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 29 #