data_5UEE
#
_model_server_result.job_id            GYMFflxxtUpyS_55bnbwzQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-19 19:17:15' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          5uee 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":104}' 
#
_entry.id    5UEE 
#
_exptl.entry_id    5UEE 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            5UEE 
_cell.length_a            46.964 
_cell.length_b            46.964 
_cell.length_c            83.103 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5UEE 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        150 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 3 2 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 D N N 
? 3 E N N 
? 3 F N N 
? 3 H N N 
? 3 I N N 
? 3 J N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A O3' LCC 1 A LCC 1 1_555 A P LCC 2 A LCC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.685 ? 
covale ? covale2 A O3' LCC 2 A LCC 2 1_555 A P LCC 3 A LCC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.695 ? 
covale ? covale3 A O3' LCC 3 A LCC 3 1_555 A P G 4 A G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.662 ? 
covale ? covale4 B O3' LCC 1 B LCC 1 1_555 B P LCC 2 B LCC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.643 ? 
covale ? covale5 B O3' LCC 2 B LCC 2 1_555 B P LCC 3 B LCC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.688 ? 
covale ? covale6 B O3' LCC 3 B LCC 3 1_555 B P G 4 B G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.614 ? 
metalc ? metalc1 C O3D GP3 . A GP3 101 1_555 H MG MG . B MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? 
metalc ? metalc2 C O2D GP3 . A GP3 101 1_555 H MG MG . B MG 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? 
metalc ? metalc3 C O3D GP3 . A GP3 101 1_555 H MG MG . B MG 102 3_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc4 C O2D GP3 . A GP3 101 1_555 H MG MG . B MG 102 2_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
metalc ? metalc5 C O2A GP3 . A GP3 101 1_555 I MG MG . B MG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc6 C O2B GP3 . A GP3 101 1_555 I MG MG . B MG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? 
metalc ? metalc7 C O2G GP3 . A GP3 101 1_555 I MG MG . B MG 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.978 ? 
metalc ? metalc8 C O2A GP3 . A GP3 101 1_555 J MG MG . B MG 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? 
metalc ? metalc9 C O3E GP3 . A GP3 101 1_555 J MG MG . B MG 104 3_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc10 C O2E GP3 . A GP3 101 1_555 J MG MG . B MG 104 3_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? 
metalc ? metalc11 D MG MG . A MG 102 1_555 G O3D GP3 . B GP3 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? 
metalc ? metalc12 D MG MG . A MG 102 1_555 G O2D GP3 . B GP3 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? 
metalc ? metalc13 D MG MG . A MG 102 1_555 G O3D GP3 . B GP3 101 3_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
metalc ? metalc14 D MG MG . A MG 102 1_555 G O2D GP3 . B GP3 101 2_665 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? 
metalc ? metalc15 E MG MG . A MG 103 1_555 G O2B GP3 . B GP3 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? 
metalc ? metalc16 E MG MG . A MG 103 1_555 G O2A GP3 . B GP3 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? 
metalc ? metalc17 F MG MG . A MG 104 1_555 G O2A GP3 . B GP3 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.21 ? 
metalc ? metalc18 F MG MG . A MG 104 1_555 G O2E GP3 . B GP3 101 3_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? 
metalc ? metalc19 F MG MG . A MG 104 1_555 G O3E GP3 . B GP3 101 3_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? 
metalc ? metalc20 K O HOH . A HOH 208 1_555 J MG MG . B MG 104 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.928 ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 G 4 A G 4 1_555 B N3 C 13 B C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 G 4 A G 4 1_555 B O2 C 13 B C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 G 4 A G 4 1_555 B N4 C 13 B C 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 A 5 A A 5 1_555 B N3 U 12 B U 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N6 A 5 A A 5 1_555 B O4 U 12 B U 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A N3 C 6 A C 6 1_555 B N1 G 11 B G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N4 C 6 A C 6 1_555 B O6 G 11 B G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A O2 C 6 A C 6 1_555 B N2 G 11 B G 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N3 U 7 A U 7 1_555 B N1 A 10 B A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A O4 U 7 A U 7 1_555 B N6 A 10 B A 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N3 U 8 A U 8 1_555 B N1 A 9 B A 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A O4 U 8 A U 8 1_555 B N6 A 9 B A 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N1 A 9 A A 9 1_555 B N3 U 8 B U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N6 A 9 A A 9 1_555 B O4 U 8 B U 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N1 A 10 A A 10 1_555 B N3 U 7 B U 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N6 A 10 A A 10 1_555 B O4 U 7 B U 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N1 G 11 A G 11 1_555 B N3 C 6 B C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N2 G 11 A G 11 1_555 B O2 C 6 B C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A O6 G 11 A G 11 1_555 B N4 C 6 B C 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N3 U 12 A U 12 1_555 B N1 A 5 B A 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A O4 U 12 A U 12 1_555 B N6 A 5 B A 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N3 C 13 A C 13 1_555 B N1 G 4 B G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N4 C 13 A C 13 1_555 B O6 G 4 B G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A O2 C 13 A C 13 1_555 B N2 G 4 B G 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     5UEE 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.021293 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.012293 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.024587 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.012033 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 GP3 A 1 101 2 GP3 GP3 . 
D 3 MG A 1 102 1 MG MG . 
E 3 MG A 1 103 3 MG MG . 
F 3 MG A 1 104 4 MG MG . 
G 2 GP3 B 1 101 1 GP3 GP3 . 
H 3 MG B 1 102 2 MG MG . 
I 3 MG B 1 103 5 MG MG . 
J 3 MG B 1 104 6 MG MG . 
K 4 HOH A 1 201 1 HOH HOH . 
K 4 HOH A 2 202 13 HOH HOH . 
K 4 HOH A 3 203 5 HOH HOH . 
K 4 HOH A 4 204 12 HOH HOH . 
K 4 HOH A 5 205 3 HOH HOH . 
K 4 HOH A 6 206 4 HOH HOH . 
K 4 HOH A 7 207 22 HOH HOH . 
K 4 HOH A 8 208 23 HOH HOH . 
K 4 HOH A 9 209 2 HOH HOH . 
K 4 HOH A 10 210 14 HOH HOH . 
L 4 HOH B 1 201 9 HOH HOH . 
L 4 HOH B 2 202 21 HOH HOH . 
L 4 HOH B 3 203 16 HOH HOH . 
L 4 HOH B 4 204 11 HOH HOH . 
L 4 HOH B 5 205 17 HOH HOH . 
L 4 HOH B 6 206 15 HOH HOH . 
L 4 HOH B 7 207 6 HOH HOH . 
L 4 HOH B 8 208 10 HOH HOH . 
L 4 HOH B 9 209 7 HOH HOH . 
L 4 HOH B 10 210 18 HOH HOH . 
L 4 HOH B 11 211 20 HOH HOH . 
L 4 HOH B 12 212 19 HOH HOH . 
L 4 HOH B 13 213 8 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         J 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               5.015 
_atom_site.Cartn_y               23.727 
_atom_site.Cartn_z               85.504 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        48.56 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           104 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              9 
_model_server_stats.parse_time_ms           18 
_model_server_stats.create_model_time_ms    11 
_model_server_stats.query_time_ms           335 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           1 
#