data_5UG8 # _model_server_result.job_id BOIlMQil8gigkpbEc8pCpw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-07 08:45:04' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5ug8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":9007}' # _entry.id 5UG8 # _exptl.entry_id 5UG8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 92.094 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description GLYCEROL _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5UG8 _cell.length_a 34.948 _cell.length_b 69.836 _cell.length_c 113.252 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5UG8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 E N N ? 4 F N N ? 4 G N N ? 4 H N N # _struct_conn.conn_type_id covale _struct_conn.details ? _struct_conn.id covale1 _struct_conn.ptnr1_label_asym_id A _struct_conn.ptnr1_label_atom_id SG _struct_conn.ptnr1_label_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_label_seq_id 104 _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id A _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id CYS _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id 797 _struct_conn.ptnr1_symmetry 1_555 _struct_conn.ptnr2_label_asym_id B _struct_conn.ptnr2_label_atom_id C29 _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 8BP _struct_conn.ptnr2_label_seq_id . _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id A _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id 8BP _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id 9001 _struct_conn.ptnr2_symmetry 1_555 _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code ? _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id ? _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id ? _struct_conn.pdbx_PDB_id ? _struct_conn.pdbx_dist_value 1.806 _struct_conn.pdbx_value_order ? # _chem_comp.formula 'C3 H8 O3' _chem_comp.formula_weight 92.094 _chem_comp.id GOL _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name GLYCEROL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL # _atom_sites.entry_id 5UG8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.028614 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014319 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00883 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 8BP A 1 9001 9001 8BP LIG . C 3 SO4 A 1 9002 9002 SO4 SO4 . D 3 SO4 A 1 9003 9003 SO4 SO4 . E 4 GOL A 1 9004 9004 GOL GOL . F 4 GOL A 1 9005 9005 GOL GOL . G 4 GOL A 1 9006 9006 GOL GOL . H 4 GOL A 1 9007 9007 GOL GOL . I 5 HOH A 1 9101 37 HOH WAT . I 5 HOH A 2 9102 161 HOH WAT . I 5 HOH A 3 9103 256 HOH WAT . I 5 HOH A 4 9104 262 HOH WAT . I 5 HOH A 5 9105 64 HOH WAT . I 5 HOH A 6 9106 141 HOH WAT . I 5 HOH A 7 9107 45 HOH WAT . I 5 HOH A 8 9108 120 HOH WAT . I 5 HOH A 9 9109 77 HOH WAT . I 5 HOH A 10 9110 25 HOH WAT . I 5 HOH A 11 9111 32 HOH WAT . I 5 HOH A 12 9112 19 HOH WAT . I 5 HOH A 13 9113 57 HOH WAT . I 5 HOH A 14 9114 258 HOH WAT . I 5 HOH A 15 9115 86 HOH WAT . I 5 HOH A 16 9116 52 HOH WAT . I 5 HOH A 17 9117 138 HOH WAT . I 5 HOH A 18 9118 29 HOH WAT . I 5 HOH A 19 9119 180 HOH WAT . I 5 HOH A 20 9120 51 HOH WAT . I 5 HOH A 21 9121 58 HOH WAT . I 5 HOH A 22 9122 72 HOH WAT . I 5 HOH A 23 9123 176 HOH WAT . I 5 HOH A 24 9124 55 HOH WAT . I 5 HOH A 25 9125 175 HOH WAT . I 5 HOH A 26 9126 104 HOH WAT . I 5 HOH A 27 9127 60 HOH WAT . I 5 HOH A 28 9128 178 HOH WAT . I 5 HOH A 29 9129 113 HOH WAT . I 5 HOH A 30 9130 107 HOH WAT . I 5 HOH A 31 9131 177 HOH WAT . I 5 HOH A 32 9132 128 HOH WAT . I 5 HOH A 33 9133 30 HOH WAT . I 5 HOH A 34 9134 21 HOH WAT . I 5 HOH A 35 9135 169 HOH WAT . I 5 HOH A 36 9136 119 HOH WAT . I 5 HOH A 37 9137 97 HOH WAT . I 5 HOH A 38 9138 246 HOH WAT . I 5 HOH A 39 9139 23 HOH WAT . I 5 HOH A 40 9140 75 HOH WAT . I 5 HOH A 41 9141 197 HOH WAT . I 5 HOH A 42 9142 275 HOH WAT . I 5 HOH A 43 9143 185 HOH WAT . I 5 HOH A 44 9144 140 HOH WAT . I 5 HOH A 45 9145 17 HOH WAT . I 5 HOH A 46 9146 2 HOH WAT . I 5 HOH A 47 9147 79 HOH WAT . I 5 HOH A 48 9148 8 HOH WAT . I 5 HOH A 49 9149 129 HOH WAT . I 5 HOH A 50 9150 182 HOH WAT . I 5 HOH A 51 9151 127 HOH WAT . I 5 HOH A 52 9152 3 HOH WAT . I 5 HOH A 53 9153 71 HOH WAT . I 5 HOH A 54 9154 9 HOH WAT . I 5 HOH A 55 9155 4 HOH WAT . I 5 HOH A 56 9156 53 HOH WAT . I 5 HOH A 57 9157 98 HOH WAT . I 5 HOH A 58 9158 111 HOH WAT . I 5 HOH A 59 9159 92 HOH WAT . I 5 HOH A 60 9160 7 HOH WAT . I 5 HOH A 61 9161 41 HOH WAT . I 5 HOH A 62 9162 50 HOH WAT . I 5 HOH A 63 9163 156 HOH WAT . I 5 HOH A 64 9164 20 HOH WAT . I 5 HOH A 65 9165 145 HOH WAT . I 5 HOH A 66 9166 142 HOH WAT . I 5 HOH A 67 9167 268 HOH WAT . I 5 HOH A 68 9168 272 HOH WAT . I 5 HOH A 69 9169 103 HOH WAT . I 5 HOH A 70 9170 81 HOH WAT . I 5 HOH A 71 9171 26 HOH WAT . I 5 HOH A 72 9172 68 HOH WAT . I 5 HOH A 73 9173 1 HOH WAT . I 5 HOH A 74 9174 84 HOH WAT . I 5 HOH A 75 9175 124 HOH WAT . I 5 HOH A 76 9176 179 HOH WAT . I 5 HOH A 77 9177 101 HOH WAT . I 5 HOH A 78 9178 105 HOH WAT . I 5 HOH A 79 9179 88 HOH WAT . I 5 HOH A 80 9180 217 HOH WAT . I 5 HOH A 81 9181 121 HOH WAT . I 5 HOH A 82 9182 150 HOH WAT . I 5 HOH A 83 9183 62 HOH WAT . I 5 HOH A 84 9184 166 HOH WAT . I 5 HOH A 85 9185 163 HOH WAT . I 5 HOH A 86 9186 61 HOH WAT . I 5 HOH A 87 9187 152 HOH WAT . I 5 HOH A 88 9188 59 HOH WAT . I 5 HOH A 89 9189 56 HOH WAT . I 5 HOH A 90 9190 24 HOH WAT . I 5 HOH A 91 9191 6 HOH WAT . I 5 HOH A 92 9192 65 HOH WAT . I 5 HOH A 93 9193 167 HOH WAT . I 5 HOH A 94 9194 11 HOH WAT . I 5 HOH A 95 9195 242 HOH WAT . I 5 HOH A 96 9196 48 HOH WAT . I 5 HOH A 97 9197 112 HOH WAT . I 5 HOH A 98 9198 215 HOH WAT . I 5 HOH A 99 9199 28 HOH WAT . I 5 HOH A 100 9200 18 HOH WAT . I 5 HOH A 101 9201 255 HOH WAT . I 5 HOH A 102 9202 14 HOH WAT . I 5 HOH A 103 9203 116 HOH WAT . I 5 HOH A 104 9204 271 HOH WAT . I 5 HOH A 105 9205 74 HOH WAT . I 5 HOH A 106 9206 183 HOH WAT . I 5 HOH A 107 9207 22 HOH WAT . I 5 HOH A 108 9208 44 HOH WAT . I 5 HOH A 109 9209 237 HOH WAT . I 5 HOH A 110 9210 158 HOH WAT . I 5 HOH A 111 9211 66 HOH WAT . I 5 HOH A 112 9212 228 HOH WAT . I 5 HOH A 113 9213 170 HOH WAT . I 5 HOH A 114 9214 114 HOH WAT . I 5 HOH A 115 9215 159 HOH WAT . I 5 HOH A 116 9216 5 HOH WAT . I 5 HOH A 117 9217 244 HOH WAT . I 5 HOH A 118 9218 63 HOH WAT . I 5 HOH A 119 9219 160 HOH WAT . I 5 HOH A 120 9220 93 HOH WAT . I 5 HOH A 121 9221 38 HOH WAT . I 5 HOH A 122 9222 248 HOH WAT . I 5 HOH A 123 9223 87 HOH WAT . I 5 HOH A 124 9224 210 HOH WAT . I 5 HOH A 125 9225 196 HOH WAT . I 5 HOH A 126 9226 46 HOH WAT . I 5 HOH A 127 9227 69 HOH WAT . I 5 HOH A 128 9228 67 HOH WAT . I 5 HOH A 129 9229 108 HOH WAT . I 5 HOH A 130 9230 15 HOH WAT . I 5 HOH A 131 9231 96 HOH WAT . I 5 HOH A 132 9232 47 HOH WAT . I 5 HOH A 133 9233 12 HOH WAT . I 5 HOH A 134 9234 263 HOH WAT . I 5 HOH A 135 9235 117 HOH WAT . I 5 HOH A 136 9236 76 HOH WAT . I 5 HOH A 137 9237 132 HOH WAT . I 5 HOH A 138 9238 188 HOH WAT . I 5 HOH A 139 9239 36 HOH WAT . I 5 HOH A 140 9240 49 HOH WAT . I 5 HOH A 141 9241 73 HOH WAT . I 5 HOH A 142 9242 122 HOH WAT . I 5 HOH A 143 9243 40 HOH WAT . I 5 HOH A 144 9244 89 HOH WAT . I 5 HOH A 145 9245 220 HOH WAT . I 5 HOH A 146 9246 27 HOH WAT . I 5 HOH A 147 9247 83 HOH WAT . I 5 HOH A 148 9248 130 HOH WAT . I 5 HOH A 149 9249 94 HOH WAT . I 5 HOH A 150 9250 34 HOH WAT . I 5 HOH A 151 9251 43 HOH WAT . I 5 HOH A 152 9252 131 HOH WAT . I 5 HOH A 153 9253 90 HOH WAT . I 5 HOH A 154 9254 13 HOH WAT . I 5 HOH A 155 9255 165 HOH WAT . I 5 HOH A 156 9256 267 HOH WAT . I 5 HOH A 157 9257 16 HOH WAT . I 5 HOH A 158 9258 115 HOH WAT . I 5 HOH A 159 9259 109 HOH WAT . I 5 HOH A 160 9260 80 HOH WAT . I 5 HOH A 161 9261 232 HOH WAT . I 5 HOH A 162 9262 31 HOH WAT . I 5 HOH A 163 9263 118 HOH WAT . I 5 HOH A 164 9264 153 HOH WAT . I 5 HOH A 165 9265 253 HOH WAT . I 5 HOH A 166 9266 251 HOH WAT . I 5 HOH A 167 9267 162 HOH WAT . I 5 HOH A 168 9268 110 HOH WAT . I 5 HOH A 169 9269 85 HOH WAT . I 5 HOH A 170 9270 148 HOH WAT . I 5 HOH A 171 9271 135 HOH WAT . I 5 HOH A 172 9272 54 HOH WAT . I 5 HOH A 173 9273 35 HOH WAT . I 5 HOH A 174 9274 102 HOH WAT . I 5 HOH A 175 9275 78 HOH WAT . I 5 HOH A 176 9276 208 HOH WAT . I 5 HOH A 177 9277 151 HOH WAT . I 5 HOH A 178 9278 157 HOH WAT . I 5 HOH A 179 9279 10 HOH WAT . I 5 HOH A 180 9280 106 HOH WAT . I 5 HOH A 181 9281 221 HOH WAT . I 5 HOH A 182 9282 273 HOH WAT . I 5 HOH A 183 9283 133 HOH WAT . I 5 HOH A 184 9284 42 HOH WAT . I 5 HOH A 185 9285 99 HOH WAT . I 5 HOH A 186 9286 39 HOH WAT . I 5 HOH A 187 9287 172 HOH WAT . I 5 HOH A 188 9288 250 HOH WAT . I 5 HOH A 189 9289 139 HOH WAT . I 5 HOH A 190 9290 254 HOH WAT . I 5 HOH A 191 9291 227 HOH WAT . I 5 HOH A 192 9292 155 HOH WAT . I 5 HOH A 193 9293 278 HOH WAT . I 5 HOH A 194 9294 206 HOH WAT . I 5 HOH A 195 9295 70 HOH WAT . I 5 HOH A 196 9296 236 HOH WAT . I 5 HOH A 197 9297 147 HOH WAT . I 5 HOH A 198 9298 149 HOH WAT . I 5 HOH A 199 9299 235 HOH WAT . I 5 HOH A 200 9300 33 HOH WAT . I 5 HOH A 201 9301 239 HOH WAT . I 5 HOH A 202 9302 123 HOH WAT . I 5 HOH A 203 9303 146 HOH WAT . I 5 HOH A 204 9304 264 HOH WAT . I 5 HOH A 205 9305 82 HOH WAT . I 5 HOH A 206 9306 164 HOH WAT . I 5 HOH A 207 9307 222 HOH WAT . I 5 HOH A 208 9308 95 HOH WAT . I 5 HOH A 209 9309 261 HOH WAT . I 5 HOH A 210 9310 154 HOH WAT . I 5 HOH A 211 9311 171 HOH WAT . I 5 HOH A 212 9312 211 HOH WAT . I 5 HOH A 213 9313 226 HOH WAT . I 5 HOH A 214 9314 143 HOH WAT . I 5 HOH A 215 9315 181 HOH WAT . I 5 HOH A 216 9316 249 HOH WAT . I 5 HOH A 217 9317 266 HOH WAT . I 5 HOH A 218 9318 213 HOH WAT . I 5 HOH A 219 9319 260 HOH WAT . I 5 HOH A 220 9320 187 HOH WAT . I 5 HOH A 221 9321 230 HOH WAT . I 5 HOH A 222 9322 125 HOH WAT . I 5 HOH A 223 9323 247 HOH WAT . I 5 HOH A 224 9324 243 HOH WAT . I 5 HOH A 225 9325 184 HOH WAT . I 5 HOH A 226 9326 190 HOH WAT . I 5 HOH A 227 9327 126 HOH WAT . I 5 HOH A 228 9328 223 HOH WAT . I 5 HOH A 229 9329 136 HOH WAT . I 5 HOH A 230 9330 134 HOH WAT . I 5 HOH A 231 9331 173 HOH WAT . I 5 HOH A 232 9332 168 HOH WAT . I 5 HOH A 233 9333 174 HOH WAT . I 5 HOH A 234 9334 91 HOH WAT . I 5 HOH A 235 9335 137 HOH WAT . I 5 HOH A 236 9336 252 HOH WAT . I 5 HOH A 237 9337 277 HOH WAT . I 5 HOH A 238 9338 100 HOH WAT . I 5 HOH A 239 9339 189 HOH WAT . I 5 HOH A 240 9340 274 HOH WAT . I 5 HOH A 241 9341 198 HOH WAT . I 5 HOH A 242 9342 192 HOH WAT . I 5 HOH A 243 9343 225 HOH WAT . I 5 HOH A 244 9344 229 HOH WAT . I 5 HOH A 245 9345 194 HOH WAT . I 5 HOH A 246 9346 186 HOH WAT . I 5 HOH A 247 9347 240 HOH WAT . I 5 HOH A 248 9348 144 HOH WAT . I 5 HOH A 249 9349 209 HOH WAT . I 5 HOH A 250 9350 265 HOH WAT . I 5 HOH A 251 9351 245 HOH WAT . I 5 HOH A 252 9352 191 HOH WAT . I 5 HOH A 253 9353 195 HOH WAT . I 5 HOH A 254 9354 205 HOH WAT . I 5 HOH A 255 9355 270 HOH WAT . I 5 HOH A 256 9356 238 HOH WAT . I 5 HOH A 257 9357 224 HOH WAT . I 5 HOH A 258 9358 234 HOH WAT . I 5 HOH A 259 9359 219 HOH WAT . I 5 HOH A 260 9360 216 HOH WAT . I 5 HOH A 261 9361 207 HOH WAT . I 5 HOH A 262 9362 202 HOH WAT . I 5 HOH A 263 9363 201 HOH WAT . I 5 HOH A 264 9364 204 HOH WAT . I 5 HOH A 265 9365 193 HOH WAT . I 5 HOH A 266 9366 279 HOH WAT . I 5 HOH A 267 9367 200 HOH WAT . I 5 HOH A 268 9368 199 HOH WAT . I 5 HOH A 269 9369 259 HOH WAT . I 5 HOH A 270 9370 214 HOH WAT . I 5 HOH A 271 9371 218 HOH WAT . I 5 HOH A 272 9372 269 HOH WAT . I 5 HOH A 273 9373 241 HOH WAT . I 5 HOH A 274 9374 203 HOH WAT . I 5 HOH A 275 9375 257 HOH WAT . I 5 HOH A 276 9376 276 HOH WAT . I 5 HOH A 277 9377 231 HOH WAT . I 5 HOH A 278 9378 233 HOH WAT . I 5 HOH A 279 9379 212 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 GOL . . . H 4 -11.982 23.313 -22.816 1 37.5 ? C1 GOL 9007 A 1 HETATM 2 O O1 GOL . . . H 4 -11.817 21.955 -23.204 1 40.21 ? O1 GOL 9007 A 1 HETATM 3 C C2 GOL . . . H 4 -11.131 24.199 -23.717 1 36.35 ? C2 GOL 9007 A 1 HETATM 4 O O2 GOL . . . H 4 -11.865 24.503 -24.906 1 37.24 ? O2 GOL 9007 A 1 HETATM 5 C C3 GOL . . . H 4 -10.77 25.488 -22.979 1 35.89 ? C3 GOL 9007 A 1 HETATM 6 O O3 GOL . . . H 4 -9.842 25.192 -21.93 1 30.65 ? O3 GOL 9007 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 25 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 305 _model_server_stats.encode_time_ms 10 _model_server_stats.element_count 6 #