data_5UHG
#
_model_server_result.job_id            '_pwEIjpaSJgOz-3G419tWA' 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-15 23:55:12' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5uhg 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":1404}' 
#
_entry.id    5UHG 
#
_exptl.entry_id    5UHG 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              358.433 
_entity.id                          11 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5UHG 
_cell.length_a            151.434 
_cell.length_b            162.147 
_cell.length_c            194.316 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5UHG 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    octameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      8 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      11 
_struct_asym.id                             M 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 D SG CYS 975 D CYS 975 1_555 D SG CYS 978 D CYS 978 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? 
metalc ? metalc1 D SG CYS 60 D CYS 60 1_555 K ZN ZN . D ZN 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? 
metalc ? metalc2 D SG CYS 62 D CYS 62 1_555 K ZN ZN . D ZN 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? 
metalc ? metalc3 D SG CYS 75 D CYS 75 1_555 K ZN ZN . D ZN 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.3 ? 
metalc ? metalc4 D SG CYS 78 D CYS 78 1_555 K ZN ZN . D ZN 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? 
metalc ? metalc5 D OD1 ASP 535 D ASP 535 1_555 L MG MG . D MG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? 
metalc ? metalc6 D OD1 ASP 537 D ASP 537 1_555 L MG MG . D MG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? 
metalc ? metalc7 D OD2 ASP 537 D ASP 537 1_555 L MG MG . D MG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.997 ? 
metalc ? metalc8 D OD1 ASP 539 D ASP 539 1_555 L MG MG . D MG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? 
metalc ? metalc9 D SG CYS 891 D CYS 891 1_555 J ZN ZN . D ZN 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? 
metalc ? metalc10 D SG CYS 968 D CYS 968 1_555 J ZN ZN . D ZN 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc11 D SG CYS 975 D CYS 975 1_555 J ZN ZN . D ZN 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? 
metalc ? metalc12 D SG CYS 978 D CYS 978 1_555 J ZN ZN . D ZN 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog1 G N3 DT 15 H DT 15 1_555 H N1 DA 9 G DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 G O4 DT 15 H DT 15 1_555 H N6 DA 9 G DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog3 G N3 DC 16 H DC 16 1_555 H N2 DG 8 G DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog 'REVERSED WATSON-CRICK' hydrog4 G O2 DC 16 H DC 16 1_555 H N1 DG 8 G DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 G N1 DA 17 H DA 17 1_555 H N3 DT 7 G DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 G N6 DA 17 H DA 17 1_555 H O4 DT 7 G DT 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog7 G N3 DC 18 H DC 18 1_555 H N1 DG 6 G DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 G N4 DC 18 H DC 18 1_555 H O6 DG 6 G DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 G O2 DC 18 H DC 18 1_555 H N2 DG 6 G DG 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog10 G N1 DG 19 H DG 19 1_555 H N3 DC 5 G DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 G N2 DG 19 H DG 19 1_555 H O2 DC 5 G DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 G O6 DG 19 H DG 19 1_555 H N4 DC 5 G DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog13 G N1 DG 20 H DG 20 1_555 H N3 DC 4 G DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 G N2 DG 20 H DG 20 1_555 H O2 DC 4 G DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 G O6 DG 20 H DG 20 1_555 H N4 DC 4 G DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 G N1 DA 21 H DA 21 1_555 H N3 DT 3 G DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog17 G N6 DA 21 H DA 21 1_555 H O4 DT 3 G DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog18 G N3 DT 22 H DT 22 1_555 H N1 DA 2 G DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog19 G O4 DT 22 H DT 22 1_555 H N6 DA 2 G DA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog20 G N1 DG 23 H DG 23 1_555 H N3 DC 1 G DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog21 G N2 DG 23 H DG 23 1_555 H O2 DC 1 G DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog22 G O6 DG 23 H DG 23 1_555 H N4 DC 1 G DC 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'C23 H22 N2 O2' 
_chem_comp.formula_weight    358.433 
_chem_comp.id                88G 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              Nalpha-(benzenecarbonyl)-N-(2-methylphenyl)-D-phenylalaninamide 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
CAE CAH 88G doub 1 n y 
CAE CAI 88G sing 2 n y 
CAH CAO 88G sing 3 n y 
CAI CAP 88G doub 4 n y 
CAO CAY 88G doub 5 n y 
CAP CAY 88G sing 6 n y 
CAY CAU 88G sing 7 n n 
CAU N 88G sing 8 n n 
CAU OAB 88G doub 9 n n 
N CA 88G sing 10 n n 
O C 88G doub 11 n n 
CA CB 88G sing 12 n n 
CA C 88G sing 13 n n 
CB CG 88G sing 14 n n 
C NAS 88G sing 15 n n 
CAA CAW 88G sing 16 n n 
CAW CAL 88G doub 17 n y 
CAW CAZ 88G sing 18 n y 
NAS CAZ 88G sing 19 n n 
CG CD1 88G doub 20 n y 
CG CD2 88G sing 21 n y 
CAL CAJ 88G sing 22 n y 
CAZ CAQ 88G doub 23 n y 
CD1 CE1 88G sing 24 n y 
CAJ CAK 88G doub 25 n y 
CAQ CAK 88G sing 26 n y 
CD2 CE2 88G doub 27 n y 
CE1 CZ 88G doub 28 n y 
CE2 CZ 88G sing 29 n y 
CAA H1 88G sing 30 n n 
CAA H2 88G sing 31 n n 
CAA H3 88G sing 32 n n 
CAL H4 88G sing 33 n n 
CAJ H5 88G sing 34 n n 
CAK H6 88G sing 35 n n 
CAQ H7 88G sing 36 n n 
NAS H8 88G sing 37 n n 
CA H9 88G sing 38 n n 
CB H10 88G sing 39 n n 
CB H11 88G sing 40 n n 
CD1 H12 88G sing 41 n n 
CE1 H13 88G sing 42 n n 
CZ H14 88G sing 43 n n 
CE2 H15 88G sing 44 n n 
CD2 H16 88G sing 45 n n 
N H17 88G sing 46 n n 
CAO H18 88G sing 47 n n 
CAH H19 88G sing 48 n n 
CAE H20 88G sing 49 n n 
CAI H21 88G sing 50 n n 
CAP H22 88G sing 51 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     5UHG 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.006604 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006167 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005146 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 8 RFP C 1 1201 2006 RFP RFP . 
J 9 ZN D 1 1401 2002 ZN ZN . 
K 9 ZN D 1 1402 2003 ZN ZN . 
L 10 MG D 1 1403 2004 MG MG . 
M 11 88G D 1 1404 2007 88G DRG . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C CAA 88G . . . M 11 334.368 346.104 210.266 1 41.84 ? CAA 88G 1404 D 1 
HETATM 2 C CAW 88G . . . M 11 333.576 344.963 210.41 1 34.38 ? CAW 88G 1404 D 1 
HETATM 3 C CAL 88G . . . M 11 332.221 345.083 210.714 1 31.27 ? CAL 88G 1404 D 1 
HETATM 4 C CAJ 88G . . . M 11 331.428 343.949 210.855 1 29.13 ? CAJ 88G 1404 D 1 
HETATM 5 C CAK 88G . . . M 11 331.99 342.687 210.691 1 27.43 ? CAK 88G 1404 D 1 
HETATM 6 C CAQ 88G . . . M 11 333.344 342.557 210.391 1 35.92 ? CAQ 88G 1404 D 1 
HETATM 7 C CAZ 88G . . . M 11 334.136 343.695 210.247 1 35.48 ? CAZ 88G 1404 D 1 
HETATM 8 N NAS 88G . . . M 11 335.448 343.662 209.953 1 37.81 ? NAS 88G 1404 D 1 
HETATM 9 C C 88G . . . M 11 335.87 342.952 208.88 1 35.25 ? C 88G 1404 D 1 
HETATM 10 O O 88G . . . M 11 335.138 342.318 208.122 1 34.44 ? O 88G 1404 D 1 
HETATM 11 C CA 88G . . . M 11 337.38 343.005 208.599 1 38.75 ? CA 88G 1404 D 1 
HETATM 12 C CB 88G . . . M 11 338.013 341.636 208.885 1 36.93 ? CB 88G 1404 D 1 
HETATM 13 C CG 88G . . . M 11 337.87 341.362 210.249 1 36.67 ? CG 88G 1404 D 1 
HETATM 14 C CD1 88G . . . M 11 336.859 340.504 210.687 1 32.96 ? CD1 88G 1404 D 1 
HETATM 15 C CE1 88G . . . M 11 336.714 340.239 212.049 1 34.67 ? CE1 88G 1404 D 1 
HETATM 16 C CZ 88G . . . M 11 337.574 340.814 212.982 1 36.45 ? CZ 88G 1404 D 1 
HETATM 17 C CE2 88G . . . M 11 338.583 341.666 212.537 1 40.5 ? CE2 88G 1404 D 1 
HETATM 18 C CD2 88G . . . M 11 338.736 341.944 211.177 1 39.25 ? CD2 88G 1404 D 1 
HETATM 19 N N 88G . . . M 11 337.603 343.41 207.194 1 40.09 ? N 88G 1404 D 1 
HETATM 20 C CAU 88G . . . M 11 337.284 344.65 206.765 1 40.52 ? CAU 88G 1404 D 1 
HETATM 21 O OAB 88G . . . M 11 336.802 345.514 207.496 1 43.28 ? OAB 88G 1404 D 1 
HETATM 22 C CAY 88G . . . M 11 337.546 344.911 205.418 1 37.61 ? CAY 88G 1404 D 1 
HETATM 23 C CAO 88G . . . M 11 338.152 343.922 204.645 1 33.9 ? CAO 88G 1404 D 1 
HETATM 24 C CAH 88G . . . M 11 338.42 344.182 203.3 1 34.08 ? CAH 88G 1404 D 1 
HETATM 25 C CAE 88G . . . M 11 338.083 345.401 202.714 1 33.68 ? CAE 88G 1404 D 1 
HETATM 26 C CAI 88G . . . M 11 337.474 346.388 203.484 1 35.57 ? CAI 88G 1404 D 1 
HETATM 27 C CAP 88G . . . M 11 337.212 346.14 204.835 1 40.12 ? CAP 88G 1404 D 1 
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