data_5ULU # _model_server_result.job_id wEDyeOI5HVeijeodIynJ0w _model_server_result.datetime_utc '2024-11-05 01:19:39' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5ulu # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":2306}' # _entry.id 5ULU # _exptl.entry_id 5ULU _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 98.62 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5ULU _cell.length_a 84.238 _cell.length_b 65.386 _cell.length_c 114.651 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5ULU _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE2 GLU 17 A GLU 1947 1_555 B CA CA . A CA 2301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc2 A OE1 GLU 17 A GLU 1947 1_555 C CA CA . A CA 2302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 75 A ASP 2005 1_555 B CA CA . A CA 2301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? metalc ? metalc4 A OE2 GLU 77 A GLU 2007 1_555 B CA CA . A CA 2301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc5 A OE1 GLU 77 A GLU 2007 1_555 C CA CA . A CA 2302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? metalc ? metalc6 A OE2 GLU 77 A GLU 2007 1_555 C CA CA . A CA 2302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 108 A ASP 2038 1_555 C CA CA . A CA 2302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc8 A O ASP 109 A ASP 2039 1_555 C CA CA . A CA 2302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASN 110 A ASN 2040 1_555 D CA CA . A CA 2303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 111 A ASP 2041 1_555 B CA CA . A CA 2301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.945 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 111 A ASP 2041 1_555 B CA CA . A CA 2301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 111 A ASP 2041 1_555 C CA CA . A CA 2302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? metalc ? metalc13 A O ASN 112 A ASN 2042 1_555 D CA CA . A CA 2303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? metalc ? metalc14 A OE2 GLU 127 A GLU 2057 1_555 E CA CA . A CA 2304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? metalc ? metalc15 A OE1 GLU 127 A GLU 2057 1_555 F CA CA . A CA 2305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASP 142 A ASP 2072 1_555 D CA CA . A CA 2303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? metalc ? metalc17 A OD2 ASP 142 A ASP 2072 1_555 D CA CA . A CA 2303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? metalc ? metalc18 A OD1 ASP 144 A ASP 2074 1_555 C CA CA . A CA 2302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc19 A OD2 ASP 144 A ASP 2074 1_555 D CA CA . A CA 2303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? metalc ? metalc20 A O ASN 148 A ASN 2078 1_555 D CA CA . A CA 2303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? metalc ? metalc21 A OD1 ASP 180 A ASP 2110 1_555 E CA CA . A CA 2304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? metalc ? metalc22 A OE2 GLU 182 A GLU 2112 1_555 E CA CA . A CA 2304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc23 A OE1 GLU 182 A GLU 2112 1_555 F CA CA . A CA 2305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? metalc ? metalc24 A OE2 GLU 182 A GLU 2112 1_555 F CA CA . A CA 2305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? metalc ? metalc25 A OD1 ASN 195 A ASN 2125 1_555 D CA CA . A CA 2303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc26 A OD1 ASP 213 A ASP 2143 1_555 F CA CA . A CA 2305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc27 A O ILE 214 A ILE 2144 1_555 F CA CA . A CA 2305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? metalc ? metalc28 A OD1 ASN 215 A ASN 2145 1_555 G CA CA . A CA 2306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? metalc ? metalc29 A OD1 ASP 216 A ASP 2146 1_555 E CA CA . A CA 2304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc30 A OD2 ASP 216 A ASP 2146 1_555 E CA CA . A CA 2304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc31 A OD1 ASP 216 A ASP 2146 1_555 F CA CA . A CA 2305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.612 ? metalc ? metalc32 A O SER 217 A SER 2147 1_555 G CA CA . A CA 2306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc33 A OD1 ASP 247 A ASP 2177 1_555 G CA CA . A CA 2306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.81 ? metalc ? metalc34 A OD2 ASP 247 A ASP 2177 1_555 G CA CA . A CA 2306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? metalc ? metalc35 A OD1 ASP 249 A ASP 2179 1_555 F CA CA . A CA 2305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc36 A OD2 ASP 249 A ASP 2179 1_555 G CA CA . A CA 2306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc37 A OD2 ASP 309 A ASP 2239 1_555 G CA CA . A CA 2306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? metalc ? metalc38 B CA CA . A CA 2301 1_555 H O HOH . A HOH 2403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? metalc ? metalc39 B CA CA . A CA 2301 1_555 H O HOH . A HOH 2404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 5ULU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.011871 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.0018 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.015294 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008822 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CA A 1 2301 2263 CA CA . C 2 CA A 1 2302 2264 CA CA . D 2 CA A 1 2303 2265 CA CA . E 2 CA A 1 2304 2266 CA CA . F 2 CA A 1 2305 2267 CA CA . G 2 CA A 1 2306 2268 CA CA . H 3 HOH A 1 2401 2271 HOH HOH . H 3 HOH A 2 2402 2274 HOH HOH . H 3 HOH A 3 2403 2272 HOH HOH . H 3 HOH A 4 2404 2273 HOH HOH . H 3 HOH A 5 2405 2270 HOH HOH . H 3 HOH A 6 2406 2275 HOH HOH . H 3 HOH A 7 2407 2269 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id G _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -20.268 _atom_site.Cartn_y 1.921 _atom_site.Cartn_z 37 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 91.58 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 2306 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 279 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #