data_5UO8
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_model_server_result.job_id            XJyu2HEt5j47K9d0gc34jA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-24 00:05:53' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5uo8 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":503}' 
#
_entry.id    5UO8 
#
_exptl.entry_id    5UO8 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              318.372 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            3-[(2-aminoquinolin-7-yl)methoxy]-5-[(methylamino)methyl]benzonitrile 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.74 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5UO8 
_cell.length_a            59.37 
_cell.length_b            152.74 
_cell.length_c            108.511 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5UO8 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,GA,HA 1 1 
C,D,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,IA,JA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 G N N 
? 4 O N N 
? 4 U N N 
? 4 CA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 54 A CYS 94 1_555 J ZN ZN . A ZN 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 59 A CYS 99 1_555 J ZN ZN . A ZN 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 144 A CYS 184 1_555 E FE HEM . A HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc4 H O3 BTB . A BTB 504 1_555 L GD GD . A GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.7 ? 
metalc ? metalc5 H O4 BTB . A BTB 504 1_555 L GD GD . A GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.737 ? 
metalc ? metalc6 H N BTB . A BTB 504 1_555 L GD GD . A GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.834 ? 
metalc ? metalc7 H O6 BTB . A BTB 504 1_555 L GD GD . A GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.78 ? 
metalc ? metalc8 H O8 BTB . A BTB 504 1_555 L GD GD . A GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? 
metalc ? metalc9 J ZN ZN . A ZN 506 1_555 B SG CYS 54 B CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc10 J ZN ZN . A ZN 506 1_555 B SG CYS 59 B CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? 
metalc ? metalc11 GA O HOH . A HOH 604 1_655 FA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc12 B SG CYS 144 B CYS 184 1_555 M FE HEM . B HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? 
metalc ? metalc13 B O THR 279 B THR 319 1_555 R GD GD . B GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.651 ? 
metalc ? metalc14 B OE1 GLU 281 B GLU 321 1_555 R GD GD . B GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? 
metalc ? metalc15 B OE2 GLU 281 B GLU 321 1_555 R GD GD . B GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? 
metalc ? metalc16 P O3 BTB . B BTB 504 1_555 R GD GD . B GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? 
metalc ? metalc17 P O4 BTB . B BTB 504 1_555 R GD GD . B GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.683 ? 
metalc ? metalc18 P N BTB . B BTB 504 1_555 R GD GD . B GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? 
metalc ? metalc19 P O6 BTB . B BTB 504 1_555 R GD GD . B GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? 
metalc ? metalc20 P O8 BTB . B BTB 504 1_555 R GD GD . B GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.609 ? 
metalc ? metalc21 C SG CYS 54 C CYS 94 1_555 X ZN ZN . C ZN 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc22 C SG CYS 59 C CYS 99 1_555 X ZN ZN . C ZN 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc23 C SG CYS 144 C CYS 184 1_555 S FE HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? 
metalc ? metalc24 V O3 BTB . C BTB 504 1_555 Z GD GD . C GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.709 ? 
metalc ? metalc25 V O4 BTB . C BTB 504 1_555 Z GD GD . C GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? 
metalc ? metalc26 V N BTB . C BTB 504 1_555 Z GD GD . C GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.7 ? 
metalc ? metalc27 V O6 BTB . C BTB 504 1_555 Z GD GD . C GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? 
metalc ? metalc28 V O8 BTB . C BTB 504 1_555 Z GD GD . C GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.771 ? 
metalc ? metalc29 X ZN ZN . C ZN 506 1_555 D SG CYS 54 D CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? 
metalc ? metalc30 X ZN ZN . C ZN 506 1_555 D SG CYS 59 D CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? 
metalc ? metalc31 D SG CYS 144 D CYS 184 1_555 AA FE HEM . D HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? 
metalc ? metalc32 D O THR 279 D THR 319 1_555 FA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? 
metalc ? metalc33 D OE1 GLU 281 D GLU 321 1_555 FA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.618 ? 
metalc ? metalc34 D OE2 GLU 281 D GLU 321 1_555 FA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.688 ? 
metalc ? metalc35 DA O3 BTB . D BTB 504 1_555 FA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? 
metalc ? metalc36 DA O4 BTB . D BTB 504 1_555 FA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? 
metalc ? metalc37 DA N BTB . D BTB 504 1_555 FA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.697 ? 
metalc ? metalc38 DA O6 BTB . D BTB 504 1_555 FA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.796 ? 
metalc ? metalc39 DA O8 BTB . D BTB 504 1_555 FA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? 
#
_chem_comp.formula           'C19 H18 N4 O' 
_chem_comp.formula_weight    318.372 
_chem_comp.id                8EV 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              3-[(2-aminoquinolin-7-yl)methoxy]-5-[(methylamino)methyl]benzonitrile 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C04 C03 8EV doub 1 n y 
C04 C05 8EV sing 2 n y 
C03 C02 8EV sing 3 n y 
C06 C05 8EV sing 4 n y 
C06 C07 8EV doub 5 n y 
C05 C10 8EV doub 6 n y 
C02 N02 8EV sing 7 n n 
C02 N01 8EV doub 8 n y 
N28 C27 8EV trip 9 n n 
C07 C08 8EV sing 10 n y 
C10 N01 8EV sing 11 n y 
C10 C09 8EV sing 12 n y 
C27 C23 8EV sing 13 n n 
C22 C23 8EV doub 14 n y 
C22 C21 8EV sing 15 n y 
C08 C09 8EV doub 16 n y 
C08 C11 8EV sing 17 n n 
O12 C21 8EV sing 18 n n 
O12 C11 8EV sing 19 n n 
C23 C24 8EV sing 20 n y 
C21 C26 8EV doub 21 n y 
C24 C25 8EV doub 22 n y 
C26 C25 8EV sing 23 n y 
C25 C29 8EV sing 24 n n 
C31 N30 8EV sing 25 n n 
C29 N30 8EV sing 26 n n 
C22 H1 8EV sing 27 n n 
C24 H2 8EV sing 28 n n 
C29 H3 8EV sing 29 n n 
C29 H4 8EV sing 30 n n 
N30 H5 8EV sing 31 n n 
C31 H7 8EV sing 32 n n 
C31 H8 8EV sing 33 n n 
C31 H9 8EV sing 34 n n 
C26 H10 8EV sing 35 n n 
C11 H11 8EV sing 36 n n 
C11 H12 8EV sing 37 n n 
C09 H13 8EV sing 38 n n 
C07 H14 8EV sing 39 n n 
C06 H15 8EV sing 40 n n 
C04 H16 8EV sing 41 n n 
C03 H17 8EV sing 42 n n 
N02 H18 8EV sing 43 n n 
N02 H19 8EV sing 44 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     5UO8 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.016844 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000218 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006547 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009216 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 HEM A 1 501 500 HEM HEM . 
F 3 H4B A 1 502 600 H4B BH4 . 
G 4 8EV A 1 503 800 8EV M23 . 
H 5 BTB A 1 504 870 BTB TRB . 
I 5 BTB A 1 505 871 BTB TRB . 
J 6 ZN A 1 506 900 ZN ZN . 
K 7 GOL A 1 507 880 GOL GOL . 
L 8 GD A 1 508 890 GD GD . 
M 2 HEM B 1 501 500 HEM HEM . 
N 3 H4B B 1 502 600 H4B BH4 . 
O 4 8EV B 1 503 800 8EV M23 . 
P 5 BTB B 1 504 870 BTB TRB . 
Q 5 BTB B 1 505 871 BTB TRB . 
R 8 GD B 1 506 890 GD GD . 
S 2 HEM C 1 501 500 HEM HEM . 
T 3 H4B C 1 502 600 H4B BH4 . 
U 4 8EV C 1 503 800 8EV M23 . 
V 5 BTB C 1 504 870 BTB TRB . 
W 5 BTB C 1 505 871 BTB TRB . 
X 6 ZN C 1 506 900 ZN ZN . 
Y 7 GOL C 1 507 880 GOL GOL . 
Z 8 GD C 1 508 890 GD GD . 
AA 2 HEM D 1 501 500 HEM HEM . 
BA 3 H4B D 1 502 600 H4B BH4 . 
CA 4 8EV D 1 503 800 8EV M23 . 
DA 5 BTB D 1 504 870 BTB TRB . 
EA 5 BTB D 1 505 871 BTB TRB . 
FA 8 GD D 1 506 890 GD GD . 
GA 9 HOH A 1 601 272 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 2 602 277 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 3 603 246 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 4 604 314 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 5 605 276 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 6 606 101 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 7 607 206 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 8 608 237 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 9 609 271 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 10 610 53 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 11 611 66 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 12 612 137 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 13 613 221 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 14 614 144 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 15 615 274 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 16 616 193 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 17 617 26 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 18 618 121 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 19 619 228 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 20 620 61 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 21 621 44 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 22 622 39 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 23 623 100 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 24 624 68 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 25 625 215 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 26 626 163 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 27 627 218 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 28 628 81 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 29 629 57 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 30 630 69 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 31 631 36 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 32 632 104 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 33 633 226 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 34 634 110 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 35 635 275 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 36 636 216 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 37 637 132 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 38 638 111 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 39 639 119 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 40 640 133 HOH HOH . 
GA 9 HOH A 41 641 156 HOH HOH . 
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HETATM 15 C C08 8EV . . . O 4 74.738 9.26 -159.776 1 50.88 ? C08 8EV 503 B 1 
HETATM 16 C C09 8EV . . . O 4 74.68 8.342 -160.809 1 42.49 ? C09 8EV 503 B 1 
HETATM 17 C C07 8EV . . . O 4 74.114 8.98 -158.567 1 39.73 ? C07 8EV 503 B 1 
HETATM 18 C C06 8EV . . . O 4 73.437 7.782 -158.386 1 31.01 ? C06 8EV 503 B 1 
HETATM 19 C C05 8EV . . . O 4 73.373 6.864 -159.429 1 38.47 ? C05 8EV 503 B 1 
HETATM 20 C C04 8EV . . . O 4 72.694 5.657 -159.29 1 39.92 ? C04 8EV 503 B 1 
HETATM 21 C C03 8EV . . . O 4 72.666 4.769 -160.366 1 40.75 ? C03 8EV 503 B 1 
HETATM 22 C C02 8EV . . . O 4 73.301 5.111 -161.561 1 32.11 ? C02 8EV 503 B 1 
HETATM 23 N N02 8EV . . . O 4 73.296 4.271 -162.628 1 33.25 ? N02 8EV 503 B 1 
HETATM 24 N N01 8EV . . . O 4 73.951 6.281 -161.664 1 35.83 ? N01 8EV 503 B 1 
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