data_5UOB
#
_model_server_result.job_id            z3z6Z_k52Z6xLYPdWj2qqA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-11 01:25:00' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5uob 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"LA","auth_seq_id":504}' 
#
_entry.id    5UOB 
#
_exptl.entry_id    5UOB 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              209.24 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    11 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.57 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5UOB 
_cell.length_a            57.534 
_cell.length_b            153.951 
_cell.length_c            109.828 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5UOB 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,RA,SA 1 1 
C,D,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,TA,UA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 H N N 
? 4 I N N 
? 4 S N N 
? 4 T N N 
? 4 U N N 
? 4 AA N N 
? 4 BA N N 
? 4 LA N N 
? 4 MA N N 
? 4 NA N N 
? 4 OA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 54 A CYS 94 1_555 J ZN ZN . A ZN 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 59 A CYS 99 1_555 J ZN ZN . A ZN 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 144 A CYS 184 1_555 E FE HEM . A HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 329 A ASP 369 1_555 K ZN ZN . A ZN 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? 
metalc ? metalc5 A OD2 ASP 344 A ASP 384 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.436 ? 
metalc ? metalc6 A NE2 HIS 421 A HIS 461 1_555 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? 
metalc ? metalc7 H O3 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.615 ? 
metalc ? metalc8 H O4 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.065 ? 
metalc ? metalc9 H N BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.472 ? 
metalc ? metalc10 H O6 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? 
metalc ? metalc11 J ZN ZN . A ZN 506 1_555 B SG CYS 54 B CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc12 J ZN ZN . A ZN 506 1_555 B SG CYS 59 B CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc13 K ZN ZN . A ZN 507 1_555 RA O HOH . A HOH 615 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? 
metalc ? metalc14 K ZN ZN . A ZN 507 1_555 RA O HOH . A HOH 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? 
metalc ? metalc15 K ZN ZN . A ZN 507 1_555 B NE2 HIS 421 B HIS 461 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? 
metalc ? metalc16 N GD GD . A GD 510 1_555 RA O HOH . A HOH 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.758 ? 
metalc ? metalc17 N GD GD . A GD 510 1_555 RA O HOH . A HOH 623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? 
metalc ? metalc18 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 RA O HOH . A HOH 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? 
metalc ? metalc19 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 B OD2 ASP 329 B ASP 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? 
metalc ? metalc20 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 SA O HOH . B HOH 622 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? 
metalc ? metalc21 RA O HOH . A HOH 602 1_655 PA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? 
metalc ? metalc22 RA O HOH . A HOH 624 1_655 PA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.904 ? 
metalc ? metalc23 B SG CYS 144 B CYS 184 1_555 P FE HEM . B HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? 
metalc ? metalc24 B O THR 279 B THR 319 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.717 ? 
metalc ? metalc25 B OE1 GLU 281 B GLU 321 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.745 ? 
metalc ? metalc26 B OE2 GLU 281 B GLU 321 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.418 ? 
metalc ? metalc27 S O3 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? 
metalc ? metalc28 S O4 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.741 ? 
metalc ? metalc29 S N BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.624 ? 
metalc ? metalc30 S O6 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? 
metalc ? metalc31 S O8 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.136 ? 
metalc ? metalc32 W GD GD . B GD 508 1_555 SA O HOH . B HOH 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc33 C SG CYS 54 C CYS 94 1_555 CA ZN ZN . C ZN 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? 
metalc ? metalc34 C SG CYS 59 C CYS 99 1_555 CA ZN ZN . C ZN 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc35 C SG CYS 144 C CYS 184 1_555 X FE HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? 
metalc ? metalc36 C OD1 ASP 329 C ASP 369 1_555 DA ZN ZN . C ZN 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc37 C OD2 ASP 329 C ASP 369 1_555 DA ZN ZN . C ZN 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? 
metalc ? metalc38 C NE2 HIS 421 C HIS 461 1_555 HA ZN ZN . C ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? 
metalc ? metalc39 AA O3 BTB . C BTB 504 1_555 GA GD GD . C GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? 
metalc ? metalc40 AA O4 BTB . C BTB 504 1_555 GA GD GD . C GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.948 ? 
metalc ? metalc41 AA N BTB . C BTB 504 1_555 GA GD GD . C GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.864 ? 
metalc ? metalc42 AA O8 BTB . C BTB 504 1_555 GA GD GD . C GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.204 ? 
metalc ? metalc43 CA ZN ZN . C ZN 506 1_555 D SG CYS 54 D CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? 
metalc ? metalc44 CA ZN ZN . C ZN 506 1_555 D SG CYS 59 D CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? 
metalc ? metalc45 DA ZN ZN . C ZN 507 1_555 TA O HOH . C HOH 620 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? 
metalc ? metalc46 DA ZN ZN . C ZN 507 1_555 TA O HOH . C HOH 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? 
metalc ? metalc47 DA ZN ZN . C ZN 507 1_555 D NE2 HIS 421 D HIS 461 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? 
metalc ? metalc48 GA GD GD . C GD 510 1_555 TA O HOH . C HOH 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.775 ? 
metalc ? metalc49 GA GD GD . C GD 510 1_555 TA O HOH . C HOH 628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.783 ? 
metalc ? metalc50 HA ZN ZN . C ZN 511 1_555 TA O HOH . C HOH 623 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? 
metalc ? metalc51 HA ZN ZN . C ZN 511 1_555 D OD1 ASP 329 D ASP 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? 
metalc ? metalc52 HA ZN ZN . C ZN 511 1_555 D OD2 ASP 329 D ASP 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? 
metalc ? metalc53 HA ZN ZN . C ZN 511 1_555 UA O HOH . D HOH 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? 
metalc ? metalc54 D SG CYS 144 D CYS 184 1_555 IA FE HEM . D HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc55 D O THR 279 D THR 319 1_555 PA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? 
metalc ? metalc56 D OE1 GLU 281 D GLU 321 1_555 PA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? 
metalc ? metalc57 D OE2 GLU 281 D GLU 321 1_555 PA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.467 ? 
metalc ? metalc58 LA O3 BTB . D BTB 504 1_555 PA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.919 ? 
metalc ? metalc59 LA O4 BTB . D BTB 504 1_555 PA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? 
metalc ? metalc60 LA N BTB . D BTB 504 1_555 PA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.872 ? 
metalc ? metalc61 LA O6 BTB . D BTB 504 1_555 PA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.96 ? 
metalc ? metalc62 LA O8 BTB . D BTB 504 1_555 PA GD GD . D GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.054 ? 
#
_chem_comp.formula           'C8 H19 N O5' 
_chem_comp.formula_weight    209.24 
_chem_comp.id                BTB 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'BIS-TRIS BUFFER' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 BTB sing 70 n n 
C1 C2 BTB sing 71 n n 
C1 H11 BTB sing 72 n n 
C1 H12 BTB sing 73 n n 
O1 HO1 BTB sing 74 n n 
C2 C3 BTB sing 75 n n 
C2 C4 BTB sing 76 n n 
C2 N BTB sing 77 n n 
C3 O3 BTB sing 78 n n 
C3 H31 BTB sing 79 n n 
C3 H32 BTB sing 80 n n 
O3 HO3 BTB sing 81 n n 
C4 O4 BTB sing 82 n n 
C4 H41 BTB sing 83 n n 
C4 H42 BTB sing 84 n n 
O4 HO4 BTB sing 85 n n 
N C5 BTB sing 86 n n 
N C7 BTB sing 87 n n 
C5 C6 BTB sing 88 n n 
C5 H51 BTB sing 89 n n 
C5 H52 BTB sing 90 n n 
C6 O6 BTB sing 91 n n 
C6 H61 BTB sing 92 n n 
C6 H62 BTB sing 93 n n 
O6 HO6 BTB sing 94 n n 
C7 C8 BTB sing 95 n n 
C7 H71 BTB sing 96 n n 
C7 H72 BTB sing 97 n n 
C8 O8 BTB sing 98 n n 
C8 H81 BTB sing 99 n n 
C8 H82 BTB sing 100 n n 
O8 HO8 BTB sing 101 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     5UOB 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.017381 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000174 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006496 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009106 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 HEM A 1 501 500 HEM HEM . 
F 3 M4R A 1 502 800 M4R M4R . 
G 3 M4R A 1 503 801 M4R M4R . 
H 4 BTB A 1 504 870 BTB TRB . 
I 4 BTB A 1 505 871 BTB TRB . 
J 5 ZN A 1 506 900 ZN ZN . 
K 5 ZN A 1 507 901 ZN ZN . 
L 6 GOL A 1 508 880 GOL GOL . 
M 7 CL A 1 509 885 CL CL . 
N 8 GD A 1 510 890 GD GD . 
O 5 ZN A 1 511 900 ZN ZN . 
P 2 HEM B 1 501 500 HEM HEM . 
Q 3 M4R B 1 502 800 M4R M4R . 
R 3 M4R B 1 503 801 M4R M4R . 
S 4 BTB B 1 504 870 BTB TRB . 
T 4 BTB B 1 505 871 BTB TRB . 
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