data_5UOC
#
_model_server_result.job_id            20W2ljDe5Xx_GDemLdUiaA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-24 09:08:40' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5uoc 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"JA","auth_seq_id":502}' 
#
_entry.id    5UOC 
#
_exptl.entry_id    5UOC 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              241.247 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            5,6,7,8-TETRAHYDROBIOPTERIN 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.62 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5UOC 
_cell.length_a            58.961 
_cell.length_b            153.504 
_cell.length_c            109.734 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5UOC 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,PA,QA 1 1 
C,D,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,RA,SA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 F N N 
? 3 Q N N 
? 3 Y N N 
? 3 JA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 54 A CYS 94 1_555 K ZN ZN . A ZN 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 59 A CYS 99 1_555 K ZN ZN . A ZN 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 144 A CYS 184 1_555 E FE HEM . A HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? 
metalc ? metalc4 A NE2 HIS 421 A HIS 461 1_555 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? 
metalc ? metalc5 H O3 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? 
metalc ? metalc6 H O4 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.321 ? 
metalc ? metalc7 H O8 BTB . A BTB 504 1_555 N GD GD . A GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.749 ? 
metalc ? metalc8 K ZN ZN . A ZN 507 1_555 B SG CYS 54 B CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.575 ? 
metalc ? metalc9 K ZN ZN . A ZN 507 1_555 B SG CYS 59 B CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
metalc ? metalc10 N GD GD . A GD 510 1_555 PA O HOH . A HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.717 ? 
metalc ? metalc11 N GD GD . A GD 510 1_555 PA O HOH . A HOH 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.75 ? 
metalc ? metalc12 N GD GD . A GD 510 1_555 PA O HOH . A HOH 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.75 ? 
metalc ? metalc13 N GD GD . A GD 510 1_555 PA O HOH . A HOH 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.751 ? 
metalc ? metalc14 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 B OD1 ASP 329 B ASP 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.122 ? 
metalc ? metalc15 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 B OD2 ASP 329 B ASP 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.005 ? 
metalc ? metalc16 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 QA O HOH . B HOH 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? 
metalc ? metalc17 O ZN ZN . A ZN 511 1_555 QA O HOH . B HOH 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? 
metalc ? metalc18 PA O HOH . A HOH 605 1_655 NA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.614 ? 
metalc ? metalc19 B SG CYS 144 B CYS 184 1_555 P FE HEM . B HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.324 ? 
metalc ? metalc20 B O THR 279 B THR 319 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? 
metalc ? metalc21 B OE1 GLU 281 B GLU 321 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? 
metalc ? metalc22 S O3 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc23 S O4 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? 
metalc ? metalc24 S N BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.836 ? 
metalc ? metalc25 S O6 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? 
metalc ? metalc26 S O8 BTB . B BTB 504 1_555 W GD GD . B GD 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.776 ? 
metalc ? metalc27 W GD GD . B GD 508 1_555 QA O HOH . B HOH 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? 
metalc ? metalc28 W GD GD . B GD 508 1_555 QA O HOH . B HOH 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? 
metalc ? metalc29 C SG CYS 54 C CYS 94 1_555 DA ZN ZN . C ZN 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? 
metalc ? metalc30 C SG CYS 59 C CYS 99 1_555 DA ZN ZN . C ZN 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? 
metalc ? metalc31 C SG CYS 144 C CYS 184 1_555 X FE HEM . C HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? 
metalc ? metalc32 C NE2 HIS 421 C HIS 461 1_555 HA ZN ZN . C ZN 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? 
metalc ? metalc33 AA O3 BTB . C BTB 504 1_555 GA GD GD . C GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? 
metalc ? metalc34 AA O4 BTB . C BTB 504 1_555 GA GD GD . C GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? 
metalc ? metalc35 AA N BTB . C BTB 504 1_555 GA GD GD . C GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.955 ? 
metalc ? metalc36 AA O6 BTB . C BTB 504 1_555 GA GD GD . C GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? 
metalc ? metalc37 AA O8 BTB . C BTB 504 1_555 GA GD GD . C GD 510 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.785 ? 
metalc ? metalc38 DA ZN ZN . C ZN 507 1_555 D SG CYS 54 D CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? 
metalc ? metalc39 DA ZN ZN . C ZN 507 1_555 D SG CYS 59 D CYS 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? 
metalc ? metalc40 GA GD GD . C GD 510 1_555 RA O HOH . C HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? 
metalc ? metalc41 GA GD GD . C GD 510 1_555 RA O HOH . C HOH 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? 
metalc ? metalc42 GA GD GD . C GD 510 1_555 RA O HOH . C HOH 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? 
metalc ? metalc43 HA ZN ZN . C ZN 511 1_555 D OD1 ASP 329 D ASP 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? 
metalc ? metalc44 HA ZN ZN . C ZN 511 1_555 D OD2 ASP 329 D ASP 369 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
metalc ? metalc45 HA ZN ZN . C ZN 511 1_555 SA O HOH . D HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? 
metalc ? metalc46 HA ZN ZN . C ZN 511 1_555 SA O HOH . D HOH 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? 
metalc ? metalc47 D SG CYS 144 D CYS 184 1_555 IA FE HEM . D HEM 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? 
metalc ? metalc48 D O THR 279 D THR 319 1_555 NA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.676 ? 
metalc ? metalc49 D OE1 GLU 281 D GLU 321 1_555 NA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? 
metalc ? metalc50 D OE2 GLU 281 D GLU 321 1_555 NA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? 
metalc ? metalc51 LA O3 BTB . D BTB 504 1_555 NA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? 
metalc ? metalc52 LA O4 BTB . D BTB 504 1_555 NA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.612 ? 
metalc ? metalc53 LA N BTB . D BTB 504 1_555 NA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.976 ? 
metalc ? metalc54 LA O6 BTB . D BTB 504 1_555 NA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? 
metalc ? metalc55 LA O8 BTB . D BTB 504 1_555 NA GD GD . D GD 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.811 ? 
metalc ? metalc56 NA GD GD . D GD 506 1_555 SA O HOH . D HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? 
#
_chem_comp.formula           'C9 H15 N5 O3' 
_chem_comp.formula_weight    241.247 
_chem_comp.id                H4B 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              5,6,7,8-TETRAHYDROBIOPTERIN 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
N1 C2 H4B doub 227 n y 
N1 C8A H4B sing 228 n y 
C2 N2 H4B sing 229 n n 
C2 N3 H4B sing 230 n y 
N2 HN21 H4B sing 231 n n 
N2 HN22 H4B sing 232 n n 
N3 C4 H4B sing 233 n y 
N3 HN3 H4B sing 234 n n 
C4 O4 H4B doub 235 n n 
C4 C4A H4B sing 236 n y 
C4A C8A H4B doub 237 n y 
C4A N5 H4B sing 238 n n 
C8A N8 H4B sing 239 n n 
N5 C6 H4B sing 240 n n 
N5 HN5 H4B sing 241 n n 
N8 C7 H4B sing 242 n n 
N8 HN8 H4B sing 243 n n 
C6 C7 H4B sing 244 n n 
C6 C9 H4B sing 245 n n 
C6 H6 H4B sing 246 n n 
C7 H71 H4B sing 247 n n 
C7 H72 H4B sing 248 n n 
C9 O9 H4B sing 249 n n 
C9 C10 H4B sing 250 n n 
C9 H9 H4B sing 251 n n 
O9 HO9 H4B sing 252 n n 
C10 C11 H4B sing 253 n n 
C10 O10 H4B sing 254 n n 
C10 H10 H4B sing 255 n n 
C11 H111 H4B sing 256 n n 
C11 H112 H4B sing 257 n n 
C11 H113 H4B sing 258 n n 
O10 HO0 H4B sing 259 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     5UOC 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.01696 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000185 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.006514 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009113 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 HEM A 1 501 500 HEM HEM . 
F 3 H4B A 1 502 600 H4B BH4 . 
G 4 8FD A 1 503 801 8FD M4S . 
H 5 BTB A 1 504 870 BTB TRB . 
I 5 BTB A 1 505 871 BTB TRB . 
J 5 BTB A 1 506 872 BTB TRB . 
K 6 ZN A 1 507 900 ZN ZN . 
L 7 GOL A 1 508 880 GOL GOL . 
M 8 CL A 1 509 885 CL CL . 
N 9 GD A 1 510 890 GD GD . 
O 6 ZN A 1 511 901 ZN ZN . 
P 2 HEM B 1 501 500 HEM HEM . 
Q 3 H4B B 1 502 600 H4B BH4 . 
R 4 8FD B 1 503 801 8FD M4S . 
S 5 BTB B 1 504 870 BTB TRB . 
T 5 BTB B 1 505 871 BTB TRB . 
U 5 BTB B 1 506 872 BTB TRB . 
V 8 CL B 1 507 885 CL CL . 
W 9 GD B 1 508 890 GD GD . 
X 2 HEM C 1 501 500 HEM HEM . 
Y 3 H4B C 1 502 600 H4B BH4 . 
Z 4 8FD C 1 503 801 8FD M4S . 
AA 5 BTB C 1 504 870 BTB TRB . 
BA 5 BTB C 1 505 871 BTB TRB . 
CA 5 BTB C 1 506 872 BTB TRB . 
DA 6 ZN C 1 507 900 ZN ZN . 
EA 7 GOL C 1 508 880 GOL GOL . 
FA 8 CL C 1 509 885 CL CL . 
GA 9 GD C 1 510 890 GD GD . 
HA 6 ZN C 1 511 901 ZN ZN . 
IA 2 HEM D 1 501 500 HEM HEM . 
JA 3 H4B D 1 502 600 H4B BH4 . 
KA 4 8FD D 1 503 801 8FD M4S . 
LA 5 BTB D 1 504 870 BTB TRB . 
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