data_5VPJ
#
_model_server_result.job_id            tKKpgRxoWQhkjXsR5aoPZA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-06-30 23:30:16' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5vpj 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"Q","auth_seq_id":201}' 
#
_entry.id    5VPJ 
#
_exptl.entry_id    5VPJ 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              35.453 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CHLORIDE ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    5 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          99.16 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5VPJ 
_cell.length_a            105.68 
_cell.length_b            96.358 
_cell.length_c            114.16 
_cell.Z_PDB               24 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5VPJ 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 3 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,M,N,S,T,U,V 1 1 
E,F,G,H,O,P,W,X,Y,Z 2 1 
I,J,K,L,Q,R,AA,BA,CA,DA 3 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 M N N 
? 2 O N N 
? 2 P N N 
? 2 Q N N 
? 2 R N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A C ARG 52 A ARG 49 1_555 A N MSE 53 A MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale2 A C MSE 53 A MSE 50 1_555 A N HIS 54 A HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale3 A C ARG 81 A ARG 78 1_555 A N MSE 82 A MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale4 A C MSE 82 A MSE 79 1_555 A N SER 83 A SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale5 A C THR 93 A THR 90 1_555 A N MSE 94 A MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale6 A C MSE 94 A MSE 91 1_555 A N GLY 95 A GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale7 B C ARG 52 B ARG 49 1_555 B N MSE 53 B MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale8 B C MSE 53 B MSE 50 1_555 B N HIS 54 B HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale9 B C ARG 81 B ARG 78 1_555 B N MSE 82 B MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale10 B C MSE 82 B MSE 79 1_555 B N SER 83 B SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale11 B C THR 93 B THR 90 1_555 B N MSE 94 B MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale12 B C MSE 94 B MSE 91 1_555 B N GLY 95 B GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale13 C C ARG 52 C ARG 49 1_555 C N MSE 53 C MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale14 C C MSE 53 C MSE 50 1_555 C N HIS 54 C HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale15 C C ARG 81 C ARG 78 1_555 C N MSE 82 C MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale16 C C MSE 82 C MSE 79 1_555 C N SER 83 C SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale17 C C THR 93 C THR 90 1_555 C N MSE 94 C MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale18 C C MSE 94 C MSE 91 1_555 C N GLY 95 C GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale19 D C MSE 4 D MSE 1 1_555 D N ARG 5 D ARG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale20 D C ARG 52 D ARG 49 1_555 D N MSE 53 D MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale21 D C MSE 53 D MSE 50 1_555 D N HIS 54 D HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale22 D C ARG 81 D ARG 78 1_555 D N MSE 82 D MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale23 D C MSE 82 D MSE 79 1_555 D N SER 83 D SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale24 D C THR 93 D THR 90 1_555 D N MSE 94 D MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale25 D C MSE 94 D MSE 91 1_555 D N GLY 95 D GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale26 E C ARG 52 E ARG 49 1_555 E N MSE 53 E MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale27 E C MSE 53 E MSE 50 1_555 E N HIS 54 E HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale28 E C ARG 81 E ARG 78 1_555 E N MSE 82 E MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale29 E C MSE 82 E MSE 79 1_555 E N SER 83 E SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale30 E C THR 93 E THR 90 1_555 E N MSE 94 E MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale31 E C MSE 94 E MSE 91 1_555 E N GLY 95 E GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale32 F C ARG 52 F ARG 49 1_555 F N MSE 53 F MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale33 F C MSE 53 F MSE 50 1_555 F N HIS 54 F HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale34 F C ARG 81 F ARG 78 1_555 F N MSE 82 F MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale35 F C MSE 82 F MSE 79 1_555 F N SER 83 F SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale36 F C THR 93 F THR 90 1_555 F N MSE 94 F MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale37 F C MSE 94 F MSE 91 1_555 F N GLY 95 F GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale38 G C ARG 52 G ARG 49 1_555 G N MSE 53 G MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale39 G C MSE 53 G MSE 50 1_555 G N HIS 54 G HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale40 G C ARG 81 G ARG 78 1_555 G N MSE 82 G MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale41 G C MSE 82 G MSE 79 1_555 G N SER 83 G SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale42 G C THR 93 G THR 90 1_555 G N MSE 94 G MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale43 G C MSE 94 G MSE 91 1_555 G N GLY 95 G GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale44 H C ARG 52 H ARG 49 1_555 H N MSE 53 H MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale45 H C MSE 53 H MSE 50 1_555 H N HIS 54 H HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale46 H C ARG 81 H ARG 78 1_555 H N MSE 82 H MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale47 H C MSE 82 H MSE 79 1_555 H N SER 83 H SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale48 H C THR 93 H THR 90 1_555 H N MSE 94 H MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale49 H C MSE 94 H MSE 91 1_555 H N GLY 95 H GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale50 I C ARG 52 I ARG 49 1_555 I N MSE 53 I MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale51 I C MSE 53 I MSE 50 1_555 I N HIS 54 I HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale52 I C ARG 81 I ARG 78 1_555 I N MSE 82 I MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale53 I C MSE 82 I MSE 79 1_555 I N SER 83 I SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale54 I C THR 93 I THR 90 1_555 I N MSE 94 I MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale55 I C MSE 94 I MSE 91 1_555 I N GLY 95 I GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale56 J C ARG 52 J ARG 49 1_555 J N MSE 53 J MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale57 J C MSE 53 J MSE 50 1_555 J N HIS 54 J HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale58 J C ARG 81 J ARG 78 1_555 J N MSE 82 J MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale59 J C MSE 82 J MSE 79 1_555 J N SER 83 J SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale60 J C THR 93 J THR 90 1_555 J N MSE 94 J MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale61 J C MSE 94 J MSE 91 1_555 J N GLY 95 J GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale62 K C ARG 52 K ARG 49 1_555 K N MSE 53 K MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale63 K C MSE 53 K MSE 50 1_555 K N HIS 54 K HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale64 K C ARG 81 K ARG 78 1_555 K N MSE 82 K MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale65 K C MSE 82 K MSE 79 1_555 K N SER 83 K SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale66 K C THR 93 K THR 90 1_555 K N MSE 94 K MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale67 K C MSE 94 K MSE 91 1_555 K N GLY 95 K GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale68 L C MSE 4 L MSE 1 1_555 L N ARG 5 L ARG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale69 L C ARG 52 L ARG 49 1_555 L N MSE 53 L MSE 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale70 L C MSE 53 L MSE 50 1_555 L N HIS 54 L HIS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale71 L C ARG 81 L ARG 78 1_555 L N MSE 82 L MSE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale72 L C MSE 82 L MSE 79 1_555 L N SER 83 L SER 80 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale73 L C THR 93 L THR 90 1_555 L N MSE 94 L MSE 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale74 L C MSE 94 L MSE 91 1_555 L N GLY 95 L GLY 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
#
_chem_comp.formula           'Cl -1' 
_chem_comp.formula_weight    35.453 
_chem_comp.id                CL 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CHLORIDE ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     5VPJ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.009463 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001525 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010378 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.008873 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 2 CL A 1 201 2 CL CL . 
N 3 PG4 D 1 201 1 PG4 PG4 . 
O 2 CL G 1 201 1 CL CL . 
P 2 CL H 1 201 5 CL CL . 
Q 2 CL K 1 201 3 CL CL . 
R 2 CL K 1 202 4 CL CL . 
S 4 HOH A 1 301 151 HOH HOH . 
S 4 HOH A 2 302 65 HOH HOH . 
S 4 HOH A 3 303 19 HOH HOH . 
S 4 HOH A 4 304 130 HOH HOH . 
S 4 HOH A 5 305 54 HOH HOH . 
S 4 HOH A 6 306 128 HOH HOH . 
S 4 HOH A 7 307 12 HOH HOH . 
S 4 HOH A 8 308 144 HOH HOH . 
S 4 HOH A 9 309 110 HOH HOH . 
S 4 HOH A 10 310 153 HOH HOH . 
S 4 HOH A 11 311 58 HOH HOH . 
S 4 HOH A 12 312 209 HOH HOH . 
S 4 HOH A 13 313 39 HOH HOH . 
S 4 HOH A 14 314 158 HOH HOH . 
S 4 HOH A 15 315 133 HOH HOH . 
S 4 HOH A 16 316 25 HOH HOH . 
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