data_5VS2 # _model_server_result.job_id qg80EqsN3NII2OIyU7lLYg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 17:35:20' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5vs2 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":401}' # _entry.id 5VS2 # _exptl.entry_id 5VS2 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 482.168 _entity.id 7 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 107.28 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5VS2 _cell.length_a 50.94 _cell.length_b 80.49 _cell.length_c 55.66 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5VS2 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 7 _struct_asym.id H _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A O3' DA 6 T DA 6 1_555 A P 8OG 7 T 8OG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.582 ? covale ? covale2 A O3' 8OG 7 T 8OG 7 1_555 A P DG 8 T DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.604 ? metalc ? metalc1 B OP1 DC 9 P DC 9 1_555 F CA CA . P CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc2 B O3' DA 10 P DA 10 1_555 E CA CA . P CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc3 E CA CA . P CA 101 1_555 D OD1 ASP 190 A ASP 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.61 ? metalc ? metalc4 E CA CA . P CA 101 1_555 D OD2 ASP 190 A ASP 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc5 E CA CA . P CA 101 1_555 D OD1 ASP 192 A ASP 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? metalc ? metalc6 E CA CA . P CA 101 1_555 D OD2 ASP 256 A ASP 256 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc7 E CA CA . P CA 101 1_555 H O2A TTP . A TTP 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? metalc ? metalc8 E CA CA . P CA 101 1_555 N O HOH . A HOH 532 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc9 F CA CA . P CA 102 1_555 D O THR 101 A THR 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc10 F CA CA . P CA 102 1_555 D O VAL 103 A VAL 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.634 ? metalc ? metalc11 F CA CA . P CA 102 1_555 D O ILE 106 A ILE 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.718 ? metalc ? metalc12 F CA CA . P CA 102 1_555 N O HOH . A HOH 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? metalc ? metalc13 C OP1 DC 3 D DC 3 1_555 G NA NA . D NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc ? metalc14 G NA NA . D NA 101 1_555 D O LYS 60 A LYS 60 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? metalc ? metalc15 G NA NA . D NA 101 1_555 D O LEU 62 A LEU 62 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? metalc ? metalc16 G NA NA . D NA 101 1_555 D O VAL 65 A VAL 65 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc17 D O ASP 190 A ASP 190 1_555 I CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.961 ? metalc ? metalc18 D OD1 ASP 190 A ASP 190 1_555 I CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc19 D OD2 ASP 192 A ASP 192 1_555 I CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? metalc ? metalc20 D OE1 GLU 249 A GLU 249 1_555 J NA NA . A NA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? metalc ? metalc21 D OE2 GLU 249 A GLU 249 1_555 J NA NA . A NA 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? metalc ? metalc22 H O2A TTP . A TTP 401 1_555 I CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc23 H O2B TTP . A TTP 401 1_555 I CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? metalc ? metalc24 H O3G TTP . A TTP 401 1_555 I CA CA . A CA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc25 I CA CA . A CA 402 1_555 N O HOH . A HOH 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? metalc ? metalc26 J NA NA . A NA 403 1_555 N O HOH . A HOH 565 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc27 J NA NA . A NA 403 1_555 N O HOH . A HOH 584 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? metalc ? metalc28 J NA NA . A NA 403 1_555 N O HOH . A HOH 586 1_556 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? metalc ? metalc29 J NA NA . A NA 403 1_555 N O HOH . A HOH 600 1_556 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? metalc ? metalc30 J NA NA . A NA 403 1_555 N O HOH . A HOH 611 1_556 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.165 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N3 DC 1 T DC 1 1_555 C N1 DG 5 D DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N4 DC 1 T DC 1 1_555 C O6 DG 5 D DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O2 DC 1 T DC 1 1_555 C N2 DG 5 D DG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N3 DC 2 T DC 2 1_555 C N1 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N4 DC 2 T DC 2 1_555 C O6 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O2 DC 2 T DC 2 1_555 C N2 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N1 DG 3 T DG 3 1_555 C N3 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N2 DG 3 T DG 3 1_555 C O2 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O6 DG 3 T DG 3 1_555 C N4 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N1 DA 4 T DA 4 1_555 C N3 DT 2 D DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N6 DA 4 T DA 4 1_555 C O4 DT 2 D DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N3 DC 5 T DC 5 1_555 C N1 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N4 DC 5 T DC 5 1_555 C O6 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A O2 DC 5 T DC 5 1_555 C N2 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog '8OG-DA MISPAIR' hydrog15 A O6 8OG 7 T 8OG 7 1_555 B N6 DA 10 P DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N1 DG 8 T DG 8 1_555 B N3 DC 9 P DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N2 DG 8 T DG 8 1_555 B O2 DC 9 P DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A O6 DG 8 T DG 8 1_555 B N4 DC 9 P DC 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A N3 DC 9 T DC 9 1_555 B N1 DG 8 P DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N4 DC 9 T DC 9 1_555 B O6 DG 8 P DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A O2 DC 9 T DC 9 1_555 B N2 DG 8 P DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A N1 DG 10 T DG 10 1_555 B N3 DC 7 P DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N2 DG 10 T DG 10 1_555 B O2 DC 7 P DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A O6 DG 10 T DG 10 1_555 B N4 DC 7 P DC 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A N3 DC 11 T DC 11 1_555 B N1 DG 6 P DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A N4 DC 11 T DC 11 1_555 B O6 DG 6 P DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A O2 DC 11 T DC 11 1_555 B N2 DG 6 P DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A N1 DA 12 T DA 12 1_555 B N3 DT 5 P DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A N6 DA 12 T DA 12 1_555 B O4 DT 5 P DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A N3 DT 13 T DT 13 1_555 B N1 DA 4 P DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 A O4 DT 13 T DT 13 1_555 B N6 DA 4 P DA 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 A N3 DC 14 T DC 14 1_555 B N1 DG 3 P DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 A N4 DC 14 T DC 14 1_555 B O6 DG 3 P DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 A O2 DC 14 T DC 14 1_555 B N2 DG 3 P DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 A N1 DA 15 T DA 15 1_555 B N3 DT 2 P DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 A N6 DA 15 T DA 15 1_555 B O4 DT 2 P DT 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 A N1 DG 16 T DG 16 1_555 B N3 DC 1 P DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 A N2 DG 16 T DG 16 1_555 B O2 DC 1 P DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 A O6 DG 16 T DG 16 1_555 B N4 DC 1 P DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H17 N2 O14 P3' _chem_comp.formula_weight 482.168 _chem_comp.id TTP _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PA O1A TTP doub 523 n n PA O2A TTP sing 524 n n PA O3A TTP sing 525 n n PA O5' TTP sing 526 n n O2A HOA2 TTP sing 527 n n O3A PB TTP sing 528 n n PB O1B TTP doub 529 n n PB O2B TTP sing 530 n n PB O3B TTP sing 531 n n O2B HOB2 TTP sing 532 n n O3B PG TTP sing 533 n n PG O1G TTP doub 534 n n PG O2G TTP sing 535 n n PG O3G TTP sing 536 n n O2G HOG2 TTP sing 537 n n O3G HOG3 TTP sing 538 n n O5' C5' TTP sing 539 n n C5' C4' TTP sing 540 n n C5' "H5'1" TTP sing 541 n n C5' "H5'2" TTP sing 542 n n C4' O4' TTP sing 543 n n C4' C3' TTP sing 544 n n C4' H4' TTP sing 545 n n O4' C1' TTP sing 546 n n C3' O3' TTP sing 547 n n C3' C2' TTP sing 548 n n C3' H3' TTP sing 549 n n O3' HO3' TTP sing 550 n n C2' C1' TTP sing 551 n n C2' "H2'1" TTP sing 552 n n C2' "H2'2" TTP sing 553 n n C1' N1 TTP sing 554 n n C1' H1' TTP sing 555 n n N1 C2 TTP sing 556 n n N1 C6 TTP sing 557 n n C2 O2 TTP doub 558 n n C2 N3 TTP sing 559 n n N3 C4 TTP sing 560 n n N3 HN3 TTP sing 561 n n C4 O4 TTP doub 562 n n C4 C5 TTP sing 563 n n C5 C5M TTP sing 564 n n C5 C6 TTP doub 565 n n C5M HM51 TTP sing 566 n n C5M HM52 TTP sing 567 n n C5M HM53 TTP sing 568 n n C6 H6 TTP sing 569 n n # _atom_sites.entry_id 5VS2 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.019631 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.006107 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012424 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.018816 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 5 CA P 1 101 1 CA CA . F 5 CA P 1 102 3 CA CA . G 6 NA D 1 101 1 NA NA . H 7 TTP A 1 401 11 TTP TTP . I 5 CA A 1 402 2 CA CA . J 6 NA A 1 403 2 NA NA . K 8 HOH T 1 101 95 HOH HOH . K 8 HOH T 2 102 111 HOH HOH . K 8 HOH T 3 103 89 HOH HOH . K 8 HOH T 4 104 122 HOH HOH . K 8 HOH T 5 105 130 HOH HOH . K 8 HOH T 6 106 121 HOH HOH . K 8 HOH T 7 107 90 HOH HOH . K 8 HOH T 8 108 91 HOH HOH . K 8 HOH T 9 109 16 HOH HOH . K 8 HOH T 10 110 123 HOH HOH . K 8 HOH T 11 111 78 HOH HOH . K 8 HOH T 12 112 92 HOH HOH . K 8 HOH T 13 113 96 HOH HOH . K 8 HOH T 14 114 136 HOH HOH . K 8 HOH T 15 115 79 HOH HOH . L 8 HOH P 1 201 100 HOH HOH . L 8 HOH P 2 202 85 HOH HOH . L 8 HOH P 3 203 94 HOH HOH . L 8 HOH P 4 204 93 HOH HOH . L 8 HOH P 5 205 144 HOH HOH . L 8 HOH P 6 206 137 HOH HOH . M 8 HOH D 1 201 101 HOH HOH . N 8 HOH A 1 501 15 HOH HOH . N 8 HOH A 2 502 129 HOH HOH . N 8 HOH A 3 503 30 HOH HOH . N 8 HOH A 4 504 117 HOH HOH . N 8 HOH A 5 505 60 HOH HOH . N 8 HOH A 6 506 40 HOH HOH . N 8 HOH A 7 507 142 HOH HOH . N 8 HOH A 8 508 51 HOH HOH . N 8 HOH A 9 509 11 HOH HOH . N 8 HOH A 10 510 45 HOH HOH . N 8 HOH A 11 511 3 HOH HOH . N 8 HOH A 12 512 24 HOH HOH . N 8 HOH A 13 513 62 HOH HOH . N 8 HOH A 14 514 115 HOH HOH . N 8 HOH A 15 515 39 HOH HOH . N 8 HOH A 16 516 56 HOH HOH . N 8 HOH A 17 517 34 HOH HOH . N 8 HOH A 18 518 71 HOH HOH . N 8 HOH A 19 519 28 HOH HOH . N 8 HOH A 20 520 120 HOH HOH . N 8 HOH A 21 521 76 HOH HOH . N 8 HOH A 22 522 82 HOH HOH . N 8 HOH A 23 523 73 HOH HOH . N 8 HOH A 24 524 114 HOH HOH . N 8 HOH A 25 525 83 HOH HOH . N 8 HOH A 26 526 12 HOH HOH . N 8 HOH A 27 527 14 HOH HOH . N 8 HOH A 28 528 126 HOH HOH . N 8 HOH A 29 529 106 HOH HOH . N 8 HOH A 30 530 58 HOH HOH . N 8 HOH A 31 531 138 HOH HOH . N 8 HOH A 32 532 1 HOH HOH . N 8 HOH A 33 533 47 HOH HOH . N 8 HOH A 34 534 80 HOH HOH . N 8 HOH A 35 535 22 HOH HOH . N 8 HOH A 36 536 63 HOH HOH . N 8 HOH A 37 537 124 HOH HOH . N 8 HOH A 38 538 146 HOH HOH . N 8 HOH A 39 539 75 HOH HOH . N 8 HOH A 40 540 6 HOH HOH . N 8 HOH A 41 541 125 HOH HOH . N 8 HOH A 42 542 81 HOH HOH . N 8 HOH A 43 543 70 HOH HOH . N 8 HOH A 44 544 18 HOH HOH . N 8 HOH A 45 545 25 HOH HOH . N 8 HOH A 46 546 74 HOH HOH . N 8 HOH A 47 547 31 HOH HOH . N 8 HOH A 48 548 132 HOH HOH . N 8 HOH A 49 549 59 HOH HOH . N 8 HOH A 50 550 29 HOH HOH . N 8 HOH A 51 551 54 HOH HOH . N 8 HOH A 52 552 42 HOH HOH . N 8 HOH A 53 553 36 HOH HOH . N 8 HOH A 54 554 61 HOH HOH . N 8 HOH A 55 555 88 HOH HOH . N 8 HOH A 56 556 50 HOH HOH . N 8 HOH A 57 557 17 HOH HOH . N 8 HOH A 58 558 55 HOH HOH . N 8 HOH A 59 559 35 HOH HOH . N 8 HOH A 60 560 128 HOH HOH . N 8 HOH A 61 561 131 HOH HOH . N 8 HOH A 62 562 48 HOH HOH . N 8 HOH A 63 563 33 HOH HOH . N 8 HOH A 64 564 21 HOH HOH . N 8 HOH A 65 565 66 HOH HOH . N 8 HOH A 66 566 145 HOH HOH . N 8 HOH A 67 567 57 HOH HOH . N 8 HOH A 68 568 69 HOH HOH . N 8 HOH A 69 569 52 HOH HOH . N 8 HOH A 70 570 32 HOH HOH . N 8 HOH A 71 571 98 HOH HOH . N 8 HOH A 72 572 26 HOH HOH . N 8 HOH A 73 573 116 HOH HOH . N 8 HOH A 74 574 135 HOH HOH . N 8 HOH A 75 575 84 HOH HOH . N 8 HOH A 76 576 103 HOH HOH . N 8 HOH A 77 577 5 HOH HOH . N 8 HOH A 78 578 49 HOH HOH . N 8 HOH A 79 579 72 HOH HOH . N 8 HOH A 80 580 53 HOH HOH . N 8 HOH A 81 581 139 HOH HOH . N 8 HOH A 82 582 2 HOH HOH . N 8 HOH A 83 583 105 HOH HOH . N 8 HOH A 84 584 65 HOH HOH . N 8 HOH A 85 585 4 HOH HOH . N 8 HOH A 86 586 86 HOH HOH . N 8 HOH A 87 587 68 HOH HOH . N 8 HOH A 88 588 107 HOH HOH . N 8 HOH A 89 589 77 HOH HOH . N 8 HOH A 90 590 19 HOH HOH . N 8 HOH A 91 591 37 HOH HOH . N 8 HOH A 92 592 10 HOH HOH . N 8 HOH A 93 593 113 HOH HOH . N 8 HOH A 94 594 20 HOH HOH . N 8 HOH A 95 595 102 HOH HOH . N 8 HOH A 96 596 141 HOH HOH . N 8 HOH A 97 597 104 HOH HOH . N 8 HOH A 98 598 13 HOH HOH . N 8 HOH A 99 599 140 HOH HOH . N 8 HOH A 100 600 64 HOH HOH . N 8 HOH A 101 601 43 HOH HOH . N 8 HOH A 102 602 27 HOH HOH . N 8 HOH A 103 603 7 HOH HOH . N 8 HOH A 104 604 108 HOH HOH . N 8 HOH A 105 605 44 HOH HOH . N 8 HOH A 106 606 143 HOH HOH . N 8 HOH A 107 607 87 HOH HOH . N 8 HOH A 108 608 118 HOH HOH . N 8 HOH A 109 609 8 HOH HOH . N 8 HOH A 110 610 38 HOH HOH . N 8 HOH A 111 611 67 HOH HOH . N 8 HOH A 112 612 110 HOH HOH . N 8 HOH A 113 613 127 HOH HOH . N 8 HOH A 114 614 147 HOH HOH . N 8 HOH A 115 615 119 HOH HOH . N 8 HOH A 116 616 112 HOH HOH . N 8 HOH A 117 617 46 HOH HOH . N 8 HOH A 118 618 133 HOH HOH . N 8 HOH A 119 619 97 HOH HOH . N 8 HOH A 120 620 23 HOH HOH . N 8 HOH A 121 621 41 HOH HOH . N 8 HOH A 122 622 99 HOH HOH . N 8 HOH A 123 623 109 HOH HOH . N 8 HOH A 124 624 9 HOH HOH . N 8 HOH A 125 625 134 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PA TTP . . . H 7 89.795 5.737 68.587 1 14.42 ? PA TTP 401 A 1 HETATM 2 O O1A TTP . . . H 7 91.275 5.759 69.035 1 14.9 ? O1A TTP 401 A 1 HETATM 3 O O2A TTP . . . H 7 88.664 5.884 69.535 1 13.74 ? O2A TTP 401 A 1 HETATM 4 O O3A TTP . . . H 7 89.715 4.343 67.761 1 15.86 ? O3A TTP 401 A 1 HETATM 5 P PB TTP . . . H 7 88.608 3.176 67.533 1 16.45 ? PB TTP 401 A 1 HETATM 6 O O1B TTP . . . H 7 88.771 2.798 66.067 1 15.22 ? O1B TTP 401 A 1 HETATM 7 O O2B TTP . . . H 7 87.208 3.584 67.901 1 15.96 ? O2B TTP 401 A 1 HETATM 8 O O3B TTP . . . H 7 89.182 2.001 68.451 1 20.88 ? O3B TTP 401 A 1 HETATM 9 P PG TTP . . . H 7 88.833 1.585 70.013 1 33.66 ? PG TTP 401 A 1 HETATM 10 O O1G TTP . . . H 7 87.84 0.408 69.955 1 24.19 ? O1G TTP 401 A 1 HETATM 11 O O2G TTP . . . H 7 90.221 1.112 70.5 1 30.84 ? O2G TTP 401 A 1 HETATM 12 O O3G TTP . . . H 7 88.343 2.861 70.781 1 28.41 ? O3G TTP 401 A 1 HETATM 13 O O5' TTP . . . H 7 89.708 6.889 67.419 1 12.73 ? O5' TTP 401 A 1 HETATM 14 C C5' TTP . . . H 7 88.499 7.242 66.77 1 12.34 ? C5' TTP 401 A 1 HETATM 15 C C4' TTP . . . H 7 88.685 7.314 65.256 1 12.37 ? C4' TTP 401 A 1 HETATM 16 O O4' TTP . . . H 7 89.51 8.442 64.94 1 11.51 ? O4' TTP 401 A 1 HETATM 17 C C3' TTP . . . H 7 89.351 6.111 64.558 1 12.41 ? C3' TTP 401 A 1 HETATM 18 O O3' TTP . . . H 7 88.535 4.939 64.32 1 11.77 ? O3' TTP 401 A 1 HETATM 19 C C2' TTP . . . H 7 89.777 6.837 63.295 1 11.74 ? C2' TTP 401 A 1 HETATM 20 C C1' TTP . . . H 7 90.229 8.199 63.777 1 11.47 ? C1' TTP 401 A 1 HETATM 21 N N1 TTP . . . H 7 91.651 8.229 64.152 1 11.41 ? N1 TTP 401 A 1 HETATM 22 C C2 TTP . . . H 7 92.549 8.751 63.223 1 11.63 ? C2 TTP 401 A 1 HETATM 23 O O2 TTP . . . H 7 92.098 9.12 62.103 1 12.03 ? O2 TTP 401 A 1 HETATM 24 N N3 TTP . . . H 7 93.864 8.79 63.506 1 11.36 ? N3 TTP 401 A 1 HETATM 25 C C4 TTP . . . H 7 94.329 8.38 64.672 1 11.26 ? C4 TTP 401 A 1 HETATM 26 O O4 TTP . . . H 7 95.532 8.396 64.934 1 11.24 ? O4 TTP 401 A 1 HETATM 27 C C5 TTP . . . H 7 93.418 7.838 65.7 1 11.88 ? C5 TTP 401 A 1 HETATM 28 C C5M TTP . . . H 7 93.984 7.36 67.047 1 11.56 ? C5M TTP 401 A 1 HETATM 29 C C6 TTP . . . H 7 92.088 7.796 65.352 1 11.47 ? C6 TTP 401 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 11 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 20 _model_server_stats.query_time_ms 314 _model_server_stats.encode_time_ms 8 _model_server_stats.element_count 29 #