data_5VZF # _model_server_result.job_id aWGvKZo_26qDq2hB3L1Rog _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 19:33:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5vzf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"L","auth_seq_id":701}' # _entry.id 5VZF # _exptl.entry_id 5VZF _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 482.168 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5VZF _cell.length_a 59.866 _cell.length_b 68.69 _cell.length_c 110.224 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5VZF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 E N N ? 5 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O THR 113 A THR 241 1_555 H NA NA . A NA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc2 A O ILE 115 A ILE 243 1_555 H NA NA . A NA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? metalc ? metalc3 A O VAL 118 A VAL 246 1_555 H NA NA . A NA 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 202 A ASP 330 1_555 F MG MG . A MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 202 A ASP 330 1_555 G MG MG . A MG 703 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 202 A ASP 330 1_555 I NA NA . A NA 705 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 3.079 ? metalc ? metalc7 A OD2 ASP 202 A ASP 330 1_555 I NA NA . A NA 705 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? metalc ? metalc8 A OD2 ASP 204 A ASP 332 1_555 F MG MG . A MG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 204 A ASP 332 1_555 G MG MG . A MG 703 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 204 A ASP 332 1_555 I NA NA . A NA 705 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 278 A ASP 418 1_555 G MG MG . A MG 703 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? metalc ? metalc12 A OD2 ASP 278 A ASP 418 1_555 I NA NA . A NA 705 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? metalc ? metalc13 E O2B TTP . A TTP 701 1_555 F MG MG . A MG 702 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? metalc ? metalc14 E O2G TTP . A TTP 701 1_555 F MG MG . A MG 702 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc15 E O1B TTP . A TTP 701 1_555 M MG MG . P MG 702 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.927 ? metalc ? metalc16 F MG MG . A MG 702 1_555 N O HOH . A HOH 898 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc17 F MG MG . A MG 702 1_555 C OP1 DT 5 P DT 5 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? metalc ? metalc18 F MG MG . A MG 702 1_555 L O2A TTP . P TTP 701 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.916 ? metalc ? metalc19 F MG MG . A MG 702 1_555 L O2B TTP . P TTP 701 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? metalc ? metalc20 F MG MG . A MG 702 1_555 L O3G TTP . P TTP 701 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? metalc ? metalc21 G MG MG . A MG 703 1_555 N O HOH . A HOH 864 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc22 G MG MG . A MG 703 1_555 L O2A TTP . P TTP 701 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc23 G MG MG . A MG 703 1_555 P O HOH . P HOH 818 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? metalc ? metalc24 H NA NA . A NA 704 1_555 N O HOH . A HOH 1029 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.17 ? metalc ? metalc25 H NA NA . A NA 704 1_555 C OP1 DT 3 P DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc26 H NA NA . A NA 704 1_555 C OP1 DT 5 P DT 5 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc27 H NA NA . A NA 704 1_555 P O HOH . P HOH 821 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? metalc ? metalc28 I NA NA . A NA 705 1_555 C O3' DA 4 P DA 4 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc29 I NA NA . A NA 705 1_555 C OP1 DT 5 P DT 5 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc30 N O HOH . A HOH 823 1_555 M MG MG . P MG 702 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? metalc ? metalc31 N O HOH . A HOH 906 1_555 M MG MG . P MG 702 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.997 ? metalc ? metalc32 K MG MG . T MG 101 1_555 O O HOH . T HOH 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.944 ? metalc ? metalc33 K MG MG . T MG 101 1_555 O O HOH . T HOH 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.097 ? metalc ? metalc34 K MG MG . T MG 101 1_555 O O HOH . T HOH 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? metalc ? metalc35 K MG MG . T MG 101 1_555 O O HOH . T HOH 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.145 ? metalc ? metalc36 C OP2 DT 5 P DT 5 1_555 M MG MG . P MG 702 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? metalc ? metalc37 M MG MG . P MG 702 1_555 P O HOH . P HOH 815 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? metalc ? metalc38 M MG MG . P MG 702 1_555 P O HOH . P HOH 819 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 B N3 DC 1 T DC 1 1_555 D N1 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 B N4 DC 1 T DC 1 1_555 D O6 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 B O2 DC 1 T DC 1 1_555 D N2 DG 4 D DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 B N1 DG 2 T DG 2 1_555 D N3 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 B N2 DG 2 T DG 2 1_555 D O2 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 B O6 DG 2 T DG 2 1_555 D N4 DC 3 D DC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 B N1 DG 3 T DG 3 1_555 D N3 DC 2 D DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 B N2 DG 3 T DG 3 1_555 D O2 DC 2 D DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 B O6 DG 3 T DG 3 1_555 D N4 DC 2 D DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 B N3 DC 4 T DC 4 1_555 D N1 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 B N4 DC 4 T DC 4 1_555 D O6 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 B O2 DC 4 T DC 4 1_555 D N2 DG 1 D DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 B N1 DA 5 T DA 5 1_555 C N3 DT 5 P DT 5 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 B N6 DA 5 T DA 5 1_555 C O4 DT 5 P DT 5 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 B N3 DT 6 T DT 6 1_555 C N1 DA 4 P DA 4 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 B N3 DT 6 T DT 6 1_555 C N1 DA 4 P DA 4 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 B O4 DT 6 T DT 6 1_555 C N6 DA 4 P DA 4 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog18 B N1 DA 7 T DA 7 1_555 C N3 DT 3 P DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog19 B N6 DA 7 T DA 7 1_555 C O4 DT 3 P DT 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog20 B N3 DC 8 T DC 8 1_555 C N1 DG 2 P DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog21 B N4 DC 8 T DC 8 1_555 C O6 DG 2 P DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog22 B O2 DC 8 T DC 8 1_555 C N2 DG 2 P DG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog23 B N1 DG 9 T DG 9 1_555 C N3 DC 1 P DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog24 B N2 DG 9 T DG 9 1_555 C O2 DC 1 P DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog25 B O6 DG 9 T DG 9 1_555 C N4 DC 1 P DC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'C10 H17 N2 O14 P3' _chem_comp.formula_weight 482.168 _chem_comp.id TTP _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PA O1A TTP doub 492 n n PA O2A TTP sing 493 n n PA O3A TTP sing 494 n n PA O5' TTP sing 495 n n O2A HOA2 TTP sing 496 n n O3A PB TTP sing 497 n n PB O1B TTP doub 498 n n PB O2B TTP sing 499 n n PB O3B TTP sing 500 n n O2B HOB2 TTP sing 501 n n O3B PG TTP sing 502 n n PG O1G TTP doub 503 n n PG O2G TTP sing 504 n n PG O3G TTP sing 505 n n O2G HOG2 TTP sing 506 n n O3G HOG3 TTP sing 507 n n O5' C5' TTP sing 508 n n C5' C4' TTP sing 509 n n C5' "H5'1" TTP sing 510 n n C5' "H5'2" TTP sing 511 n n C4' O4' TTP sing 512 n n C4' C3' TTP sing 513 n n C4' H4' TTP sing 514 n n O4' C1' TTP sing 515 n n C3' O3' TTP sing 516 n n C3' C2' TTP sing 517 n n C3' H3' TTP sing 518 n n O3' HO3' TTP sing 519 n n C2' C1' TTP sing 520 n n C2' "H2'1" TTP sing 521 n n C2' "H2'2" TTP sing 522 n n C1' N1 TTP sing 523 n n C1' H1' TTP sing 524 n n N1 C2 TTP sing 525 n n N1 C6 TTP sing 526 n n C2 O2 TTP doub 527 n n C2 N3 TTP sing 528 n n N3 C4 TTP sing 529 n n N3 HN3 TTP sing 530 n n C4 O4 TTP doub 531 n n C4 C5 TTP sing 532 n n C5 C5M TTP sing 533 n n C5 C6 TTP doub 534 n n C5M HM51 TTP sing 535 n n C5M HM52 TTP sing 536 n n C5M HM53 TTP sing 537 n n C6 H6 TTP sing 538 n n # _atom_sites.entry_id 5VZF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.016704 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014558 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009072 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 5 TTP A 1 701 701 TTP TTP . F 6 MG A 1 702 1 MG MG . G 6 MG A 1 703 2 MG MG . H 7 NA A 1 704 5 NA NA . I 7 NA A 1 705 6 NA NA . J 8 EDO A 1 706 1 EDO EDO . K 6 MG T 1 101 4 MG MG . L 5 TTP P 1 701 701 TTP TTP . M 6 MG P 1 702 3 MG MG . N 9 HOH A 1 801 108 HOH HOH . N 9 HOH A 2 802 269 HOH HOH . N 9 HOH A 3 803 454 HOH HOH . N 9 HOH A 4 804 152 HOH HOH . N 9 HOH A 5 805 241 HOH HOH . N 9 HOH A 6 806 368 HOH HOH . N 9 HOH A 7 807 468 HOH HOH . N 9 HOH A 8 808 42 HOH HOH . N 9 HOH A 9 809 115 HOH HOH . N 9 HOH A 10 810 191 HOH HOH . N 9 HOH A 11 811 275 HOH HOH . N 9 HOH A 12 812 207 HOH HOH . N 9 HOH A 13 813 208 HOH HOH . N 9 HOH A 14 814 225 HOH HOH . N 9 HOH A 15 815 4 HOH HOH . N 9 HOH A 16 816 273 HOH HOH . N 9 HOH A 17 817 317 HOH HOH . N 9 HOH A 18 818 12 HOH HOH . N 9 HOH A 19 819 292 HOH HOH . N 9 HOH A 20 820 465 HOH HOH . N 9 HOH A 21 821 57 HOH HOH . N 9 HOH A 22 822 103 HOH HOH . N 9 HOH A 23 823 448 HOH HOH . N 9 HOH A 24 824 60 HOH HOH . N 9 HOH A 25 825 298 HOH HOH . N 9 HOH A 26 826 136 HOH HOH . N 9 HOH A 27 827 68 HOH HOH . N 9 HOH A 28 828 52 HOH HOH . N 9 HOH A 29 829 84 HOH HOH . N 9 HOH A 30 830 417 HOH HOH . N 9 HOH A 31 831 189 HOH HOH . N 9 HOH A 32 832 370 HOH HOH . N 9 HOH A 33 833 91 HOH HOH . N 9 HOH A 34 834 250 HOH HOH . N 9 HOH A 35 835 69 HOH HOH . N 9 HOH A 36 836 23 HOH HOH . N 9 HOH A 37 837 31 HOH HOH . N 9 HOH A 38 838 133 HOH HOH . N 9 HOH A 39 839 471 HOH HOH . N 9 HOH A 40 840 125 HOH HOH . N 9 HOH A 41 841 121 HOH HOH . N 9 HOH A 42 842 323 HOH HOH . N 9 HOH A 43 843 212 HOH HOH . N 9 HOH A 44 844 260 HOH HOH . N 9 HOH A 45 845 359 HOH HOH . N 9 HOH A 46 846 20 HOH HOH . N 9 HOH A 47 847 178 HOH HOH . N 9 HOH A 48 848 453 HOH HOH . N 9 HOH A 49 849 263 HOH HOH . N 9 HOH A 50 850 25 HOH HOH . N 9 HOH A 51 851 376 HOH HOH . N 9 HOH A 52 852 205 HOH HOH . N 9 HOH A 53 853 229 HOH HOH . N 9 HOH A 54 854 41 HOH HOH . N 9 HOH A 55 855 93 HOH HOH . N 9 HOH A 56 856 22 HOH HOH . N 9 HOH A 57 857 73 HOH HOH . N 9 HOH A 58 858 11 HOH HOH . N 9 HOH A 59 859 17 HOH HOH . N 9 HOH A 60 860 122 HOH HOH . N 9 HOH A 61 861 412 HOH HOH . N 9 HOH A 62 862 112 HOH HOH . N 9 HOH A 63 863 354 HOH HOH . N 9 HOH A 64 864 479 HOH HOH . N 9 HOH A 65 865 400 HOH HOH . N 9 HOH A 66 866 63 HOH HOH . N 9 HOH A 67 867 62 HOH HOH . N 9 HOH A 68 868 101 HOH HOH . N 9 HOH A 69 869 296 HOH HOH . N 9 HOH A 70 870 194 HOH HOH . N 9 HOH A 71 871 154 HOH HOH . N 9 HOH A 72 872 50 HOH HOH . N 9 HOH A 73 873 201 HOH HOH . N 9 HOH A 74 874 2 HOH HOH . N 9 HOH A 75 875 393 HOH HOH . N 9 HOH A 76 876 36 HOH HOH . N 9 HOH A 77 877 219 HOH HOH . N 9 HOH A 78 878 161 HOH HOH . N 9 HOH A 79 879 149 HOH HOH . N 9 HOH A 80 880 291 HOH HOH . N 9 HOH A 81 881 339 HOH HOH . N 9 HOH A 82 882 65 HOH HOH . N 9 HOH A 83 883 18 HOH HOH . N 9 HOH A 84 884 5 HOH HOH . N 9 HOH A 85 885 89 HOH HOH . N 9 HOH A 86 886 45 HOH HOH . N 9 HOH A 87 887 15 HOH HOH . N 9 HOH A 88 888 330 HOH HOH . N 9 HOH A 89 889 83 HOH HOH . N 9 HOH A 90 890 24 HOH HOH . N 9 HOH A 91 891 28 HOH HOH . N 9 HOH A 92 892 48 HOH HOH . N 9 HOH A 93 893 35 HOH HOH . N 9 HOH A 94 894 98 HOH HOH . N 9 HOH A 95 895 118 HOH HOH . N 9 HOH A 96 896 59 HOH HOH . N 9 HOH A 97 897 27 HOH HOH . N 9 HOH A 98 898 450 HOH HOH . N 9 HOH A 99 899 165 HOH HOH . N 9 HOH A 100 900 352 HOH HOH . N 9 HOH A 101 901 267 HOH HOH . N 9 HOH A 102 902 240 HOH HOH . N 9 HOH A 103 903 329 HOH HOH . N 9 HOH A 104 904 127 HOH HOH . N 9 HOH A 105 905 174 HOH HOH . N 9 HOH A 106 906 288 HOH HOH . N 9 HOH A 107 907 387 HOH HOH . N 9 HOH A 108 908 47 HOH HOH . N 9 HOH A 109 909 140 HOH HOH . N 9 HOH A 110 910 170 HOH HOH . N 9 HOH A 111 911 107 HOH HOH . N 9 HOH A 112 912 327 HOH HOH . N 9 HOH A 113 913 94 HOH HOH . N 9 HOH A 114 914 257 HOH HOH . N 9 HOH A 115 915 470 HOH HOH . N 9 HOH A 116 916 96 HOH HOH . N 9 HOH A 117 917 196 HOH HOH . N 9 HOH A 118 918 44 HOH HOH . N 9 HOH A 119 919 70 HOH HOH . N 9 HOH A 120 920 19 HOH HOH . N 9 HOH A 121 921 7 HOH HOH . N 9 HOH A 122 922 153 HOH HOH . N 9 HOH A 123 923 53 HOH HOH . N 9 HOH A 124 924 226 HOH HOH . N 9 HOH A 125 925 402 HOH HOH . N 9 HOH A 126 926 326 HOH HOH . N 9 HOH A 127 927 335 HOH HOH . N 9 HOH A 128 928 360 HOH HOH . N 9 HOH A 129 929 9 HOH HOH . N 9 HOH A 130 930 30 HOH HOH . N 9 HOH A 131 931 214 HOH HOH . N 9 HOH A 132 932 72 HOH HOH . N 9 HOH A 133 933 242 HOH HOH . N 9 HOH A 134 934 26 HOH HOH . N 9 HOH A 135 935 3 HOH HOH . N 9 HOH A 136 936 239 HOH HOH . N 9 HOH A 137 937 58 HOH HOH . N 9 HOH A 138 938 40 HOH HOH . N 9 HOH A 139 939 175 HOH HOH . N 9 HOH A 140 940 150 HOH HOH . N 9 HOH A 141 941 247 HOH HOH . N 9 HOH A 142 942 54 HOH HOH . N 9 HOH A 143 943 88 HOH HOH . N 9 HOH A 144 944 210 HOH HOH . N 9 HOH A 145 945 120 HOH HOH . N 9 HOH A 146 946 396 HOH HOH . N 9 HOH A 147 947 277 HOH HOH . N 9 HOH A 148 948 137 HOH HOH . N 9 HOH A 149 949 409 HOH HOH . N 9 HOH A 150 950 38 HOH HOH . N 9 HOH A 151 951 109 HOH HOH . N 9 HOH A 152 952 280 HOH HOH . N 9 HOH A 153 953 124 HOH HOH . N 9 HOH A 154 954 444 HOH HOH . N 9 HOH A 155 955 385 HOH HOH . N 9 HOH A 156 956 445 HOH HOH . N 9 HOH A 157 957 92 HOH HOH . N 9 HOH A 158 958 155 HOH HOH . N 9 HOH A 159 959 436 HOH HOH . N 9 HOH A 160 960 258 HOH HOH . N 9 HOH A 161 961 281 HOH HOH . N 9 HOH A 162 962 303 HOH HOH . N 9 HOH A 163 963 95 HOH HOH . N 9 HOH A 164 964 455 HOH HOH . N 9 HOH A 165 965 114 HOH HOH . N 9 HOH A 166 966 16 HOH HOH . N 9 HOH A 167 967 452 HOH HOH . N 9 HOH A 168 968 158 HOH HOH . N 9 HOH A 169 969 476 HOH HOH . N 9 HOH A 170 970 221 HOH HOH . N 9 HOH A 171 971 245 HOH HOH . N 9 HOH A 172 972 217 HOH HOH . N 9 HOH A 173 973 228 HOH HOH . N 9 HOH A 174 974 81 HOH HOH . N 9 HOH A 175 975 34 HOH HOH . N 9 HOH A 176 976 464 HOH HOH . N 9 HOH A 177 977 224 HOH HOH . N 9 HOH A 178 978 80 HOH HOH . N 9 HOH A 179 979 472 HOH HOH . N 9 HOH A 180 980 415 HOH HOH . N 9 HOH A 181 981 76 HOH HOH . N 9 HOH A 182 982 43 HOH HOH . N 9 HOH A 183 983 104 HOH HOH . N 9 HOH A 184 984 251 HOH HOH . N 9 HOH A 185 985 67 HOH HOH . N 9 HOH A 186 986 190 HOH HOH . N 9 HOH A 187 987 308 HOH HOH . N 9 HOH A 188 988 345 HOH HOH . N 9 HOH A 189 989 56 HOH HOH . N 9 HOH A 190 990 375 HOH HOH . N 9 HOH A 191 991 286 HOH HOH . N 9 HOH A 192 992 304 HOH HOH . N 9 HOH A 193 993 249 HOH HOH . N 9 HOH A 194 994 51 HOH HOH . N 9 HOH A 195 995 10 HOH HOH . N 9 HOH A 196 996 279 HOH HOH . N 9 HOH A 197 997 49 HOH HOH . N 9 HOH A 198 998 134 HOH HOH . N 9 HOH A 199 999 176 HOH HOH . N 9 HOH A 200 1000 13 HOH HOH . N 9 HOH A 201 1001 342 HOH HOH . N 9 HOH A 202 1002 159 HOH HOH . N 9 HOH A 203 1003 384 HOH HOH . N 9 HOH A 204 1004 231 HOH HOH . N 9 HOH A 205 1005 139 HOH HOH . N 9 HOH A 206 1006 179 HOH HOH . N 9 HOH A 207 1007 146 HOH HOH . N 9 HOH A 208 1008 144 HOH HOH . N 9 HOH A 209 1009 74 HOH HOH . N 9 HOH A 210 1010 377 HOH HOH . N 9 HOH A 211 1011 79 HOH HOH . N 9 HOH A 212 1012 82 HOH HOH . N 9 HOH A 213 1013 435 HOH HOH . N 9 HOH A 214 1014 110 HOH HOH . N 9 HOH A 215 1015 192 HOH HOH . N 9 HOH A 216 1016 449 HOH HOH . N 9 HOH A 217 1017 168 HOH HOH . N 9 HOH A 218 1018 457 HOH HOH . N 9 HOH A 219 1019 21 HOH HOH . N 9 HOH A 220 1020 262 HOH HOH . N 9 HOH A 221 1021 188 HOH HOH . N 9 HOH A 222 1022 418 HOH HOH . N 9 HOH A 223 1023 406 HOH HOH . N 9 HOH A 224 1024 358 HOH HOH . N 9 HOH A 225 1025 142 HOH HOH . N 9 HOH A 226 1026 369 HOH HOH . N 9 HOH A 227 1027 14 HOH HOH . N 9 HOH A 228 1028 78 HOH HOH . N 9 HOH A 229 1029 438 HOH HOH . N 9 HOH A 230 1030 237 HOH HOH . N 9 HOH A 231 1031 46 HOH HOH . N 9 HOH A 232 1032 55 HOH HOH . N 9 HOH A 233 1033 111 HOH HOH . N 9 HOH A 234 1034 203 HOH HOH . N 9 HOH A 235 1035 407 HOH HOH . N 9 HOH A 236 1036 151 HOH HOH . N 9 HOH A 237 1037 200 HOH HOH . N 9 HOH A 238 1038 458 HOH HOH . N 9 HOH A 239 1039 351 HOH HOH . N 9 HOH A 240 1040 424 HOH HOH . N 9 HOH A 241 1041 461 HOH HOH . N 9 HOH A 242 1042 113 HOH HOH . N 9 HOH A 243 1043 422 HOH HOH . N 9 HOH A 244 1044 236 HOH HOH . N 9 HOH A 245 1045 383 HOH HOH . N 9 HOH A 246 1046 389 HOH HOH . N 9 HOH A 247 1047 61 HOH HOH . N 9 HOH A 248 1048 177 HOH HOH . N 9 HOH A 249 1049 372 HOH HOH . N 9 HOH A 250 1050 186 HOH HOH . N 9 HOH A 251 1051 346 HOH HOH . N 9 HOH A 252 1052 341 HOH HOH . N 9 HOH A 253 1053 381 HOH HOH . N 9 HOH A 254 1054 222 HOH HOH . N 9 HOH A 255 1055 319 HOH HOH . N 9 HOH A 256 1056 252 HOH HOH . N 9 HOH A 257 1057 128 HOH HOH . N 9 HOH A 258 1058 374 HOH HOH . N 9 HOH A 259 1059 460 HOH HOH . N 9 HOH A 260 1060 169 HOH HOH . N 9 HOH A 261 1061 473 HOH HOH . N 9 HOH A 262 1062 256 HOH HOH . N 9 HOH A 263 1063 282 HOH HOH . N 9 HOH A 264 1064 355 HOH HOH . N 9 HOH A 265 1065 390 HOH HOH . N 9 HOH A 266 1066 456 HOH HOH . N 9 HOH A 267 1067 220 HOH HOH . N 9 HOH A 268 1068 344 HOH HOH . N 9 HOH A 269 1069 218 HOH HOH . N 9 HOH A 270 1070 395 HOH HOH . N 9 HOH A 271 1071 99 HOH HOH . N 9 HOH A 272 1072 343 HOH HOH . N 9 HOH A 273 1073 278 HOH HOH . N 9 HOH A 274 1074 302 HOH HOH . N 9 HOH A 275 1075 261 HOH HOH . N 9 HOH A 276 1076 272 HOH HOH . N 9 HOH A 277 1077 477 HOH HOH . N 9 HOH A 278 1078 432 HOH HOH . N 9 HOH A 279 1079 463 HOH HOH . N 9 HOH A 280 1080 184 HOH HOH . N 9 HOH A 281 1081 348 HOH HOH . N 9 HOH A 282 1082 195 HOH HOH . N 9 HOH A 283 1083 287 HOH HOH . N 9 HOH A 284 1084 413 HOH HOH . N 9 HOH A 285 1085 290 HOH HOH . N 9 HOH A 286 1086 391 HOH HOH . N 9 HOH A 287 1087 421 HOH HOH . N 9 HOH A 288 1088 274 HOH HOH . N 9 HOH A 289 1089 199 HOH HOH . N 9 HOH A 290 1090 462 HOH HOH . N 9 HOH A 291 1091 347 HOH HOH . N 9 HOH A 292 1092 433 HOH HOH . N 9 HOH A 293 1093 235 HOH HOH . N 9 HOH A 294 1094 306 HOH HOH . N 9 HOH A 295 1095 148 HOH HOH . N 9 HOH A 296 1096 243 HOH HOH . N 9 HOH A 297 1097 380 HOH HOH . N 9 HOH A 298 1098 379 HOH HOH . N 9 HOH A 299 1099 248 HOH HOH . N 9 HOH A 300 1100 264 HOH HOH . N 9 HOH A 301 1101 459 HOH HOH . N 9 HOH A 302 1102 132 HOH HOH . N 9 HOH A 303 1103 97 HOH HOH . N 9 HOH A 304 1104 467 HOH HOH . N 9 HOH A 305 1105 382 HOH HOH . N 9 HOH A 306 1106 322 HOH HOH . N 9 HOH A 307 1107 411 HOH HOH . N 9 HOH A 308 1108 321 HOH HOH . N 9 HOH A 309 1109 332 HOH HOH . N 9 HOH A 310 1110 350 HOH HOH . N 9 HOH A 311 1111 386 HOH HOH . N 9 HOH A 312 1112 238 HOH HOH . N 9 HOH A 313 1113 246 HOH HOH . N 9 HOH A 314 1114 403 HOH HOH . N 9 HOH A 315 1115 215 HOH HOH . N 9 HOH A 316 1116 349 HOH HOH . N 9 HOH A 317 1117 414 HOH HOH . N 9 HOH A 318 1118 366 HOH HOH . N 9 HOH A 319 1119 466 HOH HOH . O 9 HOH T 1 201 255 HOH HOH . O 9 HOH T 2 202 428 HOH HOH . O 9 HOH T 3 203 299 HOH HOH . O 9 HOH T 4 204 318 HOH HOH . O 9 HOH T 5 205 171 HOH HOH . O 9 HOH T 6 206 211 HOH HOH . O 9 HOH T 7 207 162 HOH HOH . O 9 HOH T 8 208 37 HOH HOH . O 9 HOH T 9 209 216 HOH HOH . O 9 HOH T 10 210 392 HOH HOH . O 9 HOH T 11 211 100 HOH HOH . O 9 HOH T 12 212 265 HOH HOH . O 9 HOH T 13 213 85 HOH HOH . O 9 HOH T 14 214 338 HOH HOH . O 9 HOH T 15 215 106 HOH HOH . O 9 HOH T 16 216 244 HOH HOH . O 9 HOH T 17 217 33 HOH HOH . O 9 HOH T 18 218 138 HOH HOH . O 9 HOH T 19 219 157 HOH HOH . O 9 HOH T 20 220 180 HOH HOH . O 9 HOH T 21 221 172 HOH HOH . O 9 HOH T 22 222 356 HOH HOH . O 9 HOH T 23 223 204 HOH HOH . O 9 HOH T 24 224 430 HOH HOH . O 9 HOH T 25 225 147 HOH HOH . O 9 HOH T 26 226 160 HOH HOH . O 9 HOH T 27 227 284 HOH HOH . O 9 HOH T 28 228 130 HOH HOH . O 9 HOH T 29 229 259 HOH HOH . O 9 HOH T 30 230 336 HOH HOH . O 9 HOH T 31 231 163 HOH HOH . O 9 HOH T 32 232 182 HOH HOH . O 9 HOH T 33 233 309 HOH HOH . O 9 HOH T 34 234 399 HOH HOH . O 9 HOH T 35 235 126 HOH HOH . O 9 HOH T 36 236 315 HOH HOH . O 9 HOH T 37 237 232 HOH HOH . O 9 HOH T 38 238 173 HOH HOH . O 9 HOH T 39 239 295 HOH HOH . O 9 HOH T 40 240 425 HOH HOH . P 9 HOH P 1 801 116 HOH HOH . P 9 HOH P 2 802 437 HOH HOH . P 9 HOH P 3 803 75 HOH HOH . P 9 HOH P 4 804 166 HOH HOH . P 9 HOH P 5 805 66 HOH HOH . P 9 HOH P 6 806 193 HOH HOH . P 9 HOH P 7 807 119 HOH HOH . P 9 HOH P 8 808 480 HOH HOH . P 9 HOH P 9 809 90 HOH HOH . P 9 HOH P 10 810 105 HOH HOH . P 9 HOH P 11 811 202 HOH HOH . P 9 HOH P 12 812 39 HOH HOH . P 9 HOH P 13 813 8 HOH HOH . P 9 HOH P 14 814 145 HOH HOH . P 9 HOH P 15 815 86 HOH HOH . P 9 HOH P 16 816 440 HOH HOH . P 9 HOH P 17 817 230 HOH HOH . P 9 HOH P 18 818 478 HOH HOH . P 9 HOH P 19 819 451 HOH HOH . P 9 HOH P 20 820 441 HOH HOH . P 9 HOH P 21 821 443 HOH HOH . P 9 HOH P 22 822 209 HOH HOH . P 9 HOH P 23 823 129 HOH HOH . P 9 HOH P 24 824 77 HOH HOH . P 9 HOH P 25 825 442 HOH HOH . P 9 HOH P 26 826 283 HOH HOH . Q 9 HOH D 1 101 164 HOH HOH . Q 9 HOH D 2 102 394 HOH HOH . Q 9 HOH D 3 103 102 HOH HOH . Q 9 HOH D 4 104 289 HOH HOH . Q 9 HOH D 5 105 294 HOH HOH . Q 9 HOH D 6 106 187 HOH HOH . Q 9 HOH D 7 107 131 HOH HOH . Q 9 HOH D 8 108 427 HOH HOH . Q 9 HOH D 9 109 254 HOH HOH . Q 9 HOH D 10 110 331 HOH HOH . Q 9 HOH D 11 111 206 HOH HOH . Q 9 HOH D 12 112 143 HOH HOH . Q 9 HOH D 13 113 141 HOH HOH . Q 9 HOH D 14 114 87 HOH HOH . Q 9 HOH D 15 115 397 HOH HOH . Q 9 HOH D 16 116 426 HOH HOH . Q 9 HOH D 17 117 227 HOH HOH . Q 9 HOH D 18 118 365 HOH HOH . Q 9 HOH D 19 119 401 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 P PA TTP . B . L 5 3.232 -0.972 -8.245 0.44 7.22 ? PA TTP 701 P 1 HETATM 2 O O1A TTP . B . L 5 4.124 -0.59 -9.426 0.44 8.23 ? O1A TTP 701 P 1 HETATM 3 O O2A TTP . B . L 5 3.154 -0.049 -7.066 0.44 3.61 ? O2A TTP 701 P 1 HETATM 4 O O3A TTP . B . L 5 3.784 -2.465 -7.83 0.44 5.33 ? O3A TTP 701 P 1 HETATM 5 P PB TTP . B . L 5 3.607 -3.213 -6.387 0.44 6.57 ? PB TTP 701 P 1 HETATM 6 O O1B TTP . B . L 5 3.166 -4.627 -6.683 0.44 4.61 ? O1B TTP 701 P 1 HETATM 7 O O2B TTP . B . L 5 2.742 -2.371 -5.456 0.44 4.22 ? O2B TTP 701 P 1 HETATM 8 O O3B TTP . B . L 5 5.151 -3.378 -5.982 0.44 7.96 ? O3B TTP 701 P 1 HETATM 9 P PG TTP . B . L 5 6.266 -2.235 -5.579 0.44 10.26 ? PG TTP 701 P 1 HETATM 10 O O1G TTP . B . L 5 7.408 -2.269 -6.626 0.44 16.89 ? O1G TTP 701 P 1 HETATM 11 O O2G TTP . B . L 5 6.837 -2.518 -4.216 0.44 15.99 ? O2G TTP 701 P 1 HETATM 12 O O3G TTP . B . L 5 5.556 -0.959 -5.537 0.44 6.3 ? O3G TTP 701 P 1 HETATM 13 O O5' TTP . B . L 5 1.754 -1.335 -8.84 0.44 1.73 ? O5' TTP 701 P 1 HETATM 14 C C5' TTP . B . L 5 0.706 -1.579 -7.902 0.44 3.33 ? C5' TTP 701 P 1 HETATM 15 C C4' TTP . B . L 5 -0.339 -2.546 -8.435 0.44 4.06 ? C4' TTP 701 P 1 HETATM 16 O O4' TTP . B . L 5 -0.938 -2.069 -9.673 0.44 2.24 ? O4' TTP 701 P 1 HETATM 17 C C3' TTP . B . L 5 0.234 -3.919 -8.859 0.44 3.61 ? C3' TTP 701 P 1 HETATM 18 O O3' TTP . B . L 5 0.582 -4.813 -7.785 0.44 4.07 ? O3' TTP 701 P 1 HETATM 19 C C2' TTP . B . L 5 -0.906 -4.42 -9.743 0.44 4.14 ? C2' TTP 701 P 1 HETATM 20 C C1' TTP . B . L 5 -1.245 -3.162 -10.54 0.44 2.22 ? C1' TTP 701 P 1 HETATM 21 N N1 TTP . B . L 5 -0.449 -3.036 -11.796 0.44 3.68 ? N1 TTP 701 P 1 HETATM 22 C C2 TTP . B . L 5 -1 -3.522 -12.965 0.44 5.53 ? C2 TTP 701 P 1 HETATM 23 O O2 TTP . B . L 5 -2.134 -3.961 -13.05 0.44 6.48 ? O2 TTP 701 P 1 HETATM 24 N N3 TTP . B . L 5 -0.233 -3.377 -14.091 0.44 6.92 ? N3 TTP 701 P 1 HETATM 25 C C4 TTP . B . L 5 1.041 -2.83 -14.168 0.44 8.89 ? C4 TTP 701 P 1 HETATM 26 O O4 TTP . B . L 5 1.73 -2.749 -15.199 0.44 9.31 ? O4 TTP 701 P 1 HETATM 27 C C5 TTP . B . L 5 1.564 -2.388 -12.907 0.44 6.77 ? C5 TTP 701 P 1 HETATM 28 C C5M TTP . B . L 5 2.937 -1.787 -12.881 0.44 8.28 ? C5M TTP 701 P 1 HETATM 29 C C6 TTP . B . L 5 0.832 -2.527 -11.782 0.44 6.01 ? C6 TTP 701 P 1 # _model_server_stats.io_time_ms 17 _model_server_stats.parse_time_ms 13 _model_server_stats.create_model_time_ms 13 _model_server_stats.query_time_ms 284 _model_server_stats.encode_time_ms 13 _model_server_stats.element_count 29 #