data_5W1F # _model_server_result.job_id B7wkaDGliJn57mca18euGw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-05 04:11:59' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5w1f # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"V","auth_seq_id":201}' # _entry.id 5W1F # _exptl.entry_id 5W1F _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 58.693 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'NICKEL (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5W1F _cell.length_a 57.02 _cell.length_b 77.611 _cell.length_c 222.722 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5W1F _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 1 PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,EA,FA,GA,HA 1 1 E,F,G,H,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,IA,JA,KA,LA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 K N N ? 5 N N N ? 5 Q N N ? 5 V N N ? 5 Y N N ? 5 BA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A NE2 HIS 17 A HIS 17 1_555 K NI NI . B NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.25 ? metalc ? metalc2 A O SER 20 A SER 20 1_555 I NA NA . A NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.396 ? metalc ? metalc3 A O LYS 23 A LYS 23 1_555 I NA NA . A NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc4 A O ASN 25 A ASN 25 1_555 I NA NA . A NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? metalc ? metalc5 A NE2 HIS 27 A HIS 27 1_555 K NI NI . B NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc6 A O ALA 28 A ALA 28 1_555 I NA NA . A NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 59 A ASP 59 1_555 J CA CA . A CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASN 61 A ASN 61 1_555 J CA CA . A CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 63 A ASP 63 1_555 J CA CA . A CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? metalc ? metalc10 A O ALA 65 A ALA 65 1_555 J CA CA . A CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc11 A OE1 GLU 70 A GLU 70 1_555 J CA CA . A CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.458 ? metalc ? metalc12 A OE2 GLU 70 A GLU 70 1_555 J CA CA . A CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc13 I NA NA . A NA 101 1_555 EA O HOH . A HOH 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc ? metalc14 J CA CA . A CA 102 1_555 EA O HOH . A HOH 212 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.564 ? metalc ? metalc15 B O SER 23 B SER 23 1_555 L NA NA . B NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? metalc ? metalc16 B O LEU 26 B LEU 26 1_555 L NA NA . B NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc17 B O HIS 28 B HIS 28 1_555 L NA NA . B NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc18 B O THR 31 B THR 31 1_555 L NA NA . B NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? metalc ? metalc19 B OE1 GLU 36 B GLU 36 1_555 L NA NA . B NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc20 B OE2 GLU 36 B GLU 36 1_555 L NA NA . B NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.841 ? metalc ? metalc21 B OD1 ASP 67 B ASP 67 1_555 M CA CA . B CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.596 ? metalc ? metalc22 B OD1 ASN 69 B ASN 69 1_555 M CA CA . B CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? metalc ? metalc23 B OD1 ASP 71 B ASP 71 1_555 M CA CA . B CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc ? metalc24 B O GLN 73 B GLN 73 1_555 M CA CA . B CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc25 B OE1 GLU 78 B GLU 78 1_555 M CA CA . B CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc26 B OE2 GLU 78 B GLU 78 1_555 M CA CA . B CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.854 ? metalc ? metalc27 B NE2 HIS 91 B HIS 91 1_555 K NI NI . B NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? metalc ? metalc28 B NE2 HIS 95 B HIS 95 1_555 K NI NI . B NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? metalc ? metalc29 B NE2 HIS 103 B HIS 103 1_555 K NI NI . B NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? metalc ? metalc30 B NE2 HIS 105 B HIS 105 1_555 K NI NI . B NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? metalc ? metalc31 L NA NA . B NA 202 1_555 FA O HOH . B HOH 312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc32 M CA CA . B CA 203 1_555 FA O HOH . B HOH 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? metalc ? metalc33 C NE2 HIS 17 C HIS 17 1_555 Q NI NI . D NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? metalc ? metalc34 C O SER 20 C SER 20 1_555 O NA NA . C NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc ? metalc35 C O LYS 23 C LYS 23 1_555 O NA NA . C NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc36 C O ASN 25 C ASN 25 1_555 O NA NA . C NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc37 C NE2 HIS 27 C HIS 27 1_555 Q NI NI . D NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? metalc ? metalc38 C O ALA 28 C ALA 28 1_555 O NA NA . C NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc39 C OD1 ASP 59 C ASP 59 1_555 P CA CA . C CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.504 ? metalc ? metalc40 C OD1 ASN 61 C ASN 61 1_555 P CA CA . C CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? metalc ? metalc41 C OD1 ASP 63 C ASP 63 1_555 P CA CA . C CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc42 C O ALA 65 C ALA 65 1_555 P CA CA . C CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? metalc ? metalc43 C OE1 GLU 70 C GLU 70 1_555 P CA CA . C CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.49 ? metalc ? metalc44 C OE2 GLU 70 C GLU 70 1_555 P CA CA . C CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.691 ? metalc ? metalc45 C NE2 HIS 83 C HIS 83 1_555 N NI NI . C NI 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? metalc ? metalc46 C NE2 HIS 87 C HIS 87 1_555 N NI NI . C NI 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? metalc ? metalc47 N NI NI . C NI 101 1_555 D NE2 HIS 20 D HIS 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? metalc ? metalc48 N NI NI . C NI 101 1_555 D OD1 ASP 30 D ASP 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.903 ? metalc ? metalc49 O NA NA . C NA 102 1_555 GA O HOH . C HOH 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? metalc ? metalc50 P CA CA . C CA 103 1_555 GA O HOH . C HOH 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? metalc ? metalc51 D O SER 23 D SER 23 1_555 R CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc52 D O LEU 26 D LEU 26 1_555 R CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? metalc ? metalc53 D O HIS 28 D HIS 28 1_555 R CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc54 D O THR 31 D THR 31 1_555 R CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc55 D OE1 GLU 36 D GLU 36 1_555 R CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? metalc ? metalc56 D OE2 GLU 36 D GLU 36 1_555 R CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.721 ? metalc ? metalc57 D OD1 ASP 67 D ASP 67 1_555 S CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? metalc ? metalc58 D OD1 ASN 69 D ASN 69 1_555 S CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc59 D OD1 ASP 71 D ASP 71 1_555 S CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? metalc ? metalc60 D O GLN 73 D GLN 73 1_555 S CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? metalc ? metalc61 D OE1 GLU 78 D GLU 78 1_555 S CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? metalc ? metalc62 D OE2 GLU 78 D GLU 78 1_555 S CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? metalc ? metalc63 D NE2 HIS 91 D HIS 91 1_555 Q NI NI . D NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc64 D NE2 HIS 95 D HIS 95 1_555 Q NI NI . D NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? metalc ? metalc65 D NE2 HIS 103 D HIS 103 1_555 Q NI NI . D NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc66 D NE2 HIS 105 D HIS 105 1_555 Q NI NI . D NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? metalc ? metalc67 R CA CA . D CA 202 1_555 HA O HOH . D HOH 317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? metalc ? metalc68 S CA CA . D CA 203 1_555 HA O HOH . D HOH 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? metalc ? metalc69 E NE2 HIS 17 G HIS 17 1_555 V NI NI . H NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc70 E O SER 20 G SER 20 1_555 T NA NA . G NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? metalc ? metalc71 E O LYS 23 G LYS 23 1_555 T NA NA . G NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? metalc ? metalc72 E O ASN 25 G ASN 25 1_555 T NA NA . G NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? metalc ? metalc73 E NE2 HIS 27 G HIS 27 1_555 V NI NI . H NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? metalc ? metalc74 E O ALA 28 G ALA 28 1_555 T NA NA . G NA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.418 ? metalc ? metalc75 E OD1 ASP 59 G ASP 59 1_555 U CA CA . G CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc ? metalc76 E OD1 ASN 61 G ASN 61 1_555 U CA CA . G CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.405 ? metalc ? metalc77 E OD1 ASP 63 G ASP 63 1_555 U CA CA . G CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? metalc ? metalc78 E O ALA 65 G ALA 65 1_555 U CA CA . G CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? metalc ? metalc79 E OE1 GLU 70 G GLU 70 1_555 U CA CA . G CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? metalc ? metalc80 E OE2 GLU 70 G GLU 70 1_555 U CA CA . G CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc81 T NA NA . G NA 101 1_555 IA O HOH . G HOH 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc82 U CA CA . G CA 102 1_555 IA O HOH . G HOH 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? metalc ? metalc83 F O SER 23 H SER 23 1_555 W NA NA . H NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc84 F O LEU 26 H LEU 26 1_555 W NA NA . H NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc85 F O HIS 28 H HIS 28 1_555 W NA NA . H NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc86 F O THR 31 H THR 31 1_555 W NA NA . H NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc87 F OE1 GLU 36 H GLU 36 1_555 W NA NA . H NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc88 F OE2 GLU 36 H GLU 36 1_555 W NA NA . H NA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc89 F OD1 ASP 67 H ASP 67 1_555 X CA CA . H CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.655 ? metalc ? metalc90 F OD1 ASN 69 H ASN 69 1_555 X CA CA . H CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc91 F OD1 ASP 71 H ASP 71 1_555 X CA CA . H CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? metalc ? metalc92 F O GLN 73 H GLN 73 1_555 X CA CA . H CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc93 F OE1 GLU 78 H GLU 78 1_555 X CA CA . H CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? metalc ? metalc94 F OE2 GLU 78 H GLU 78 1_555 X CA CA . H CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? metalc ? metalc95 F NE2 HIS 91 H HIS 91 1_555 V NI NI . H NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc96 F NE2 HIS 95 H HIS 95 1_555 V NI NI . H NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc97 F NE2 HIS 103 H HIS 103 1_555 V NI NI . H NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? metalc ? metalc98 F NE2 HIS 105 H HIS 105 1_555 V NI NI . H NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? metalc ? metalc99 W NA NA . H NA 202 1_555 JA O HOH . H HOH 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.534 ? metalc ? metalc100 X CA CA . H CA 203 1_555 JA O HOH . H HOH 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc ? metalc101 G NE2 HIS 17 E HIS 17 1_555 BA NI NI . F NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc102 G O SER 20 E SER 20 1_555 Z NA NA . E NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? metalc ? metalc103 G O LYS 23 E LYS 23 1_555 Z NA NA . E NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? metalc ? metalc104 G O ASN 25 E ASN 25 1_555 Z NA NA . E NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? metalc ? metalc105 G NE2 HIS 27 E HIS 27 1_555 BA NI NI . F NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? metalc ? metalc106 G O ALA 28 E ALA 28 1_555 Z NA NA . E NA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? metalc ? metalc107 G OD1 ASP 59 E ASP 59 1_555 AA CA CA . E CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.542 ? metalc ? metalc108 G OD1 ASN 61 E ASN 61 1_555 AA CA CA . E CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc ? metalc109 G OD1 ASP 63 E ASP 63 1_555 AA CA CA . E CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc110 G O ALA 65 E ALA 65 1_555 AA CA CA . E CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? metalc ? metalc111 G OE1 GLU 70 E GLU 70 1_555 AA CA CA . E CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.432 ? metalc ? metalc112 G OE2 GLU 70 E GLU 70 1_555 AA CA CA . E CA 103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? metalc ? metalc113 G NE2 HIS 83 E HIS 83 1_555 Y NI NI . E NI 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.951 ? metalc ? metalc114 G NE2 HIS 87 E HIS 87 1_555 Y NI NI . E NI 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? metalc ? metalc115 Y NI NI . E NI 101 1_555 H NE2 HIS 20 F HIS 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? metalc ? metalc116 Y NI NI . E NI 101 1_555 H OD1 ASP 30 F ASP 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.886 ? metalc ? metalc117 Z NA NA . E NA 102 1_555 KA O HOH . E HOH 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? metalc ? metalc118 AA CA CA . E CA 103 1_555 KA O HOH . E HOH 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? metalc ? metalc119 H O SER 23 F SER 23 1_555 CA CA CA . F CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? metalc ? metalc120 H O LEU 26 F LEU 26 1_555 CA CA CA . F CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? metalc ? metalc121 H O HIS 28 F HIS 28 1_555 CA CA CA . F CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? metalc ? metalc122 H O THR 31 F THR 31 1_555 CA CA CA . F CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? metalc ? metalc123 H OE1 GLU 36 F GLU 36 1_555 CA CA CA . F CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.491 ? metalc ? metalc124 H OE2 GLU 36 F GLU 36 1_555 CA CA CA . F CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? metalc ? metalc125 H OD1 ASP 67 F ASP 67 1_555 DA CA CA . F CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? metalc ? metalc126 H OD1 ASN 69 F ASN 69 1_555 DA CA CA . F CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc127 H OD1 ASP 71 F ASP 71 1_555 DA CA CA . F CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? metalc ? metalc128 H O GLN 73 F GLN 73 1_555 DA CA CA . F CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc129 H OE1 GLU 78 F GLU 78 1_555 DA CA CA . F CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc130 H OE2 GLU 78 F GLU 78 1_555 DA CA CA . F CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? metalc ? metalc131 H NE2 HIS 91 F HIS 91 1_555 BA NI NI . F NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc132 H NE2 HIS 95 F HIS 95 1_555 BA NI NI . F NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc133 H NE2 HIS 103 F HIS 103 1_555 BA NI NI . F NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc134 H NE2 HIS 105 F HIS 105 1_555 BA NI NI . F NI 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc135 CA CA CA . F CA 202 1_555 LA O HOH . F HOH 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.886 ? metalc ? metalc136 DA CA CA . F CA 203 1_555 LA O HOH . F HOH 320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? # _chem_comp.formula 'Ni 2' _chem_comp.formula_weight 58.693 _chem_comp.id NI _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'NICKEL (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 5W1F _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.017538 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012885 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00449 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 3 NA A 1 101 1 NA NA . J 4 CA A 1 102 1 CA CA . K 5 NI B 1 201 1 NI NI . L 3 NA B 1 202 6 NA NA . M 4 CA B 1 203 3 CA CA . N 5 NI C 1 101 3 NI NI . O 3 NA C 1 102 2 NA NA . P 4 CA C 1 103 4 CA CA . Q 5 NI D 1 201 2 NI NI . R 4 CA D 1 202 5 CA CA . S 4 CA D 1 203 6 CA CA . T 3 NA G 1 101 3 NA NA . U 4 CA G 1 102 7 CA CA . V 5 NI H 1 201 4 NI NI . W 3 NA H 1 202 5 NA NA . X 4 CA H 1 203 13 CA CA . Y 5 NI E 1 101 5 NI NI . Z 3 NA E 1 102 4 NA NA . AA 4 CA E 1 103 10 CA CA . BA 5 NI F 1 201 6 NI NI . CA 4 CA F 1 202 11 CA CA . DA 4 CA F 1 203 12 CA CA . EA 6 HOH A 1 201 1 HOH HOH . EA 6 HOH A 2 202 200 HOH HOH . EA 6 HOH A 3 203 11 HOH HOH . EA 6 HOH A 4 204 205 HOH HOH . EA 6 HOH A 5 205 8 HOH HOH . EA 6 HOH A 6 206 49 HOH HOH . EA 6 HOH A 7 207 5 HOH HOH . EA 6 HOH A 8 208 7 HOH HOH . EA 6 HOH A 9 209 50 HOH HOH . EA 6 HOH A 10 210 47 HOH HOH . EA 6 HOH A 11 211 113 HOH HOH . EA 6 HOH A 12 212 6 HOH HOH . EA 6 HOH A 13 213 165 HOH HOH . EA 6 HOH A 14 214 198 HOH HOH . EA 6 HOH A 15 215 67 HOH HOH . EA 6 HOH A 16 216 48 HOH HOH . EA 6 HOH A 17 217 54 HOH HOH . EA 6 HOH A 18 218 199 HOH HOH . EA 6 HOH A 19 219 197 HOH HOH . EA 6 HOH A 20 220 115 HOH HOH . EA 6 HOH A 21 221 52 HOH HOH . EA 6 HOH A 22 222 195 HOH HOH . FA 6 HOH B 1 301 56 HOH HOH . FA 6 HOH B 2 302 201 HOH HOH . FA 6 HOH B 3 303 38 HOH HOH . FA 6 HOH B 4 304 190 HOH HOH . FA 6 HOH B 5 305 152 HOH HOH . FA 6 HOH B 6 306 61 HOH HOH . FA 6 HOH B 7 307 39 HOH HOH . FA 6 HOH B 8 308 120 HOH HOH . FA 6 HOH B 9 309 114 HOH HOH . FA 6 HOH B 10 310 118 HOH HOH . FA 6 HOH B 11 311 151 HOH HOH . FA 6 HOH B 12 312 9 HOH HOH . FA 6 HOH B 13 313 62 HOH HOH . FA 6 HOH B 14 314 189 HOH HOH . FA 6 HOH B 15 315 60 HOH HOH . FA 6 HOH B 16 316 10 HOH HOH . FA 6 HOH B 17 317 188 HOH HOH . FA 6 HOH B 18 318 119 HOH HOH . FA 6 HOH B 19 319 161 HOH HOH . FA 6 HOH B 20 320 162 HOH HOH . GA 6 HOH C 1 201 169 HOH HOH . GA 6 HOH C 2 202 36 HOH HOH . GA 6 HOH C 3 203 28 HOH HOH . GA 6 HOH C 4 204 13 HOH HOH . GA 6 HOH C 5 205 131 HOH HOH . GA 6 HOH C 6 206 132 HOH HOH . GA 6 HOH C 7 207 66 HOH HOH . GA 6 HOH C 8 208 202 HOH HOH . GA 6 HOH C 9 209 2 HOH HOH . GA 6 HOH C 10 210 192 HOH HOH . GA 6 HOH C 11 211 187 HOH HOH . GA 6 HOH C 12 212 73 HOH HOH . GA 6 HOH C 13 213 29 HOH HOH . GA 6 HOH C 14 214 164 HOH HOH . GA 6 HOH C 15 215 65 HOH HOH . GA 6 HOH C 16 216 63 HOH HOH . GA 6 HOH C 17 217 153 HOH HOH . HA 6 HOH D 1 301 22 HOH HOH . HA 6 HOH D 2 302 70 HOH HOH . HA 6 HOH D 3 303 15 HOH HOH . HA 6 HOH D 4 304 180 HOH HOH . HA 6 HOH D 5 305 130 HOH HOH . HA 6 HOH D 6 306 182 HOH HOH . HA 6 HOH D 7 307 23 HOH HOH . HA 6 HOH D 8 308 53 HOH HOH . HA 6 HOH D 9 309 160 HOH HOH . HA 6 HOH D 10 310 158 HOH HOH . HA 6 HOH D 11 311 14 HOH HOH . HA 6 HOH D 12 312 150 HOH HOH . HA 6 HOH D 13 313 159 HOH HOH . HA 6 HOH D 14 314 191 HOH HOH . HA 6 HOH D 15 315 55 HOH HOH . HA 6 HOH D 16 316 68 HOH HOH . HA 6 HOH D 17 317 26 HOH HOH . HA 6 HOH D 18 318 133 HOH HOH . HA 6 HOH D 19 319 135 HOH HOH . IA 6 HOH G 1 201 173 HOH HOH . IA 6 HOH G 2 202 16 HOH HOH . IA 6 HOH G 3 203 3 HOH HOH . IA 6 HOH G 4 204 91 HOH HOH . IA 6 HOH G 5 205 71 HOH HOH . IA 6 HOH G 6 206 172 HOH HOH . IA 6 HOH G 7 207 90 HOH HOH . IA 6 HOH G 8 208 174 HOH HOH . IA 6 HOH G 9 209 89 HOH HOH . IA 6 HOH G 10 210 35 HOH HOH . IA 6 HOH G 11 211 203 HOH HOH . IA 6 HOH G 12 212 84 HOH HOH . IA 6 HOH G 13 213 148 HOH HOH . IA 6 HOH G 14 214 92 HOH HOH . IA 6 HOH G 15 215 139 HOH HOH . JA 6 HOH H 1 301 140 HOH HOH . JA 6 HOH H 2 302 74 HOH HOH . JA 6 HOH H 3 303 193 HOH HOH . JA 6 HOH H 4 304 145 HOH HOH . JA 6 HOH H 5 305 206 HOH HOH . JA 6 HOH H 6 306 144 HOH HOH . JA 6 HOH H 7 307 86 HOH HOH . JA 6 HOH H 8 308 183 HOH HOH . JA 6 HOH H 9 309 194 HOH HOH . JA 6 HOH H 10 310 105 HOH HOH . JA 6 HOH H 11 311 42 HOH HOH . JA 6 HOH H 12 312 104 HOH HOH . JA 6 HOH H 13 313 77 HOH HOH . JA 6 HOH H 14 314 154 HOH HOH . JA 6 HOH H 15 315 106 HOH HOH . JA 6 HOH H 16 316 103 HOH HOH . KA 6 HOH E 1 201 146 HOH HOH . KA 6 HOH E 2 202 4 HOH HOH . KA 6 HOH E 3 203 95 HOH HOH . KA 6 HOH E 4 204 82 HOH HOH . KA 6 HOH E 5 205 20 HOH HOH . KA 6 HOH E 6 206 78 HOH HOH . KA 6 HOH E 7 207 96 HOH HOH . KA 6 HOH E 8 208 85 HOH HOH . KA 6 HOH E 9 209 87 HOH HOH . KA 6 HOH E 10 210 21 HOH HOH . KA 6 HOH E 11 211 184 HOH HOH . KA 6 HOH E 12 212 83 HOH HOH . KA 6 HOH E 13 213 88 HOH HOH . KA 6 HOH E 14 214 137 HOH HOH . LA 6 HOH F 1 301 110 HOH HOH . LA 6 HOH F 2 302 97 HOH HOH . LA 6 HOH F 3 303 17 HOH HOH . LA 6 HOH F 4 304 179 HOH HOH . LA 6 HOH F 5 305 186 HOH HOH . LA 6 HOH F 6 306 99 HOH HOH . LA 6 HOH F 7 307 147 HOH HOH . LA 6 HOH F 8 308 32 HOH HOH . LA 6 HOH F 9 309 93 HOH HOH . LA 6 HOH F 10 310 45 HOH HOH . LA 6 HOH F 11 311 94 HOH HOH . LA 6 HOH F 12 312 80 HOH HOH . LA 6 HOH F 13 313 100 HOH HOH . LA 6 HOH F 14 314 204 HOH HOH . LA 6 HOH F 15 315 31 HOH HOH . LA 6 HOH F 16 316 101 HOH HOH . LA 6 HOH F 17 317 33 HOH HOH . LA 6 HOH F 18 318 207 HOH HOH . LA 6 HOH F 19 319 34 HOH HOH . LA 6 HOH F 20 320 18 HOH HOH . LA 6 HOH F 21 321 98 HOH HOH . LA 6 HOH F 22 322 196 HOH HOH . LA 6 HOH F 23 323 176 HOH HOH . LA 6 HOH F 24 324 108 HOH HOH . LA 6 HOH F 25 325 102 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol NI _atom_site.label_atom_id NI _atom_site.label_comp_id NI _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id V _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x -2.012 _atom_site.Cartn_y 31.533 _atom_site.Cartn_z -22.844 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 32.35 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id NI _atom_site.auth_comp_id NI _atom_site.auth_seq_id 201 _atom_site.auth_asym_id H _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 20 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 7 _model_server_stats.query_time_ms 272 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 1 #