data_5W9H # _model_server_result.job_id Ga3xnPThKMSAkRrRHObA_g _model_server_result.datetime_utc '2025-09-02 23:46:05' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5w9h # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"OA","auth_seq_id":1405}' # _entry.id 5W9H # _exptl.entry_id 5W9H _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 21 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5W9H _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB 1 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5W9H _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 HA N N ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N ? 5 LA N N ? 5 MA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N ? 5 TA N N ? 5 UA N N ? 5 VA N N ? 5 WA N N ? 5 XA N N ? 5 YA N N ? 5 ZA N N ? 5 AB N N ? 5 BB N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n M NAG 1 J 1 NAG 6 4342 NAG 4 n M NAG 2 J 2 NAG 6 4343 NAG 4 n N NAG 1 K 1 NAG e 4360 NAG 4 n N NAG 2 K 2 NAG e 4361 NAG 4 n O NAG 1 L 1 NAG g 4364 NAG 4 n O NAG 2 L 2 NAG g 4365 NAG 4 n P NAG 1 M 1 NAG n 4378 NAG 4 n P NAG 2 M 2 NAG n 4379 NAG 4 n Q NAG 1 N 1 NAG 9 4348 NAG 4 n Q NAG 2 N 2 NAG 9 4349 NAG 4 n R NAG 1 O 1 NAG j 4370 NAG 4 n R NAG 2 O 2 NAG j 4371 NAG 4 n S NAG 1 P 1 NAG m 4376 NAG 4 n S NAG 2 P 2 NAG m 4377 NAG 4 n T NAG 1 Q 1 NAG o 4380 NAG 4 n T NAG 2 Q 2 NAG o 4381 NAG 4 n U NAG 1 R 1 NAG b 4354 NAG 4 n U NAG 2 R 2 NAG b 4355 NAG 4 n V NAG 1 S 1 NAG c 4356 NAG 4 n V NAG 2 S 2 NAG c 4357 NAG 4 n W NAG 1 T 1 NAG h 4366 NAG 4 n W NAG 2 T 2 NAG h 4367 NAG 4 n X NAG 1 U 1 NAG l 4374 NAG 4 n X NAG 2 U 2 NAG l 4375 NAG 4 n Y NAG 1 V 1 NAG 8 4346 NAG 4 n Y NAG 2 V 2 NAG 8 4347 NAG 4 n Z NAG 1 W 1 NAG a 4352 NAG 4 n Z NAG 2 W 2 NAG a 4353 NAG 4 n AA NAG 1 X 1 NAG k 4372 NAG 4 n AA NAG 2 X 2 NAG k 4373 NAG 4 n BA NAG 1 Y 1 NAG 5 4340 NAG 4 n BA NAG 2 Y 2 NAG 5 4341 NAG 4 n CA NAG 1 Z 1 NAG 7 4344 NAG 4 n CA NAG 2 Z 2 NAG 7 4345 NAG 4 n DA NAG 1 a 1 NAG 0 4350 NAG 4 n DA NAG 2 a 2 NAG 0 4351 NAG 4 n EA NAG 1 b 1 NAG d 4358 NAG 4 n EA NAG 2 b 2 NAG d 4359 NAG 4 n FA NAG 1 c 1 NAG f 4362 NAG 4 n FA NAG 2 c 2 NAG f 4363 NAG 4 n GA NAG 1 d 1 NAG i 4368 NAG 4 n GA NAG 2 d 2 NAG i 4369 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 806 A CYS 806 1_555 A SG CYS 828 A CYS 828 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 811 A CYS 811 1_555 A SG CYS 817 A CYS 817 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.127 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 912 A CYS 912 1_555 A SG CYS 925 A CYS 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 1106 A CYS 1106 1_555 A SG CYS 1117 A CYS 1117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 1156 A CYS 1156 1_555 A SG CYS 1164 A CYS 1164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 22 B CYS 22 1_555 B SG CYS 96 B CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf7 C SG CYS 23 C CYS 23 1_555 C SG CYS 92 C CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf8 D SG CYS 806 D CYS 806 1_555 D SG CYS 828 D CYS 828 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf9 D SG CYS 811 D CYS 811 1_555 D SG CYS 817 D CYS 817 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf10 D SG CYS 912 D CYS 912 1_555 D SG CYS 925 D CYS 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf11 D SG CYS 1106 D CYS 1106 1_555 D SG CYS 1117 D CYS 1117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf12 D SG CYS 1156 D CYS 1156 1_555 D SG CYS 1164 D CYS 1164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf13 E SG CYS 22 E CYS 22 1_555 E SG CYS 96 E CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.21 ? disulf ? disulf14 F SG CYS 23 F CYS 23 1_555 F SG CYS 92 F CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf15 G SG CYS 806 G CYS 806 1_555 G SG CYS 828 G CYS 828 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf16 G SG CYS 811 G CYS 811 1_555 G SG CYS 817 G CYS 817 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf17 G SG CYS 912 G CYS 912 1_555 G SG CYS 925 G CYS 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf18 G SG CYS 1106 G CYS 1106 1_555 G SG CYS 1117 G CYS 1117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf19 G SG CYS 1156 G CYS 1156 1_555 G SG CYS 1164 G CYS 1164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf20 H SG CYS 22 H CYS 22 1_555 H SG CYS 96 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf21 I SG CYS 23 I CYS 23 1_555 I SG CYS 92 I CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf22 J SG CYS 30 p CYS 30 1_555 J SG CYS 195 p CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf23 J SG CYS 176 p CYS 176 1_555 J SG CYS 214 p CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? disulf ? disulf24 J SG CYS 185 p CYS 185 1_555 J SG CYS 237 p CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.087 ? disulf ? disulf25 J SG CYS 339 p CYS 339 1_555 J SG CYS 349 p CYS 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf26 J SG CYS 383 p CYS 383 1_555 J SG CYS 407 p CYS 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? disulf ? disulf27 J SG CYS 425 p CYS 425 1_555 J SG CYS 478 p CYS 478 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? disulf ? disulf28 J SG CYS 437 p CYS 437 1_555 J SG CYS 585 p CYS 585 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? disulf ? disulf29 J SG CYS 503 p CYS 503 1_555 J SG CYS 526 p CYS 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf30 J SG CYS 603 p CYS 603 1_555 J SG CYS 654 p CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.852 ? disulf ? disulf31 J SG CYS 620 p CYS 620 1_555 J SG CYS 650 p CYS 650 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? disulf ? disulf32 J SG CYS 679 p CYS 679 1_555 J SG CYS 713 p CYS 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf33 J SG CYS 727 p CYS 727 1_555 J SG CYS 736 p CYS 736 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? disulf ? disulf34 K SG CYS 30 q CYS 30 1_555 K SG CYS 195 q CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf35 K SG CYS 176 q CYS 176 1_555 K SG CYS 214 q CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf36 K SG CYS 185 q CYS 185 1_555 K SG CYS 237 q CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf37 K SG CYS 339 q CYS 339 1_555 K SG CYS 349 q CYS 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf38 K SG CYS 383 q CYS 383 1_555 K SG CYS 407 q CYS 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? disulf ? disulf39 K SG CYS 425 q CYS 425 1_555 K SG CYS 478 q CYS 478 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? disulf ? disulf40 K SG CYS 437 q CYS 437 1_555 K SG CYS 585 q CYS 585 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? disulf ? disulf41 K SG CYS 503 q CYS 503 1_555 K SG CYS 526 q CYS 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf42 K SG CYS 603 q CYS 603 1_555 K SG CYS 654 q CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? disulf ? disulf43 K SG CYS 679 q CYS 679 1_555 K SG CYS 713 q CYS 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf44 K SG CYS 727 q CYS 727 1_555 K SG CYS 736 q CYS 736 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf45 L SG CYS 30 r CYS 30 1_555 L SG CYS 195 r CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf46 L SG CYS 176 r CYS 176 1_555 L SG CYS 214 r CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? disulf ? disulf47 L SG CYS 185 r CYS 185 1_555 L SG CYS 237 r CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? disulf ? disulf48 L SG CYS 339 r CYS 339 1_555 L SG CYS 349 r CYS 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf49 L SG CYS 383 r CYS 383 1_555 L SG CYS 407 r CYS 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.939 ? disulf ? disulf50 L SG CYS 425 r CYS 425 1_555 L SG CYS 478 r CYS 478 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? disulf ? disulf51 L SG CYS 437 r CYS 437 1_555 L SG CYS 585 r CYS 585 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf52 L SG CYS 503 r CYS 503 1_555 L SG CYS 526 r CYS 526 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf53 L SG CYS 603 r CYS 603 1_555 L SG CYS 654 r CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? disulf ? disulf54 L SG CYS 620 r CYS 620 1_555 L SG CYS 650 r CYS 650 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.129 ? disulf ? disulf55 L SG CYS 679 r CYS 679 1_555 L SG CYS 713 r CYS 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf56 L SG CYS 727 r CYS 727 1_555 L SG CYS 736 r CYS 736 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 774 A ASN 774 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 785 A ASN 785 1_555 O C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 870 A ASN 870 1_555 P C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 1176 A ASN 1176 1_555 M C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 1213 A ASN 1213 1_555 N C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale6 D ND2 ASN 774 D ASN 774 1_555 IA C1 NAG . D NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale7 D ND2 ASN 785 D ASN 785 1_555 Q C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale8 D ND2 ASN 870 D ASN 870 1_555 S C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale9 D ND2 ASN 1176 D ASN 1176 1_555 T C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale10 D ND2 ASN 1213 D ASN 1213 1_555 R C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale11 G ND2 ASN 774 G ASN 774 1_555 JA C1 NAG . G NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale12 G ND2 ASN 785 G ASN 785 1_555 U C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale13 G ND2 ASN 870 G ASN 870 1_555 W C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale14 G ND2 ASN 1176 G ASN 1176 1_555 V C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale15 G ND2 ASN 1213 G ASN 1213 1_555 X C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale16 J ND2 ASN 66 p ASN 66 1_555 Z C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale17 J ND2 ASN 104 p ASN 104 1_555 LA C1 NAG . p NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.518 ? covale ? covale18 J ND2 ASN 125 p ASN 125 1_555 AA C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale19 J ND2 ASN 155 p ASN 155 1_555 NA C1 NAG . p NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale20 J ND2 ASN 166 p ASN 166 1_555 MA C1 NAG . p NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale21 J ND2 ASN 236 p ASN 236 1_555 KA C1 NAG . p NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale22 J ND2 ASN 244 p ASN 244 1_555 Y C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale23 J ND2 ASN 619 p ASN 619 1_555 PA C1 NAG . p NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale24 J ND2 ASN 719 p ASN 719 1_555 OA C1 NAG . p NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale25 K ND2 ASN 66 q ASN 66 1_555 BA C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale26 K ND2 ASN 104 q ASN 104 1_555 UA C1 NAG . q NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale27 K ND2 ASN 125 q ASN 125 1_555 CA C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? covale ? covale28 K ND2 ASN 155 q ASN 155 1_555 VA C1 NAG . q NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale29 K ND2 ASN 166 q ASN 166 1_555 QA C1 NAG . q NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? covale ? covale30 K ND2 ASN 236 q ASN 236 1_555 RA C1 NAG . q NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale31 K ND2 ASN 244 q ASN 244 1_555 DA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale32 K ND2 ASN 619 q ASN 619 1_555 SA C1 NAG . q NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale33 K ND2 ASN 719 q ASN 719 1_555 TA C1 NAG . q NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale34 L ND2 ASN 66 r ASN 66 1_555 FA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale35 L ND2 ASN 104 r ASN 104 1_555 XA C1 NAG . r NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale36 L ND2 ASN 125 r ASN 125 1_555 EA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? covale ? covale37 L ND2 ASN 155 r ASN 155 1_555 ZA C1 NAG . r NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale38 L ND2 ASN 166 r ASN 166 1_555 YA C1 NAG . r NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale39 L ND2 ASN 236 r ASN 236 1_555 BB C1 NAG . r NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale40 L ND2 ASN 244 r ASN 244 1_555 GA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.46 ? covale ? covale41 L ND2 ASN 619 r ASN 619 1_555 AB C1 NAG . r NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale42 L ND2 ASN 719 r ASN 719 1_555 WA C1 NAG . r NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale43 M O4 NAG . J NAG 1 1_555 M C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale44 N O4 NAG . K NAG 1 1_555 N C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale45 O O4 NAG . L NAG 1 1_555 O C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale46 P O4 NAG . M NAG 1 1_555 P C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale47 Q O4 NAG . N NAG 1 1_555 Q C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale48 R O4 NAG . O NAG 1 1_555 R C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale49 S O4 NAG . P NAG 1 1_555 S C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale50 T O4 NAG . Q NAG 1 1_555 T C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale51 U O4 NAG . R NAG 1 1_555 U C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale52 V O4 NAG . S NAG 1 1_555 V C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale53 W O4 NAG . T NAG 1 1_555 W C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale54 X O4 NAG . U NAG 1 1_555 X C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale55 Y O4 NAG . V NAG 1 1_555 Y C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale56 Z O4 NAG . W NAG 1 1_555 Z C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale57 AA O4 NAG . X NAG 1 1_555 AA C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale58 BA O4 NAG . Y NAG 1 1_555 BA C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale59 CA O4 NAG . Z NAG 1 1_555 CA C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale60 DA O4 NAG . a NAG 1 1_555 DA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale61 EA O4 NAG . b NAG 1 1_555 EA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale62 FA O4 NAG . c NAG 1 1_555 FA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale63 GA O4 NAG . d NAG 1 1_555 GA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 235 n n C1 O1 NAG sing 236 n n C1 O5 NAG sing 237 n n C1 H1 NAG sing 238 n n C2 C3 NAG sing 239 n n C2 N2 NAG sing 240 n n C2 H2 NAG sing 241 n n C3 C4 NAG sing 242 n n C3 O3 NAG sing 243 n n C3 H3 NAG sing 244 n n C4 C5 NAG sing 245 n n C4 O4 NAG sing 246 n n C4 H4 NAG sing 247 n n C5 C6 NAG sing 248 n n C5 O5 NAG sing 249 n n C5 H5 NAG sing 250 n n C6 O6 NAG sing 251 n n C6 H61 NAG sing 252 n n C6 H62 NAG sing 253 n n C7 C8 NAG sing 254 n n C7 N2 NAG sing 255 n n C7 O7 NAG doub 256 n n C8 H81 NAG sing 257 n n C8 H82 NAG sing 258 n n C8 H83 NAG sing 259 n n N2 HN2 NAG sing 260 n n O1 HO1 NAG sing 261 n n O3 HO3 NAG sing 262 n n O4 HO4 NAG sing 263 n n O6 HO6 NAG sing 264 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 5W9H _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code HA 5 NAG A 1 1401 4323 NAG NAG . IA 5 NAG D 1 1401 4327 NAG NAG . JA 5 NAG G 1 1401 4332 NAG NAG . KA 5 NAG p 1 1401 4325 NAG NAG . LA 5 NAG p 1 1402 4328 NAG NAG . MA 5 NAG p 1 1403 4335 NAG NAG . NA 5 NAG p 1 1404 4336 NAG NAG . OA 5 NAG p 1 1405 4337 NAG NAG . PA 5 NAG p 1 1406 4338 NAG NAG . QA 5 NAG q 1 1401 4319 NAG NAG . RA 5 NAG q 1 1402 4320 NAG NAG . SA 5 NAG q 1 1403 4321 NAG NAG . TA 5 NAG q 1 1404 4329 NAG NAG . UA 5 NAG q 1 1405 4330 NAG NAG . VA 5 NAG q 1 1406 4333 NAG NAG . WA 5 NAG r 1 1401 4318 NAG NAG . XA 5 NAG r 1 1402 4322 NAG NAG . YA 5 NAG r 1 1403 4324 NAG NAG . ZA 5 NAG r 1 1404 4326 NAG NAG . AB 5 NAG r 1 1405 4331 NAG NAG . BB 5 NAG r 1 1406 4334 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . OA 5 192.847 133.947 161.971 1 132.9 ? C1 NAG 1405 p 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . OA 5 193.065 132.57 161.328 1 132.9 ? C2 NAG 1405 p 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . OA 5 192.268 131.493 162.067 1 132.9 ? C3 NAG 1405 p 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . OA 5 192.58 131.511 163.556 1 132.9 ? C4 NAG 1405 p 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . OA 5 192.28 132.894 164.11 1 132.9 ? C5 NAG 1405 p 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . OA 5 192.622 133.029 165.574 1 132.9 ? C6 NAG 1405 p 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . OA 5 193.524 133.014 158.952 1 132.9 ? C7 NAG 1405 p 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . OA 5 192.983 132.948 157.558 1 132.9 ? C8 NAG 1405 p 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . OA 5 192.704 132.589 159.919 1 132.9 ? N2 NAG 1405 p 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . OA 5 192.581 130.213 161.532 1 132.9 ? O3 NAG 1405 p 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . OA 5 191.785 130.549 164.238 1 132.9 ? O4 NAG 1405 p 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . OA 5 193.07 133.863 163.406 1 132.9 ? O5 NAG 1405 p 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . OA 5 191.775 132.218 166.377 1 132.9 ? O6 NAG 1405 p 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . OA 5 194.649 133.437 159.193 1 132.9 ? O7 NAG 1405 p 1 # _model_server_stats.io_time_ms 29 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 37 _model_server_stats.query_time_ms 324 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #