data_5W9I # _model_server_result.job_id Z5Una3bAzjBatzhbl7r3cw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-11 22:45:45' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5w9i # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"PA","auth_seq_id":1401}' # _entry.id 5W9I # _exptl.entry_id 5W9I _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 5 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 21 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5W9I _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB 1 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5W9I _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 HA N N ? 5 IA N N ? 5 JA N N ? 5 KA N N ? 5 LA N N ? 5 MA N N ? 5 NA N N ? 5 OA N N ? 5 PA N N ? 5 QA N N ? 5 RA N N ? 5 SA N N ? 5 TA N N ? 5 UA N N ? 5 VA N N ? 5 WA N N ? 5 XA N N ? 5 YA N N ? 5 ZA N N ? 5 AB N N ? 5 BB N N # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n M NAG 1 M 1 NAG e 3715 NAG 4 n M NAG 2 M 2 NAG e 3716 NAG 4 n N NAG 1 N 1 NAG l 3729 NAG 4 n N NAG 2 N 2 NAG l 3730 NAG 4 n O NAG 1 O 1 NAG p 3737 NAG 4 n O NAG 2 O 2 NAG p 3738 NAG 4 n P NAG 1 P 1 NAG r 3741 NAG 4 n P NAG 2 P 2 NAG r 3742 NAG 4 n Q NAG 1 Q 1 NAG 9 3703 NAG 4 n Q NAG 2 Q 2 NAG 9 3704 NAG 4 n R NAG 1 R 1 NAG b 3709 NAG 4 n R NAG 2 R 2 NAG b 3710 NAG 4 n S NAG 1 S 1 NAG m 3731 NAG 4 n S NAG 2 S 2 NAG m 3732 NAG 4 n T NAG 1 T 1 NAG 0 3705 NAG 4 n T NAG 2 T 2 NAG 0 3706 NAG 4 n U NAG 1 U 1 NAG g 3719 NAG 4 n U NAG 2 U 2 NAG g 3720 NAG 4 n V NAG 1 V 1 NAG j 3725 NAG 4 n V NAG 2 V 2 NAG j 3726 NAG 4 n W NAG 1 W 1 NAG n 3733 NAG 4 n W NAG 2 W 2 NAG n 3734 NAG 4 n X NAG 1 X 1 NAG 8 3701 NAG 4 n X NAG 2 X 2 NAG 8 3702 NAG 4 n Y NAG 1 Y 1 NAG a 3707 NAG 4 n Y NAG 2 Y 2 NAG a 3708 NAG 4 n Z NAG 1 Z 1 NAG k 3727 NAG 4 n Z NAG 2 Z 2 NAG k 3728 NAG 4 n AA NAG 1 a 1 NAG h 3721 NAG 4 n AA NAG 2 a 2 NAG h 3722 NAG 4 n BA NAG 1 b 1 NAG i 3723 NAG 4 n BA NAG 2 b 2 NAG i 3724 NAG 4 n CA NAG 1 c 1 NAG o 3735 NAG 4 n CA NAG 2 c 2 NAG o 3736 NAG 4 n DA NAG 1 d 1 NAG q 3739 NAG 4 n DA NAG 2 d 2 NAG q 3740 NAG 4 n EA NAG 1 e 1 NAG c 3711 NAG 4 n EA NAG 2 e 2 NAG c 3712 NAG 4 n FA NAG 1 f 1 NAG d 3713 NAG 4 n FA NAG 2 f 2 NAG d 3714 NAG 4 n GA NAG 1 g 1 NAG f 3717 NAG 4 n GA NAG 2 g 2 NAG f 3718 NAG # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 806 A CYS 806 1_555 A SG CYS 828 A CYS 828 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 811 A CYS 811 1_555 A SG CYS 817 A CYS 817 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 912 A CYS 912 1_555 A SG CYS 925 A CYS 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 1106 A CYS 1106 1_555 A SG CYS 1117 A CYS 1117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.995 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 1156 A CYS 1156 1_555 A SG CYS 1164 A CYS 1164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 30 B CYS 30 1_555 B SG CYS 195 B CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 176 B CYS 176 1_555 B SG CYS 214 B CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 185 B CYS 185 1_555 B SG CYS 237 B CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 339 B CYS 339 1_555 B SG CYS 349 B CYS 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 603 B CYS 603 1_555 B SG CYS 654 B CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.091 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 620 B CYS 620 1_555 B SG CYS 650 B CYS 650 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 679 B CYS 679 1_555 B SG CYS 713 B CYS 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 727 B CYS 727 1_555 B SG CYS 736 B CYS 736 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? disulf ? disulf14 C SG CYS 22 C CYS 22 1_555 C SG CYS 96 C CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf15 D SG CYS 23 D CYS 23 1_555 D SG CYS 92 D CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf16 E SG CYS 806 E CYS 806 1_555 E SG CYS 828 E CYS 828 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.89 ? disulf ? disulf17 E SG CYS 811 E CYS 811 1_555 E SG CYS 817 E CYS 817 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? disulf ? disulf18 E SG CYS 912 E CYS 912 1_555 E SG CYS 925 E CYS 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? disulf ? disulf19 E SG CYS 1156 E CYS 1156 1_555 E SG CYS 1164 E CYS 1164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf20 F SG CYS 30 F CYS 30 1_555 F SG CYS 195 F CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? disulf ? disulf21 F SG CYS 176 F CYS 176 1_555 F SG CYS 214 F CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.124 ? disulf ? disulf22 F SG CYS 185 F CYS 185 1_555 F SG CYS 237 F CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.079 ? disulf ? disulf23 F SG CYS 339 F CYS 339 1_555 F SG CYS 349 F CYS 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 F SG CYS 603 F CYS 603 1_555 F SG CYS 654 F CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.92 ? disulf ? disulf25 F SG CYS 620 F CYS 620 1_555 F SG CYS 650 F CYS 650 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.877 ? disulf ? disulf26 F SG CYS 679 F CYS 679 1_555 F SG CYS 713 F CYS 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf27 F SG CYS 727 F CYS 727 1_555 F SG CYS 736 F CYS 736 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? disulf ? disulf28 G SG CYS 22 G CYS 22 1_555 G SG CYS 96 G CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf29 H SG CYS 23 H CYS 23 1_555 H SG CYS 92 H CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf30 I SG CYS 806 I CYS 806 1_555 I SG CYS 828 I CYS 828 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf31 I SG CYS 811 I CYS 811 1_555 I SG CYS 817 I CYS 817 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? disulf ? disulf32 I SG CYS 912 I CYS 912 1_555 I SG CYS 925 I CYS 925 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf33 I SG CYS 1156 I CYS 1156 1_555 I SG CYS 1164 I CYS 1164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf34 J SG CYS 30 J CYS 30 1_555 J SG CYS 195 J CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? disulf ? disulf35 J SG CYS 176 J CYS 176 1_555 J SG CYS 214 J CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.135 ? disulf ? disulf36 J SG CYS 185 J CYS 185 1_555 J SG CYS 237 J CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? disulf ? disulf37 J SG CYS 339 J CYS 339 1_555 J SG CYS 349 J CYS 349 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf38 J SG CYS 603 J CYS 603 1_555 J SG CYS 654 J CYS 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? disulf ? disulf39 J SG CYS 620 J CYS 620 1_555 J SG CYS 650 J CYS 650 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? disulf ? disulf40 J SG CYS 679 J CYS 679 1_555 J SG CYS 713 J CYS 713 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf41 J SG CYS 727 J CYS 727 1_555 J SG CYS 736 J CYS 736 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? disulf ? disulf42 K SG CYS 22 K CYS 22 1_555 K SG CYS 96 K CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf43 L SG CYS 23 L CYS 23 1_555 L SG CYS 92 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 774 A ASN 774 1_555 HA C1 NAG . A NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 785 A ASN 785 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.42 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 870 A ASN 870 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 1176 A ASN 1176 1_555 P C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 1213 A ASN 1213 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale6 B CE2 TYR 18 B TYR 18 1_555 IA O7 NAG . B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? covale ? covale7 B ND2 ASN 66 B ASN 66 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale8 B ND2 ASN 104 B ASN 104 1_555 NA C1 NAG . B NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale9 B ND2 ASN 125 B ASN 125 1_555 S C1 NAG . S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale10 B ND2 ASN 155 B ASN 155 1_555 JA C1 NAG . B NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale11 B ND2 ASN 166 B ASN 166 1_555 KA C1 NAG . B NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale12 B ND2 ASN 236 B ASN 236 1_555 IA C1 NAG . B NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale13 B ND2 ASN 244 B ASN 244 1_555 R C1 NAG . R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale14 B ND2 ASN 619 B ASN 619 1_555 MA C1 NAG . B NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale15 B ND2 ASN 719 B ASN 719 1_555 LA C1 NAG . B NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale16 E ND2 ASN 774 E ASN 774 1_555 OA C1 NAG . E NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale17 E ND2 ASN 785 E ASN 785 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale18 E ND2 ASN 870 E ASN 870 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale19 E ND2 ASN 1176 E ASN 1176 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale20 E ND2 ASN 1213 E ASN 1213 1_555 W C1 NAG . W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale21 F ND2 ASN 66 F ASN 66 1_555 X C1 NAG . X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale22 F ND2 ASN 104 F ASN 104 1_555 UA C1 NAG . F NAG 1406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale23 F ND2 ASN 125 F ASN 125 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale24 F ND2 ASN 155 F ASN 155 1_555 SA C1 NAG . F NAG 1404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.474 ? covale ? covale25 F ND2 ASN 166 F ASN 166 1_555 RA C1 NAG . F NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale26 F NH2 ARG 221 F ARG 221 1_555 Y O6 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.297 ? covale ? covale27 F ND2 ASN 236 F ASN 236 1_555 PA C1 NAG . F NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale28 F ND2 ASN 244 F ASN 244 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale29 F ND2 ASN 619 F ASN 619 1_555 TA C1 NAG . F NAG 1405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale30 F ND2 ASN 719 F ASN 719 1_555 QA C1 NAG . F NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale31 I ND2 ASN 774 I ASN 774 1_555 VA C1 NAG . I NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.42 ? covale ? covale32 I ND2 ASN 785 I ASN 785 1_555 CA C1 NAG . c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? covale ? covale33 I ND2 ASN 870 I ASN 870 1_555 BA C1 NAG . b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale34 I ND2 ASN 1176 I ASN 1176 1_555 DA C1 NAG . d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? covale ? covale35 I ND2 ASN 1213 I ASN 1213 1_555 AA C1 NAG . a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale36 J ND2 ASN 66 J ASN 66 1_555 FA C1 NAG . f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale37 J ND2 ASN 104 J ASN 104 1_555 WA C1 NAG . J NAG 1401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale38 J ND2 ASN 125 J ASN 125 1_555 GA C1 NAG . g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale39 J ND2 ASN 155 J ASN 155 1_555 XA C1 NAG . J NAG 1402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale40 J CG PHE 165 J PHE 165 1_555 BB C8 NAG . J NAG 1412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale41 J ND2 ASN 166 J ASN 166 1_555 BB C1 NAG . J NAG 1412 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.47 ? covale ? covale42 J ND2 ASN 236 J ASN 236 1_555 ZA C1 NAG . J NAG 1410 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale43 J ND2 ASN 244 J ASN 244 1_555 EA C1 NAG . e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale44 J ND2 ASN 619 J ASN 619 1_555 AB C1 NAG . J NAG 1411 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale45 J ND2 ASN 719 J ASN 719 1_555 YA C1 NAG . J NAG 1403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale46 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.461 ? covale ? covale47 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale48 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale49 P O4 NAG . P NAG 1 1_555 P C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale50 Q O4 NAG . Q NAG 1 1_555 Q C1 NAG . Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale51 R O4 NAG . R NAG 1 1_555 R C1 NAG . R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale52 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale53 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale54 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale55 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? covale ? covale56 W O4 NAG . W NAG 1 1_555 W C1 NAG . W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale57 X O4 NAG . X NAG 1 1_555 X C1 NAG . X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale58 Y O4 NAG . Y NAG 1 1_555 Y C1 NAG . Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale59 Z O4 NAG . Z NAG 1 1_555 Z C1 NAG . Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale60 AA O4 NAG . a NAG 1 1_555 AA C1 NAG . a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale61 BA O4 NAG . b NAG 1 1_555 BA C1 NAG . b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale62 CA O4 NAG . c NAG 1 1_555 CA C1 NAG . c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale63 DA O4 NAG . d NAG 1 1_555 DA C1 NAG . d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale64 EA O4 NAG . e NAG 1 1_555 EA C1 NAG . e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.475 ? covale ? covale65 FA O4 NAG . f NAG 1 1_555 FA C1 NAG . f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale66 GA O4 NAG . g NAG 1 1_555 GA C1 NAG . g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 5W9I _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code HA 5 NAG A 1 1401 3690 NAG NAG . IA 5 NAG B 1 1401 3681 NAG NAG . JA 5 NAG B 1 1402 3682 NAG NAG . KA 5 NAG B 1 1403 3684 NAG NAG . LA 5 NAG B 1 1404 3686 NAG NAG . MA 5 NAG B 1 1405 3696 NAG NAG . NA 5 NAG B 1 1406 3698 NAG NAG . OA 5 NAG E 1 1401 3692 NAG NAG . PA 5 NAG F 1 1401 3679 NAG NAG . QA 5 NAG F 1 1402 3683 NAG NAG . RA 5 NAG F 1 1403 3688 NAG NAG . SA 5 NAG F 1 1404 3689 NAG NAG . TA 5 NAG F 1 1405 3693 NAG NAG . UA 5 NAG F 1 1406 3699 NAG NAG . VA 5 NAG I 1 1401 3685 NAG NAG . WA 5 NAG J 1 1401 3687 NAG NAG . XA 5 NAG J 1 1402 3695 NAG NAG . YA 5 NAG J 1 1403 3697 NAG NAG . ZA 5 NAG J 1 1410 3694 NAG NAG . AB 5 NAG J 1 1411 3691 NAG NAG . BB 5 NAG J 1 1412 3680 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . PA 5 127.778 190.22 90.848 1 72.81 ? C1 NAG 1401 F 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . PA 5 129.187 190.843 90.907 1 72.81 ? C2 NAG 1401 F 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . PA 5 129.787 190.984 89.505 1 72.81 ? C3 NAG 1401 F 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . PA 5 129.729 189.651 88.771 1 72.81 ? C4 NAG 1401 F 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . PA 5 128.285 189.16 88.738 1 72.81 ? C5 NAG 1401 F 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . PA 5 128.117 187.825 88.054 1 72.81 ? C6 NAG 1401 F 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . PA 5 128.546 193.236 91.353 1 72.81 ? C7 NAG 1401 F 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . PA 5 128.77 194.379 92.295 1 72.81 ? C8 NAG 1401 F 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . PA 5 129.22 192.106 91.642 1 72.81 ? N2 NAG 1401 F 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . PA 5 131.135 191.426 89.613 1 72.81 ? O3 NAG 1401 F 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . PA 5 130.23 189.782 87.446 1 72.81 ? O4 NAG 1401 F 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . PA 5 127.815 188.998 90.084 1 72.81 ? O5 NAG 1401 F 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . PA 5 126.742 187.482 87.947 1 72.81 ? O6 NAG 1401 F 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . PA 5 127.8 193.345 90.379 1 72.81 ? O7 NAG 1401 F 1 # _model_server_stats.io_time_ms 18 _model_server_stats.parse_time_ms 25 _model_server_stats.create_model_time_ms 47 _model_server_stats.query_time_ms 327 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 14 #