data_5WB7 # _model_server_result.job_id OfhkhHUM_o6k0UR6P7rPOQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 22:26:01' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5wb7 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"U","auth_seq_id":603}' # _entry.id 5WB7 # _exptl.entry_id 5WB7 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 7 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 7 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 96.74 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5WB7 _cell.length_a 76.647 _cell.length_b 199.288 _cell.length_c 87.916 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5WB7 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 1 PISA tetrameric 4 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,D,E,H,I,N,O,P,Q,R,V,W,Z,AA 1 1 B,C,F,G,J,K,L,M,S,T,U,X,Y,BA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 7 P N N ? 7 Q N N ? 7 R N N ? 7 S N N ? 7 T N N ? 7 U N N ? 7 V N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 3 oligosaccharide 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 3 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 3 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 3 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 4 ? 4 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 4 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 6 ? 4 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 7 ? 4 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 8 ? 5 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 9 ? 5 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 10 ? 6 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 3 n I NAG 1 I 1 NAG A 3281 NAG 3 n I NAG 2 I 2 NAG A 3282 NAG 3 n I BMA 3 I 3 BMA A 3283 BMA 3 n I MAN 4 I 4 MAN A 3284 MAN 4 n J NAG 1 J 1 NAG B 3281 NAG 4 n J NAG 2 J 2 NAG B 3282 NAG 4 n J BMA 3 J 3 BMA B 3283 BMA 4 n J MAN 4 J 4 MAN B 3284 MAN 4 n J MAN 5 J 5 MAN B 3285 MAN 5 n K NAG 1 K 1 NAG B 4201 NAG 5 n K NAG 2 K 2 NAG B 4202 NAG 5 n K BMA 3 K 3 BMA B 4203 BMA 6 n L NAG 1 L 1 NAG C 1511 NAG 6 n L NAG 2 L 2 NAG C 1512 NAG 3 n M NAG 1 M 1 NAG C 3281 NAG 3 n M NAG 2 M 2 NAG C 3282 NAG 3 n M BMA 3 M 3 BMA C 3283 BMA 3 n M MAN 4 M 4 MAN C 3284 MAN 6 n N NAG 1 N 1 NAG D 3201 NAG 6 n N NAG 2 N 2 NAG D 3202 NAG 3 n O NAG 1 O 1 NAG D 3281 NAG 3 n O NAG 2 O 2 NAG D 3282 NAG 3 n O BMA 3 O 3 BMA D 3283 BMA 3 n O MAN 4 O 4 MAN D 3284 MAN # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 7 A CYS 7 1_555 A SG CYS 34 A CYS 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 133 A CYS 133 1_555 A SG CYS 163 A CYS 163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 166 A CYS 166 1_555 A SG CYS 175 A CYS 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 170 A CYS 170 1_555 A SG CYS 183 A CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 191 A CYS 191 1_555 A SG CYS 199 A CYS 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 195 A CYS 195 1_555 A SG CYS 207 A CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 208 A CYS 208 1_555 A SG CYS 216 A CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf8 A SG CYS 212 A CYS 212 1_555 A SG CYS 224 A CYS 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf9 A SG CYS 227 A CYS 227 1_555 A SG CYS 236 A CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf10 A SG CYS 240 A CYS 240 1_555 A SG CYS 267 A CYS 267 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf11 A SG CYS 271 A CYS 271 1_555 A SG CYS 283 A CYS 283 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf12 A SG CYS 287 A CYS 287 1_555 A SG CYS 302 A CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf13 A SG CYS 305 A CYS 305 1_555 A SG CYS 309 A CYS 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf14 A SG CYS 313 A CYS 313 1_555 A SG CYS 338 A CYS 338 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf15 A SG CYS 446 A CYS 446 1_555 A SG CYS 475 A CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf16 A SG CYS 482 A CYS 482 1_555 A SG CYS 491 A CYS 491 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf17 A SG CYS 486 A CYS 486 1_555 A SG CYS 499 A CYS 499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? disulf ? disulf18 B SG CYS 7 B CYS 7 1_555 B SG CYS 34 B CYS 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf19 B SG CYS 133 B CYS 133 1_555 B SG CYS 163 B CYS 163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf20 B SG CYS 166 B CYS 166 1_555 B SG CYS 175 B CYS 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf21 B SG CYS 170 B CYS 170 1_555 B SG CYS 183 B CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf22 B SG CYS 191 B CYS 191 1_555 B SG CYS 199 B CYS 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf23 B SG CYS 195 B CYS 195 1_555 B SG CYS 207 B CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf24 B SG CYS 208 B CYS 208 1_555 B SG CYS 216 B CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf25 B SG CYS 212 B CYS 212 1_555 B SG CYS 224 B CYS 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf26 B SG CYS 227 B CYS 227 1_555 B SG CYS 236 B CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf27 B SG CYS 240 B CYS 240 1_555 B SG CYS 267 B CYS 267 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf28 B SG CYS 271 B CYS 271 1_555 B SG CYS 283 B CYS 283 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf29 B SG CYS 287 B CYS 287 1_555 B SG CYS 302 B CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf30 B SG CYS 305 B CYS 305 1_555 B SG CYS 309 B CYS 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf31 B SG CYS 313 B CYS 313 1_555 B SG CYS 338 B CYS 338 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf32 B SG CYS 446 B CYS 446 1_555 B SG CYS 475 B CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf33 B SG CYS 482 B CYS 482 1_555 B SG CYS 491 B CYS 491 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf34 B SG CYS 486 B CYS 486 1_555 B SG CYS 499 B CYS 499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf35 C SG CYS 7 C CYS 7 1_555 C SG CYS 34 C CYS 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf36 C SG CYS 133 C CYS 133 1_555 C SG CYS 163 C CYS 163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf37 C SG CYS 166 C CYS 166 1_555 C SG CYS 175 C CYS 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf38 C SG CYS 170 C CYS 170 1_555 C SG CYS 183 C CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf39 C SG CYS 191 C CYS 191 1_555 C SG CYS 199 C CYS 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf ? disulf40 C SG CYS 195 C CYS 195 1_555 C SG CYS 207 C CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf41 C SG CYS 208 C CYS 208 1_555 C SG CYS 216 C CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf42 C SG CYS 212 C CYS 212 1_555 C SG CYS 224 C CYS 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf43 C SG CYS 227 C CYS 227 1_555 C SG CYS 236 C CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf44 C SG CYS 240 C CYS 240 1_555 C SG CYS 267 C CYS 267 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf45 C SG CYS 271 C CYS 271 1_555 C SG CYS 283 C CYS 283 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf46 C SG CYS 287 C CYS 287 1_555 C SG CYS 302 C CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf47 C SG CYS 305 C CYS 305 1_555 C SG CYS 309 C CYS 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf48 C SG CYS 313 C CYS 313 1_555 C SG CYS 338 C CYS 338 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf49 C SG CYS 446 C CYS 446 1_555 C SG CYS 475 C CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf ? disulf50 C SG CYS 482 C CYS 482 1_555 C SG CYS 491 C CYS 491 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf51 C SG CYS 486 C CYS 486 1_555 C SG CYS 499 C CYS 499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf52 D SG CYS 7 D CYS 7 1_555 D SG CYS 34 D CYS 34 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? disulf ? disulf53 D SG CYS 133 D CYS 133 1_555 D SG CYS 163 D CYS 163 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf54 D SG CYS 166 D CYS 166 1_555 D SG CYS 175 D CYS 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf55 D SG CYS 170 D CYS 170 1_555 D SG CYS 183 D CYS 183 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf56 D SG CYS 191 D CYS 191 1_555 D SG CYS 199 D CYS 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf57 D SG CYS 195 D CYS 195 1_555 D SG CYS 207 D CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf58 D SG CYS 208 D CYS 208 1_555 D SG CYS 216 D CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf59 D SG CYS 212 D CYS 212 1_555 D SG CYS 224 D CYS 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf60 D SG CYS 227 D CYS 227 1_555 D SG CYS 236 D CYS 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf61 D SG CYS 240 D CYS 240 1_555 D SG CYS 267 D CYS 267 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf62 D SG CYS 271 D CYS 271 1_555 D SG CYS 283 D CYS 283 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf63 D SG CYS 287 D CYS 287 1_555 D SG CYS 302 D CYS 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf64 D SG CYS 305 D CYS 305 1_555 D SG CYS 309 D CYS 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf65 D SG CYS 313 D CYS 313 1_555 D SG CYS 338 D CYS 338 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf66 D SG CYS 446 D CYS 446 1_555 D SG CYS 475 D CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf67 D SG CYS 482 D CYS 482 1_555 D SG CYS 491 D CYS 491 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf68 D SG CYS 486 D CYS 486 1_555 D SG CYS 499 D CYS 499 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf69 E SG CYS 14 E CYS 6 1_555 E SG CYS 27 E CYS 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf70 E SG CYS 22 E CYS 14 1_555 E SG CYS 38 E CYS 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf71 E SG CYS 40 E CYS 32 1_555 E SG CYS 49 E CYS 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf72 F SG CYS 14 F CYS 6 1_555 F SG CYS 27 F CYS 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf73 F SG CYS 22 F CYS 14 1_555 F SG CYS 38 F CYS 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf74 F SG CYS 40 F CYS 32 1_555 F SG CYS 49 F CYS 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf75 G SG CYS 14 G CYS 6 1_555 G SG CYS 27 G CYS 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf76 G SG CYS 22 G CYS 14 1_555 G SG CYS 38 G CYS 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf77 G SG CYS 40 G CYS 32 1_555 G SG CYS 49 G CYS 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf78 H SG CYS 14 H CYS 6 1_555 H SG CYS 27 H CYS 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf79 H SG CYS 22 H CYS 14 1_555 H SG CYS 38 H CYS 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf80 H SG CYS 40 H CYS 32 1_555 H SG CYS 49 H CYS 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 32 A ASN 32 1_555 P C1 NAG . A NAG 3201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 328 A ASN 328 1_555 I C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale ? covale3 A ND2 ASN 389 A ASN 389 1_555 Q C1 NAG . A NAG 3206 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale4 A ND2 ASN 420 A ASN 420 1_555 R C1 NAG . A NAG 3207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale5 B ND2 ASN 32 B ASN 32 1_555 T C1 NAG . B NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale6 B ND2 ASN 151 B ASN 151 1_555 S C1 NAG . B NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? covale ? covale7 B ND2 ASN 328 B ASN 328 1_555 J C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale8 B ND2 ASN 420 B ASN 420 1_555 K C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.487 ? covale ? covale9 C ND2 ASN 32 C ASN 32 1_555 U C1 NAG . C NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale10 C ND2 ASN 151 C ASN 151 1_555 L C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.483 ? covale ? covale11 C ND2 ASN 328 C ASN 328 1_555 M C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.486 ? covale ? covale12 D ND2 ASN 32 D ASN 32 1_555 N C1 NAG . N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.49 ? covale ? covale13 D ND2 ASN 151 D ASN 151 1_555 V C1 NAG . D NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale14 D ND2 ASN 328 D ASN 328 1_555 O C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale ? covale15 I O4 NAG . I NAG 1 1_555 I C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale16 I O4 NAG . I NAG 2 1_555 I C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale17 I O3 BMA . I BMA 3 1_555 I C1 MAN . I MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale18 J O4 NAG . J NAG 1 1_555 J C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale19 J O4 NAG . J NAG 2 1_555 J C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale20 J O3 BMA . J BMA 3 1_555 J C1 MAN . J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? covale ? covale21 J O6 BMA . J BMA 3 1_555 J C1 MAN . J MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale22 K O4 NAG . K NAG 1 1_555 K C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale23 K O4 NAG . K NAG 2 1_555 K C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale24 L O4 NAG . L NAG 1 1_555 L C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale25 M O4 NAG . M NAG 1 1_555 M C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale26 M O4 NAG . M NAG 2 1_555 M C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale27 M O3 BMA . M BMA 3 1_555 M C1 MAN . M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale28 N O4 NAG . N NAG 1 1_555 N C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale29 O O4 NAG . O NAG 1 1_555 O C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale30 O O4 NAG . O NAG 2 1_555 O C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale31 O O3 BMA . O BMA 3 1_555 O C1 MAN . O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 285 n n C1 O1 NAG sing 286 n n C1 O5 NAG sing 287 n n C1 H1 NAG sing 288 n n C2 C3 NAG sing 289 n n C2 N2 NAG sing 290 n n C2 H2 NAG sing 291 n n C3 C4 NAG sing 292 n n C3 O3 NAG sing 293 n n C3 H3 NAG sing 294 n n C4 C5 NAG sing 295 n n C4 O4 NAG sing 296 n n C4 H4 NAG sing 297 n n C5 C6 NAG sing 298 n n C5 O5 NAG sing 299 n n C5 H5 NAG sing 300 n n C6 O6 NAG sing 301 n n C6 H61 NAG sing 302 n n C6 H62 NAG sing 303 n n C7 C8 NAG sing 304 n n C7 N2 NAG sing 305 n n C7 O7 NAG doub 306 n n C8 H81 NAG sing 307 n n C8 H82 NAG sing 308 n n C8 H83 NAG sing 309 n n N2 HN2 NAG sing 310 n n O1 HO1 NAG sing 311 n n O3 HO3 NAG sing 312 n n O4 HO4 NAG sing 313 n n O6 HO6 NAG sing 314 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 5WB7 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.013047 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001541 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005018 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.011454 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code P 7 NAG A 1 3201 3201 NAG NAG . Q 7 NAG A 1 3206 3891 NAG NAG . R 7 NAG A 1 3207 4201 NAG NAG . S 7 NAG B 1 601 1511 NAG NAG . T 7 NAG B 1 602 3201 NAG NAG . U 7 NAG C 1 603 3201 NAG NAG . V 7 NAG D 1 601 1511 NAG NAG . W 8 HOH A 1 3301 88 HOH HOH . W 8 HOH A 2 3302 26 HOH HOH . W 8 HOH A 3 3303 116 HOH HOH . W 8 HOH A 4 3304 9 HOH HOH . W 8 HOH A 5 3305 32 HOH HOH . X 8 HOH B 1 701 107 HOH HOH . X 8 HOH B 2 702 115 HOH HOH . X 8 HOH B 3 703 24 HOH HOH . X 8 HOH B 4 704 48 HOH HOH . X 8 HOH B 5 705 11 HOH HOH . X 8 HOH B 6 706 72 HOH HOH . X 8 HOH B 7 707 30 HOH HOH . X 8 HOH B 8 708 80 HOH HOH . X 8 HOH B 9 709 44 HOH HOH . X 8 HOH B 10 710 96 HOH HOH . X 8 HOH B 11 711 34 HOH HOH . X 8 HOH B 12 712 23 HOH HOH . X 8 HOH B 13 713 97 HOH HOH . X 8 HOH B 14 714 33 HOH HOH . X 8 HOH B 15 715 106 HOH HOH . X 8 HOH B 16 716 12 HOH HOH . X 8 HOH B 17 717 68 HOH HOH . X 8 HOH B 18 718 86 HOH HOH . X 8 HOH B 19 719 37 HOH HOH . X 8 HOH B 20 720 2 HOH HOH . Y 8 HOH C 1 701 67 HOH HOH . Y 8 HOH C 2 702 10 HOH HOH . Y 8 HOH C 3 703 49 HOH HOH . Y 8 HOH C 4 704 31 HOH HOH . Y 8 HOH C 5 705 53 HOH HOH . Y 8 HOH C 6 706 73 HOH HOH . Y 8 HOH C 7 707 55 HOH HOH . Y 8 HOH C 8 708 6 HOH HOH . Y 8 HOH C 9 709 70 HOH HOH . Z 8 HOH D 1 701 112 HOH HOH . Z 8 HOH D 2 702 29 HOH HOH . Z 8 HOH D 3 703 43 HOH HOH . Z 8 HOH D 4 704 15 HOH HOH . Z 8 HOH D 5 705 85 HOH HOH . AA 8 HOH E 1 101 25 HOH HOH . BA 8 HOH F 1 101 1 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . U 7 56.361 43.452 45.349 1 74.88 ? C1 NAG 603 C 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . U 7 57.161 44.709 45.648 1 101.49 ? C2 NAG 603 C 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . U 7 56.779 45.807 44.668 1 111.88 ? C3 NAG 603 C 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . U 7 57.001 45.322 43.241 1 105.85 ? C4 NAG 603 C 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . U 7 56.277 43.997 42.995 1 88.45 ? C5 NAG 603 C 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . U 7 56.647 43.376 41.667 1 89.7 ? C6 NAG 603 C 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . U 7 57.759 44.749 48.022 1 87.39 ? C7 NAG 603 C 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . U 7 57.434 45.3 49.375 1 76.64 ? C8 NAG 603 C 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . U 7 56.971 45.151 47.019 1 104.09 ? N2 NAG 603 C 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . U 7 57.568 46.966 44.917 1 123.86 ? O3 NAG 603 C 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . U 7 56.511 46.295 42.326 1 112.33 ? O4 NAG 603 C 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . U 7 56.619 43.029 44.003 1 81.15 ? O5 NAG 603 C 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . U 7 55.53 42.755 41.047 1 99.96 ? O6 NAG 603 C 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . U 7 58.698 43.98 47.843 1 80.61 ? O7 NAG 603 C 1 # _model_server_stats.io_time_ms 38 _model_server_stats.parse_time_ms 19 _model_server_stats.create_model_time_ms 37 _model_server_stats.query_time_ms 279 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 14 #