data_5WG6
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_model_server_params.name     atom_site 
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
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_symmetry.Int_Tables_number        97 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'I 4 2 2' 
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loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,I,J,K,L,M 1 1 
C,D,N,O,P,Q,R,S,T,U 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
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_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      4 
_struct_asym.id                             M 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
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loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 281 A CYS 286 1_555 L ZN ZN . A ZN 9008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 284 A CYS 289 1_555 L ZN ZN . A ZN 9008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.149 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 289 A CYS 294 1_555 L ZN ZN . A ZN 9008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? 
metalc ? metalc4 A ND1 HIS 292 A HIS 297 1_555 L ZN ZN . A ZN 9008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 412 A CYS 452 1_555 E ZN ZN . A ZN 9001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 423 A CYS 463 1_555 E ZN ZN . A ZN 9001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? 
metalc ? metalc7 A SG CYS 483 A CYS 523 1_555 G ZN ZN . A ZN 9003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc8 A SG CYS 483 A CYS 523 1_555 H ZN ZN . A ZN 9004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? 
metalc ? metalc9 A NE2 HIS 485 A HIS 525 1_555 H ZN ZN . A ZN 9004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? 
metalc ? metalc10 A SG CYS 490 A CYS 530 1_555 F ZN ZN . A ZN 9002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? 
metalc ? metalc11 A SG CYS 490 A CYS 530 1_555 H ZN ZN . A ZN 9004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc12 A SG CYS 494 A CYS 534 1_555 H ZN ZN . A ZN 9004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc13 A SG CYS 496 A CYS 536 1_555 G ZN ZN . A ZN 9003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc14 A SG CYS 503 A CYS 543 1_555 F ZN ZN . A ZN 9002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? 
metalc ? metalc15 A SG CYS 503 A CYS 543 1_555 G ZN ZN . A ZN 9003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? 
metalc ? metalc16 A SG CYS 507 A CYS 547 1_555 G ZN ZN . A ZN 9003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? 
metalc ? metalc17 A SG CYS 509 A CYS 549 1_555 F ZN ZN . A ZN 9002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc18 A SG CYS 513 A CYS 553 1_555 F ZN ZN . A ZN 9002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.5 ? 
metalc ? metalc19 A SG CYS 520 A CYS 560 1_555 I ZN ZN . A ZN 9005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc20 A SG CYS 520 A CYS 560 1_555 K ZN ZN . A ZN 9007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? 
metalc ? metalc21 A SG CYS 522 A CYS 562 1_555 K ZN ZN . A ZN 9007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? 
metalc ? metalc22 A SG CYS 526 A CYS 566 1_555 J ZN ZN . A ZN 9006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc23 A SG CYS 526 A CYS 566 1_555 K ZN ZN . A ZN 9007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? 
metalc ? metalc24 A SG CYS 531 A CYS 571 1_555 K ZN ZN . A ZN 9007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? 
metalc ? metalc25 A SG CYS 533 A CYS 573 1_555 I ZN ZN . A ZN 9005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? 
metalc ? metalc26 A SG CYS 540 A CYS 580 1_555 I ZN ZN . A ZN 9005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? 
metalc ? metalc27 A SG CYS 540 A CYS 580 1_555 J ZN ZN . A ZN 9006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? 
metalc ? metalc28 A SG CYS 545 A CYS 585 1_555 I ZN ZN . A ZN 9005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? 
metalc ? metalc29 A SG CYS 548 A CYS 588 1_555 J ZN ZN . A ZN 9006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? 
metalc ? metalc30 A SG CYS 561 A CYS 601 1_555 J ZN ZN . A ZN 9006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? 
metalc ? metalc31 C SG CYS 281 C CYS 286 1_555 U ZN ZN . C ZN 9008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? 
metalc ? metalc32 C SG CYS 284 C CYS 289 1_555 U ZN ZN . C ZN 9008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? 
metalc ? metalc33 C SG CYS 289 C CYS 294 1_555 U ZN ZN . C ZN 9008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? 
metalc ? metalc34 C ND1 HIS 292 C HIS 297 1_555 U ZN ZN . C ZN 9008 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? 
metalc ? metalc35 C SG CYS 412 C CYS 452 1_555 N ZN ZN . C ZN 9001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? 
metalc ? metalc36 C SG CYS 483 C CYS 523 1_555 P ZN ZN . C ZN 9003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? 
metalc ? metalc37 C SG CYS 483 C CYS 523 1_555 Q ZN ZN . C ZN 9004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.448 ? 
metalc ? metalc38 C NE2 HIS 485 C HIS 525 1_555 Q ZN ZN . C ZN 9004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc39 C SG CYS 490 C CYS 530 1_555 O ZN ZN . C ZN 9002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? 
metalc ? metalc40 C SG CYS 490 C CYS 530 1_555 Q ZN ZN . C ZN 9004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? 
metalc ? metalc41 C SG CYS 494 C CYS 534 1_555 Q ZN ZN . C ZN 9004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? 
metalc ? metalc42 C SG CYS 496 C CYS 536 1_555 P ZN ZN . C ZN 9003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? 
metalc ? metalc43 C SG CYS 503 C CYS 543 1_555 O ZN ZN . C ZN 9002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? 
metalc ? metalc44 C SG CYS 503 C CYS 543 1_555 P ZN ZN . C ZN 9003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? 
metalc ? metalc45 C SG CYS 507 C CYS 547 1_555 P ZN ZN . C ZN 9003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc46 C SG CYS 509 C CYS 549 1_555 O ZN ZN . C ZN 9002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? 
metalc ? metalc47 C SG CYS 513 C CYS 553 1_555 O ZN ZN . C ZN 9002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? 
metalc ? metalc48 C SG CYS 520 C CYS 560 1_555 R ZN ZN . C ZN 9005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? 
metalc ? metalc49 C SG CYS 520 C CYS 560 1_555 T ZN ZN . C ZN 9007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? 
metalc ? metalc50 C SG CYS 522 C CYS 562 1_555 T ZN ZN . C ZN 9007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? 
metalc ? metalc51 C SG CYS 526 C CYS 566 1_555 S ZN ZN . C ZN 9006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? 
metalc ? metalc52 C SG CYS 526 C CYS 566 1_555 T ZN ZN . C ZN 9007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc53 C SG CYS 531 C CYS 571 1_555 T ZN ZN . C ZN 9007 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.231 ? 
metalc ? metalc54 C SG CYS 533 C CYS 573 1_555 R ZN ZN . C ZN 9005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? 
metalc ? metalc55 C SG CYS 540 C CYS 580 1_555 R ZN ZN . C ZN 9005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? 
metalc ? metalc56 C SG CYS 540 C CYS 580 1_555 S ZN ZN . C ZN 9006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? 
metalc ? metalc57 C SG CYS 545 C CYS 585 1_555 R ZN ZN . C ZN 9005 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? 
metalc ? metalc58 C SG CYS 548 C CYS 588 1_555 S ZN ZN . C ZN 9006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? 
metalc ? metalc59 C SG CYS 561 C CYS 601 1_555 S ZN ZN . C ZN 9006 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? 
#
_chem_comp.formula           'C31 H38 N6 O2' 
_chem_comp.formula_weight    526.672 
_chem_comp.id                A9G 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1-[(2S)-butan-2-yl]-N-[(4,6-dimethyl-2-oxo-1,2-dihydropyridin-3-yl)methyl]-3-methyl-6-[6-(piperazin-1-yl)pyridin-3-yl]-1H-indole-4-carboxamide 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C17 C16 A9G sing 1 n n 
C18 C16 A9G sing 2 n n 
C18 C19 A9G doub 3 n n 
C20 C19 A9G sing 4 n n 
C16 C15 A9G doub 5 n n 
C19 N21 A9G sing 6 n n 
C15 C14 A9G sing 7 n n 
C15 C22 A9G sing 8 n n 
C08 C07 A9G sing 9 n n 
N21 C22 A9G sing 10 n n 
C14 N13 A9G sing 11 n n 
C22 O23 A9G doub 12 n n 
O12 C11 A9G doub 13 n n 
N13 C11 A9G sing 14 n n 
C07 C06 A9G doub 15 n y 
C07 C09 A9G sing 16 n y 
C11 C10 A9G sing 17 n n 
C06 N05 A9G sing 18 n y 
C09 C10 A9G doub 19 n y 
C09 C39 A9G sing 20 n y 
C10 C24 A9G sing 21 n y 
N05 C39 A9G sing 22 n y 
N05 C03 A9G sing 23 n n 
C04 C03 A9G sing 24 n n 
C39 C38 A9G doub 25 n y 
C01 C02 A9G sing 26 n n 
C24 C25 A9G doub 27 n y 
C03 C02 A9G sing 28 n n 
C38 C25 A9G sing 29 n y 
C25 C26 A9G sing 30 n n 
C26 C37 A9G doub 31 n y 
C26 C27 A9G sing 32 n y 
C37 N36 A9G sing 33 n y 
C27 C28 A9G doub 34 n y 
N36 C29 A9G doub 35 n y 
C29 C28 A9G sing 36 n y 
C29 N30 A9G sing 37 n n 
N30 C35 A9G sing 38 n n 
N30 C31 A9G sing 39 n n 
C35 C34 A9G sing 40 n n 
C31 C32 A9G sing 41 n n 
C34 N33 A9G sing 42 n n 
N33 C32 A9G sing 43 n n 
C24 H1 A9G sing 44 n n 
C28 H2 A9G sing 45 n n 
C27 H3 A9G sing 46 n n 
C20 H4 A9G sing 47 n n 
C20 H5 A9G sing 48 n n 
C20 H6 A9G sing 49 n n 
C18 H7 A9G sing 50 n n 
C17 H8 A9G sing 51 n n 
C17 H9 A9G sing 52 n n 
C17 H10 A9G sing 53 n n 
C14 H12 A9G sing 54 n n 
C14 H13 A9G sing 55 n n 
C01 H14 A9G sing 56 n n 
C01 H15 A9G sing 57 n n 
C01 H16 A9G sing 58 n n 
C02 H17 A9G sing 59 n n 
C02 H18 A9G sing 60 n n 
C03 H19 A9G sing 61 n n 
C04 H20 A9G sing 62 n n 
C04 H21 A9G sing 63 n n 
C04 H22 A9G sing 64 n n 
C06 H23 A9G sing 65 n n 
C08 H24 A9G sing 66 n n 
C08 H25 A9G sing 67 n n 
C08 H26 A9G sing 68 n n 
C31 H27 A9G sing 69 n n 
C31 H28 A9G sing 70 n n 
C32 H29 A9G sing 71 n n 
C32 H30 A9G sing 72 n n 
C34 H31 A9G sing 73 n n 
C34 H32 A9G sing 74 n n 
C35 H33 A9G sing 75 n n 
C35 H34 A9G sing 76 n n 
C37 H35 A9G sing 77 n n 
C38 H36 A9G sing 78 n n 
N13 H37 A9G sing 79 n n 
N33 H38 A9G sing 80 n n 
N21 H11 A9G sing 81 n n 
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E 3 ZN A 1 9001 9001 ZN ZN . 
F 3 ZN A 1 9002 9002 ZN ZN . 
G 3 ZN A 1 9003 9003 ZN ZN . 
H 3 ZN A 1 9004 9004 ZN ZN . 
I 3 ZN A 1 9005 9005 ZN ZN . 
J 3 ZN A 1 9006 9006 ZN ZN . 
K 3 ZN A 1 9007 9007 ZN ZN . 
L 3 ZN A 1 9008 9008 ZN ZN . 
M 4 A9G A 1 9009 9009 A9G A9G . 
N 3 ZN C 1 9001 9001 ZN ZN . 
O 3 ZN C 1 9002 9002 ZN ZN . 
P 3 ZN C 1 9003 9003 ZN ZN . 
Q 3 ZN C 1 9004 9004 ZN ZN . 
R 3 ZN C 1 9005 9005 ZN ZN . 
S 3 ZN C 1 9006 9006 ZN ZN . 
T 3 ZN C 1 9007 9007 ZN ZN . 
U 3 ZN C 1 9008 9008 ZN ZN . 
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loop_
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_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
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HETATM 2 C C25 A9G . . . M 4 -81.342 2.827 -56.132 1 21.49 ? C25 A9G 9009 A 1 
HETATM 3 C C26 A9G . . . M 4 -82.643 2.903 -56.883 1 20.73 ? C26 A9G 9009 A 1 
HETATM 4 C C28 A9G . . . M 4 -84.093 3.565 -58.784 1 19.92 ? C28 A9G 9009 A 1 
HETATM 5 C C27 A9G . . . M 4 -82.849 3.521 -58.131 1 20.64 ? C27 A9G 9009 A 1 
HETATM 6 C C20 A9G . . . M 4 -83.283 2.208 -46.764 1 20.18 ? C20 A9G 9009 A 1 
HETATM 7 C C19 A9G . . . M 4 -82.648 1.528 -47.958 1 20.61 ? C19 A9G 9009 A 1 
HETATM 8 C C22 A9G . . . M 4 -82.85 0.413 -49.994 1 20.59 ? C22 A9G 9009 A 1 
HETATM 9 C C18 A9G . . . M 4 -81.26 1.416 -48.077 1 21.43 ? C18 A9G 9009 A 1 
HETATM 10 C C17 A9G . . . M 4 -79.201 0.703 -49.268 1 22.74 ? C17 A9G 9009 A 1 
HETATM 11 C C16 A9G . . . M 4 -80.676 0.793 -49.184 1 21.84 ? C16 A9G 9009 A 1 
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