data_5WGQ
#
_model_server_result.job_id            sMdRVs8NdjR-oyLwR0VO5g 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-25 09:18:52' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5wgq 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":601}' 
#
_entry.id    5WGQ 
#
_exptl.entry_id    5WGQ 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              272.382 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            ESTRADIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          111.25 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5WGQ 
_cell.length_a            54.038 
_cell.length_b            84.044 
_cell.length_c            58.209 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5WGQ 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 E N N 
? 3 F N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 C C ACE 1 E ACE 1 1_555 C N HIS 2 E HIS 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? 
covale ? covale2 C C LYS 3 E LYS 3 1_555 C N MK8 4 E MK8 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? 
covale ? covale3 C C MK8 4 E MK8 4 1_555 C N LEU 5 E LEU 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.378 ? 
covale ? covale4 C CE MK8 4 E MK8 4 1_555 C CE MK8 8 E MK8 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.38 ? 
covale ? covale5 C C LYS 7 E LYS 7 1_555 C N MK8 8 E MK8 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.343 ? 
covale ? covale6 C C MK8 8 E MK8 8 1_555 C N LEU 9 E LEU 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.377 ? 
covale ? covale7 C C SER 12 E SER 12 1_555 C N NH2 13 E NH2 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.308 ? 
covale ? covale8 D C ACE 1 F ACE 1 1_555 D N HIS 2 F HIS 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? 
covale ? covale9 D C LYS 3 F LYS 3 1_555 D N MK8 4 F MK8 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale10 D C MK8 4 F MK8 4 1_555 D N LEU 5 F LEU 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.359 ? 
covale ? covale11 D CE MK8 4 F MK8 4 1_555 D CE MK8 8 F MK8 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.38 ? 
covale ? covale12 D C LYS 7 F LYS 7 1_555 D N MK8 8 F MK8 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.37 ? 
covale ? covale13 D C MK8 8 F MK8 8 1_555 D N LEU 9 F LEU 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.356 ? 
#
_chem_comp.formula           'C18 H24 O2' 
_chem_comp.formula_weight    272.382 
_chem_comp.id                EST 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              ESTRADIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 EST doub 89 n y 
C1 C10 EST sing 90 n y 
C1 H1 EST sing 91 n n 
C2 C3 EST sing 92 n y 
C2 H2 EST sing 93 n n 
C3 O3 EST sing 94 n n 
C3 C4 EST doub 95 n y 
O3 HO3 EST sing 96 n n 
C4 C5 EST sing 97 n y 
C4 H4 EST sing 98 n n 
C5 C6 EST sing 99 n n 
C5 C10 EST doub 100 n y 
C6 C7 EST sing 101 n n 
C6 H61 EST sing 102 n n 
C6 H62 EST sing 103 n n 
C7 C8 EST sing 104 n n 
C7 H71 EST sing 105 n n 
C7 H72 EST sing 106 n n 
C8 C9 EST sing 107 n n 
C8 C14 EST sing 108 n n 
C8 H8 EST sing 109 n n 
C9 C10 EST sing 110 n n 
C9 C11 EST sing 111 n n 
C9 H9 EST sing 112 n n 
C11 C12 EST sing 113 n n 
C11 H111 EST sing 114 n n 
C11 H112 EST sing 115 n n 
C12 C13 EST sing 116 n n 
C12 H121 EST sing 117 n n 
C12 H122 EST sing 118 n n 
C13 C14 EST sing 119 n n 
C13 C17 EST sing 120 n n 
C13 C18 EST sing 121 n n 
C14 C15 EST sing 122 n n 
C14 H14 EST sing 123 n n 
C15 C16 EST sing 124 n n 
C15 H151 EST sing 125 n n 
C15 H152 EST sing 126 n n 
C16 C17 EST sing 127 n n 
C16 H161 EST sing 128 n n 
C16 H162 EST sing 129 n n 
C17 O17 EST sing 130 n n 
C17 H17 EST sing 131 n n 
O17 HO7 EST sing 132 n n 
C18 H181 EST sing 133 n n 
C18 H182 EST sing 134 n n 
C18 H183 EST sing 135 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     5WGQ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.018505 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.007198 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.011899 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.018433 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 EST A 1 601 601 EST EST . 
F 3 EST B 1 601 601 EST EST . 
G 4 HOH A 1 701 701 HOH HOH . 
G 4 HOH A 2 702 702 HOH HOH . 
G 4 HOH A 3 703 703 HOH HOH . 
G 4 HOH A 4 704 704 HOH HOH . 
G 4 HOH A 5 705 705 HOH HOH . 
G 4 HOH A 6 706 706 HOH HOH . 
G 4 HOH A 7 707 707 HOH HOH . 
G 4 HOH A 8 708 708 HOH HOH . 
G 4 HOH A 9 709 709 HOH HOH . 
G 4 HOH A 10 710 710 HOH HOH . 
G 4 HOH A 11 711 711 HOH HOH . 
G 4 HOH A 12 712 712 HOH HOH . 
G 4 HOH A 13 713 713 HOH HOH . 
G 4 HOH A 14 714 714 HOH HOH . 
G 4 HOH A 15 715 715 HOH HOH . 
G 4 HOH A 16 716 716 HOH HOH . 
G 4 HOH A 17 717 717 HOH HOH . 
G 4 HOH A 18 718 718 HOH HOH . 
G 4 HOH A 19 719 719 HOH HOH . 
G 4 HOH A 20 720 720 HOH HOH . 
G 4 HOH A 21 721 721 HOH HOH . 
G 4 HOH A 22 722 722 HOH HOH . 
G 4 HOH A 23 723 723 HOH HOH . 
G 4 HOH A 24 724 724 HOH HOH . 
G 4 HOH A 25 725 725 HOH HOH . 
G 4 HOH A 26 726 726 HOH HOH . 
G 4 HOH A 27 727 727 HOH HOH . 
G 4 HOH A 28 728 728 HOH HOH . 
G 4 HOH A 29 729 729 HOH HOH . 
G 4 HOH A 30 730 730 HOH HOH . 
G 4 HOH A 31 731 731 HOH HOH . 
G 4 HOH A 32 732 732 HOH HOH . 
G 4 HOH A 33 733 733 HOH HOH . 
G 4 HOH A 34 734 734 HOH HOH . 
G 4 HOH A 35 735 735 HOH HOH . 
G 4 HOH A 36 736 736 HOH HOH . 
G 4 HOH A 37 737 737 HOH HOH . 
G 4 HOH A 38 738 738 HOH HOH . 
G 4 HOH A 39 739 739 HOH HOH . 
G 4 HOH A 40 740 740 HOH HOH . 
G 4 HOH A 41 741 741 HOH HOH . 
G 4 HOH A 42 742 742 HOH HOH . 
G 4 HOH A 43 743 743 HOH HOH . 
G 4 HOH A 44 744 744 HOH HOH . 
G 4 HOH A 45 745 745 HOH HOH . 
G 4 HOH A 46 746 746 HOH HOH . 
G 4 HOH A 47 747 747 HOH HOH . 
H 4 HOH B 1 701 701 HOH HOH . 
H 4 HOH B 2 702 702 HOH HOH . 
H 4 HOH B 3 703 703 HOH HOH . 
H 4 HOH B 4 704 704 HOH HOH . 
H 4 HOH B 5 705 705 HOH HOH . 
H 4 HOH B 6 706 706 HOH HOH . 
H 4 HOH B 7 707 707 HOH HOH . 
H 4 HOH B 8 708 708 HOH HOH . 
H 4 HOH B 9 709 709 HOH HOH . 
H 4 HOH B 10 710 710 HOH HOH . 
H 4 HOH B 11 711 711 HOH HOH . 
H 4 HOH B 12 712 712 HOH HOH . 
H 4 HOH B 13 713 713 HOH HOH . 
H 4 HOH B 14 714 714 HOH HOH . 
H 4 HOH B 15 715 715 HOH HOH . 
H 4 HOH B 16 716 716 HOH HOH . 
H 4 HOH B 17 717 717 HOH HOH . 
H 4 HOH B 18 718 718 HOH HOH . 
H 4 HOH B 19 719 719 HOH HOH . 
H 4 HOH B 20 720 720 HOH HOH . 
H 4 HOH B 21 721 721 HOH HOH . 
H 4 HOH B 22 722 722 HOH HOH . 
H 4 HOH B 23 723 723 HOH HOH . 
H 4 HOH B 24 724 724 HOH HOH . 
H 4 HOH B 25 725 725 HOH HOH . 
H 4 HOH B 26 726 726 HOH HOH . 
H 4 HOH B 27 727 727 HOH HOH . 
H 4 HOH B 28 728 728 HOH HOH . 
H 4 HOH B 29 729 729 HOH HOH . 
H 4 HOH B 30 730 730 HOH HOH . 
H 4 HOH B 31 731 731 HOH HOH . 
H 4 HOH B 32 732 732 HOH HOH . 
H 4 HOH B 33 733 733 HOH HOH . 
H 4 HOH B 34 734 734 HOH HOH . 
H 4 HOH B 35 735 735 HOH HOH . 
H 4 HOH B 36 736 736 HOH HOH . 
H 4 HOH B 37 737 737 HOH HOH . 
H 4 HOH B 38 738 738 HOH HOH . 
H 4 HOH B 39 739 739 HOH HOH . 
H 4 HOH B 40 740 740 HOH HOH . 
H 4 HOH B 41 741 741 HOH HOH . 
H 4 HOH B 42 742 742 HOH HOH . 
H 4 HOH B 43 743 743 HOH HOH . 
H 4 HOH B 44 744 744 HOH HOH . 
H 4 HOH B 45 745 745 HOH HOH . 
H 4 HOH B 46 746 746 HOH HOH . 
H 4 HOH B 47 747 747 HOH HOH . 
H 4 HOH B 48 748 748 HOH HOH . 
H 4 HOH B 49 749 749 HOH HOH . 
H 4 HOH B 50 750 750 HOH HOH . 
H 4 HOH B 51 751 751 HOH HOH . 
H 4 HOH B 52 752 752 HOH HOH . 
H 4 HOH B 53 753 753 HOH HOH . 
H 4 HOH B 54 754 754 HOH HOH . 
H 4 HOH B 55 755 755 HOH HOH . 
H 4 HOH B 56 756 756 HOH HOH . 
H 4 HOH B 57 757 757 HOH HOH . 
I 4 HOH F 1 101 101 HOH HOH . 
I 4 HOH F 2 102 102 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 EST . . . F 3 1.355 10.223 -25.281 1 27.41 ? C1 EST 601 B 1 
HETATM 2 C C2 EST . . . F 3 0.658 10.744 -26.369 1 26.4 ? C2 EST 601 B 1 
HETATM 3 C C3 EST . . . F 3 -0.712 10.986 -26.289 1 26.49 ? C3 EST 601 B 1 
HETATM 4 O O3 EST . . . F 3 -1.369 11.495 -27.364 1 27.2 ? O3 EST 601 B 1 
HETATM 5 C C4 EST . . . F 3 -1.425 10.714 -25.121 1 25.85 ? C4 EST 601 B 1 
HETATM 6 C C5 EST . . . F 3 -0.772 10.196 -24.009 1 26.72 ? C5 EST 601 B 1 
HETATM 7 C C6 EST . . . F 3 -1.563 9.91 -22.746 1 27.51 ? C6 EST 601 B 1 
HETATM 8 C C7 EST . . . F 3 -0.779 8.988 -21.816 1 28.7 ? C7 EST 601 B 1 
HETATM 9 C C8 EST . . . F 3 0.653 9.473 -21.632 1 29.38 ? C8 EST 601 B 1 
HETATM 10 C C9 EST . . . F 3 1.434 9.372 -22.937 1 28.61 ? C9 EST 601 B 1 
HETATM 11 C C10 EST . . . F 3 0.688 9.945 -24.088 1 26.89 ? C10 EST 601 B 1 
HETATM 12 C C11 EST . . . F 3 2.846 9.948 -22.773 1 29.93 ? C11 EST 601 B 1 
HETATM 13 C C12 EST . . . F 3 3.628 9.184 -21.696 1 29.79 ? C12 EST 601 B 1 
HETATM 14 C C13 EST . . . F 3 2.833 9.129 -20.4 1 30.44 ? C13 EST 601 B 1 
HETATM 15 C C14 EST . . . F 3 1.433 8.603 -20.658 1 30.6 ? C14 EST 601 B 1 
HETATM 16 C C15 EST . . . F 3 0.86 8.366 -19.269 1 31.12 ? C15 EST 601 B 1 
HETATM 17 C C16 EST . . . F 3 2.084 7.935 -18.456 1 30.25 ? C16 EST 601 B 1 
HETATM 18 C C17 EST . . . F 3 3.305 8.134 -19.355 1 30.87 ? C17 EST 601 B 1 
HETATM 19 O O17 EST . . . F 3 4.423 8.611 -18.602 1 32.1 ? O17 EST 601 B 1 
HETATM 20 C C18 EST . . . F 3 2.784 10.517 -19.767 1 30.95 ? C18 EST 601 B 1 
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