data_5WHA
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_model_server_result.job_id            k2VvoPY72mGQQyeMV58mzA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-23 08:29:06' 
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_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          5wha 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"T","auth_seq_id":204}' 
#
_entry.id    5WHA 
#
_exptl.entry_id    5WHA 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          5 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.99 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5WHA 
_cell.length_a            48.003 
_cell.length_b            40.328 
_cell.length_c            230.939 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5WHA 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 3 
PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,M,N,O,P,CA,DA,EA 1 1 
D,E,F,Q,R,S,T,FA,GA,HA 2 1 
G,H,I,U,V,W,X,Y,Z,IA,JA,KA 3 1 
J,K,L,AA,BA,LA,MA,NA 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 5 O N N 
? 5 P N N 
? 5 S N N 
? 5 T N N 
? 5 W N N 
? 5 X N N 
? 5 Y N N 
? 5 Z N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 B SG CYS 10 B CYS 7 1_555 C SG CYS 10 C CYS 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf2 E SG CYS 10 E CYS 7 1_555 F SG CYS 10 F CYS 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf3 H SG CYS 10 H CYS 7 1_555 I SG CYS 10 I CYS 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
disulf ? disulf4 K SG CYS 10 K CYS 7 1_555 L SG CYS 10 L CYS 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? 
metalc ? metalc1 A OG SER 21 A SER 17 1_555 M MG MG . A MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? 
metalc ? metalc2 A OE1 GLU 67 A GLU 63 1_555 O CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.198 ? 
metalc ? metalc3 A OE1 GLU 67 A GLU 63 1_555 P CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? 
metalc ? metalc4 A OE2 GLU 67 A GLU 63 1_555 P CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? 
metalc ? metalc5 A O TYR 68 A TYR 64 1_555 O CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.4 ? 
metalc ? metalc6 M MG MG . A MG 201 1_555 N O1B GDP . A GDP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? 
metalc ? metalc7 M MG MG . A MG 201 1_555 CA O HOH . A HOH 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? 
metalc ? metalc8 M MG MG . A MG 201 1_555 CA O HOH . A HOH 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? 
metalc ? metalc9 O CA CA . A CA 203 1_655 F OD1 ASP 19 F ASP 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? 
metalc ? metalc10 O CA CA . A CA 203 1_655 F OE1 GLU 22 F GLU 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? 
metalc ? metalc11 O CA CA . A CA 203 1_655 F OE2 GLU 22 F GLU 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? 
metalc ? metalc12 P CA CA . A CA 204 1_555 B O ALA 35 B ALA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? 
metalc ? metalc13 P CA CA . A CA 204 1_555 B OXT ALA 35 B ALA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.908 ? 
metalc ? metalc14 P CA CA . A CA 204 1_655 F OD1 ASP 19 F ASP 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.197 ? 
metalc ? metalc15 P CA CA . A CA 204 1_655 F OD2 ASP 19 F ASP 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? 
metalc ? metalc16 C OD1 ASP 19 C ASP 16 1_555 S CA CA . D CA 203 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.055 ? 
metalc ? metalc17 C OD2 ASP 19 C ASP 16 1_555 S CA CA . D CA 203 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? 
metalc ? metalc18 C OD1 ASP 19 C ASP 16 1_555 T CA CA . D CA 204 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? 
metalc ? metalc19 C OE1 GLU 22 C GLU 19 1_555 T CA CA . D CA 204 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? 
metalc ? metalc20 C OE2 GLU 22 C GLU 19 1_555 T CA CA . D CA 204 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? 
metalc ? metalc21 D OG SER 21 D SER 17 1_555 Q MG MG . D MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.983 ? 
metalc ? metalc22 D OE1 GLU 67 D GLU 63 1_555 S CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.823 ? 
metalc ? metalc23 D OE2 GLU 67 D GLU 63 1_555 S CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.477 ? 
metalc ? metalc24 D OE2 GLU 67 D GLU 63 1_555 T CA CA . D CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.842 ? 
metalc ? metalc25 D O TYR 68 D TYR 64 1_555 T CA CA . D CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? 
metalc ? metalc26 Q MG MG . D MG 201 1_555 R O3B GDP . D GDP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? 
metalc ? metalc27 Q MG MG . D MG 201 1_555 FA O HOH . D HOH 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.203 ? 
metalc ? metalc28 Q MG MG . D MG 201 1_555 FA O HOH . D HOH 329 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.908 ? 
metalc ? metalc29 S CA CA . D CA 203 1_555 E O ALA 35 E ALA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.443 ? 
metalc ? metalc30 S CA CA . D CA 203 1_555 E OXT ALA 35 E ALA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? 
metalc ? metalc31 T CA CA . D CA 204 1_555 FA O HOH . D HOH 319 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.067 ? 
metalc ? metalc32 G OG SER 21 G SER 17 1_555 U MG MG . G MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.541 ? 
metalc ? metalc33 G OE1 GLU 67 G GLU 63 1_555 W CA CA . G CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? 
metalc ? metalc34 G OE2 GLU 67 G GLU 63 1_555 W CA CA . G CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? 
metalc ? metalc35 G OE1 GLU 67 G GLU 63 1_555 X CA CA . G CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? 
metalc ? metalc36 G O TYR 68 G TYR 64 1_555 X CA CA . G CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? 
metalc ? metalc37 U MG MG . G MG 201 1_555 V O1B GDP . G GDP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? 
metalc ? metalc38 U MG MG . G MG 201 1_555 IA O HOH . G HOH 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? 
metalc ? metalc39 U MG MG . G MG 201 1_555 IA O HOH . G HOH 312 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.176 ? 
metalc ? metalc40 U MG MG . G MG 201 1_555 IA O HOH . G HOH 317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.991 ? 
metalc ? metalc41 W CA CA . G CA 203 1_555 H OXT ALA 35 H ALA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.948 ? 
metalc ? metalc42 W CA CA . G CA 203 1_555 L OD1 ASP 19 L ASP 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.932 ? 
metalc ? metalc43 W CA CA . G CA 203 1_555 L OD2 ASP 19 L ASP 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? 
metalc ? metalc44 X CA CA . G CA 204 1_555 JA O HOH . H HOH 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? 
metalc ? metalc45 X CA CA . G CA 204 1_555 L OD1 ASP 19 L ASP 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? 
metalc ? metalc46 X CA CA . G CA 204 1_555 L OE1 GLU 22 L GLU 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.51 ? 
metalc ? metalc47 X CA CA . G CA 204 1_555 L OE2 GLU 22 L GLU 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
metalc ? metalc48 I OD1 ASP 19 I ASP 16 1_555 Y CA CA . I CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? 
metalc ? metalc49 I OD2 ASP 19 I ASP 16 1_555 Y CA CA . I CA 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? 
metalc ? metalc50 I OD1 ASP 19 I ASP 16 1_555 Z CA CA . I CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.49 ? 
metalc ? metalc51 I OE1 GLU 22 I GLU 19 1_555 Z CA CA . I CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? 
metalc ? metalc52 I OE2 GLU 22 I GLU 19 1_555 Z CA CA . I CA 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? 
metalc ? metalc53 Y CA CA . I CA 101 1_555 KA O HOH . I HOH 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.55 ? 
metalc ? metalc54 Y CA CA . I CA 101 1_555 J OE1 GLU 67 J GLU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? 
metalc ? metalc55 Y CA CA . I CA 101 1_555 J OE2 GLU 67 J GLU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? 
metalc ? metalc56 Y CA CA . I CA 101 1_555 K O ALA 35 K ALA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? 
metalc ? metalc57 Y CA CA . I CA 101 1_555 K OXT ALA 35 K ALA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? 
metalc ? metalc58 Z CA CA . I CA 102 1_555 J OE1 GLU 67 J GLU 63 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? 
metalc ? metalc59 Z CA CA . I CA 102 1_555 J O TYR 68 J TYR 64 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.42 ? 
metalc ? metalc60 J OG SER 21 J SER 17 1_555 AA MG MG . J MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc61 AA MG MG . J MG 201 1_555 BA O3B GDP . J GDP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.145 ? 
metalc ? metalc62 AA MG MG . J MG 201 1_555 LA O HOH . J HOH 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? 
metalc ? metalc63 AA MG MG . J MG 201 1_555 LA O HOH . J HOH 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.11 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     5WHA 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.020832 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.00036 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.024797 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004331 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
M 3 MG A 1 201 201 MG MG . 
N 4 GDP A 1 202 202 GDP GDP . 
O 5 CA A 1 203 203 CA CA . 
P 5 CA A 1 204 204 CA CA . 
Q 3 MG D 1 201 201 MG MG . 
R 4 GDP D 1 202 202 GDP GDP . 
S 5 CA D 1 203 203 CA CA . 
T 5 CA D 1 204 204 CA CA . 
U 3 MG G 1 201 201 MG MG . 
V 4 GDP G 1 202 202 GDP GDP . 
W 5 CA G 1 203 203 CA CA . 
X 5 CA G 1 204 101 CA CA . 
Y 5 CA I 1 101 101 CA CA . 
Z 5 CA I 1 102 102 CA CA . 
AA 3 MG J 1 201 201 MG MG . 
BA 4 GDP J 1 202 202 GDP GDP . 
CA 6 HOH A 1 301 301 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 2 302 302 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 3 303 303 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 4 304 304 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 5 305 305 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 6 306 306 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 7 307 307 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 8 308 308 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 9 309 309 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 10 310 310 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 11 311 311 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 12 312 312 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 13 313 313 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 14 314 314 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 15 315 315 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 16 316 316 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 17 317 317 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 18 318 318 HOH HOH . 
CA 6 HOH A 19 319 319 HOH HOH . 
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CA 6 HOH A 21 321 321 HOH HOH . 
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