data_5WP9
#
_model_server_result.job_id            FcShek_ikI-mBWvmUMVpFQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-04-13 11:24:32' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5wp9 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"R","auth_seq_id":802}' 
#
_entry.id    5WP9 
#
_exptl.entry_id    5WP9 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              24.305 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MAGNESIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    hexadecameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      16 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 R N N 
? 4 T N N 
? 4 V N N 
? 4 X N N 
? 4 Z N N 
? 4 BA N N 
? 4 DA N N 
? 4 FA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OG SER 39 A SER 39 1_555 R MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
metalc ? metalc2 A OG1 THR 59 A THR 59 1_555 R MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc3 Q O1G GCP . A GCP 801 1_555 R MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.919 ? 
metalc ? metalc4 Q O1B GCP . A GCP 801 1_555 R MG MG . A MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? 
metalc ? metalc5 C OG SER 39 C SER 39 1_555 T MG MG . C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
metalc ? metalc6 C OG1 THR 59 C THR 59 1_555 T MG MG . C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc7 S O1G GCP . C GCP 801 1_555 T MG MG . C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.918 ? 
metalc ? metalc8 S O1B GCP . C GCP 801 1_555 T MG MG . C MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? 
metalc ? metalc9 E OG SER 39 E SER 39 1_555 V MG MG . E MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
metalc ? metalc10 E OG1 THR 59 E THR 59 1_555 V MG MG . E MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc11 U O3G GCP . E GCP 801 1_555 V MG MG . E MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.918 ? 
metalc ? metalc12 U O2B GCP . E GCP 801 1_555 V MG MG . E MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? 
metalc ? metalc13 G OG SER 39 G SER 39 1_555 X MG MG . G MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? 
metalc ? metalc14 G OG1 THR 59 G THR 59 1_555 X MG MG . G MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc15 W O3G GCP . G GCP 801 1_555 X MG MG . G MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.919 ? 
metalc ? metalc16 W O2B GCP . G GCP 801 1_555 X MG MG . G MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.144 ? 
metalc ? metalc17 I OG SER 39 I SER 39 1_555 Z MG MG . I MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
metalc ? metalc18 I OG1 THR 59 I THR 59 1_555 Z MG MG . I MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc19 Y O1G GCP . I GCP 801 1_555 Z MG MG . I MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.918 ? 
metalc ? metalc20 Y O1B GCP . I GCP 801 1_555 Z MG MG . I MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? 
metalc ? metalc21 K OG SER 39 K SER 39 1_555 BA MG MG . K MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? 
metalc ? metalc22 K OG1 THR 59 K THR 59 1_555 BA MG MG . K MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc23 AA O3G GCP . K GCP 801 1_555 BA MG MG . K MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.919 ? 
metalc ? metalc24 AA O2B GCP . K GCP 801 1_555 BA MG MG . K MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? 
metalc ? metalc25 M OG SER 39 M SER 39 1_555 DA MG MG . M MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc26 M OG1 THR 59 M THR 59 1_555 DA MG MG . M MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
metalc ? metalc27 CA O1G GCP . M GCP 801 1_555 DA MG MG . M MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.918 ? 
metalc ? metalc28 CA O1B GCP . M GCP 801 1_555 DA MG MG . M MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? 
metalc ? metalc29 O OG SER 39 O SER 39 1_555 FA MG MG . O MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? 
metalc ? metalc30 O OG1 THR 59 O THR 59 1_555 FA MG MG . O MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc31 EA O3G GCP . O GCP 801 1_555 FA MG MG . O MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.918 ? 
metalc ? metalc32 EA O2B GCP . O GCP 801 1_555 FA MG MG . O MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mg 2' 
_chem_comp.formula_weight    24.305 
_chem_comp.id                MG 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MAGNESIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     5WP9 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
Q 3 GCP A 1 801 711 GCP GCP . 
R 4 MG A 1 802 712 MG MG . 
S 3 GCP C 1 801 711 GCP GCP . 
T 4 MG C 1 802 712 MG MG . 
U 3 GCP E 1 801 711 GCP GCP . 
V 4 MG E 1 802 712 MG MG . 
W 3 GCP G 1 801 711 GCP GCP . 
X 4 MG G 1 802 712 MG MG . 
Y 3 GCP I 1 801 711 GCP GCP . 
Z 4 MG I 1 802 712 MG MG . 
AA 3 GCP K 1 801 711 GCP GCP . 
BA 4 MG K 1 802 712 MG MG . 
CA 3 GCP M 1 801 711 GCP GCP . 
DA 4 MG M 1 802 712 MG MG . 
EA 3 GCP O 1 801 711 GCP GCP . 
FA 4 MG O 1 802 712 MG MG . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MG 
_atom_site.label_atom_id         MG 
_atom_site.label_comp_id         MG 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         R 
_atom_site.label_entity_id       4 
_atom_site.Cartn_x               160.552 
_atom_site.Cartn_y               213.448 
_atom_site.Cartn_z               288.221 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        162.43 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MG 
_atom_site.auth_comp_id          MG 
_atom_site.auth_seq_id           802 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              40 
_model_server_stats.parse_time_ms           12 
_model_server_stats.create_model_time_ms    173 
_model_server_stats.query_time_ms           284 
_model_server_stats.encode_time_ms          7 
_model_server_stats.element_count           1 
#