data_5WSV
#
_model_server_result.job_id            XAIfXZ-y-XFtJQXK8KPWXw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-21 23:44:53' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          5wsv 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":202}' 
#
_entry.id    5WSV 
#
_exptl.entry_id    5WSV 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          106.03 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            5WSV 
_cell.length_a            38.683 
_cell.length_b            89.755 
_cell.length_c            45.724 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 5WSV 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,P,Q 1 1 
C,D,I,J,K,L,M,N,O,R,S 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 E N N 
? 3 F N N 
? 3 G N N 
? 3 H N N 
? 3 I N N 
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 L N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 25 A ASP 20 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASP 27 A ASP 22 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASP 29 A ASP 24 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 29 A ASP 24 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.938 ? 
metalc ? metalc5 A O THR 31 A THR 26 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? 
metalc ? metalc6 A OE1 GLU 36 A GLU 31 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? 
metalc ? metalc7 A OE2 GLU 36 A GLU 31 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? 
metalc ? metalc8 A OD1 ASP 61 A ASP 56 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? 
metalc ? metalc9 A OD1 ASP 63 A ASP 58 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.719 ? 
metalc ? metalc10 A OD1 ASN 65 A ASN 60 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? 
metalc ? metalc11 A O THR 67 A THR 62 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? 
metalc ? metalc12 A OE1 GLU 72 A GLU 67 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? 
metalc ? metalc13 A OE2 GLU 72 A GLU 67 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? 
metalc ? metalc14 A OD1 ASP 98 A ASP 93 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? 
metalc ? metalc15 A OD2 ASP 100 A ASP 95 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? 
metalc ? metalc16 A OD1 ASN 102 A ASN 97 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? 
metalc ? metalc17 A O TYR 104 A TYR 99 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc18 A OE1 GLU 109 A GLU 104 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? 
metalc ? metalc19 A OE2 GLU 109 A GLU 104 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc20 A OD1 ASP 134 A ASP 129 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? 
metalc ? metalc21 A OD1 ASP 136 A ASP 131 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? 
metalc ? metalc22 A OD1 ASP 138 A ASP 133 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? 
metalc ? metalc23 A OD2 ASP 138 A ASP 133 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.08 ? 
metalc ? metalc24 A O GLN 140 A GLN 135 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc25 A OE1 GLU 145 A GLU 140 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? 
metalc ? metalc26 A OE2 GLU 145 A GLU 140 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? 
metalc ? metalc27 G CA CA . A CA 203 1_555 P O HOH . A HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
metalc ? metalc28 C OD1 ASP 25 C ASP 20 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? 
metalc ? metalc29 C OD1 ASP 27 C ASP 22 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? 
metalc ? metalc30 C OD1 ASP 29 C ASP 24 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? 
metalc ? metalc31 C O THR 31 C THR 26 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? 
metalc ? metalc32 C OE1 GLU 36 C GLU 31 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.087 ? 
metalc ? metalc33 C OE2 GLU 36 C GLU 31 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? 
metalc ? metalc34 C OD1 ASP 61 C ASP 56 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.853 ? 
metalc ? metalc35 C OD1 ASP 63 C ASP 58 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.859 ? 
metalc ? metalc36 C OD1 ASN 65 C ASN 60 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? 
metalc ? metalc37 C O THR 67 C THR 62 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? 
metalc ? metalc38 C OE1 GLU 72 C GLU 67 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? 
metalc ? metalc39 C OE2 GLU 72 C GLU 67 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? 
metalc ? metalc40 C OD1 ASP 98 C ASP 93 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? 
metalc ? metalc41 C OD1 ASP 100 C ASP 95 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? 
metalc ? metalc42 C OD1 ASN 102 C ASN 97 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? 
metalc ? metalc43 C O TYR 104 C TYR 99 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? 
metalc ? metalc44 C OE1 GLU 109 C GLU 104 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? 
metalc ? metalc45 C OE2 GLU 109 C GLU 104 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? 
metalc ? metalc46 C OD1 ASP 136 C ASP 131 1_555 L CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? 
metalc ? metalc47 C OD1 ASP 138 C ASP 133 1_555 L CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? 
metalc ? metalc48 C O GLN 140 C GLN 135 1_555 L CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? 
metalc ? metalc49 C OE1 GLU 145 C GLU 140 1_555 L CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? 
metalc ? metalc50 C OE2 GLU 145 C GLU 140 1_555 L CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.712 ? 
metalc ? metalc51 J CA CA . C CA 202 1_555 R O HOH . C HOH 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? 
metalc ? metalc52 L CA CA . C CA 204 1_555 R O HOH . C HOH 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     5WSV 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.025851 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.007428 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.011141 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.022755 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 3 CA A 1 201 1 CA CA . 
F 3 CA A 1 202 2 CA CA . 
G 3 CA A 1 203 3 CA CA . 
H 3 CA A 1 204 4 CA CA . 
I 3 CA C 1 201 1 CA CA . 
J 3 CA C 1 202 2 CA CA . 
K 3 CA C 1 203 3 CA CA . 
L 3 CA C 1 204 4 CA CA . 
M 4 SO4 C 1 205 1 SO4 SO4 . 
N 4 SO4 D 1 901 1 SO4 SO4 . 
O 4 SO4 D 1 902 1 SO4 SO4 . 
P 5 HOH A 1 301 2 HOH HOH . 
Q 5 HOH B 1 901 7 HOH HOH . 
Q 5 HOH B 2 902 3 HOH HOH . 
Q 5 HOH B 3 903 12 HOH HOH . 
R 5 HOH C 1 301 1 HOH HOH . 
R 5 HOH C 2 302 11 HOH HOH . 
R 5 HOH C 3 303 13 HOH HOH . 
R 5 HOH C 4 304 14 HOH HOH . 
R 5 HOH C 5 305 8 HOH HOH . 
R 5 HOH C 6 306 9 HOH HOH . 
S 5 HOH D 1 1001 4 HOH HOH . 
S 5 HOH D 2 1002 6 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         F 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               46.02 
_atom_site.Cartn_y               -55.604 
_atom_site.Cartn_z               58.53 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        49.39 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           202 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              41 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    3 
_model_server_stats.query_time_ms           238 
_model_server_stats.encode_time_ms          20 
_model_server_stats.element_count           1 
#