data_5WSV # _model_server_result.job_id eCTkSSpYxK581HLtOBg0Tg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 23:45:19' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 5wsv # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":901}' # _entry.id 5WSV # _exptl.entry_id 5WSV _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 96.063 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SULFATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 106.03 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 5WSV _cell.length_a 38.683 _cell.length_b 89.755 _cell.length_c 45.724 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 5WSV _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,E,F,G,H,P,Q 1 1 C,D,I,J,K,L,M,N,O,R,S 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 M N N ? 4 N N N ? 4 O N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 25 A ASP 20 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 27 A ASP 22 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 29 A ASP 24 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.566 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 29 A ASP 24 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.938 ? metalc ? metalc5 A O THR 31 A THR 26 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 36 A GLU 31 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 36 A GLU 31 1_555 E CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.665 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 61 A ASP 56 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 63 A ASP 58 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.719 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASN 65 A ASN 60 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.33 ? metalc ? metalc11 A O THR 67 A THR 62 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.589 ? metalc ? metalc12 A OE1 GLU 72 A GLU 67 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? metalc ? metalc13 A OE2 GLU 72 A GLU 67 1_555 F CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 98 A ASP 93 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc15 A OD2 ASP 100 A ASP 95 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASN 102 A ASN 97 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? metalc ? metalc17 A O TYR 104 A TYR 99 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc18 A OE1 GLU 109 A GLU 104 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? metalc ? metalc19 A OE2 GLU 109 A GLU 104 1_555 G CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc20 A OD1 ASP 134 A ASP 129 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? metalc ? metalc21 A OD1 ASP 136 A ASP 131 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? metalc ? metalc22 A OD1 ASP 138 A ASP 133 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.161 ? metalc ? metalc23 A OD2 ASP 138 A ASP 133 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.08 ? metalc ? metalc24 A O GLN 140 A GLN 135 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? metalc ? metalc25 A OE1 GLU 145 A GLU 140 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? metalc ? metalc26 A OE2 GLU 145 A GLU 140 1_555 H CA CA . A CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc ? metalc27 G CA CA . A CA 203 1_555 P O HOH . A HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? metalc ? metalc28 C OD1 ASP 25 C ASP 20 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? metalc ? metalc29 C OD1 ASP 27 C ASP 22 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? metalc ? metalc30 C OD1 ASP 29 C ASP 24 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc31 C O THR 31 C THR 26 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc32 C OE1 GLU 36 C GLU 31 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.087 ? metalc ? metalc33 C OE2 GLU 36 C GLU 31 1_555 I CA CA . C CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? metalc ? metalc34 C OD1 ASP 61 C ASP 56 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.853 ? metalc ? metalc35 C OD1 ASP 63 C ASP 58 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.859 ? metalc ? metalc36 C OD1 ASN 65 C ASN 60 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? metalc ? metalc37 C O THR 67 C THR 62 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.452 ? metalc ? metalc38 C OE1 GLU 72 C GLU 67 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? metalc ? metalc39 C OE2 GLU 72 C GLU 67 1_555 J CA CA . C CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc40 C OD1 ASP 98 C ASP 93 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.23 ? metalc ? metalc41 C OD1 ASP 100 C ASP 95 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc42 C OD1 ASN 102 C ASN 97 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc43 C O TYR 104 C TYR 99 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? metalc ? metalc44 C OE1 GLU 109 C GLU 104 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? metalc ? metalc45 C OE2 GLU 109 C GLU 104 1_555 K CA CA . C CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? metalc ? metalc46 C OD1 ASP 136 C ASP 131 1_555 L CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.261 ? metalc ? metalc47 C OD1 ASP 138 C ASP 133 1_555 L CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? metalc ? metalc48 C O GLN 140 C GLN 135 1_555 L CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc49 C OE1 GLU 145 C GLU 140 1_555 L CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc50 C OE2 GLU 145 C GLU 140 1_555 L CA CA . C CA 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.712 ? metalc ? metalc51 J CA CA . C CA 202 1_555 R O HOH . C HOH 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? metalc ? metalc52 L CA CA . C CA 204 1_555 R O HOH . C HOH 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? # _chem_comp.formula 'O4 S -2' _chem_comp.formula_weight 96.063 _chem_comp.id SO4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SULFATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag S O1 SO4 doub 277 n n S O2 SO4 doub 278 n n S O3 SO4 sing 279 n n S O4 SO4 sing 280 n n # _atom_sites.entry_id 5WSV _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.025851 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.007428 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.011141 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.022755 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 CA A 1 201 1 CA CA . F 3 CA A 1 202 2 CA CA . G 3 CA A 1 203 3 CA CA . H 3 CA A 1 204 4 CA CA . I 3 CA C 1 201 1 CA CA . J 3 CA C 1 202 2 CA CA . K 3 CA C 1 203 3 CA CA . L 3 CA C 1 204 4 CA CA . M 4 SO4 C 1 205 1 SO4 SO4 . N 4 SO4 D 1 901 1 SO4 SO4 . O 4 SO4 D 1 902 1 SO4 SO4 . P 5 HOH A 1 301 2 HOH HOH . Q 5 HOH B 1 901 7 HOH HOH . Q 5 HOH B 2 902 3 HOH HOH . Q 5 HOH B 3 903 12 HOH HOH . R 5 HOH C 1 301 1 HOH HOH . R 5 HOH C 2 302 11 HOH HOH . R 5 HOH C 3 303 13 HOH HOH . R 5 HOH C 4 304 14 HOH HOH . R 5 HOH C 5 305 8 HOH HOH . R 5 HOH C 6 306 9 HOH HOH . S 5 HOH D 1 1001 4 HOH HOH . S 5 HOH D 2 1002 6 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 S S SO4 . . . N 4 38.333 -86.75 30.244 1 72.42 ? S SO4 901 D 1 HETATM 2 O O1 SO4 . . . N 4 38.842 -87.423 29.021 1 69.63 ? O1 SO4 901 D 1 HETATM 3 O O2 SO4 . . . N 4 36.919 -86.38 30.029 1 72.31 ? O2 SO4 901 D 1 HETATM 4 O O3 SO4 . . . N 4 38.476 -87.696 31.38 1 76.84 ? O3 SO4 901 D 1 HETATM 5 O O4 SO4 . . . N 4 39.086 -85.516 30.537 1 70.58 ? O4 SO4 901 D 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 282 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 5 #