data_6B8H # _model_server_result.job_id JitjU-uJbxqHSNqwr99b-w _model_server_result.datetime_utc '2025-01-05 02:09:50' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6b8h # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"NB","auth_seq_id":602}' # _entry.id 6B8H # _exptl.entry_id 6B8H _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 19 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 10 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 60-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 60 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 19 JB N N ? 19 LB N N ? 19 NB N N ? 19 PB N N ? 19 RB N N ? 19 TB N N ? 19 VB N N ? 19 XB N N ? 19 ZB N N ? 19 BC N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 RA NZ LYS 148 r LYS 148 1_555 TA CB SER 11 t SER 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.251 ? metalc ? metalc1 T OG1 THR 178 K THR 178 1_555 JB MG MG . K MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? metalc ? metalc2 IB O1G ANP . K ANP 601 1_555 JB MG MG . K MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? metalc ? metalc3 IB O2B ANP . K ANP 601 1_555 JB MG MG . K MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.974 ? metalc ? metalc4 U OG1 THR 178 B THR 178 1_555 LB MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.916 ? metalc ? metalc5 KB O2G ANP . B ANP 601 1_555 LB MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.777 ? metalc ? metalc6 KB O2B ANP . B ANP 601 1_555 LB MG MG . B MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? metalc ? metalc7 V OG1 THR 178 C THR 178 1_555 NB MG MG . C MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? metalc ? metalc8 MB O2G ANP . C ANP 601 1_555 NB MG MG . C MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.805 ? metalc ? metalc9 MB O2B ANP . C ANP 601 1_555 NB MG MG . C MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc10 W OG1 THR 164 D THR 164 1_555 PB MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? metalc ? metalc11 OB O2G ANP . D ANP 501 1_555 PB MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.848 ? metalc ? metalc12 OB O2B ANP . D ANP 501 1_555 PB MG MG . D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? metalc ? metalc13 Y OG1 THR 164 F THR 164 1_555 RB MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.771 ? metalc ? metalc14 Y OE1 GLU 189 F GLU 189 1_555 RB MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.799 ? metalc ? metalc15 QB O2B ANP . F ANP 501 1_555 RB MG MG . F MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc ? metalc16 XA OG1 THR 178 n THR 178 1_555 TB MG MG . n MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? metalc ? metalc17 SB O1G ANP . n ANP 601 1_555 TB MG MG . n MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? metalc ? metalc18 SB O2B ANP . n ANP 601 1_555 TB MG MG . n MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.975 ? metalc ? metalc19 YA OG1 THR 178 W THR 178 1_555 VB MG MG . W MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.915 ? metalc ? metalc20 UB O2G ANP . W ANP 601 1_555 VB MG MG . W MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.779 ? metalc ? metalc21 UB O2B ANP . W ANP 601 1_555 VB MG MG . W MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? metalc ? metalc22 ZA OG1 THR 178 X THR 178 1_555 XB MG MG . X MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? metalc ? metalc23 WB O2G ANP . X ANP 601 1_555 XB MG MG . X MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.805 ? metalc ? metalc24 WB O2B ANP . X ANP 601 1_555 XB MG MG . X MG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.1 ? metalc ? metalc25 AB OG1 THR 164 Y THR 164 1_555 ZB MG MG . Y MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.143 ? metalc ? metalc26 YB O2G ANP . Y ANP 501 1_555 ZB MG MG . Y MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.847 ? metalc ? metalc27 YB O2B ANP . Y ANP 501 1_555 ZB MG MG . Y MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? metalc ? metalc28 CB OG1 THR 164 c THR 164 1_555 BC MG MG . c MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.772 ? metalc ? metalc29 CB OE1 GLU 189 c GLU 189 1_555 BC MG MG . c MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.8 ? metalc ? metalc30 AC O2B ANP . c ANP 501 1_555 BC MG MG . c MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6B8H _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code IB 18 ANP K 1 601 600 ANP ANP . JB 19 MG K 1 602 700 MG MG . KB 18 ANP B 1 601 600 ANP ANP . LB 19 MG B 1 602 700 MG MG . MB 18 ANP C 1 601 600 ANP ANP . NB 19 MG C 1 602 700 MG MG . OB 18 ANP D 1 501 600 ANP ANP . PB 19 MG D 1 502 700 MG MG . QB 18 ANP F 1 501 600 ANP ANP . RB 19 MG F 1 502 700 MG MG . SB 18 ANP n 1 601 600 ANP ANP . TB 19 MG n 1 602 700 MG MG . UB 18 ANP W 1 601 600 ANP ANP . VB 19 MG W 1 602 700 MG MG . WB 18 ANP X 1 601 600 ANP ANP . XB 19 MG X 1 602 700 MG MG . YB 18 ANP Y 1 501 600 ANP ANP . ZB 19 MG Y 1 502 700 MG MG . AC 18 ANP c 1 501 600 ANP ANP . BC 19 MG c 1 502 700 MG MG . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id NB _atom_site.label_entity_id 19 _atom_site.Cartn_x 113.768 _atom_site.Cartn_y 221.093 _atom_site.Cartn_z 268.464 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 80.39 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 602 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 362 _model_server_stats.parse_time_ms 65 _model_server_stats.create_model_time_ms 324 _model_server_stats.query_time_ms 1025 _model_server_stats.encode_time_ms 24 _model_server_stats.element_count 1 #