data_6BA1 # _model_server_result.job_id n3zx61_z0Vb1bPK-EO7SmA _model_server_result.datetime_utc '2024-10-10 17:14:22' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6ba1 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Z","auth_seq_id":400}' # _entry.id 6BA1 # _exptl.entry_id 6BA1 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 18 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 106.5 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6BA1 _cell.length_a 163.27 _cell.length_b 80.24 _cell.length_c 223.82 _cell.Z_PDB 36 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6BA1 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 4 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 5 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 6 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 7 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 8 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 9 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,S,W 1 1 B,D,T,V 2 1 C,I,U,AA 3 1 F,H,X,Z 4 1 G,L,Y,DA 5 1 J,P,BA,HA 6 1 K,N,CA,FA 7 1 M,R,EA,JA 8 1 O,Q,GA,IA 9 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 S N N ? 2 T N N ? 2 U N N ? 2 V N N ? 2 W N N ? 2 X N N ? 2 Y N N ? 2 Z N N ? 2 AA N N ? 2 BA N N ? 2 CA N N ? 2 DA N N ? 2 EA N N ? 2 FA N N ? 2 GA N N ? 2 HA N N ? 2 IA N N ? 2 JA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASP 12 A ASP 9 1_555 S CA CA . A CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 17 A ASP 14 1_555 S CA CA . A CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc3 A O THR 130 A THR 127 1_555 S CA CA . A CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 248 A ASP 245 1_555 S CA CA . A CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.52 ? metalc ? metalc5 B OD1 ASP 12 B ASP 9 1_555 T CA CA . B CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? metalc ? metalc6 B OD1 ASP 17 B ASP 14 1_555 T CA CA . B CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.601 ? metalc ? metalc7 B O THR 130 B THR 127 1_555 T CA CA . B CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? metalc ? metalc8 B OD2 ASP 248 B ASP 245 1_555 T CA CA . B CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? metalc ? metalc9 C OD1 ASP 12 C ASP 9 1_555 U CA CA . C CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? metalc ? metalc10 C OD1 ASP 17 C ASP 14 1_555 U CA CA . C CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.594 ? metalc ? metalc11 C OD2 ASP 17 C ASP 14 1_555 U CA CA . C CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.121 ? metalc ? metalc12 C O THR 130 C THR 127 1_555 U CA CA . C CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc13 C OD2 ASP 248 C ASP 245 1_555 U CA CA . C CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? metalc ? metalc14 D OD1 ASP 12 D ASP 9 1_555 V CA CA . D CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.611 ? metalc ? metalc15 D OD1 ASP 17 D ASP 14 1_555 V CA CA . D CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? metalc ? metalc16 D O THR 130 D THR 127 1_555 V CA CA . D CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? metalc ? metalc17 D OD2 ASP 248 D ASP 245 1_555 V CA CA . D CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc18 E OD1 ASP 12 E ASP 9 1_555 W CA CA . E CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc ? metalc19 E OD1 ASP 17 E ASP 14 1_555 W CA CA . E CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? metalc ? metalc20 E O THR 130 E THR 127 1_555 W CA CA . E CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.823 ? metalc ? metalc21 E OD2 ASP 248 E ASP 245 1_555 W CA CA . E CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? metalc ? metalc22 F OD1 ASP 12 F ASP 9 1_555 X CA CA . F CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc ? metalc23 F OD1 ASP 17 F ASP 14 1_555 X CA CA . F CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? metalc ? metalc24 F O THR 130 F THR 127 1_555 X CA CA . F CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? metalc ? metalc25 F OD2 ASP 248 F ASP 245 1_555 X CA CA . F CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? metalc ? metalc26 G OD1 ASP 12 G ASP 9 1_555 Y CA CA . G CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.823 ? metalc ? metalc27 G OD1 ASP 17 G ASP 14 1_555 Y CA CA . G CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? metalc ? metalc28 G O THR 130 G THR 127 1_555 Y CA CA . G CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? metalc ? metalc29 G OD2 ASP 248 G ASP 245 1_555 Y CA CA . G CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? metalc ? metalc30 H OD1 ASP 12 H ASP 9 1_555 Z CA CA . H CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.716 ? metalc ? metalc31 H OD1 ASP 17 H ASP 14 1_555 Z CA CA . H CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc ? metalc32 H O THR 130 H THR 127 1_555 Z CA CA . H CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.847 ? metalc ? metalc33 H OD2 ASP 248 H ASP 245 1_555 Z CA CA . H CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? metalc ? metalc34 I OD1 ASP 12 I ASP 9 1_555 AA CA CA . I CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.101 ? metalc ? metalc35 I OD1 ASP 16 I ASP 13 1_555 AA CA CA . I CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.042 ? metalc ? metalc36 I OD1 ASP 17 I ASP 14 1_555 AA CA CA . I CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? metalc ? metalc37 I O THR 130 I THR 127 1_555 AA CA CA . I CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.1 ? metalc ? metalc38 I OD2 ASP 248 I ASP 245 1_555 AA CA CA . I CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? metalc ? metalc39 J OD1 ASP 12 J ASP 9 1_555 BA CA CA . J CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? metalc ? metalc40 J OD1 ASP 17 J ASP 14 1_555 BA CA CA . J CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? metalc ? metalc41 J O THR 130 J THR 127 1_555 BA CA CA . J CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.715 ? metalc ? metalc42 J OD2 ASP 248 J ASP 245 1_555 BA CA CA . J CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? metalc ? metalc43 K OD1 ASP 12 K ASP 9 1_555 CA CA CA . K CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? metalc ? metalc44 K OD1 ASP 17 K ASP 14 1_555 CA CA CA . K CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? metalc ? metalc45 K O THR 130 K THR 127 1_555 CA CA CA . K CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? metalc ? metalc46 K OD2 ASP 248 K ASP 245 1_555 CA CA CA . K CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? metalc ? metalc47 L OD1 ASP 12 L ASP 9 1_555 DA CA CA . L CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.562 ? metalc ? metalc48 L OD1 ASP 17 L ASP 14 1_555 DA CA CA . L CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.775 ? metalc ? metalc49 L O THR 130 L THR 127 1_555 DA CA CA . L CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc50 L OD2 ASP 248 L ASP 245 1_555 DA CA CA . L CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? metalc ? metalc51 M OD1 ASP 12 M ASP 9 1_555 EA CA CA . M CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.57 ? metalc ? metalc52 M OD1 ASP 17 M ASP 14 1_555 EA CA CA . M CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? metalc ? metalc53 M O THR 130 M THR 127 1_555 EA CA CA . M CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc54 M OD2 ASP 248 M ASP 245 1_555 EA CA CA . M CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? metalc ? metalc55 N OD1 ASP 12 N ASP 9 1_555 FA CA CA . N CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.913 ? metalc ? metalc56 N OD1 ASP 17 N ASP 14 1_555 FA CA CA . N CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.867 ? metalc ? metalc57 N O THR 130 N THR 127 1_555 FA CA CA . N CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.653 ? metalc ? metalc58 N OD2 ASP 248 N ASP 245 1_555 FA CA CA . N CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? metalc ? metalc59 O OD1 ASP 12 O ASP 9 1_555 GA CA CA . O CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc60 O OD1 ASP 17 O ASP 14 1_555 GA CA CA . O CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.66 ? metalc ? metalc61 O O THR 130 O THR 127 1_555 GA CA CA . O CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? metalc ? metalc62 O OD2 ASP 248 O ASP 245 1_555 GA CA CA . O CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? metalc ? metalc63 P OD1 ASP 12 P ASP 9 1_555 HA CA CA . P CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.587 ? metalc ? metalc64 P OD1 ASP 17 P ASP 14 1_555 HA CA CA . P CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.536 ? metalc ? metalc65 P O THR 130 P THR 127 1_555 HA CA CA . P CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? metalc ? metalc66 P OD2 ASP 248 P ASP 245 1_555 HA CA CA . P CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.46 ? metalc ? metalc67 Q OD1 ASP 12 Q ASP 9 1_555 IA CA CA . Q CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.823 ? metalc ? metalc68 Q OD1 ASP 17 Q ASP 14 1_555 IA CA CA . Q CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.737 ? metalc ? metalc69 Q O THR 130 Q THR 127 1_555 IA CA CA . Q CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.804 ? metalc ? metalc70 Q OD2 ASP 248 Q ASP 245 1_555 IA CA CA . Q CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? metalc ? metalc71 R OD1 ASP 12 R ASP 9 1_555 JA CA CA . R CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.851 ? metalc ? metalc72 R OD1 ASP 17 R ASP 14 1_555 JA CA CA . R CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.817 ? metalc ? metalc73 R O THR 130 R THR 127 1_555 JA CA CA . R CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.408 ? metalc ? metalc74 R OD2 ASP 248 R ASP 245 1_555 JA CA CA . R CA 400 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6BA1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006125 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001814 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012463 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00466 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code S 2 CA A 1 400 400 CA CA . T 2 CA B 1 400 400 CA CA . U 2 CA C 1 400 400 CA CA . V 2 CA D 1 400 400 CA CA . W 2 CA E 1 400 400 CA CA . X 2 CA F 1 400 400 CA CA . Y 2 CA G 1 400 400 CA CA . Z 2 CA H 1 400 400 CA CA . AA 2 CA I 1 400 400 CA CA . BA 2 CA J 1 400 400 CA CA . CA 2 CA K 1 400 400 CA CA . DA 2 CA L 1 400 400 CA CA . EA 2 CA M 1 400 400 CA CA . FA 2 CA N 1 400 400 CA CA . GA 2 CA O 1 400 400 CA CA . HA 2 CA P 1 400 400 CA CA . IA 2 CA Q 1 400 400 CA CA . JA 2 CA R 1 400 400 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id Z _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 22.654 _atom_site.Cartn_y -11.554 _atom_site.Cartn_z 852.139 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 36.17 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 400 _atom_site.auth_asym_id H _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 80 _model_server_stats.parse_time_ms 20 _model_server_stats.create_model_time_ms 35 _model_server_stats.query_time_ms 257 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #