data_6BCU
#
_model_server_result.job_id            VvSoZJvYGGvr6nq74IYjLA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-01-15 10:30:58' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6bcu 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":201}' 
#
_entry.id    6BCU 
#
_exptl.entry_id    6BCU 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          8 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6BCU 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6BCU 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    decameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      10 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 8 N N N 
? 8 S N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASN 2343 A ASN 2343 1_555 L MG MG . A MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 2357 A ASP 2357 1_555 M MG MG . A MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? 
metalc ? metalc3 K O1G ATP . A ATP 3000 1_555 L MG MG . A MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? 
metalc ? metalc4 K O1A ATP . A ATP 3000 1_555 L MG MG . A MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc5 K O2G ATP . A ATP 3000 1_555 M MG MG . A MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? 
metalc ? metalc6 K O1B ATP . A ATP 3000 1_555 M MG MG . A MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc7 E OG SER 24 S SER 20 1_555 O MG MG . S MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? 
metalc ? metalc8 E OG1 THR 42 S THR 38 1_555 O MG MG . S MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? 
metalc ? metalc9 N O3G GTP . S GTP 201 1_555 O MG MG . S MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? 
metalc ? metalc10 N O1B GTP . S GTP 201 1_555 O MG MG . S MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? 
metalc ? metalc11 F OD1 ASN 2343 B ASN 2343 1_555 Q MG MG . B MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? 
metalc ? metalc12 F OD2 ASP 2357 B ASP 2357 1_555 R MG MG . B MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.22 ? 
metalc ? metalc13 P O1G ATP . B ATP 3000 1_555 Q MG MG . B MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? 
metalc ? metalc14 P O1A ATP . B ATP 3000 1_555 Q MG MG . B MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc15 P O2G ATP . B ATP 3000 1_555 R MG MG . B MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? 
metalc ? metalc16 P O1B ATP . B ATP 3000 1_555 R MG MG . B MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc17 J OG SER 24 R SER 20 1_555 T MG MG . R MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? 
metalc ? metalc18 J OG1 THR 42 R THR 38 1_555 T MG MG . R MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? 
metalc ? metalc19 S O3G GTP . R GTP 201 1_555 T MG MG . R MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? 
metalc ? metalc20 S O1B GTP . R GTP 201 1_555 T MG MG . R MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 178 n n 
PG O2G GTP sing 179 n n 
PG O3G GTP sing 180 n n 
PG O3B GTP sing 181 n n 
O2G HOG2 GTP sing 182 n n 
O3G HOG3 GTP sing 183 n n 
O3B PB GTP sing 184 n n 
PB O1B GTP doub 185 n n 
PB O2B GTP sing 186 n n 
PB O3A GTP sing 187 n n 
O2B HOB2 GTP sing 188 n n 
O3A PA GTP sing 189 n n 
PA O1A GTP doub 190 n n 
PA O2A GTP sing 191 n n 
PA O5' GTP sing 192 n n 
O2A HOA2 GTP sing 193 n n 
O5' C5' GTP sing 194 n n 
C5' C4' GTP sing 195 n n 
C5' H5' GTP sing 196 n n 
C5' "H5''" GTP sing 197 n n 
C4' O4' GTP sing 198 n n 
C4' C3' GTP sing 199 n n 
C4' H4' GTP sing 200 n n 
O4' C1' GTP sing 201 n n 
C3' O3' GTP sing 202 n n 
C3' C2' GTP sing 203 n n 
C3' H3' GTP sing 204 n n 
O3' HO3' GTP sing 205 n n 
C2' O2' GTP sing 206 n n 
C2' C1' GTP sing 207 n n 
C2' H2' GTP sing 208 n n 
O2' HO2' GTP sing 209 n n 
C1' N9 GTP sing 210 n n 
C1' H1' GTP sing 211 n n 
N9 C8 GTP sing 212 n y 
N9 C4 GTP sing 213 n y 
C8 N7 GTP doub 214 n y 
C8 H8 GTP sing 215 n n 
N7 C5 GTP sing 216 n y 
C5 C6 GTP sing 217 n n 
C5 C4 GTP doub 218 n y 
C6 O6 GTP doub 219 n n 
C6 N1 GTP sing 220 n n 
N1 C2 GTP sing 221 n n 
N1 HN1 GTP sing 222 n n 
C2 N2 GTP sing 223 n n 
C2 N3 GTP doub 224 n n 
N2 HN21 GTP sing 225 n n 
N2 HN22 GTP sing 226 n n 
N3 C4 GTP sing 227 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6BCU 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
K 6 ATP A 1 3000 3000 ATP ATP . 
L 7 MG A 1 3001 3001 MG MG . 
M 7 MG A 1 3002 3002 MG MG . 
N 8 GTP S 1 201 201 GTP GTP . 
O 7 MG S 1 202 202 MG MG . 
P 6 ATP B 1 3000 3000 ATP ATP . 
Q 7 MG B 1 3001 3001 MG MG . 
R 7 MG B 1 3002 3002 MG MG . 
S 8 GTP R 1 201 201 GTP GTP . 
T 7 MG R 1 202 201 MG MG . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . N 8 243.21 207.425 208.545 1 37.35 ? PG GTP 201 S 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . N 8 241.955 207.097 209.327 1 37.74 ? O1G GTP 201 S 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . N 8 243.708 208.845 208.659 1 35.39 ? O2G GTP 201 S 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . N 8 244.343 206.433 208.676 1 39.64 ? O3G GTP 201 S 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . N 8 242.681 207.32 207.033 1 34.79 ? O3B GTP 201 S 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . N 8 242.242 205.931 206.344 1 34.63 ? PB GTP 201 S 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . N 8 243.255 204.859 206.66 1 37.95 ? O1B GTP 201 S 1 
HETATM 8 O O2B GTP . . . N 8 242.018 206.297 204.9 1 34.66 ? O2B GTP 201 S 1 
HETATM 9 O O3A GTP . . . N 8 240.834 205.453 206.974 1 31.38 ? O3A GTP 201 S 1 
HETATM 10 P PA GTP . . . N 8 240.131 204.062 206.521 1 28.89 ? PA GTP 201 S 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . N 8 239.552 203.459 207.768 1 29.94 ? O1A GTP 201 S 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . N 8 241.021 203.194 205.664 1 27.32 ? O2A GTP 201 S 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . N 8 238.948 204.556 205.554 1 31.9 ? O5' GTP 201 S 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . N 8 237.635 204.858 206.014 1 35.87 ? C5' GTP 201 S 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . N 8 236.642 203.88 205.399 1 41.66 ? C4' GTP 201 S 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . N 8 236.76 203.882 203.977 1 46 ? O4' GTP 201 S 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . N 8 236.781 202.408 205.807 1 44.04 ? C3' GTP 201 S 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . N 8 235.866 202.095 206.867 1 43.19 ? O3' GTP 201 S 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . N 8 236.498 201.622 204.527 1 46.17 ? C2' GTP 201 S 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . N 8 235.47 200.629 204.653 1 44.4 ? O2' GTP 201 S 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . N 8 236.079 202.706 203.543 1 49.98 ? C1' GTP 201 S 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . N 8 236.351 202.372 202.116 1 55.6 ? N9 GTP 201 S 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . N 8 237.476 202.594 201.398 1 57.86 ? C8 GTP 201 S 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . N 8 237.327 202.161 200.114 1 56.36 ? N7 GTP 201 S 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . N 8 236.083 201.654 200.005 1 58.26 ? C5 GTP 201 S 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . N 8 235.244 201.029 198.944 1 59.61 ? C6 GTP 201 S 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . N 8 235.708 200.865 197.795 1 61.34 ? O6 GTP 201 S 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . N 8 233.98 200.645 199.259 1 57.8 ? N1 GTP 201 S 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . N 8 233.451 200.814 200.505 1 54.54 ? C2 GTP 201 S 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . N 8 232.182 200.42 200.777 1 53.87 ? N2 GTP 201 S 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . N 8 234.163 201.379 201.518 1 53.95 ? N3 GTP 201 S 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . N 8 235.444 201.805 201.327 1 56.91 ? C4 GTP 201 S 1 
HETATM 33 H H5' GTP . . . N 8 237.555 204.835 207.101 1 35.95 ? H5' GTP 201 S 1 
HETATM 34 H "H5''" GTP . . . N 8 237.369 205.866 205.694 1 35.97 ? "H5''" GTP 201 S 1 
HETATM 35 H H4' GTP . . . N 8 235.631 204.215 205.672 1 41.65 ? H4' GTP 201 S 1 
HETATM 36 H H3' GTP . . . N 8 237.808 202.198 206.126 1 43.81 ? H3' GTP 201 S 1 
HETATM 37 H HO3' GTP . . . N 8 235.942 201.163 207.069 0 90 ? HO3' GTP 201 S 1 
HETATM 38 H H2' GTP . . . N 8 237.426 201.154 204.175 1 46.07 ? H2' GTP 201 S 1 
HETATM 39 H HO2' GTP . . . N 8 235.736 199.975 205.258 0 90 ? HO2' GTP 201 S 1 
HETATM 40 H H1' GTP . . . N 8 235 202.868 203.674 1 49.53 ? H1' GTP 201 S 1 
HETATM 41 H H8 GTP . . . N 8 238.373 203.045 201.796 1 57.14 ? H8 GTP 201 S 1 
HETATM 42 H HN1 GTP . . . N 8 233.395 200.209 198.519 1 57.46 ? HN1 GTP 201 S 1 
HETATM 43 H HN21 GTP . . . N 8 231.802 200.549 201.704 1 54.07 ? HN21 GTP 201 S 1 
HETATM 44 H HN22 GTP . . . N 8 231.611 199.997 200.062 1 54.07 ? HN22 GTP 201 S 1 
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