data_6BCU
#
_model_server_result.job_id            yYCxATVtqZtniPQ5zLsCWg 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-01-15 10:08:25' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6bcu 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"S","auth_seq_id":201}' 
#
_entry.id    6BCU 
#
_exptl.entry_id    6BCU 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          8 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6BCU 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6BCU 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    decameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      10 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 8 N N N 
? 8 S N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASN 2343 A ASN 2343 1_555 L MG MG . A MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 2357 A ASP 2357 1_555 M MG MG . A MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? 
metalc ? metalc3 K O1G ATP . A ATP 3000 1_555 L MG MG . A MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? 
metalc ? metalc4 K O1A ATP . A ATP 3000 1_555 L MG MG . A MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc5 K O2G ATP . A ATP 3000 1_555 M MG MG . A MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? 
metalc ? metalc6 K O1B ATP . A ATP 3000 1_555 M MG MG . A MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc7 E OG SER 24 S SER 20 1_555 O MG MG . S MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.13 ? 
metalc ? metalc8 E OG1 THR 42 S THR 38 1_555 O MG MG . S MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? 
metalc ? metalc9 N O3G GTP . S GTP 201 1_555 O MG MG . S MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? 
metalc ? metalc10 N O1B GTP . S GTP 201 1_555 O MG MG . S MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? 
metalc ? metalc11 F OD1 ASN 2343 B ASN 2343 1_555 Q MG MG . B MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? 
metalc ? metalc12 F OD2 ASP 2357 B ASP 2357 1_555 R MG MG . B MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.22 ? 
metalc ? metalc13 P O1G ATP . B ATP 3000 1_555 Q MG MG . B MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? 
metalc ? metalc14 P O1A ATP . B ATP 3000 1_555 Q MG MG . B MG 3001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc15 P O2G ATP . B ATP 3000 1_555 R MG MG . B MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? 
metalc ? metalc16 P O1B ATP . B ATP 3000 1_555 R MG MG . B MG 3002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? 
metalc ? metalc17 J OG SER 24 R SER 20 1_555 T MG MG . R MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? 
metalc ? metalc18 J OG1 THR 42 R THR 38 1_555 T MG MG . R MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? 
metalc ? metalc19 S O3G GTP . R GTP 201 1_555 T MG MG . R MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? 
metalc ? metalc20 S O1B GTP . R GTP 201 1_555 T MG MG . R MG 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 178 n n 
PG O2G GTP sing 179 n n 
PG O3G GTP sing 180 n n 
PG O3B GTP sing 181 n n 
O2G HOG2 GTP sing 182 n n 
O3G HOG3 GTP sing 183 n n 
O3B PB GTP sing 184 n n 
PB O1B GTP doub 185 n n 
PB O2B GTP sing 186 n n 
PB O3A GTP sing 187 n n 
O2B HOB2 GTP sing 188 n n 
O3A PA GTP sing 189 n n 
PA O1A GTP doub 190 n n 
PA O2A GTP sing 191 n n 
PA O5' GTP sing 192 n n 
O2A HOA2 GTP sing 193 n n 
O5' C5' GTP sing 194 n n 
C5' C4' GTP sing 195 n n 
C5' H5' GTP sing 196 n n 
C5' "H5''" GTP sing 197 n n 
C4' O4' GTP sing 198 n n 
C4' C3' GTP sing 199 n n 
C4' H4' GTP sing 200 n n 
O4' C1' GTP sing 201 n n 
C3' O3' GTP sing 202 n n 
C3' C2' GTP sing 203 n n 
C3' H3' GTP sing 204 n n 
O3' HO3' GTP sing 205 n n 
C2' O2' GTP sing 206 n n 
C2' C1' GTP sing 207 n n 
C2' H2' GTP sing 208 n n 
O2' HO2' GTP sing 209 n n 
C1' N9 GTP sing 210 n n 
C1' H1' GTP sing 211 n n 
N9 C8 GTP sing 212 n y 
N9 C4 GTP sing 213 n y 
C8 N7 GTP doub 214 n y 
C8 H8 GTP sing 215 n n 
N7 C5 GTP sing 216 n y 
C5 C6 GTP sing 217 n n 
C5 C4 GTP doub 218 n y 
C6 O6 GTP doub 219 n n 
C6 N1 GTP sing 220 n n 
N1 C2 GTP sing 221 n n 
N1 HN1 GTP sing 222 n n 
C2 N2 GTP sing 223 n n 
C2 N3 GTP doub 224 n n 
N2 HN21 GTP sing 225 n n 
N2 HN22 GTP sing 226 n n 
N3 C4 GTP sing 227 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6BCU 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
K 6 ATP A 1 3000 3000 ATP ATP . 
L 7 MG A 1 3001 3001 MG MG . 
M 7 MG A 1 3002 3002 MG MG . 
N 8 GTP S 1 201 201 GTP GTP . 
O 7 MG S 1 202 202 MG MG . 
P 6 ATP B 1 3000 3000 ATP ATP . 
Q 7 MG B 1 3001 3001 MG MG . 
R 7 MG B 1 3002 3002 MG MG . 
S 8 GTP R 1 201 201 GTP GTP . 
T 7 MG R 1 202 201 MG MG . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . S 8 254.274 290.048 208.567 1 40.37 ? PG GTP 201 R 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . S 8 255.552 290.325 209.331 1 40.62 ? O1G GTP 201 R 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . S 8 253.736 288.639 208.664 1 38.4 ? O2G GTP 201 R 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . S 8 253.184 291.082 208.744 1 42.95 ? O3G GTP 201 R 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . S 8 254.777 290.17 207.047 1 37.38 ? O3B GTP 201 R 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . S 8 255.224 291.558 206.362 1 36.78 ? PB GTP 201 R 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . S 8 254.184 292.614 206.637 1 40.97 ? O1B GTP 201 R 1 
HETATM 8 O O2B GTP . . . S 8 255.497 291.195 204.928 1 36.45 ? O2B GTP 201 R 1 
HETATM 9 O O3A GTP . . . S 8 256.606 292.051 207.043 1 33.7 ? O3A GTP 201 R 1 
HETATM 10 P PA GTP . . . S 8 257.335 293.438 206.618 1 31.37 ? PA GTP 201 R 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . S 8 257.947 293.992 207.874 1 32.03 ? O1A GTP 201 R 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . S 8 256.456 294.346 205.793 1 29.77 ? O2A GTP 201 R 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . S 8 258.491 292.95 205.616 1 34.78 ? O5' GTP 201 R 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . S 8 259.807 292.61 206.04 1 39.09 ? C5' GTP 201 R 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . S 8 260.809 293.577 205.421 1 45.49 ? C4' GTP 201 R 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . S 8 260.686 293.575 203.999 1 50.45 ? O4' GTP 201 R 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . S 8 260.687 295.052 205.829 1 47.95 ? C3' GTP 201 R 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . S 8 261.63 295.364 206.863 1 47.18 ? O3' GTP 201 R 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . S 8 260.947 295.837 204.544 1 50.37 ? C2' GTP 201 R 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . S 8 261.969 296.839 204.656 1 48.26 ? O2' GTP 201 R 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . S 8 261.365 294.753 203.561 1 54.79 ? C1' GTP 201 R 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . S 8 261.096 295.082 202.132 1 60.46 ? N9 GTP 201 R 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . S 8 259.973 294.852 201.414 1 63.05 ? C8 GTP 201 R 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . S 8 260.121 295.281 200.128 1 60.31 ? N7 GTP 201 R 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . S 8 261.361 295.793 200.018 1 60.88 ? C5 GTP 201 R 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . S 8 262.193 296.418 198.954 1 61.18 ? C6 GTP 201 R 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . S 8 261.721 296.57 197.807 1 62.68 ? O6 GTP 201 R 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . S 8 263.456 296.811 199.265 1 58.79 ? N1 GTP 201 R 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . S 8 263.987 296.652 200.51 1 55.06 ? C2 GTP 201 R 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . S 8 265.254 297.054 200.782 1 53.48 ? N2 GTP 201 R 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . S 8 263.28 296.088 201.527 1 56.03 ? N3 GTP 201 R 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . S 8 262.002 295.652 201.341 1 60.31 ? C4 GTP 201 R 1 
HETATM 33 H H5' GTP . . . S 8 259.912 292.612 207.125 1 39.2 ? H5' GTP 201 R 1 
HETATM 34 H "H5''" GTP . . . S 8 260.04 291.601 205.696 1 39.21 ? "H5''" GTP 201 R 1 
HETATM 35 H H4' GTP . . . S 8 261.816 293.231 205.69 1 45.5 ? H4' GTP 201 R 1 
HETATM 36 H H3' GTP . . . S 8 259.67 295.272 206.175 1 47.77 ? H3' GTP 201 R 1 
HETATM 37 H HO3' GTP . . . S 8 261.586 296.231 207.067 0 90 ? HO3' GTP 201 R 1 
HETATM 38 H H2' GTP . . . S 8 260.01 296.294 204.201 1 50.23 ? H2' GTP 201 R 1 
HETATM 39 H HO2' GTP . . . S 8 261.703 297.443 205.271 0 90 ? HO2' GTP 201 R 1 
HETATM 40 H H1' GTP . . . S 8 262.445 294.593 203.692 1 54.26 ? H1' GTP 201 R 1 
HETATM 41 H H8 GTP . . . S 8 259.077 294.397 201.812 1 61.93 ? H8 GTP 201 R 1 
HETATM 42 H HN1 GTP . . . S 8 264.035 297.246 198.52 1 58.51 ? HN1 GTP 201 R 1 
HETATM 43 H HN21 GTP . . . S 8 265.635 296.93 201.71 1 53.94 ? HN21 GTP 201 R 1 
HETATM 44 H HN22 GTP . . . S 8 265.824 297.477 200.066 1 53.94 ? HN22 GTP 201 R 1 
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