data_6BGP
#
_model_server_result.job_id            cjkaj_gAOUOiR5lXfKtafg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-22 06:19:07' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6bgp 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":502}' 
#
_entry.id    6BGP 
#
_exptl.entry_id    6BGP 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6BGP 
_cell.length_a            60.1 
_cell.length_b            106.18 
_cell.length_c            225.62 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6BGP 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
? monomeric 1 author_defined_assembly 3 
? monomeric 1 author_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,F,G,Q 1 1 
B,H,I,J,R 2 1 
C,K,L,M,S 3 1 
D,N,O,P,T 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 H N N 
? 2 I N N 
? 2 K N N 
? 2 L N N 
? 2 N N N 
? 2 O N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O ILE 68 A ILE 113 1_555 E CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? 
metalc ? metalc2 A O GLY 70 A GLY 115 1_555 E CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASP 75 A ASP 120 1_555 E CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 75 A ASP 120 1_555 E CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? 
metalc ? metalc5 A OE1 GLU 154 A GLU 199 1_555 E CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? 
metalc ? metalc6 A OE2 GLU 154 A GLU 199 1_555 E CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? 
metalc ? metalc7 A OE1 GLU 319 A GLU 364 1_555 F CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? 
metalc ? metalc8 A OE2 GLU 319 A GLU 364 1_555 F CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? 
metalc ? metalc9 A OD2 ASP 326 A ASP 371 1_555 F CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.259 ? 
metalc ? metalc10 A O THR 347 A THR 392 1_555 F CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? 
metalc ? metalc11 A OD1 ASP 349 A ASP 394 1_555 F CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? 
metalc ? metalc12 A O GLU 351 A GLU 396 1_555 F CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.239 ? 
metalc ? metalc13 B O ILE 68 B ILE 113 1_555 H CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? 
metalc ? metalc14 B O GLY 70 B GLY 115 1_555 H CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? 
metalc ? metalc15 B OD1 ASP 75 B ASP 120 1_555 H CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? 
metalc ? metalc16 B OD2 ASP 75 B ASP 120 1_555 H CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? 
metalc ? metalc17 B OE1 GLU 154 B GLU 199 1_555 H CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.797 ? 
metalc ? metalc18 B OE2 GLU 154 B GLU 199 1_555 H CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.416 ? 
metalc ? metalc19 B OE1 GLU 319 B GLU 364 1_555 I CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? 
metalc ? metalc20 B OE2 GLU 319 B GLU 364 1_555 I CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? 
metalc ? metalc21 B OD2 ASP 326 B ASP 371 1_555 I CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? 
metalc ? metalc22 B O THR 347 B THR 392 1_555 I CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.464 ? 
metalc ? metalc23 B OD1 ASP 349 B ASP 394 1_555 I CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? 
metalc ? metalc24 B O GLU 351 B GLU 396 1_555 I CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? 
metalc ? metalc25 C O ILE 68 C ILE 113 1_555 K CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc26 C O GLY 70 C GLY 115 1_555 K CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? 
metalc ? metalc27 C OD1 ASP 75 C ASP 120 1_555 K CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.789 ? 
metalc ? metalc28 C OD2 ASP 75 C ASP 120 1_555 K CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc29 C OE1 GLU 154 C GLU 199 1_555 K CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.828 ? 
metalc ? metalc30 C OE2 GLU 154 C GLU 199 1_555 K CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? 
metalc ? metalc31 C OE1 GLU 319 C GLU 364 1_555 L CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.865 ? 
metalc ? metalc32 C OE2 GLU 319 C GLU 364 1_555 L CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? 
metalc ? metalc33 C OD2 ASP 326 C ASP 371 1_555 L CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc34 C O THR 347 C THR 392 1_555 L CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? 
metalc ? metalc35 C OD1 ASP 349 C ASP 394 1_555 L CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.588 ? 
metalc ? metalc36 C O GLU 351 C GLU 396 1_555 L CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? 
metalc ? metalc37 D O ILE 68 D ILE 113 1_555 N CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? 
metalc ? metalc38 D O GLY 70 D GLY 115 1_555 N CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? 
metalc ? metalc39 D OD1 ASP 75 D ASP 120 1_555 N CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.78 ? 
metalc ? metalc40 D OD2 ASP 75 D ASP 120 1_555 N CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? 
metalc ? metalc41 D OE1 GLU 154 D GLU 199 1_555 N CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.837 ? 
metalc ? metalc42 D OE2 GLU 154 D GLU 199 1_555 N CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? 
metalc ? metalc43 D OE1 GLU 319 D GLU 364 1_555 O CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.863 ? 
metalc ? metalc44 D OE2 GLU 319 D GLU 364 1_555 O CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? 
metalc ? metalc45 D OD2 ASP 326 D ASP 371 1_555 O CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? 
metalc ? metalc46 D O THR 347 D THR 392 1_555 O CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? 
metalc ? metalc47 D OD1 ASP 349 D ASP 394 1_555 O CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? 
metalc ? metalc48 D O GLU 351 D GLU 396 1_555 O CA CA . D CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     6BGP 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.016639 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009418 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004432 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 CA A 1 501 1 CA CA . 
F 2 CA A 1 502 2 CA CA . 
G 3 CL A 1 503 2 CL CL . 
H 2 CA B 1 501 3 CA CA . 
I 2 CA B 1 502 4 CA CA . 
J 3 CL B 1 503 1 CL CL . 
K 2 CA C 1 501 5 CA CA . 
L 2 CA C 1 502 6 CA CA . 
M 3 CL C 1 503 3 CL CL . 
N 2 CA D 1 501 7 CA CA . 
O 2 CA D 1 502 8 CA CA . 
P 3 CL D 1 503 4 CL CL . 
Q 4 HOH A 1 601 11 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 2 602 3 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 3 603 21 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 4 604 47 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 5 605 5 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 6 606 26 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 7 607 8 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 8 608 6 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 9 609 28 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 10 610 16 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 11 611 27 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 12 612 43 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 13 613 25 HOH HOH . 
Q 4 HOH A 14 614 22 HOH HOH . 
R 4 HOH B 1 601 12 HOH HOH . 
R 4 HOH B 2 602 41 HOH HOH . 
R 4 HOH B 3 603 2 HOH HOH . 
R 4 HOH B 4 604 7 HOH HOH . 
R 4 HOH B 5 605 32 HOH HOH . 
R 4 HOH B 6 606 44 HOH HOH . 
R 4 HOH B 7 607 30 HOH HOH . 
R 4 HOH B 8 608 29 HOH HOH . 
R 4 HOH B 9 609 1 HOH HOH . 
R 4 HOH B 10 610 42 HOH HOH . 
R 4 HOH B 11 611 13 HOH HOH . 
R 4 HOH B 12 612 31 HOH HOH . 
R 4 HOH B 13 613 24 HOH HOH . 
R 4 HOH B 14 614 50 HOH HOH . 
R 4 HOH B 15 615 46 HOH HOH . 
R 4 HOH B 16 616 45 HOH HOH . 
R 4 HOH B 17 617 17 HOH HOH . 
R 4 HOH B 18 618 49 HOH HOH . 
S 4 HOH C 1 601 39 HOH HOH . 
S 4 HOH C 2 602 20 HOH HOH . 
S 4 HOH C 3 603 4 HOH HOH . 
S 4 HOH C 4 604 23 HOH HOH . 
S 4 HOH C 5 605 9 HOH HOH . 
S 4 HOH C 6 606 40 HOH HOH . 
S 4 HOH C 7 607 14 HOH HOH . 
S 4 HOH C 8 608 18 HOH HOH . 
S 4 HOH C 9 609 19 HOH HOH . 
T 4 HOH D 1 601 15 HOH HOH . 
T 4 HOH D 2 602 10 HOH HOH . 
T 4 HOH D 3 603 48 HOH HOH . 
T 4 HOH D 4 604 34 HOH HOH . 
T 4 HOH D 5 605 37 HOH HOH . 
T 4 HOH D 6 606 33 HOH HOH . 
T 4 HOH D 7 607 38 HOH HOH . 
T 4 HOH D 8 608 36 HOH HOH . 
T 4 HOH D 9 609 35 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         I 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               -5.896 
_atom_site.Cartn_y               -1.119 
_atom_site.Cartn_z               -17.171 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        57.9 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           502 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              12 
_model_server_stats.parse_time_ms           12 
_model_server_stats.create_model_time_ms    25 
_model_server_stats.query_time_ms           338 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#