data_6BNQ # _model_server_result.job_id CKomsFdJjInwqH-ee-qGQw _model_server_result.datetime_utc '2024-10-20 13:06:27' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6bnq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"U","auth_seq_id":401}' # _entry.id 6BNQ # _exptl.entry_id 6BNQ _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6BNQ _cell.length_a 1 _cell.length_b 1 _cell.length_c 1 _cell.Z_PDB ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6BNQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 O N N ? 3 Q N N ? 3 S N N ? 3 U N N ? 3 W N N ? 3 Y N N ? 3 AA N N ? 3 CA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 G OE1 GLN 139 A GLN 137 1_555 O MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.861 ? metalc ? metalc2 G OD2 ASP 156 A ASP 154 1_555 O MG MG . A MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.894 ? metalc ? metalc3 O MG MG . A MG 401 1_555 P O1B ADP . A ADP 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? metalc ? metalc4 H OE1 GLN 139 B GLN 137 1_555 Q MG MG . B MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.82 ? metalc ? metalc5 H OD1 ASP 156 B ASP 154 1_555 Q MG MG . B MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.866 ? metalc ? metalc6 H OD2 ASP 156 B ASP 154 1_555 Q MG MG . B MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.925 ? metalc ? metalc7 Q MG MG . B MG 401 1_555 R O1B ADP . B ADP 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc8 I OE1 GLN 139 C GLN 137 1_555 S MG MG . C MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.827 ? metalc ? metalc9 I OD1 ASP 156 C ASP 154 1_555 S MG MG . C MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.909 ? metalc ? metalc10 I OD2 ASP 156 C ASP 154 1_555 S MG MG . C MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.876 ? metalc ? metalc11 S MG MG . C MG 401 1_555 T O1B ADP . C ADP 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc12 J OE1 GLN 139 D GLN 137 1_555 U MG MG . D MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.831 ? metalc ? metalc13 J OD1 ASP 156 D ASP 154 1_555 U MG MG . D MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.882 ? metalc ? metalc14 J OD2 ASP 156 D ASP 154 1_555 U MG MG . D MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.916 ? metalc ? metalc15 U MG MG . D MG 401 1_555 V O1B ADP . D ADP 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc16 K OE1 GLN 139 E GLN 137 1_555 W MG MG . E MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.811 ? metalc ? metalc17 K OD1 ASP 156 E ASP 154 1_555 W MG MG . E MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.86 ? metalc ? metalc18 K OD2 ASP 156 E ASP 154 1_555 W MG MG . E MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.867 ? metalc ? metalc19 W MG MG . E MG 401 1_555 X O1B ADP . E ADP 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc20 L OE1 GLN 139 F GLN 137 1_555 Y MG MG . F MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.813 ? metalc ? metalc21 L OD1 ASP 156 F ASP 154 1_555 Y MG MG . F MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.863 ? metalc ? metalc22 L OD2 ASP 156 F ASP 154 1_555 Y MG MG . F MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.959 ? metalc ? metalc23 Y MG MG . F MG 401 1_555 Z O1B ADP . F ADP 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? metalc ? metalc24 M OE1 GLN 139 G GLN 137 1_555 AA MG MG . G MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.869 ? metalc ? metalc25 M OD2 ASP 156 G ASP 154 1_555 AA MG MG . G MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.91 ? metalc ? metalc26 AA MG MG . G MG 401 1_555 BA O1B ADP . G ADP 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.41 ? metalc ? metalc27 N OE1 GLN 139 H GLN 137 1_555 CA MG MG . H MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.816 ? metalc ? metalc28 N OD1 ASP 156 H ASP 154 1_555 CA MG MG . H MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.874 ? metalc ? metalc29 N OD2 ASP 156 H ASP 154 1_555 CA MG MG . H MG 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.94 ? metalc ? metalc30 CA MG MG . H MG 401 1_555 DA O1B ADP . H ADP 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6BNQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code O 3 MG A 1 401 401 MG MG . P 4 ADP A 1 402 402 ADP ADP . Q 3 MG B 1 401 401 MG MG . R 4 ADP B 1 402 402 ADP ADP . S 3 MG C 1 401 401 MG MG . T 4 ADP C 1 402 402 ADP ADP . U 3 MG D 1 401 401 MG MG . V 4 ADP D 1 402 402 ADP ADP . W 3 MG E 1 401 401 MG MG . X 4 ADP E 1 402 402 ADP ADP . Y 3 MG F 1 401 401 MG MG . Z 4 ADP F 1 402 402 ADP ADP . AA 3 MG G 1 401 401 MG MG . BA 4 ADP G 1 402 402 ADP ADP . CA 3 MG H 1 401 401 MG MG . DA 4 ADP H 1 402 402 ADP ADP . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id U _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -6.082 _atom_site.Cartn_y 14.853 _atom_site.Cartn_z -10.151 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 0 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 401 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 38 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 73 _model_server_stats.query_time_ms 526 _model_server_stats.encode_time_ms 21 _model_server_stats.element_count 1 #