data_6BXU # _model_server_result.job_id CDDJ5O7r1bEn4iAGDQqbSQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 09:23:44' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6bxu # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":901}' # _entry.id 6BXU # _exptl.entry_id 6BXU _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 10 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6BXU _cell.length_a 180.905 _cell.length_b 180.905 _cell.length_c 127.161 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6BXU _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 93 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 42 2 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 1 PISA monomeric 1 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,E,F,G 1 1 B,H,I,J,K,L 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASN 5 A ASN 482 1_555 G CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? metalc ? metalc2 A O ASN 7 A ASN 484 1_555 G CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 37 A ASP 514 1_555 G CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.825 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 37 A ASP 514 1_555 G CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.947 ? metalc ? metalc5 A O ASN 43 A ASN 520 1_555 G CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.778 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 89 A ASP 566 1_555 G CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.617 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLN 113 A GLN 590 1_555 C CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc8 A O SER 114 A SER 591 1_555 C CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.203 ? metalc ? metalc9 A OE1 GLU 129 A GLU 606 1_555 D CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? metalc ? metalc10 A OE2 GLU 129 A GLU 606 1_555 E CA CA . A CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 144 A ASP 621 1_555 C CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc12 A OE1 GLU 146 A GLU 623 1_555 C CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? metalc ? metalc13 A OD1 ASP 179 A ASP 656 1_555 D CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? metalc ? metalc14 A OE1 GLU 181 A GLU 658 1_555 D CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? metalc ? metalc15 A OE2 GLU 181 A GLU 658 1_555 E CA CA . A CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.916 ? metalc ? metalc16 A OD1 ASP 194 A ASP 671 1_555 C CA CA . A CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.625 ? metalc ? metalc17 A OD1 ASP 211 A ASP 688 1_555 E CA CA . A CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.044 ? metalc ? metalc18 A O VAL 212 A VAL 689 1_555 E CA CA . A CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc19 A OD1 ASN 213 A ASN 690 1_555 F CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? metalc ? metalc20 A OD1 ASP 214 A ASP 691 1_555 D CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.19 ? metalc ? metalc21 A OD2 ASP 214 A ASP 691 1_555 D CA CA . A CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? metalc ? metalc22 A OD1 ASP 214 A ASP 691 1_555 E CA CA . A CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? metalc ? metalc23 A O ASN 215 A ASN 692 1_555 F CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc24 A OD1 ASP 245 A ASP 722 1_555 F CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.886 ? metalc ? metalc25 A OD2 ASP 245 A ASP 722 1_555 F CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc26 A OD1 ASP 247 A ASP 724 1_555 E CA CA . A CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? metalc ? metalc27 A OD2 ASP 247 A ASP 724 1_555 F CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? metalc ? metalc28 A O ASN 251 A ASN 728 1_555 F CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.843 ? metalc ? metalc29 A OD2 ASP 295 A ASP 772 1_555 F CA CA . A CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.692 ? metalc ? metalc30 B OD1 ASN 5 B ASN 482 1_555 L CA CA . B CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? metalc ? metalc31 B O ASN 7 B ASN 484 1_555 L CA CA . B CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? metalc ? metalc32 B OD1 ASP 37 B ASP 514 1_555 L CA CA . B CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? metalc ? metalc33 B OD2 ASP 37 B ASP 514 1_555 L CA CA . B CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? metalc ? metalc34 B OD1 ASP 39 B ASP 516 1_555 L CA CA . B CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? metalc ? metalc35 B O ASN 43 B ASN 520 1_555 L CA CA . B CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.537 ? metalc ? metalc36 B OD2 ASP 89 B ASP 566 1_555 L CA CA . B CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc37 B OE1 GLN 113 B GLN 590 1_555 H CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc ? metalc38 B O SER 114 B SER 591 1_555 H CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc39 B OE1 GLU 129 B GLU 606 1_555 J CA CA . B CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? metalc ? metalc40 B OE2 GLU 129 B GLU 606 1_555 K CA CA . B CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc41 B OD1 ASP 144 B ASP 621 1_555 H CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.672 ? metalc ? metalc42 B OE1 GLU 146 B GLU 623 1_555 H CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? metalc ? metalc43 B OD2 ASP 148 B ASP 625 1_555 H CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.833 ? metalc ? metalc44 B OD2 ASP 179 B ASP 656 1_555 J CA CA . B CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.071 ? metalc ? metalc45 B OE1 GLU 181 B GLU 658 1_555 J CA CA . B CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.995 ? metalc ? metalc46 B OE1 GLU 181 B GLU 658 1_555 K CA CA . B CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.118 ? metalc ? metalc47 B OE2 GLU 181 B GLU 658 1_555 K CA CA . B CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.957 ? metalc ? metalc48 B OD1 ASP 194 B ASP 671 1_555 H CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.198 ? metalc ? metalc49 B OD2 ASP 194 B ASP 671 1_555 H CA CA . B CA 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? metalc ? metalc50 B OD1 ASP 211 B ASP 688 1_555 K CA CA . B CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc51 B O VAL 212 B VAL 689 1_555 K CA CA . B CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.803 ? metalc ? metalc52 B OD1 ASN 213 B ASN 690 1_555 I CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc53 B OD1 ASP 214 B ASP 691 1_555 J CA CA . B CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? metalc ? metalc54 B OD2 ASP 214 B ASP 691 1_555 J CA CA . B CA 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.953 ? metalc ? metalc55 B OD2 ASP 214 B ASP 691 1_555 K CA CA . B CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.19 ? metalc ? metalc56 B O ASN 215 B ASN 692 1_555 I CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.345 ? metalc ? metalc57 B OD1 ASP 245 B ASP 722 1_555 I CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.061 ? metalc ? metalc58 B OD2 ASP 245 B ASP 722 1_555 I CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? metalc ? metalc59 B OD2 ASP 247 B ASP 724 1_555 I CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? metalc ? metalc60 B OD1 ASP 247 B ASP 724 1_555 K CA CA . B CA 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? metalc ? metalc61 B O ASN 251 B ASN 728 1_555 I CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.023 ? metalc ? metalc62 B OD2 ASP 295 B ASP 772 1_555 I CA CA . B CA 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.178 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6BXU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.005528 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005528 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007864 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 901 1 CA CA . D 2 CA A 1 902 6 CA CA . E 2 CA A 1 903 7 CA CA . F 2 CA A 1 904 8 CA CA . G 2 CA A 1 905 9 CA CA . H 2 CA B 1 901 2 CA CA . I 2 CA B 1 902 3 CA CA . J 2 CA B 1 903 4 CA CA . K 2 CA B 1 904 5 CA CA . L 2 CA B 1 905 10 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 63.726 _atom_site.Cartn_y 49.462 _atom_site.Cartn_z -10.728 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 113.74 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 901 _atom_site.auth_asym_id B _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 19 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 295 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #