data_6CFN
#
_model_server_result.job_id            S9qAHglHAyQe7HvRicXfIg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-26 22:22:57' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6cfn 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":602}' 
#
_entry.id    6CFN 
#
_exptl.entry_id    6CFN 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              65.409 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ZINC ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    16 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         71.27 
_cell.angle_beta          84.96 
_cell.angle_gamma         68.44 
_cell.entry_id            6CFN 
_cell.length_a            65.803 
_cell.length_b            65.432 
_cell.length_c            72.659 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6CFN 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
? monomeric 1 author_defined_assembly 3 
? monomeric 1 author_defined_assembly 4 
? monomeric 1 author_defined_assembly 5 
? monomeric 1 author_defined_assembly 6 
? monomeric 1 author_defined_assembly 7 
? monomeric 1 author_defined_assembly 8 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,I,J,Y 1 1 
B,K,L,Z 2 1 
C,M,N,AA 3 1 
D,O,P,BA 4 1 
E,Q,R,CA 5 1 
F,S,T,DA 6 1 
G,U,V,EA 7 1 
H,W,X,FA 8 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 I N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
? 2 L N N 
? 2 M N N 
? 2 N N N 
? 2 O N N 
? 2 P N N 
? 2 Q N N 
? 2 R N N 
? 2 S N N 
? 2 T N N 
? 2 U N N 
? 2 V N N 
? 2 W N N 
? 2 X N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 15 A CYS 431 1_555 D SG CYS 15 D CYS 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf2 B SG CYS 15 B CYS 431 1_555 C SG CYS 15 C CYS 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf3 E SG CYS 15 E CYS 431 1_555 G SG CYS 15 G CYS 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf4 F SG CYS 15 F CYS 431 1_555 H SG CYS 15 H CYS 431 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
metalc ? metalc1 A SG CYS 5 A CYS 421 1_555 I ZN ZN . A ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 8 A CYS 424 1_555 I ZN ZN . A ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 22 A CYS 438 1_555 I ZN ZN . A ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.374 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 25 A CYS 441 1_555 I ZN ZN . A ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 41 A CYS 457 1_555 J ZN ZN . A ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 47 A CYS 463 1_555 J ZN ZN . A ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc7 A SG CYS 57 A CYS 473 1_555 J ZN ZN . A ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? 
metalc ? metalc8 A SG CYS 60 A CYS 476 1_555 J ZN ZN . A ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.521 ? 
metalc ? metalc9 B SG CYS 5 B CYS 421 1_555 K ZN ZN . B ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? 
metalc ? metalc10 B SG CYS 8 B CYS 424 1_555 K ZN ZN . B ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? 
metalc ? metalc11 B SG CYS 22 B CYS 438 1_555 K ZN ZN . B ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.397 ? 
metalc ? metalc12 B SG CYS 25 B CYS 441 1_555 K ZN ZN . B ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? 
metalc ? metalc13 B SG CYS 41 B CYS 457 1_555 L ZN ZN . B ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? 
metalc ? metalc14 B SG CYS 47 B CYS 463 1_555 L ZN ZN . B ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? 
metalc ? metalc15 B SG CYS 57 B CYS 473 1_555 L ZN ZN . B ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? 
metalc ? metalc16 B SG CYS 60 B CYS 476 1_555 L ZN ZN . B ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.581 ? 
metalc ? metalc17 C SG CYS 5 C CYS 421 1_555 M ZN ZN . C ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? 
metalc ? metalc18 C SG CYS 8 C CYS 424 1_555 M ZN ZN . C ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? 
metalc ? metalc19 C SG CYS 22 C CYS 438 1_555 M ZN ZN . C ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? 
metalc ? metalc20 C SG CYS 25 C CYS 441 1_555 M ZN ZN . C ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.388 ? 
metalc ? metalc21 C SG CYS 41 C CYS 457 1_555 N ZN ZN . C ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? 
metalc ? metalc22 C SG CYS 47 C CYS 463 1_555 N ZN ZN . C ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc23 C SG CYS 57 C CYS 473 1_555 N ZN ZN . C ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? 
metalc ? metalc24 C SG CYS 60 C CYS 476 1_555 N ZN ZN . C ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? 
metalc ? metalc25 D SG CYS 5 D CYS 421 1_555 O ZN ZN . D ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? 
metalc ? metalc26 D SG CYS 8 D CYS 424 1_555 O ZN ZN . D ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.236 ? 
metalc ? metalc27 D SG CYS 22 D CYS 438 1_555 O ZN ZN . D ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? 
metalc ? metalc28 D SG CYS 25 D CYS 441 1_555 O ZN ZN . D ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? 
metalc ? metalc29 D SG CYS 41 D CYS 457 1_555 P ZN ZN . D ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.36 ? 
metalc ? metalc30 D SG CYS 47 D CYS 463 1_555 P ZN ZN . D ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? 
metalc ? metalc31 D SG CYS 57 D CYS 473 1_555 P ZN ZN . D ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc32 D SG CYS 60 D CYS 476 1_555 P ZN ZN . D ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? 
metalc ? metalc33 E SG CYS 5 E CYS 421 1_555 Q ZN ZN . E ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? 
metalc ? metalc34 E SG CYS 8 E CYS 424 1_555 Q ZN ZN . E ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? 
metalc ? metalc35 E SG CYS 22 E CYS 438 1_555 Q ZN ZN . E ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? 
metalc ? metalc36 E SG CYS 25 E CYS 441 1_555 Q ZN ZN . E ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.348 ? 
metalc ? metalc37 E SG CYS 41 E CYS 457 1_555 R ZN ZN . E ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? 
metalc ? metalc38 E SG CYS 47 E CYS 463 1_555 R ZN ZN . E ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.321 ? 
metalc ? metalc39 E SG CYS 57 E CYS 473 1_555 R ZN ZN . E ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? 
metalc ? metalc40 E SG CYS 60 E CYS 476 1_555 R ZN ZN . E ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc41 F SG CYS 5 F CYS 421 1_555 S ZN ZN . F ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.456 ? 
metalc ? metalc42 F SG CYS 8 F CYS 424 1_555 S ZN ZN . F ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? 
metalc ? metalc43 F SG CYS 22 F CYS 438 1_555 S ZN ZN . F ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.438 ? 
metalc ? metalc44 F SG CYS 25 F CYS 441 1_555 S ZN ZN . F ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.358 ? 
metalc ? metalc45 F SG CYS 41 F CYS 457 1_555 T ZN ZN . F ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.299 ? 
metalc ? metalc46 F SG CYS 47 F CYS 463 1_555 T ZN ZN . F ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? 
metalc ? metalc47 F SG CYS 57 F CYS 473 1_555 T ZN ZN . F ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.22 ? 
metalc ? metalc48 F SG CYS 60 F CYS 476 1_555 T ZN ZN . F ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? 
metalc ? metalc49 G SG CYS 5 G CYS 421 1_555 U ZN ZN . G ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? 
metalc ? metalc50 G SG CYS 8 G CYS 424 1_555 U ZN ZN . G ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.28 ? 
metalc ? metalc51 G SG CYS 22 G CYS 438 1_555 U ZN ZN . G ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.22 ? 
metalc ? metalc52 G SG CYS 25 G CYS 441 1_555 U ZN ZN . G ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? 
metalc ? metalc53 G SG CYS 41 G CYS 457 1_555 V ZN ZN . G ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? 
metalc ? metalc54 G SG CYS 47 G CYS 463 1_555 V ZN ZN . G ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? 
metalc ? metalc55 G SG CYS 57 G CYS 473 1_555 V ZN ZN . G ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? 
metalc ? metalc56 G SG CYS 60 G CYS 476 1_555 V ZN ZN . G ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? 
metalc ? metalc57 H SG CYS 5 H CYS 421 1_555 W ZN ZN . H ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? 
metalc ? metalc58 H SG CYS 8 H CYS 424 1_555 W ZN ZN . H ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? 
metalc ? metalc59 H SG CYS 22 H CYS 438 1_555 W ZN ZN . H ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? 
metalc ? metalc60 H SG CYS 25 H CYS 441 1_555 W ZN ZN . H ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? 
metalc ? metalc61 H SG CYS 41 H CYS 457 1_555 X ZN ZN . H ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? 
metalc ? metalc62 H SG CYS 47 H CYS 463 1_555 X ZN ZN . H ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? 
metalc ? metalc63 H SG CYS 57 H CYS 473 1_555 X ZN ZN . H ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc64 H SG CYS 60 H CYS 476 1_555 X ZN ZN . H ZN 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.447 ? 
#
_chem_comp.formula           'Zn 2' 
_chem_comp.formula_weight    65.409 
_chem_comp.id                ZN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ZINC ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     6CFN 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.015197 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    -0.006005 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000561 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.016433 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    -0.005393 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.014541 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 2 ZN A 1 601 601 ZN ZN . 
J 2 ZN A 1 602 602 ZN ZN . 
K 2 ZN B 1 601 601 ZN ZN . 
L 2 ZN B 1 602 602 ZN ZN . 
M 2 ZN C 1 601 601 ZN ZN . 
N 2 ZN C 1 602 602 ZN ZN . 
O 2 ZN D 1 601 601 ZN ZN . 
P 2 ZN D 1 602 602 ZN ZN . 
Q 2 ZN E 1 601 601 ZN ZN . 
R 2 ZN E 1 602 602 ZN ZN . 
S 2 ZN F 1 601 601 ZN ZN . 
T 2 ZN F 1 602 602 ZN ZN . 
U 2 ZN G 1 601 601 ZN ZN . 
V 2 ZN G 1 602 602 ZN ZN . 
W 2 ZN H 1 601 601 ZN ZN . 
X 2 ZN H 1 602 602 ZN ZN . 
Y 3 HOH A 1 701 4 HOH HOH . 
Y 3 HOH A 2 702 32 HOH HOH . 
Y 3 HOH A 3 703 10 HOH HOH . 
Y 3 HOH A 4 704 11 HOH HOH . 
Z 3 HOH B 1 701 8 HOH HOH . 
Z 3 HOH B 2 702 26 HOH HOH . 
Z 3 HOH B 3 703 12 HOH HOH . 
AA 3 HOH C 1 701 7 HOH HOH . 
AA 3 HOH C 2 702 5 HOH HOH . 
AA 3 HOH C 3 703 1 HOH HOH . 
AA 3 HOH C 4 704 14 HOH HOH . 
BA 3 HOH D 1 701 25 HOH HOH . 
BA 3 HOH D 2 702 22 HOH HOH . 
BA 3 HOH D 3 703 13 HOH HOH . 
BA 3 HOH D 4 704 2 HOH HOH . 
BA 3 HOH D 5 705 21 HOH HOH . 
BA 3 HOH D 6 706 3 HOH HOH . 
CA 3 HOH E 1 701 20 HOH HOH . 
CA 3 HOH E 2 702 19 HOH HOH . 
CA 3 HOH E 3 703 23 HOH HOH . 
DA 3 HOH F 1 701 24 HOH HOH . 
EA 3 HOH G 1 701 16 HOH HOH . 
EA 3 HOH G 2 702 17 HOH HOH . 
FA 3 HOH H 1 701 31 HOH HOH . 
FA 3 HOH H 2 702 15 HOH HOH . 
FA 3 HOH H 3 703 18 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           ZN 
_atom_site.label_atom_id         ZN 
_atom_site.label_comp_id         ZN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         N 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               26.001 
_atom_site.Cartn_y               -67.697 
_atom_site.Cartn_z               -31.893 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        48.46 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          ZN 
_atom_site.auth_comp_id          ZN 
_atom_site.auth_seq_id           602 
_atom_site.auth_asym_id          C 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              16 
_model_server_stats.parse_time_ms           11 
_model_server_stats.create_model_time_ms    4 
_model_server_stats.query_time_ms           298 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#