data_6CH8 # _model_server_result.job_id WVE1hOPRC3wYbsR1LfQwSQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-23 14:24:15' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6ch8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Y","auth_seq_id":658}' # _entry.id 6CH8 # _exptl.entry_id 6CH8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 221.208 _entity.id 19 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 6CH8 _cell.length_a 239.223 _cell.length_b 239.223 _cell.length_c 355.266 _cell.Z_PDB 18 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6CH8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 155 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'H 3 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details octadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 18 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z 1 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z 1 2 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z 1 3 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_545 -y,x-y-1,z -0.5 -0.866025 0 0.866025 -0.5 0 0 0 1 119.61 -207.170597 0 3 'crystal symmetry operation' 3_655 -x+y+1,-x,z -0.5 0.866025 0 -0.866025 -0.5 0 0 0 1 239.22 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 19 W N N ? 19 X N N ? 19 Y N N ? 19 Z N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide 9 oligosaccharide 10 oligosaccharide 11 oligosaccharide 12 oligosaccharide 13 oligosaccharide 14 oligosaccharide 15 oligosaccharide 16 oligosaccharide 17 oligosaccharide 18 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 7 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 7 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 3 ? 8 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 4 ? 8 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 5 ? 8 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 6 ? 8 5 4 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 7 ? 9 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 8 ? 9 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 9 ? 9 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 10 ? 9 5 4 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 11 ? 9 6 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 12 ? 9 7 6 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 13 ? 10 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 14 ? 10 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 15 ? 10 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 16 ? 10 5 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 17 ? 11 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 18 ? 11 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 19 ? 11 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 20 ? 11 5 4 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 21 ? 11 6 5 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 22 ? 11 7 4 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 23 ? 12 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 24 ? 12 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 25 ? 12 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 26 ? 13 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 27 ? 13 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 28 ? 13 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 29 ? 14 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 30 ? 14 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 31 ? 14 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 32 ? 14 5 4 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 33 ? 14 6 4 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 34 ? 14 7 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 35 ? 15 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 36 ? 15 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 37 ? 15 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 38 ? 15 5 4 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 39 ? 15 6 5 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 40 ? 15 7 4 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 41 ? 15 8 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 42 ? 16 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 43 ? 16 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 44 ? 16 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 45 ? 16 5 4 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 46 ? 16 6 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 47 ? 17 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 48 ? 17 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 49 ? 17 4 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 50 ? 17 5 4 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 51 ? 17 6 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 52 ? 17 7 6 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 53 ? 17 8 6 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 54 ? 18 2 1 NAG NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 55 ? 18 3 2 BMA NAG C1 O1 . O4 HO4 . sing 56 ? 18 4 3 MAN BMA C1 O1 . O6 HO6 . sing 57 ? 18 5 4 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing 58 ? 18 6 5 MAN MAN C1 O1 . O2 HO2 . sing 59 ? 18 7 4 MAN MAN C1 O1 . O3 HO3 . sing 60 ? 18 8 3 MAN BMA C1 O1 . O3 HO3 . sing 61 ? 18 9 8 MAN MAN C1 O1 . O6 HO6 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 7 n G NAG 1 A 1 NAG B 6180 NAG 7 n G NAG 2 A 2 NAG B 6181 NAG 7 n G BMA 3 A 3 BMA B 6182 BMA 8 n H NAG 1 C 1 NAG B 6370 NAG 8 n H NAG 2 C 2 NAG B 6371 NAG 8 n H BMA 3 C 3 BMA B 6372 BMA 8 n H MAN 4 C 4 MAN B 6373 MAN 8 n H MAN 5 C 5 MAN B 6374 MAN 9 n I NAG 1 F 1 NAG G 880 NAG 9 n I NAG 2 F 2 NAG G 881 NAG 9 n I BMA 3 F 3 BMA G 882 BMA 9 n I MAN 4 F 4 MAN G 884 MAN 9 n I MAN 5 F 5 MAN G 886 MAN 9 n I MAN 6 F 6 MAN G 883 MAN 9 n I MAN 7 F 7 MAN G 885 MAN 10 n J NAG 1 H 1 NAG G 1370 NAG 10 n J NAG 2 H 2 NAG G 1371 NAG 10 n J BMA 3 H 3 BMA G 1372 BMA 10 n J MAN 4 H 4 MAN G 1374 MAN 10 n J MAN 5 H 5 MAN G 1373 MAN 11 n K NAG 1 I 1 NAG G 1560 NAG 11 n K NAG 2 I 2 NAG G 1561 NAG 11 n K BMA 3 I 3 BMA G 1562 BMA 11 n K MAN 4 I 4 MAN G 1563 MAN 11 n K MAN 5 I 5 MAN G 1565 MAN 11 n K MAN 6 I 6 MAN G 1566 MAN 11 n K MAN 7 I 7 MAN G 1564 MAN 8 n L NAG 1 J 1 NAG G 1600 NAG 8 n L NAG 2 J 2 NAG G 1601 NAG 8 n L BMA 3 J 3 BMA G 1602 BMA 8 n L MAN 4 J 4 MAN G 1603 MAN 8 n L MAN 5 J 5 MAN G 1604 MAN 12 n M NAG 1 K 1 NAG G 1970 NAG 12 n M NAG 2 K 2 NAG G 1971 NAG 12 n M BMA 3 K 3 BMA G 1972 BMA 12 n M MAN 4 K 4 MAN G 1973 MAN 13 n N NAG 1 L 1 NAG G 2340 NAG 13 n N NAG 2 L 2 NAG G 2341 NAG 13 n N BMA 3 L 3 BMA G 2342 BMA 13 n N MAN 4 L 4 MAN G 2343 MAN 14 n O NAG 1 M 1 NAG G 2620 NAG 14 n O NAG 2 M 2 NAG G 2621 NAG 14 n O BMA 3 M 3 BMA G 2622 BMA 14 n O MAN 4 M 4 MAN G 2623 MAN 14 n O MAN 5 M 5 MAN G 2626 MAN 14 n O MAN 6 M 6 MAN G 2624 MAN 14 n O MAN 7 M 7 MAN G 2625 MAN 15 n P NAG 1 N 1 NAG G 2760 NAG 15 n P NAG 2 N 2 NAG G 2761 NAG 15 n P BMA 3 N 3 BMA G 2762 BMA 15 n P MAN 4 N 4 MAN G 2763 MAN 15 n P MAN 5 N 5 MAN G 2764 MAN 15 n P MAN 6 N 6 MAN G 2767 MAN 15 n P MAN 7 N 7 MAN G 2765 MAN 15 n P MAN 8 N 8 MAN G 2766 MAN 7 n Q NAG 1 O 1 NAG G 2950 NAG 7 n Q NAG 2 O 2 NAG G 2951 NAG 7 n Q BMA 3 O 3 BMA G 2952 BMA 16 n R NAG 1 P 1 NAG G 3010 NAG 16 n R NAG 2 P 2 NAG G 3011 NAG 16 n R BMA 3 P 3 BMA G 3012 BMA 16 n R MAN 4 P 4 MAN G 3013 MAN 16 n R MAN 5 P 5 MAN G 3015 MAN 16 n R MAN 6 P 6 MAN G 3014 MAN 17 n S NAG 1 S 1 NAG G 3860 NAG 17 n S NAG 2 S 2 NAG G 3861 NAG 17 n S BMA 3 S 3 BMA G 3862 BMA 17 n S MAN 4 S 4 MAN G 3863 MAN 17 n S MAN 5 S 5 MAN G 3867 MAN 17 n S MAN 6 S 6 MAN G 3864 MAN 17 n S MAN 7 S 7 MAN G 3866 MAN 17 n S MAN 8 S 8 MAN G 3865 MAN 12 n T NAG 1 T 1 NAG G 3920 NAG 12 n T NAG 2 T 2 NAG G 3921 NAG 12 n T BMA 3 T 3 BMA G 3922 BMA 12 n T MAN 4 T 4 MAN G 3923 MAN 10 n U NAG 1 U 1 NAG G 4480 NAG 10 n U NAG 2 U 2 NAG G 4481 NAG 10 n U BMA 3 U 3 BMA G 4482 BMA 10 n U MAN 4 U 4 MAN G 4483 MAN 10 n U MAN 5 U 5 MAN G 4484 MAN 18 n V NAG 1 V 1 NAG G 3320 NAG 18 n V NAG 2 V 2 NAG G 3321 NAG 18 n V BMA 3 V 3 BMA G 3322 BMA 18 n V MAN 4 V 4 MAN G 3323 MAN 18 n V MAN 5 V 5 MAN G 3324 MAN 18 n V MAN 6 V 6 MAN G 3329 MAN 18 n V MAN 7 V 7 MAN G 3325 MAN 18 n V MAN 8 V 8 MAN G 3327 MAN 18 n V MAN 9 V 9 MAN G 3328 MAN # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 B SG CYS 22 D CYS 22 1_555 B SG CYS 104 D CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 158 D CYS 140 1_555 B SG CYS 214 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf3 D SG CYS 24 G CYS 54 1_555 D SG CYS 44 G CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf4 D SG CYS 96 G CYS 126 1_555 D SG CYS 166 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf5 D SG CYS 266 G CYS 296 1_555 D SG CYS 300 G CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.985 ? disulf ? disulf6 D SG CYS 347 G CYS 378 1_555 D SG CYS 413 G CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf7 D SG CYS 354 G CYS 385 1_555 D SG CYS 386 G CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf8 E SG CYS 22 Q CYS 22 1_555 E SG CYS 96 Q CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf9 E SG CYS 157 Q CYS 157 1_555 E SG CYS 213 Q CYS 213 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf10 F SG CYS 24 R CYS 24 1_555 F SG CYS 89 R CYS 89 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? covale ? covale1 A ND2 ASN 100 B ASN 611 1_555 W C1 NAG . B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale2 A ND2 ASN 107 B ASN 618 1_555 G C1 NAG . A NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale3 A OD2 ASP 113 B ASP 624 1_555 B CB ASP 111 D ASP 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale ? covale4 A OD2 ASP 113 B ASP 624 1_555 B CG ASP 111 D ASP 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.237 ? covale ? covale5 A ND2 ASN 126 B ASN 637 1_555 H C1 NAG . C NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale6 D OE1 GLU 34 G GLU 64 1_555 O C2 MAN . M MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.377 ? covale ? covale7 D ND2 ASN 58 G ASN 88 1_555 I C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale8 D ND2 ASN 103 G ASN 133 1_555 J C1 NAG . H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale9 D ND2 ASN 118 G ASN 156 1_555 K C1 NAG . I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale10 D ND2 ASN 122 G ASN 160 1_555 L C1 NAG . J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? covale ? covale11 D ND2 ASN 167 G ASN 197 1_555 M C1 NAG . K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.5 ? covale ? covale12 D ND2 ASN 204 G ASN 234 1_555 N C1 NAG . L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale13 D ND2 ASN 232 G ASN 262 1_555 O C1 NAG . M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale14 D ND2 ASN 265 G ASN 295 1_555 Q C1 NAG . O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.359 ? covale ? covale15 D ND2 ASN 271 G ASN 301 1_555 R C1 NAG . P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale16 D ND2 ASN 301 G ASN 332 1_555 V C1 NAG . V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale17 D ND2 ASN 324 G ASN 355 1_555 X C1 NAG . G NAG 657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale18 D ND2 ASN 332 G ASN 363 1_555 Y C1 NAG . G NAG 658 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale19 D ND2 ASN 361 G ASN 392 1_555 T C1 NAG . T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale20 D ND2 ASN 379 G ASN 411 1_555 Z C1 NAG . G NAG 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale21 D ND2 ASN 416 G ASN 448 1_555 U C1 NAG . U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale22 E NE2 HIS 33 Q HIS 33 1_555 V O6 MAN . V MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.299 ? covale ? covale23 E CA GLN 188 Q GLN 188 1_555 F OE1 GLU 164 R GLU 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale24 E CB GLN 188 Q GLN 188 1_555 F OE2 GLU 164 R GLU 164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.481 ? covale ? covale25 G O4 NAG . A NAG 1 1_555 G C1 NAG . A NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale26 G O4 NAG . A NAG 2 1_555 G C1 BMA . A BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale27 H O4 NAG . C NAG 1 1_555 H C1 NAG . C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale28 H O4 NAG . C NAG 2 1_555 H C1 BMA . C BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale29 H O6 BMA . C BMA 3 1_555 H C1 MAN . C MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? covale ? covale30 H O6 MAN . C MAN 4 1_555 H C1 MAN . C MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? covale ? covale31 I O4 NAG . F NAG 1 1_555 I C1 NAG . F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale32 I O4 NAG . F NAG 2 1_555 I C1 BMA . F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? covale ? covale33 I O3 BMA . F BMA 3 1_555 I C1 MAN . F MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale34 I O6 BMA . F BMA 3 1_555 I C1 MAN . F MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? covale ? covale35 I O6 MAN . F MAN 4 1_555 I C1 MAN . F MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale36 I O3 MAN . F MAN 6 1_555 I C1 MAN . F MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? covale ? covale37 J O4 NAG . H NAG 1 1_555 J C1 NAG . H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale38 J O4 NAG . H NAG 2 1_555 J C1 BMA . H BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale39 J O3 BMA . H BMA 3 1_555 J C1 MAN . H MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? covale ? covale40 J O6 BMA . H BMA 3 1_555 J C1 MAN . H MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? covale ? covale41 K O4 NAG . I NAG 1 1_555 K C1 NAG . I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale42 K O4 NAG . I NAG 2 1_555 K C1 BMA . I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale43 K O6 BMA . I BMA 3 1_555 K C1 MAN . I MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale44 K O3 MAN . I MAN 4 1_555 K C1 MAN . I MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale45 K O6 MAN . I MAN 4 1_555 K C1 MAN . I MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? covale ? covale46 K O6 MAN . I MAN 5 1_555 K C1 MAN . I MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale47 L O4 NAG . J NAG 1 1_555 L C1 NAG . J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale48 L O4 NAG . J NAG 2 1_555 L C1 BMA . J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? covale ? covale49 L O6 BMA . J BMA 3 1_555 L C1 MAN . J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale50 L O6 MAN . J MAN 4 1_555 L C1 MAN . J MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale51 M O4 NAG . K NAG 1 1_555 M C1 NAG . K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? covale ? covale52 M O4 NAG . K NAG 2 1_555 M C1 BMA . K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? covale ? covale53 M O3 BMA . K BMA 3 1_555 M C1 MAN . K MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale54 N O4 NAG . L NAG 1 1_555 N C1 NAG . L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale55 N O4 NAG . L NAG 2 1_555 N C1 BMA . L BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale56 N O6 BMA . L BMA 3 1_555 N C1 MAN . L MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? covale ? covale57 O O4 NAG . M NAG 1 1_555 O C1 NAG . M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale58 O O4 NAG . M NAG 2 1_555 O C1 BMA . M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale59 O O6 BMA . M BMA 3 1_555 O C1 MAN . M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? covale ? covale60 O O3 BMA . M BMA 3 1_555 O C1 MAN . M MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? covale ? covale61 O O3 MAN . M MAN 4 1_555 O C1 MAN . M MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale62 O O6 MAN . M MAN 4 1_555 O C1 MAN . M MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? covale ? covale63 P O4 NAG . N NAG 1 1_555 P C1 NAG . N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale64 P O4 NAG . N NAG 2 1_555 P C1 BMA . N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale65 P O6 BMA . N BMA 3 1_555 P C1 MAN . N MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale66 P O3 BMA . N BMA 3 1_555 P C1 MAN . N MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? covale ? covale67 P O3 MAN . N MAN 4 1_555 P C1 MAN . N MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale68 P O6 MAN . N MAN 4 1_555 P C1 MAN . N MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale69 P O6 MAN . N MAN 5 1_555 P C1 MAN . N MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale70 Q O4 NAG . O NAG 1 1_555 Q C1 NAG . O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale71 Q O4 NAG . O NAG 2 1_555 Q C1 BMA . O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale72 R O4 NAG . P NAG 1 1_555 R C1 NAG . P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale73 R O4 NAG . P NAG 2 1_555 R C1 BMA . P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? covale ? covale74 R O6 BMA . P BMA 3 1_555 R C1 MAN . P MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? covale ? covale75 R O3 BMA . P BMA 3 1_555 R C1 MAN . P MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale76 R O6 MAN . P MAN 4 1_555 R C1 MAN . P MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale77 S O4 NAG . S NAG 1 1_555 S C1 NAG . S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? covale ? covale78 S O4 NAG . S NAG 2 1_555 S C1 BMA . S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? covale ? covale79 S O3 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale80 S O6 BMA . S BMA 3 1_555 S C1 MAN . S MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale81 S O2 MAN . S MAN 4 1_555 S C1 MAN . S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale82 S O3 MAN . S MAN 6 1_555 S C1 MAN . S MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale83 S O6 MAN . S MAN 6 1_555 S C1 MAN . S MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? covale ? covale84 T O4 NAG . T NAG 1 1_555 T C1 NAG . T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? covale ? covale85 T O4 NAG . T NAG 2 1_555 T C1 BMA . T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale86 T O3 BMA . T BMA 3 1_555 T C1 MAN . T MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale87 U O4 NAG . U NAG 1 1_555 U C1 NAG . U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? covale ? covale88 U O4 NAG . U NAG 2 1_555 U C1 BMA . U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale89 U O3 BMA . U BMA 3 1_555 U C1 MAN . U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.497 ? covale ? covale90 U O6 BMA . U BMA 3 1_555 U C1 MAN . U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale ? covale91 V O4 NAG . V NAG 1 1_555 V C1 NAG . V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? covale ? covale92 V O4 NAG . V NAG 2 1_555 V C1 BMA . V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale93 V O6 BMA . V BMA 3 1_555 V C1 MAN . V MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale94 V O3 BMA . V BMA 3 1_555 V C1 MAN . V MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? covale ? covale95 V O6 MAN . V MAN 4 1_555 V C1 MAN . V MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.44 ? covale ? covale96 V O3 MAN . V MAN 4 1_555 V C1 MAN . V MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? covale ? covale97 V O2 MAN . V MAN 5 1_555 V C1 MAN . V MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale98 V O6 MAN . V MAN 8 1_555 V C1 MAN . V MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? # _chem_comp.formula 'C8 H15 N O6' _chem_comp.formula_weight 221.208 _chem_comp.id NAG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-acetyl-beta-D-glucosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-D-glucose;2-acetamido-2-deoxy-glucose;N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 NAG sing 283 n n C1 O1 NAG sing 284 n n C1 O5 NAG sing 285 n n C1 H1 NAG sing 286 n n C2 C3 NAG sing 287 n n C2 N2 NAG sing 288 n n C2 H2 NAG sing 289 n n C3 C4 NAG sing 290 n n C3 O3 NAG sing 291 n n C3 H3 NAG sing 292 n n C4 C5 NAG sing 293 n n C4 O4 NAG sing 294 n n C4 H4 NAG sing 295 n n C5 C6 NAG sing 296 n n C5 O5 NAG sing 297 n n C5 H5 NAG sing 298 n n C6 O6 NAG sing 299 n n C6 H61 NAG sing 300 n n C6 H62 NAG sing 301 n n C7 C8 NAG sing 302 n n C7 N2 NAG sing 303 n n C7 O7 NAG doub 304 n n C8 H81 NAG sing 305 n n C8 H82 NAG sing 306 n n C8 H83 NAG sing 307 n n N2 HN2 NAG sing 308 n n O1 HO1 NAG sing 309 n n O3 HO3 NAG sing 310 n n O4 HO4 NAG sing 311 n n O6 HO6 NAG sing 312 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version NAG DGlcpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 NAG N-acetyl-b-D-glucopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 NAG b-D-GlcpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 NAG GlcNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 6CH8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.00418 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.002413 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004827 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.002815 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code W 19 NAG B 1 701 6110 NAG NAG . X 19 NAG G 1 657 3550 NAG NAG . Y 19 NAG G 1 658 3630 NAG NAG . Z 19 NAG G 1 671 4110 NAG NAG . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 NAG . . . Y 19 75.548 -77.304 -31.838 1 258.43 ? C1 NAG 658 G 1 HETATM 2 C C2 NAG . . . Y 19 75.678 -77.923 -33.235 1 288.02 ? C2 NAG 658 G 1 HETATM 3 C C3 NAG . . . Y 19 75.632 -76.854 -34.325 1 292.56 ? C3 NAG 658 G 1 HETATM 4 C C4 NAG . . . Y 19 74.367 -76.025 -34.169 1 301.19 ? C4 NAG 658 G 1 HETATM 5 C C5 NAG . . . Y 19 74.306 -75.459 -32.754 1 290.8 ? C5 NAG 658 G 1 HETATM 6 C C6 NAG . . . Y 19 73.035 -74.639 -32.56 1 282.94 ? C6 NAG 658 G 1 HETATM 7 C C7 NAG . . . Y 19 78.09 -78.359 -32.936 1 239.82 ? C7 NAG 658 G 1 HETATM 8 C C8 NAG . . . Y 19 78.907 -79.45 -32.31 1 213.78 ? C8 NAG 658 G 1 HETATM 9 N N2 NAG . . . Y 19 76.883 -78.729 -33.366 1 276.62 ? N2 NAG 658 G 1 HETATM 10 O O3 NAG . . . Y 19 75.642 -77.467 -35.62 1 242.42 ? O3 NAG 658 G 1 HETATM 11 O O4 NAG . . . Y 19 74.357 -74.963 -35.131 1 287.78 ? O4 NAG 658 G 1 HETATM 12 O O5 NAG . . . Y 19 74.346 -76.527 -31.799 1 276.66 ? O5 NAG 658 G 1 HETATM 13 O O6 NAG . . . Y 19 73.052 -74.017 -31.271 1 262.6 ? O6 NAG 658 G 1 HETATM 14 O O7 NAG . . . Y 19 78.519 -77.222 -33.049 1 228.25 ? O7 NAG 658 G 1 # _model_server_stats.io_time_ms 59 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 46 _model_server_stats.query_time_ms 274 _model_server_stats.encode_time_ms 14 _model_server_stats.element_count 14 #