data_6CM1
#
_model_server_result.job_id            dYrODE70aHwPKwSBiHUBhw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-22 11:56:19' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6cm1 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"ZD","auth_seq_id":371}' 
#
_entry.id    6CM1 
#
_exptl.entry_id    6CM1 
_exptl.method      'SOLUTION NMR' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              678.94 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    218 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    trimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      3 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD,QD,RD,SD,TD,UD,VD,WD,XD,YD,ZD,AE,BE,CE,DE,EE,FE,GE,HE,IE,JE,KE,LE,ME,NE,OE,PE,QE,RE,SE,TE,UE,VE,WE,XE,YE,ZE,AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,NF,OF,PF,QF,RF,SF,TF,UF,VF,WF,XF,YF,ZF,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,IG,JG,KG,LG,MG,NG,OG,PG,QG,RG,SG,TG,UG,VG,WG,XG,YG,ZG,AH,BH,CH,DH,EH,FH,GH,HH,IH,JH,KH,LH,MH,NH,OH 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 D N N 
? 3 E N N 
? 3 F N N 
? 3 G N N 
? 3 H N N 
? 3 I N N 
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 L N N 
? 3 M N N 
? 3 N N N 
? 3 O N N 
? 3 P N N 
? 3 Q N N 
? 3 R N N 
? 3 S N N 
? 3 T N N 
? 3 U N N 
? 3 V N N 
? 3 W N N 
? 3 X N N 
? 3 Y N N 
? 3 Z N N 
? 3 AA N N 
? 3 BA N N 
? 3 CA N N 
? 3 DA N N 
? 3 EA N N 
? 3 FA N N 
? 3 GA N N 
? 3 HA N N 
? 3 IA N N 
? 3 JA N N 
? 3 KA N N 
? 3 LA N N 
? 3 MA N N 
? 3 NA N N 
? 3 OA N N 
? 3 PA N N 
? 3 QA N N 
? 3 RA N N 
? 3 SA N N 
? 3 TA N N 
? 3 UA N N 
? 3 VA N N 
? 3 WA N N 
? 3 XA N N 
? 3 YA N N 
? 3 ZA N N 
? 3 AB N N 
? 3 BB N N 
? 3 CB N N 
? 3 DB N N 
? 3 EB N N 
? 3 HB N N 
? 3 IB N N 
? 3 JB N N 
? 3 KB N N 
? 3 LB N N 
? 3 MB N N 
? 3 NB N N 
? 3 OB N N 
? 3 PB N N 
? 3 QB N N 
? 3 RB N N 
? 3 SB N N 
? 3 TB N N 
? 3 UB N N 
? 3 VB N N 
? 3 WB N N 
? 3 XB N N 
? 3 YB N N 
? 3 ZB N N 
? 3 AC N N 
? 3 BC N N 
? 3 CC N N 
? 3 DC N N 
? 3 EC N N 
? 3 FC N N 
? 3 GC N N 
? 3 HC N N 
? 3 IC N N 
? 3 JC N N 
? 3 KC N N 
? 3 LC N N 
? 3 MC N N 
? 3 NC N N 
? 3 OC N N 
? 3 PC N N 
? 3 QC N N 
? 3 RC N N 
? 3 SC N N 
? 3 TC N N 
? 3 UC N N 
? 3 VC N N 
? 3 WC N N 
? 3 XC N N 
? 3 YC N N 
? 3 ZC N N 
? 3 AD N N 
? 3 BD N N 
? 3 CD N N 
? 3 DD N N 
? 3 ED N N 
? 3 FD N N 
? 3 GD N N 
? 3 HD N N 
? 3 ID N N 
? 3 JD N N 
? 3 KD N N 
? 3 LD N N 
? 3 MD N N 
? 3 ND N N 
? 3 OD N N 
? 3 PD N N 
? 3 QD N N 
? 3 RD N N 
? 3 SD N N 
? 3 TD N N 
? 3 UD N N 
? 3 VD N N 
? 3 WD N N 
? 3 XD N N 
? 3 YD N N 
? 3 ZD N N 
? 3 AE N N 
? 3 BE N N 
? 3 CE N N 
? 3 DE N N 
? 3 EE N N 
? 3 FE N N 
? 3 GE N N 
? 3 HE N N 
? 3 IE N N 
? 3 JE N N 
? 3 KE N N 
? 3 LE N N 
? 3 ME N N 
? 3 NE N N 
? 3 OE N N 
? 3 PE N N 
? 3 QE N N 
? 3 RE N N 
? 3 SE N N 
? 3 TE N N 
? 3 UE N N 
? 3 VE N N 
? 3 WE N N 
? 3 XE N N 
? 3 YE N N 
? 3 ZE N N 
? 3 AF N N 
? 3 BF N N 
? 3 CF N N 
? 3 DF N N 
? 3 EF N N 
? 3 FF N N 
? 3 GF N N 
? 3 HF N N 
? 3 IF N N 
? 3 JF N N 
? 3 KF N N 
? 3 LF N N 
? 3 MF N N 
? 3 NF N N 
? 3 OF N N 
? 3 PF N N 
? 3 QF N N 
? 3 RF N N 
? 3 SF N N 
? 3 TF N N 
? 3 UF N N 
? 3 VF N N 
? 3 WF N N 
? 3 XF N N 
? 3 YF N N 
? 3 ZF N N 
? 3 AG N N 
? 3 BG N N 
? 3 CG N N 
? 3 DG N N 
? 3 EG N N 
? 3 FG N N 
? 3 GG N N 
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? 3 IG N N 
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? 3 KG N N 
? 3 LG N N 
? 3 MG N N 
? 3 NG N N 
? 3 OG N N 
? 3 PG N N 
? 3 QG N N 
? 3 RG N N 
? 3 SG N N 
? 3 TG N N 
? 3 UG N N 
? 3 VG N N 
? 3 WG N N 
? 3 XG N N 
? 3 YG N N 
? 3 ZG N N 
? 3 AH N N 
? 3 BH N N 
? 3 CH N N 
? 3 DH N N 
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? 3 FH N N 
? 3 GH N N 
? 3 HH N N 
? 3 IH N N 
? 3 JH N N 
? 3 KH N N 
? 3 LH N N 
? 3 MH N N 
? 3 NH N N 
? 3 OH N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O ASN 54 A ASN 369 1_555 FB NA NA . A NA 655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.367 ? 
metalc ? metalc2 A OG1 THR 55 A THR 370 1_555 FB NA NA . A NA 655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.919 ? 
metalc ? metalc3 A O ASP 101 A ASP 416 1_555 FB NA NA . A NA 655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? 
metalc ? metalc4 A O ARG 149 A ARG 464 1_555 FB NA NA . A NA 655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? 
#
_chem_comp.formula           'C36 H73 N O8 P 1' 
_chem_comp.formula_weight    678.94 
_chem_comp.id                PX4 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
O1 P1 PX4 sing 275 n n 
O1 H1P PX4 sing 276 n n 
O2 P1 PX4 doub 277 n n 
P1 O3 PX4 sing 278 n n 
P1 O4 PX4 sing 279 n n 
O3 C1 PX4 sing 280 n n 
C1 C2 PX4 sing 281 n n 
C1 H1 PX4 sing 282 n n 
C1 H2 PX4 sing 283 n n 
C2 N1 PX4 sing 284 n n 
C2 H3 PX4 sing 285 n n 
C2 H4 PX4 sing 286 n n 
N1 C3 PX4 sing 287 n n 
N1 C4 PX4 sing 288 n n 
N1 C5 PX4 sing 289 n n 
C3 H5 PX4 sing 290 n n 
C3 H6 PX4 sing 291 n n 
C3 H7 PX4 sing 292 n n 
C4 H8 PX4 sing 293 n n 
C4 H9 PX4 sing 294 n n 
C4 H10 PX4 sing 295 n n 
C5 H11 PX4 sing 296 n n 
C5 H12 PX4 sing 297 n n 
C5 H13 PX4 sing 298 n n 
O4 C6 PX4 sing 299 n n 
C6 C7 PX4 sing 300 n n 
C6 H14 PX4 sing 301 n n 
C6 H15 PX4 sing 302 n n 
C7 C8 PX4 sing 303 n n 
C7 O7 PX4 sing 304 n n 
C7 H16 PX4 sing 305 n n 
C8 O5 PX4 sing 306 n n 
C8 H17 PX4 sing 307 n n 
C8 H18 PX4 sing 308 n n 
O5 C9 PX4 sing 309 n n 
C9 O6 PX4 doub 310 n n 
C9 C10 PX4 sing 311 n n 
C10 C11 PX4 sing 312 n n 
C10 H19 PX4 sing 313 n n 
C10 H20 PX4 sing 314 n n 
C11 C12 PX4 sing 315 n n 
C11 H21 PX4 sing 316 n n 
C11 H22 PX4 sing 317 n n 
C12 C13 PX4 sing 318 n n 
C12 H23 PX4 sing 319 n n 
C12 H24 PX4 sing 320 n n 
C13 C14 PX4 sing 321 n n 
C13 H25 PX4 sing 322 n n 
C13 H26 PX4 sing 323 n n 
C14 C15 PX4 sing 324 n n 
C14 H27 PX4 sing 325 n n 
C14 H28 PX4 sing 326 n n 
C15 C16 PX4 sing 327 n n 
C15 H29 PX4 sing 328 n n 
C15 H30 PX4 sing 329 n n 
C16 C17 PX4 sing 330 n n 
C16 H31 PX4 sing 331 n n 
C16 H32 PX4 sing 332 n n 
C17 C18 PX4 sing 333 n n 
C17 H33 PX4 sing 334 n n 
C17 H34 PX4 sing 335 n n 
C18 C19 PX4 sing 336 n n 
C18 H35 PX4 sing 337 n n 
C18 H36 PX4 sing 338 n n 
C19 C20 PX4 sing 339 n n 
C19 H37 PX4 sing 340 n n 
C19 H38 PX4 sing 341 n n 
C20 C21 PX4 sing 342 n n 
C20 H39 PX4 sing 343 n n 
C20 H40 PX4 sing 344 n n 
C21 C22 PX4 sing 345 n n 
C21 H41 PX4 sing 346 n n 
C21 H42 PX4 sing 347 n n 
C22 H43 PX4 sing 348 n n 
C22 H44 PX4 sing 349 n n 
C22 H45 PX4 sing 350 n n 
O7 C23 PX4 sing 351 n n 
C23 O8 PX4 doub 352 n n 
C23 C24 PX4 sing 353 n n 
C24 C25 PX4 sing 354 n n 
C24 H46 PX4 sing 355 n n 
C24 H47 PX4 sing 356 n n 
C25 C26 PX4 sing 357 n n 
C25 H48 PX4 sing 358 n n 
C25 H49 PX4 sing 359 n n 
C26 C27 PX4 sing 360 n n 
C26 H50 PX4 sing 361 n n 
C26 H51 PX4 sing 362 n n 
C27 C28 PX4 sing 363 n n 
C27 H52 PX4 sing 364 n n 
C27 H53 PX4 sing 365 n n 
C28 C29 PX4 sing 366 n n 
C28 H54 PX4 sing 367 n n 
C28 H55 PX4 sing 368 n n 
C29 C30 PX4 sing 369 n n 
C29 H56 PX4 sing 370 n n 
C29 H57 PX4 sing 371 n n 
C30 C31 PX4 sing 372 n n 
C30 H58 PX4 sing 373 n n 
C30 H59 PX4 sing 374 n n 
C31 C32 PX4 sing 375 n n 
C31 H60 PX4 sing 376 n n 
C31 H61 PX4 sing 377 n n 
C32 C33 PX4 sing 378 n n 
C32 H62 PX4 sing 379 n n 
C32 H63 PX4 sing 380 n n 
C33 C34 PX4 sing 381 n n 
C33 H64 PX4 sing 382 n n 
C33 H65 PX4 sing 383 n n 
C34 C35 PX4 sing 384 n n 
C34 H66 PX4 sing 385 n n 
C34 H67 PX4 sing 386 n n 
C35 C36 PX4 sing 387 n n 
C35 H68 PX4 sing 388 n n 
C35 H69 PX4 sing 389 n n 
C36 H70 PX4 sing 390 n n 
C36 H71 PX4 sing 391 n n 
C36 H72 PX4 sing 392 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6CM1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    1 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
D 3 PX4 A 1 601 75 PX4 PX4 . 
E 3 PX4 A 1 602 88 PX4 PX4 . 
F 3 PX4 A 1 603 92 PX4 PX4 . 
G 3 PX4 A 1 604 94 PX4 PX4 . 
H 3 PX4 A 1 605 96 PX4 PX4 . 
I 3 PX4 A 1 606 99 PX4 PX4 . 
J 3 PX4 A 1 607 101 PX4 PX4 . 
K 3 PX4 A 1 608 102 PX4 PX4 . 
L 3 PX4 A 1 609 103 PX4 PX4 . 
M 3 PX4 A 1 610 106 PX4 PX4 . 
N 3 PX4 A 1 611 108 PX4 PX4 . 
O 3 PX4 A 1 612 109 PX4 PX4 . 
P 3 PX4 A 1 613 172 PX4 PX4 . 
Q 3 PX4 A 1 614 173 PX4 PX4 . 
R 3 PX4 A 1 615 174 PX4 PX4 . 
S 3 PX4 A 1 616 175 PX4 PX4 . 
T 3 PX4 A 1 617 176 PX4 PX4 . 
U 3 PX4 A 1 618 178 PX4 PX4 . 
V 3 PX4 A 1 619 179 PX4 PX4 . 
W 3 PX4 A 1 620 181 PX4 PX4 . 
X 3 PX4 A 1 621 182 PX4 PX4 . 
Y 3 PX4 A 1 622 183 PX4 PX4 . 
Z 3 PX4 A 1 623 187 PX4 PX4 . 
AA 3 PX4 A 1 624 188 PX4 PX4 . 
BA 3 PX4 A 1 625 189 PX4 PX4 . 
CA 3 PX4 A 1 626 190 PX4 PX4 . 
DA 3 PX4 A 1 627 191 PX4 PX4 . 
EA 3 PX4 A 1 628 192 PX4 PX4 . 
FA 3 PX4 A 1 629 193 PX4 PX4 . 
GA 3 PX4 A 1 630 194 PX4 PX4 . 
HA 3 PX4 A 1 631 195 PX4 PX4 . 
IA 3 PX4 A 1 632 196 PX4 PX4 . 
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KA 3 PX4 A 1 634 198 PX4 PX4 . 
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PA 3 PX4 A 1 639 203 PX4 PX4 . 
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#
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HETATM 61 H H15 PX4 . . . ZD 3 -27.335 -14.211 -24.354 1 0 ? H15 PX4 371 B 1 
HETATM 62 H H16 PX4 . . . ZD 3 -26.216 -15.436 -22.459 1 0 ? H16 PX4 371 B 1 
HETATM 63 H H17 PX4 . . . ZD 3 -24.033 -13.398 -23.014 1 0 ? H17 PX4 371 B 1 
HETATM 64 H H18 PX4 . . . ZD 3 -23.839 -15.082 -22.907 1 0 ? H18 PX4 371 B 1 
HETATM 65 H H19 PX4 . . . ZD 3 -22.505 -14.794 -18.92 1 0 ? H19 PX4 371 B 1 
HETATM 66 H H20 PX4 . . . ZD 3 -23.325 -13.089 -19.069 1 0 ? H20 PX4 371 B 1 
HETATM 67 H H21 PX4 . . . ZD 3 -21.115 -12.086 -19.238 1 0 ? H21 PX4 371 B 1 
HETATM 68 H H22 PX4 . . . ZD 3 -20.252 -13.626 -19.555 1 0 ? H22 PX4 371 B 1 
HETATM 69 H H23 PX4 . . . ZD 3 -21.852 -13.309 -17.033 1 0 ? H23 PX4 371 B 1 
HETATM 70 H H24 PX4 . . . ZD 3 -20.305 -12.549 -17.034 1 0 ? H24 PX4 371 B 1 
HETATM 71 H H25 PX4 . . . ZD 3 -19.301 -14.86 -17.643 1 0 ? H25 PX4 371 B 1 
HETATM 72 H H26 PX4 . . . ZD 3 -20.958 -15.54 -17.497 1 0 ? H26 PX4 371 B 1 
HETATM 73 H H27 PX4 . . . ZD 3 -20.37 -16.015 -15.354 1 0 ? H27 PX4 371 B 1 
HETATM 74 H H28 PX4 . . . ZD 3 -21.021 -14.345 -15.233 1 0 ? H28 PX4 371 B 1 
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HETATM 79 H H33 PX4 . . . ZD 3 -17.899 -12.812 -12.914 1 0 ? H33 PX4 371 B 1 
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