data_6CNM
#
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_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-19 16:42:14' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          6cnm 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":1005}' 
#
_entry.id    6CNM 
#
_exptl.entry_id    6CNM 
_exptl.method      'ELECTRON MICROSCOPY' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              39.098 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'POTASSIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    5 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6CNM 
_cell.length_a            1 
_cell.length_b            1 
_cell.length_c            1 
_cell.Z_PDB               ? 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6CNM 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        1 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    octameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      8 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    ? 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 I N N 
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 L N N 
? 3 M N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O THR 250 A THR 250 1_555 K K K . A K 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.878 ? 
metalc ? metalc2 A O THR 250 A THR 250 1_555 L K K . A K 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.068 ? 
metalc ? metalc3 A OG1 THR 250 A THR 250 1_555 L K K . A K 1004 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.074 ? 
metalc ? metalc4 A O ILE 251 A ILE 251 1_555 J K K . A K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? 
metalc ? metalc5 A O ILE 251 A ILE 251 1_555 K K K . A K 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.821 ? 
metalc ? metalc6 A O GLY 252 A GLY 252 1_555 I K K . A K 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.934 ? 
metalc ? metalc7 A O GLY 252 A GLY 252 1_555 J K K . A K 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.7 ? 
metalc ? metalc8 A O TYR 253 A TYR 253 1_555 I K K . A K 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? 
metalc ? metalc9 I K K . A K 1001 1_555 B O GLY 252 B GLY 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.934 ? 
metalc ? metalc10 I K K . A K 1001 1_555 B O TYR 253 B TYR 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.628 ? 
metalc ? metalc11 I K K . A K 1001 1_555 C O GLY 252 C GLY 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.934 ? 
metalc ? metalc12 I K K . A K 1001 1_555 C O TYR 253 C TYR 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.628 ? 
metalc ? metalc13 I K K . A K 1001 1_555 D O GLY 252 D GLY 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.931 ? 
metalc ? metalc14 I K K . A K 1001 1_555 D O TYR 253 D TYR 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? 
metalc ? metalc15 J K K . A K 1002 1_555 B O ILE 251 B ILE 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? 
metalc ? metalc16 J K K . A K 1002 1_555 B O GLY 252 B GLY 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? 
metalc ? metalc17 J K K . A K 1002 1_555 C O ILE 251 C ILE 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? 
metalc ? metalc18 J K K . A K 1002 1_555 C O GLY 252 C GLY 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.7 ? 
metalc ? metalc19 J K K . A K 1002 1_555 D O ILE 251 D ILE 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.731 ? 
metalc ? metalc20 J K K . A K 1002 1_555 D O GLY 252 D GLY 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.702 ? 
metalc ? metalc21 K K K . A K 1003 1_555 B O THR 250 B THR 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.877 ? 
metalc ? metalc22 K K K . A K 1003 1_555 B O ILE 251 B ILE 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? 
metalc ? metalc23 K K K . A K 1003 1_555 C O THR 250 C THR 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.879 ? 
metalc ? metalc24 K K K . A K 1003 1_555 C O ILE 251 C ILE 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.821 ? 
metalc ? metalc25 K K K . A K 1003 1_555 D O THR 250 D THR 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.88 ? 
metalc ? metalc26 K K K . A K 1003 1_555 D O ILE 251 D ILE 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.817 ? 
metalc ? metalc27 L K K . A K 1004 1_555 B O THR 250 B THR 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.069 ? 
metalc ? metalc28 L K K . A K 1004 1_555 B OG1 THR 250 B THR 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.073 ? 
metalc ? metalc29 L K K . A K 1004 1_555 C O THR 250 C THR 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.068 ? 
metalc ? metalc30 L K K . A K 1004 1_555 C OG1 THR 250 C THR 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.075 ? 
metalc ? metalc31 L K K . A K 1004 1_555 D O THR 250 D THR 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.067 ? 
metalc ? metalc32 L K K . A K 1004 1_555 D OG1 THR 250 D THR 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.076 ? 
#
_chem_comp.formula           'K 1' 
_chem_comp.formula_weight    39.098 
_chem_comp.id                K 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'POTASSIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     6CNM 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    1 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
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_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 3 K A 1 1001 1001 K K . 
J 3 K A 1 1002 1002 K K . 
K 3 K A 1 1003 1003 K K . 
L 3 K A 1 1004 1004 K K . 
M 3 K A 1 1005 1005 K K . 
N 4 POV A 1 1101 1101 POV POV . 
O 5 LMT A 1 1103 1103 LMT LMT . 
P 5 LMT A 1 1104 1104 LMT LMT . 
Q 4 POV B 1 1101 1101 POV POV . 
R 5 LMT B 1 1103 1103 LMT LMT . 
S 5 LMT B 1 1104 1104 LMT LMT . 
T 4 POV C 1 1101 1101 POV POV . 
U 5 LMT C 1 1103 1103 LMT LMT . 
V 5 LMT C 1 1104 1104 LMT LMT . 
W 4 POV D 1 1101 1101 POV POV . 
X 5 LMT D 1 1103 1103 LMT LMT . 
Y 5 LMT D 1 1104 1104 LMT LMT . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           K 
_atom_site.label_atom_id         K 
_atom_site.label_comp_id         K 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         M 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               154.5 
_atom_site.Cartn_y               154.5 
_atom_site.Cartn_z               177.84 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        92.6 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          K 
_atom_site.auth_comp_id          K 
_atom_site.auth_seq_id           1005 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              11 
_model_server_stats.parse_time_ms           9 
_model_server_stats.create_model_time_ms    21 
_model_server_stats.query_time_ms           320 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           1 
#