data_6CQ6
#
_model_server_result.job_id            xNyCWm0JT0P1mvuLC5fvww 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-26 13:09:07' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6cq6 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":408}' 
#
_entry.id    6CQ6 
#
_exptl.entry_id    6CQ6 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              142.282 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            DECANE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6CQ6 
_cell.length_a            66.718 
_cell.length_b            120.417 
_cell.length_c            126.44 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6CQ6 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 I N N 
? 4 J N N 
? 4 K N N 
? 4 L N N 
? 4 M N N 
? 4 Q N N 
? 4 R N N 
? 4 S N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 74 A CYS 93 1_555 B SG CYS 74 B CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
metalc ? metalc1 A O THR 123 A THR 142 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.606 ? 
metalc ? metalc2 A O THR 123 A THR 142 1_555 N K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.49 ? 
metalc ? metalc3 A OG1 THR 123 A THR 142 1_555 N K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.143 ? 
metalc ? metalc4 A O ILE 124 A ILE 143 1_555 F K K . A K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.743 ? 
metalc ? metalc5 A O ILE 124 A ILE 143 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? 
metalc ? metalc6 A O GLY 125 A GLY 144 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? 
metalc ? metalc7 A O GLY 125 A GLY 144 1_555 F K K . A K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? 
metalc ? metalc8 A O PHE 126 A PHE 145 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.698 ? 
metalc ? metalc9 A O THR 232 A THR 251 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? 
metalc ? metalc10 A O THR 232 A THR 251 1_555 N K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? 
metalc ? metalc11 A OG1 THR 232 A THR 251 1_555 N K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? 
metalc ? metalc12 A O ILE 233 A ILE 252 1_555 F K K . A K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.658 ? 
metalc ? metalc13 A O ILE 233 A ILE 252 1_555 G K K . A K 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.781 ? 
metalc ? metalc14 A O GLY 234 A GLY 253 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.81 ? 
metalc ? metalc15 A O GLY 234 A GLY 253 1_555 F K K . A K 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.675 ? 
metalc ? metalc16 A O PHE 235 A PHE 254 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.721 ? 
metalc ? metalc17 A OE1 GLU 290 A GLU 309 1_555 O CD CD . B CD 402 2_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? 
metalc ? metalc18 A NE2 HIS 294 A HIS 313 1_555 O CD CD . B CD 402 2_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.656 ? 
metalc ? metalc19 E K K . A K 403 1_555 B O GLY 125 B GLY 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.02 ? 
metalc ? metalc20 E K K . A K 403 1_555 B O PHE 126 B PHE 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.212 ? 
metalc ? metalc21 E K K . A K 403 1_555 B O GLY 234 B GLY 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.014 ? 
metalc ? metalc22 E K K . A K 403 1_555 B O PHE 235 B PHE 254 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.682 ? 
metalc ? metalc23 F K K . A K 404 1_555 B O ILE 124 B ILE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? 
metalc ? metalc24 F K K . A K 404 1_555 B O GLY 125 B GLY 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.622 ? 
metalc ? metalc25 F K K . A K 404 1_555 B O ILE 233 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? 
metalc ? metalc26 F K K . A K 404 1_555 B O GLY 234 B GLY 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? 
metalc ? metalc27 G K K . A K 405 1_555 B O THR 123 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc28 G K K . A K 405 1_555 B O ILE 124 B ILE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.765 ? 
metalc ? metalc29 G K K . A K 405 1_555 B O THR 232 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? 
metalc ? metalc30 G K K . A K 405 1_555 B O ILE 233 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.777 ? 
metalc ? metalc31 B O THR 123 B THR 142 1_555 N K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.27 ? 
metalc ? metalc32 B OG1 THR 123 B THR 142 1_555 N K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.959 ? 
metalc ? metalc33 B O THR 232 B THR 251 1_555 N K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.944 ? 
metalc ? metalc34 B OG1 THR 232 B THR 251 1_555 N K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? 
metalc ? metalc35 B OE1 GLU 290 B GLU 309 1_555 O CD CD . B CD 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.612 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H22' 
_chem_comp.formula_weight    142.282 
_chem_comp.id                D10 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              DECANE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 D10 sing 83 n n 
C1 H11 D10 sing 84 n n 
C1 H12 D10 sing 85 n n 
C1 H13 D10 sing 86 n n 
C2 C3 D10 sing 87 n n 
C2 H21 D10 sing 88 n n 
C2 H22 D10 sing 89 n n 
C3 C4 D10 sing 90 n n 
C3 H31 D10 sing 91 n n 
C3 H32 D10 sing 92 n n 
C4 C5 D10 sing 93 n n 
C4 H41 D10 sing 94 n n 
C4 H42 D10 sing 95 n n 
C5 C6 D10 sing 96 n n 
C5 H51 D10 sing 97 n n 
C5 H52 D10 sing 98 n n 
C6 C7 D10 sing 99 n n 
C6 H61 D10 sing 100 n n 
C6 H62 D10 sing 101 n n 
C7 C8 D10 sing 102 n n 
C7 H71 D10 sing 103 n n 
C7 H72 D10 sing 104 n n 
C8 C9 D10 sing 105 n n 
C8 H81 D10 sing 106 n n 
C8 H82 D10 sing 107 n n 
C9 C10 D10 sing 108 n n 
C9 H91 D10 sing 109 n n 
C9 H92 D10 sing 110 n n 
C10 H101 D10 sing 111 n n 
C10 H102 D10 sing 112 n n 
C10 H103 D10 sing 113 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6CQ6 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.014988 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008304 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007909 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 CD A 1 401 401 CD CD . 
D 3 K A 1 402 402 K K . 
E 3 K A 1 403 403 K K . 
F 3 K A 1 404 404 K K . 
G 3 K A 1 405 405 K K . 
H 3 K A 1 406 406 K K . 
I 4 D10 A 1 407 407 D10 R16 . 
J 4 D10 A 1 408 408 D10 R16 . 
K 4 D10 A 1 409 409 D10 R16 . 
L 4 D10 A 1 410 410 D10 R16 . 
M 4 D10 A 1 411 411 D10 R16 . 
N 3 K B 1 401 412 K K . 
O 2 CD B 1 402 401 CD CD . 
P 2 CD B 1 403 402 CD CD . 
Q 4 D10 B 1 404 403 D10 R16 . 
R 4 D10 B 1 405 404 D10 R16 . 
S 4 D10 B 1 406 405 D10 R16 . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 D10 . . . J 4 -11.29 -6.108 -23.009 1 152.93 ? C1 D10 408 A 1 
HETATM 2 C C2 D10 . . . J 4 -10.712 -4.702 -23.151 1 155.33 ? C2 D10 408 A 1 
HETATM 3 C C3 D10 . . . J 4 -10.971 -4.186 -24.566 1 157.68 ? C3 D10 408 A 1 
HETATM 4 C C4 D10 . . . J 4 -10.238 -2.862 -24.773 1 146.81 ? C4 D10 408 A 1 
HETATM 5 C C5 D10 . . . J 4 -11.02 -1.731 -24.108 1 152.13 ? C5 D10 408 A 1 
HETATM 6 H H12 D10 . . . J 4 -11.12 -6.438 -22.113 1 183.52 ? H12 D10 408 A 1 
HETATM 7 H H13 D10 . . . J 4 -10.87 -6.697 -23.655 1 183.52 ? H13 D10 408 A 1 
HETATM 8 H H21 D10 . . . J 4 -11.136 -4.111 -22.509 1 186.39 ? H21 D10 408 A 1 
HETATM 9 H H22 D10 . . . J 4 -9.756 -4.726 -22.986 1 186.39 ? H22 D10 408 A 1 
HETATM 10 H H31 D10 . . . J 4 -10.651 -4.836 -25.21 1 189.21 ? H31 D10 408 A 1 
HETATM 11 H H32 D10 . . . J 4 -11.924 -4.05 -24.69 1 189.21 ? H32 D10 408 A 1 
HETATM 12 H H41 D10 . . . J 4 -9.354 -2.918 -24.379 1 176.17 ? H41 D10 408 A 1 
HETATM 13 H H42 D10 . . . J 4 -10.157 -2.683 -25.723 1 176.17 ? H42 D10 408 A 1 
HETATM 14 H H52 D10 . . . J 4 -11.904 -1.674 -24.502 1 182.56 ? H52 D10 408 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              10 
_model_server_stats.parse_time_ms           13 
_model_server_stats.create_model_time_ms    12 
_model_server_stats.query_time_ms           271 
_model_server_stats.encode_time_ms          8 
_model_server_stats.element_count           14 
#