data_6CQ8 # _model_server_result.job_id 4CTvtAPSiTH3QMOt9CUW-g _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 04:39:26' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6cq8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"V","auth_seq_id":410}' # _entry.id 6CQ8 # _exptl.entry_id 6CQ8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 373.254 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description N-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-[(methylsulfonyl)amino]benzamide _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6CQ8 _cell.length_a 67.074 _cell.length_b 119.386 _cell.length_c 128.179 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6CQ8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 H N N ? 4 V N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 74 A CYS 93 1_555 B SG CYS 74 B CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? metalc ? metalc1 A O THR 123 A THR 142 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? metalc ? metalc2 A O THR 123 A THR 142 1_555 N K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.272 ? metalc ? metalc3 A OG1 THR 123 A THR 142 1_555 N K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.458 ? metalc ? metalc4 A O ILE 124 A ILE 143 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.791 ? metalc ? metalc5 A O ILE 124 A ILE 143 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.812 ? metalc ? metalc6 A O GLY 125 A GLY 144 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.202 ? metalc ? metalc7 A O GLY 125 A GLY 144 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.733 ? metalc ? metalc8 A O PHE 126 A PHE 145 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.609 ? metalc ? metalc9 A O THR 232 A THR 251 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? metalc ? metalc10 A O THR 232 A THR 251 1_555 N K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.01 ? metalc ? metalc11 A OG1 THR 232 A THR 251 1_555 N K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.969 ? metalc ? metalc12 A O ILE 233 A ILE 252 1_555 E K K . A K 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc13 A O ILE 233 A ILE 252 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.946 ? metalc ? metalc14 A O GLY 234 A GLY 253 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.989 ? metalc ? metalc15 A O GLY 234 A GLY 253 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.958 ? metalc ? metalc16 A O PHE 235 A PHE 254 1_555 D K K . A K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.646 ? metalc ? metalc17 D K K . A K 402 1_555 B O GLY 125 B GLY 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.046 ? metalc ? metalc18 D K K . A K 402 1_555 B O PHE 126 B PHE 145 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.831 ? metalc ? metalc19 D K K . A K 402 1_555 B O GLY 234 B GLY 253 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.334 ? metalc ? metalc20 D K K . A K 402 1_555 B O PHE 235 B PHE 254 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.806 ? metalc ? metalc21 E K K . A K 403 1_555 B O THR 123 B THR 142 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? metalc ? metalc22 E K K . A K 403 1_555 B O ILE 124 B ILE 143 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.869 ? metalc ? metalc23 E K K . A K 403 1_555 B O THR 232 B THR 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? metalc ? metalc24 E K K . A K 403 1_555 B O ILE 233 B ILE 252 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? metalc ? metalc25 B O THR 123 B THR 142 1_555 N K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.742 ? metalc ? metalc26 B OG1 THR 123 B THR 142 1_555 N K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.916 ? metalc ? metalc27 B O ILE 124 B ILE 143 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.696 ? metalc ? metalc28 B O GLY 125 B GLY 144 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.718 ? metalc ? metalc29 B O THR 232 B THR 251 1_555 N K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.81 ? metalc ? metalc30 B OG1 THR 232 B THR 251 1_555 N K K . B K 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.083 ? metalc ? metalc31 B O ILE 233 B ILE 252 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc32 B O GLY 234 B GLY 253 1_555 M K K . B K 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? # _chem_comp.formula 'C15 H14 Cl2 N2 O3 S' _chem_comp.formula_weight 373.254 _chem_comp.id Q6F _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name N-[(2,4-dichlorophenyl)methyl]-4-[(methylsulfonyl)amino]benzamide _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag O06 S03 Q6F doub 379 n n O05 S03 Q6F doub 380 n n C15 C17 Q6F doub 381 n y C15 C10 Q6F sing 382 n y C17 C11 Q6F sing 383 n y S03 C20 Q6F sing 384 n n S03 N08 Q6F sing 385 n n C22 C19 Q6F doub 386 n y C22 C23 Q6F sing 387 n y O04 C13 Q6F doub 388 n n CL2 C23 Q6F sing 389 n n C19 C12 Q6F sing 390 n y C23 C21 Q6F doub 391 n y C13 C10 Q6F sing 392 n n C13 N07 Q6F sing 393 n n C10 C14 Q6F doub 394 n y C11 N08 Q6F sing 395 n n C11 C16 Q6F doub 396 n y C12 C09 Q6F sing 397 n n C12 C18 Q6F doub 398 n y C21 C18 Q6F sing 399 n y C14 C16 Q6F sing 400 n y N07 C09 Q6F sing 401 n n C18 CL1 Q6F sing 402 n n C15 H1 Q6F sing 403 n n C17 H2 Q6F sing 404 n n C20 H3 Q6F sing 405 n n C20 H4 Q6F sing 406 n n C20 H5 Q6F sing 407 n n C21 H6 Q6F sing 408 n n C22 H7 Q6F sing 409 n n C09 H8 Q6F sing 410 n n C09 H9 Q6F sing 411 n n C14 H10 Q6F sing 412 n n C16 H11 Q6F sing 413 n n C19 H12 Q6F sing 414 n n N07 H13 Q6F sing 415 n n N08 H14 Q6F sing 416 n n # _atom_sites.entry_id 6CQ8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014909 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008376 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007802 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 K A 1 401 401 K K . D 2 K A 1 402 402 K K . E 2 K A 1 403 403 K K . F 3 R16 A 1 404 404 R16 R16 . G 3 R16 A 1 405 405 R16 R16 . H 4 Q6F A 1 406 406 Q6F Q6F . I 5 16C A 1 407 407 16C 16C . J 3 R16 A 1 408 408 R16 R16 . K 3 R16 A 1 409 409 R16 R16 . L 3 R16 A 1 410 410 R16 R16 . M 2 K B 1 401 411 K K . N 2 K B 1 402 412 K K . O 2 K B 1 403 401 K K . P 6 CD B 1 404 402 CD CD . Q 6 CD B 1 405 403 CD CD . R 6 CD B 1 406 404 CD CD . S 3 R16 B 1 407 405 R16 R16 . T 3 R16 B 1 408 406 R16 R16 . U 3 R16 B 1 409 407 R16 R16 . V 4 Q6F B 1 410 408 Q6F Q6F . W 3 R16 B 1 411 409 R16 R16 . X 3 R16 B 1 412 410 R16 R16 . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C10 Q6F . . . V 4 10.015 -37.534 -22.603 1 82.87 ? C10 Q6F 410 B 1 HETATM 2 C C13 Q6F . . . V 4 11.158 -36.604 -23.101 1 80.04 ? C13 Q6F 410 B 1 HETATM 3 C C15 Q6F . . . V 4 8.77 -37.649 -23.239 1 81.69 ? C15 Q6F 410 B 1 HETATM 4 C C17 Q6F . . . V 4 7.755 -38.479 -22.761 1 90.13 ? C17 Q6F 410 B 1 HETATM 5 C C20 Q6F . . . V 4 4.402 -40.154 -22.403 1 99.41 ? C20 Q6F 410 B 1 HETATM 6 C C21 Q6F . . . V 4 10.27 -31.903 -25.323 1 65.9 ? C21 Q6F 410 B 1 HETATM 7 C C22 Q6F . . . V 4 11.901 -31.77 -23.539 1 57.19 ? C22 Q6F 410 B 1 HETATM 8 C C09 Q6F . . . V 4 12.162 -35.309 -25.109 1 59.48 ? C09 Q6F 410 B 1 HETATM 9 C C11 Q6F . . . V 4 7.896 -39.257 -21.595 1 103.31 ? C11 Q6F 410 B 1 HETATM 10 C C12 Q6F . . . V 4 11.753 -33.853 -24.852 1 65.44 ? C12 Q6F 410 B 1 HETATM 11 C C14 Q6F . . . V 4 10.147 -38.294 -21.434 1 89.82 ? C14 Q6F 410 B 1 HETATM 12 C C16 Q6F . . . V 4 9.139 -39.124 -20.948 1 90.14 ? C16 Q6F 410 B 1 HETATM 13 C C18 Q6F . . . V 4 10.711 -33.222 -25.567 1 82.62 ? C18 Q6F 410 B 1 HETATM 14 C C19 Q6F . . . V 4 12.307 -33.076 -23.813 1 59.07 ? C19 Q6F 410 B 1 HETATM 15 C C23 Q6F . . . V 4 10.895 -31.191 -24.292 1 61.04 ? C23 Q6F 410 B 1 HETATM 16 N N07 Q6F . . . V 4 11.182 -36.245 -24.507 1 68.93 ? N07 Q6F 410 B 1 HETATM 17 N N08 Q6F . . . V 4 6.841 -40.132 -21.089 1 117.08 ? N08 Q6F 410 B 1 HETATM 18 O O04 Q6F . . . V 4 12.063 -36.163 -22.287 1 81.22 ? O04 Q6F 410 B 1 HETATM 19 O O05 Q6F . . . V 4 4.631 -40.426 -19.853 1 112.98 ? O05 Q6F 410 B 1 HETATM 20 O O06 Q6F . . . V 4 5.115 -38.301 -20.776 1 99.41 ? O06 Q6F 410 B 1 HETATM 21 S S03 Q6F . . . V 4 5.207 -39.702 -20.917 1 83.61 ? S03 Q6F 410 B 1 HETATM 22 CL CL1 Q6F . . . V 4 9.922 -34.121 -26.884 1 65.94 ? CL1 Q6F 410 B 1 HETATM 23 CL CL2 Q6F . . . V 4 10.396 -29.535 -23.947 1 70.63 ? CL2 Q6F 410 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 12 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 295 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 23 #