data_6E7D # _model_server_result.job_id H9PUSBxN8uxJTbYiTn75_A _model_server_result.datetime_utc '2024-10-18 12:26:31' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6e7d # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"IA","auth_seq_id":301}' # _entry.id 6E7D # _exptl.entry_id 6E7D _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 96.063 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SULFATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 9 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 73.12 _cell.angle_beta 82.08 _cell.angle_gamma 84.46 _cell.entry_id 6E7D _cell.length_a 66.93 _cell.length_b 122.069 _cell.length_c 131.561 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6E7D _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dodecameric 12 software_defined_assembly 1 PISA dodecameric 12 software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,D,E,F,I,J,O,P,Q,S,U,X,Y,Z,AA,DA,EA,HA,IA,NA,OA,QA,UA 1 1 B,C,G,H,K,L,M,N,R,T,V,W,BA,CA,FA,GA,JA,KA,LA,MA,PA,RA,SA,TA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 Y N N ? 3 AA N N ? 3 CA N N ? 3 EA N N ? 3 GA N N ? 3 IA N N ? 3 KA N N ? 3 MA N N ? 3 OA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 8 A CYS 80 1_555 A SG CYS 19 A CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 36 A CYS 108 1_555 A SG CYS 118 A CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 8 B CYS 80 1_555 B SG CYS 19 B CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 36 B CYS 108 1_555 B SG CYS 118 B CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 8 C CYS 80 1_555 C SG CYS 19 C CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf6 C SG CYS 36 C CYS 108 1_555 C SG CYS 118 C CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf7 D SG CYS 8 D CYS 80 1_555 D SG CYS 19 D CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? disulf ? disulf8 D SG CYS 36 D CYS 108 1_555 D SG CYS 118 D CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf9 E SG CYS 8 E CYS 80 1_555 E SG CYS 19 E CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf10 E SG CYS 36 E CYS 108 1_555 E SG CYS 118 E CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf11 F SG CYS 8 F CYS 80 1_555 F SG CYS 19 F CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.074 ? disulf ? disulf12 F SG CYS 36 F CYS 108 1_555 F SG CYS 118 F CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf13 G SG CYS 8 G CYS 80 1_555 G SG CYS 19 G CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf14 G SG CYS 36 G CYS 108 1_555 G SG CYS 118 G CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf15 H SG CYS 8 H CYS 80 1_555 H SG CYS 19 H CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? disulf ? disulf16 H SG CYS 36 H CYS 108 1_555 H SG CYS 118 H CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? disulf ? disulf17 I SG CYS 8 I CYS 80 1_555 I SG CYS 19 I CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf18 I SG CYS 36 I CYS 108 1_555 I SG CYS 118 I CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf19 J SG CYS 8 J CYS 80 1_555 J SG CYS 19 J CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf20 J SG CYS 36 J CYS 108 1_555 J SG CYS 118 J CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf21 K SG CYS 8 K CYS 80 1_555 K SG CYS 19 K CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? disulf ? disulf22 K SG CYS 36 K CYS 108 1_555 K SG CYS 118 K CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf23 L SG CYS 8 L CYS 80 1_555 L SG CYS 19 L CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf24 L SG CYS 36 L CYS 108 1_555 L SG CYS 118 L CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf25 M SG CYS 8 M CYS 80 1_555 M SG CYS 19 M CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf26 M SG CYS 36 M CYS 108 1_555 M SG CYS 118 M CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf27 N SG CYS 8 N CYS 80 1_555 N SG CYS 19 N CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf28 N SG CYS 36 N CYS 108 1_555 N SG CYS 118 N CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? disulf ? disulf29 O SG CYS 8 O CYS 80 1_555 O SG CYS 19 O CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf30 O SG CYS 36 O CYS 108 1_555 O SG CYS 118 O CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf31 P SG CYS 8 P CYS 80 1_555 P SG CYS 19 P CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? disulf ? disulf32 P SG CYS 36 P CYS 108 1_555 P SG CYS 118 P CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? disulf ? disulf33 Q SG CYS 8 Q CYS 94 1_555 Q SG CYS 19 Q CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf34 Q SG CYS 36 Q CYS 122 1_555 Q SG CYS 124 Q CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? disulf ? disulf35 Q SG CYS 103 Q CYS 189 1_555 Q SG CYS 116 Q CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf36 R SG CYS 36 R CYS 122 1_555 R SG CYS 124 R CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? disulf ? disulf37 R SG CYS 103 R CYS 189 1_555 R SG CYS 116 R CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf38 S SG CYS 8 S CYS 94 1_555 S SG CYS 19 S CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf39 S SG CYS 36 S CYS 122 1_555 S SG CYS 124 S CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? disulf ? disulf40 S SG CYS 103 S CYS 189 1_555 S SG CYS 116 S CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf41 T SG CYS 8 T CYS 94 1_555 T SG CYS 19 T CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf42 T SG CYS 36 T CYS 122 1_555 T SG CYS 124 T CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? disulf ? disulf43 T SG CYS 103 T CYS 189 1_555 T SG CYS 116 T CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf44 U SG CYS 8 U CYS 94 1_555 U SG CYS 19 U CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf45 U SG CYS 36 U CYS 122 1_555 U SG CYS 124 U CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? disulf ? disulf46 U SG CYS 103 U CYS 189 1_555 U SG CYS 116 U CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf47 V SG CYS 8 V CYS 94 1_555 V SG CYS 19 V CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf48 V SG CYS 36 V CYS 122 1_555 V SG CYS 124 V CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? disulf ? disulf49 V SG CYS 103 V CYS 189 1_555 V SG CYS 116 V CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? disulf ? disulf50 W SG CYS 8 W CYS 94 1_555 W SG CYS 19 W CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf51 W SG CYS 36 W CYS 122 1_555 W SG CYS 124 W CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf52 W SG CYS 103 W CYS 189 1_555 W SG CYS 116 W CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf53 X SG CYS 8 X CYS 94 1_555 X SG CYS 19 X CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf54 X SG CYS 36 X CYS 122 1_555 X SG CYS 124 X CYS 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf55 X SG CYS 103 X CYS 189 1_555 X SG CYS 116 X CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? covale ? covale1 Q ND2 ASN 83 Q ASN 169 1_555 Z C1 NAG . Q NAG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.43 ? covale ? covale2 R ND2 ASN 83 R ASN 169 1_555 BA C1 NAG . R NAG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? covale ? covale3 S ND2 ASN 83 S ASN 169 1_555 DA C1 NAG . S NAG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale4 T ND2 ASN 83 T ASN 169 1_555 FA C1 NAG . T NAG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale5 U ND2 ASN 83 U ASN 169 1_555 HA C1 NAG . U NAG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? covale ? covale6 V ND2 ASN 83 V ASN 169 1_555 JA C1 NAG . V NAG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale7 W ND2 ASN 83 W ASN 169 1_555 LA C1 NAG . W NAG 300 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? covale ? covale8 X ND2 ASN 83 X ASN 169 1_555 NA C1 NAG . X NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? # _chem_comp.formula 'O4 S -2' _chem_comp.formula_weight 96.063 _chem_comp.id SO4 _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SULFATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag S O1 SO4 doub 320 n n S O2 SO4 doub 321 n n S O3 SO4 sing 322 n n S O4 SO4 sing 323 n n # _atom_sites.entry_id 6E7D _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014941 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] -0.001449 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] -0.001741 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008231 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] -0.00241 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007997 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code Y 3 SO4 D 1 201 1 SO4 SO4 . Z 4 NAG Q 1 300 300 NAG NAG . AA 3 SO4 Q 1 301 301 SO4 SO4 . BA 4 NAG R 1 300 300 NAG NAG . CA 3 SO4 R 1 301 301 SO4 SO4 . DA 4 NAG S 1 300 300 NAG NAG . EA 3 SO4 S 1 301 301 SO4 SO4 . FA 4 NAG T 1 300 300 NAG NAG . GA 3 SO4 T 1 301 301 SO4 SO4 . HA 4 NAG U 1 300 300 NAG NAG . IA 3 SO4 U 1 301 301 SO4 SO4 . JA 4 NAG V 1 300 300 NAG NAG . KA 3 SO4 V 1 301 301 SO4 SO4 . LA 4 NAG W 1 300 300 NAG NAG . MA 3 SO4 W 1 301 301 SO4 SO4 . NA 4 NAG X 1 301 300 NAG NAG . OA 3 SO4 X 1 302 2 SO4 SO4 . PA 5 HOH C 1 201 1 HOH HOH . PA 5 HOH C 2 202 2 HOH HOH . QA 5 HOH F 1 201 3 HOH HOH . RA 5 HOH H 1 201 4 HOH HOH . SA 5 HOH K 1 201 5 HOH HOH . SA 5 HOH K 2 202 6 HOH HOH . TA 5 HOH M 1 201 7 HOH HOH . UA 5 HOH O 1 201 8 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 S S SO4 . . . IA 3 -10.122 -51.056 47.192 1 80.66 ? S SO4 301 U 1 HETATM 2 O O1 SO4 . . . IA 3 -10.98 -52.2 47.521 1 85.48 ? O1 SO4 301 U 1 HETATM 3 O O2 SO4 . . . IA 3 -10.093 -50.93 45.73 1 84.11 ? O2 SO4 301 U 1 HETATM 4 O O3 SO4 . . . IA 3 -10.715 -49.854 47.768 1 77.73 ? O3 SO4 301 U 1 HETATM 5 O O4 SO4 . . . IA 3 -8.752 -51.254 47.716 1 78.06 ? O4 SO4 301 U 1 # _model_server_stats.io_time_ms 45 _model_server_stats.parse_time_ms 27 _model_server_stats.create_model_time_ms 30 _model_server_stats.query_time_ms 331 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 5 #