data_6FA2 # _model_server_result.job_id LqirCjeOl4uGc27F09k38Q _model_server_result.datetime_utc '2024-11-24 14:57:38' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6fa2 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":201}' # _entry.id 6FA2 # _exptl.entry_id 6FA2 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6FA2 _cell.length_a 63.23 _cell.length_b 117.215 _cell.length_c 156.446 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6FA2 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 ? monomeric 1 author_defined_assembly 4 ? monomeric 1 author_defined_assembly 5 ? monomeric 1 author_defined_assembly 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,G,H,I,Y 1 1 B,J,K,L,Z 2 1 C,M,N,O,AA 3 1 D,P,Q,R,BA 4 1 E,S,T,U,CA 5 1 F,V,W,X,DA 6 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 G N N ? 4 J N N ? 4 M N N ? 4 P N N ? 4 S N N ? 4 V N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OG SER 17 A SER 17 1_555 G MG MG . A MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.091 ? metalc ? metalc2 A OG1 THR 35 A THR 35 1_555 G MG MG . A MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? metalc ? metalc3 G MG MG . A MG 201 1_555 H O2B GNP . A GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? metalc ? metalc4 G MG MG . A MG 201 1_555 H O2G GNP . A GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.938 ? metalc ? metalc5 G MG MG . A MG 201 1_555 Y O HOH . A HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? metalc ? metalc6 G MG MG . A MG 201 1_555 Y O HOH . A HOH 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? metalc ? metalc7 B OG SER 20 B SER 17 1_555 J MG MG . B MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? metalc ? metalc8 B OG1 THR 38 B THR 35 1_555 J MG MG . B MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? metalc ? metalc9 J MG MG . B MG 201 1_555 K O2G GNP . B GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.926 ? metalc ? metalc10 J MG MG . B MG 201 1_555 K O2B GNP . B GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? metalc ? metalc11 J MG MG . B MG 201 1_555 Z O HOH . B HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? metalc ? metalc12 J MG MG . B MG 201 1_555 Z O HOH . B HOH 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.982 ? metalc ? metalc13 C OG SER 21 C SER 17 1_555 M MG MG . C MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc14 C OG1 THR 39 C THR 35 1_555 M MG MG . C MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc15 M MG MG . C MG 201 1_555 N O1G GNP . C GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? metalc ? metalc16 M MG MG . C MG 201 1_555 N O1B GNP . C GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? metalc ? metalc17 D OG SER 20 D SER 17 1_555 P MG MG . D MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? metalc ? metalc18 P MG MG . D MG 201 1_555 Q O2G GNP . D GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? metalc ? metalc19 P MG MG . D MG 201 1_555 Q O2B GNP . D GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.844 ? metalc ? metalc20 E OG SER 20 E SER 17 1_555 S MG MG . E MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.542 ? metalc ? metalc21 E OG1 THR 38 E THR 35 1_555 S MG MG . E MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? metalc ? metalc22 S MG MG . E MG 201 1_555 T O1G GNP . E GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.448 ? metalc ? metalc23 S MG MG . E MG 201 1_555 T O1B GNP . E GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.446 ? metalc ? metalc24 F OG SER 20 F SER 17 1_555 V MG MG . F MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc25 V MG MG . F MG 201 1_555 W O1B GNP . F GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.738 ? metalc ? metalc26 V MG MG . F MG 201 1_555 W O1G GNP . F GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6FA2 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.015815 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008531 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006392 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 4 MG A 1 201 202 MG MG . H 5 GNP A 1 202 201 GNP GNP . I 6 D2W A 1 203 205 D2W Ab5 . J 4 MG B 1 201 202 MG MG . K 5 GNP B 1 202 201 GNP GNP . L 6 D2W B 1 203 205 D2W Ab5 . M 4 MG C 1 201 202 MG MG . N 5 GNP C 1 202 201 GNP GNP . O 6 D2W C 1 203 205 D2W Ab5 . P 4 MG D 1 201 202 MG MG . Q 5 GNP D 1 202 201 GNP GNP . R 6 D2W D 1 203 205 D2W Ab5 . S 4 MG E 1 201 202 MG MG . T 5 GNP E 1 202 201 GNP GNP . U 6 D2W E 1 203 1 D2W Ab5 . V 4 MG F 1 201 202 MG MG . W 5 GNP F 1 202 201 GNP GNP . X 6 D2W F 1 203 205 D2W Ab5 . Y 7 HOH A 1 301 20 HOH HOH . Y 7 HOH A 2 302 4 HOH HOH . Y 7 HOH A 3 303 17 HOH HOH . Y 7 HOH A 4 304 7 HOH HOH . Y 7 HOH A 5 305 24 HOH HOH . Y 7 HOH A 6 306 27 HOH HOH . Y 7 HOH A 7 307 26 HOH HOH . Y 7 HOH A 8 308 25 HOH HOH . Y 7 HOH A 9 309 13 HOH HOH . Y 7 HOH A 10 310 2 HOH HOH . Y 7 HOH A 11 311 8 HOH HOH . Z 7 HOH B 1 301 9 HOH HOH . Z 7 HOH B 2 302 12 HOH HOH . Z 7 HOH B 3 303 19 HOH HOH . Z 7 HOH B 4 304 1 HOH HOH . AA 7 HOH C 1 301 14 HOH HOH . AA 7 HOH C 2 302 23 HOH HOH . BA 7 HOH D 1 301 15 HOH HOH . BA 7 HOH D 2 302 10 HOH HOH . CA 7 HOH E 1 301 22 HOH HOH . CA 7 HOH E 2 302 18 HOH HOH . CA 7 HOH E 3 303 28 HOH HOH . CA 7 HOH E 4 304 6 HOH HOH . DA 7 HOH F 1 301 16 HOH HOH . DA 7 HOH F 2 302 21 HOH HOH . DA 7 HOH F 3 303 11 HOH HOH . DA 7 HOH F 4 304 3 HOH HOH . DA 7 HOH F 5 305 5 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id M _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 74.194 _atom_site.Cartn_y 93.582 _atom_site.Cartn_z 46.181 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 88.5 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 201 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 9 _model_server_stats.query_time_ms 288 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #