data_6FE7
#
_model_server_result.job_id            wsM0WLR4zthnSltvAYAlWg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-27 10:18:56' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6fe7 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"GA","auth_seq_id":504}' 
#
_entry.id    6FE7 
#
_exptl.entry_id    6FE7 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              62.068 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            1,2-ETHANEDIOL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    58 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6FE7 
_cell.length_a            98.22 
_cell.length_b            111.03 
_cell.length_c            160.96 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6FE7 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
? monomeric 1 author_defined_assembly 3 
? monomeric 1 author_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,RC 1 1 
B,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,SC 2 1 
C,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,TC 3 1 
D,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,UC 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 G N N 
? 4 H N N 
? 4 I N N 
? 4 J N N 
? 4 K N N 
? 4 L N N 
? 4 M N N 
? 4 P N N 
? 4 Q N N 
? 4 R N N 
? 4 S N N 
? 4 Y N N 
? 4 Z N N 
? 4 AA N N 
? 4 CA N N 
? 4 FA N N 
? 4 GA N N 
? 4 HA N N 
? 4 IA N N 
? 4 JA N N 
? 4 MA N N 
? 4 NA N N 
? 4 OA N N 
? 4 PA N N 
? 4 QA N N 
? 4 RA N N 
? 4 TA N N 
? 4 UA N N 
? 4 VA N N 
? 4 WA N N 
? 4 YA N N 
? 4 AB N N 
? 4 BB N N 
? 4 EB N N 
? 4 FB N N 
? 4 GB N N 
? 4 HB N N 
? 4 IB N N 
? 4 JB N N 
? 4 MB N N 
? 4 NB N N 
? 4 OB N N 
? 4 PB N N 
? 4 TB N N 
? 4 UB N N 
? 4 XB N N 
? 4 YB N N 
? 4 ZB N N 
? 4 AC N N 
? 4 EC N N 
? 4 FC N N 
? 4 GC N N 
? 4 HC N N 
? 4 IC N N 
? 4 JC N N 
? 4 NC N N 
? 4 OC N N 
? 4 PC N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A NE2 HIS 90 A HIS 164 1_555 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? 
metalc ? metalc2 A NE2 HIS 126 A HIS 200 1_555 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.352 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASP 127 A ASP 201 1_555 F MG MG . A MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? 
metalc ? metalc4 A OD1 ASP 244 A ASP 318 1_555 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? 
metalc ? metalc5 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 RC O HOH . A HOH 629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? 
metalc ? metalc6 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 RC O HOH . A HOH 688 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.401 ? 
metalc ? metalc7 F MG MG . A MG 502 1_555 RC O HOH . A HOH 629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.968 ? 
metalc ? metalc8 F MG MG . A MG 502 1_555 RC O HOH . A HOH 634 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? 
metalc ? metalc9 F MG MG . A MG 502 1_555 RC O HOH . A HOH 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? 
metalc ? metalc10 F MG MG . A MG 502 1_555 RC O HOH . A HOH 710 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.09 ? 
metalc ? metalc11 F MG MG . A MG 502 1_555 RC O HOH . A HOH 719 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? 
metalc ? metalc12 B NE2 HIS 90 B HIS 164 1_555 DA ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? 
metalc ? metalc13 B NE2 HIS 126 B HIS 200 1_555 DA ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? 
metalc ? metalc14 B OD2 ASP 127 B ASP 201 1_555 DA ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? 
metalc ? metalc15 B OD1 ASP 127 B ASP 201 1_555 EA MG MG . B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? 
metalc ? metalc16 B OD1 ASP 244 B ASP 318 1_555 DA ZN ZN . B ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? 
metalc ? metalc17 DA ZN ZN . B ZN 501 1_555 SC O HOH . B HOH 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
metalc ? metalc18 DA ZN ZN . B ZN 501 1_555 SC O HOH . B HOH 688 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.274 ? 
metalc ? metalc19 EA MG MG . B MG 502 1_555 SC O HOH . B HOH 616 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? 
metalc ? metalc20 EA MG MG . B MG 502 1_555 SC O HOH . B HOH 645 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.97 ? 
metalc ? metalc21 EA MG MG . B MG 502 1_555 SC O HOH . B HOH 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
metalc ? metalc22 EA MG MG . B MG 502 1_555 SC O HOH . B HOH 670 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? 
metalc ? metalc23 EA MG MG . B MG 502 1_555 SC O HOH . B HOH 724 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? 
metalc ? metalc24 C NE2 HIS 90 C HIS 164 1_555 CB ZN ZN . C ZN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? 
metalc ? metalc25 C NE2 HIS 126 C HIS 200 1_555 CB ZN ZN . C ZN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? 
metalc ? metalc26 C OD2 ASP 127 C ASP 201 1_555 CB ZN ZN . C ZN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? 
metalc ? metalc27 C OD1 ASP 127 C ASP 201 1_555 DB MG MG . C MG 506 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? 
metalc ? metalc28 C OD1 ASP 244 C ASP 318 1_555 CB ZN ZN . C ZN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? 
metalc ? metalc29 CB ZN ZN . C ZN 505 1_555 TC O HOH . C HOH 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? 
metalc ? metalc30 CB ZN ZN . C ZN 505 1_555 TC O HOH . C HOH 655 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.234 ? 
metalc ? metalc31 DB MG MG . C MG 506 1_555 TC O HOH . C HOH 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? 
metalc ? metalc32 DB MG MG . C MG 506 1_555 TC O HOH . C HOH 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? 
metalc ? metalc33 DB MG MG . C MG 506 1_555 TC O HOH . C HOH 634 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? 
metalc ? metalc34 DB MG MG . C MG 506 1_555 TC O HOH . C HOH 667 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? 
metalc ? metalc35 DB MG MG . C MG 506 1_555 TC O HOH . C HOH 681 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? 
metalc ? metalc36 D NE2 HIS 90 D HIS 164 1_555 VB ZN ZN . D ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.202 ? 
metalc ? metalc37 D NE2 HIS 126 D HIS 200 1_555 VB ZN ZN . D ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc38 D OD2 ASP 127 D ASP 201 1_555 VB ZN ZN . D ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? 
metalc ? metalc39 D OD1 ASP 127 D ASP 201 1_555 WB MG MG . D MG 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? 
metalc ? metalc40 D OD1 ASP 244 D ASP 318 1_555 VB ZN ZN . D ZN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.185 ? 
metalc ? metalc41 VB ZN ZN . D ZN 502 1_555 UC O HOH . D HOH 637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? 
metalc ? metalc42 VB ZN ZN . D ZN 502 1_555 UC O HOH . D HOH 705 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.316 ? 
metalc ? metalc43 WB MG MG . D MG 503 1_555 UC O HOH . D HOH 637 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.989 ? 
metalc ? metalc44 WB MG MG . D MG 503 1_555 UC O HOH . D HOH 638 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.087 ? 
metalc ? metalc45 WB MG MG . D MG 503 1_555 UC O HOH . D HOH 654 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? 
metalc ? metalc46 WB MG MG . D MG 503 1_555 UC O HOH . D HOH 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? 
metalc ? metalc47 WB MG MG . D MG 503 1_555 UC O HOH . D HOH 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.01 ? 
#
_chem_comp.formula           'C2 H6 O2' 
_chem_comp.formula_weight    62.068 
_chem_comp.id                EDO 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              1,2-ETHANEDIOL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'ETHYLENE GLYCOL' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 EDO sing 155 n n 
C1 C2 EDO sing 156 n n 
C1 H11 EDO sing 157 n n 
C1 H12 EDO sing 158 n n 
O1 HO1 EDO sing 159 n n 
C2 O2 EDO sing 160 n n 
C2 H21 EDO sing 161 n n 
C2 H22 EDO sing 162 n n 
O2 HO2 EDO sing 163 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6FE7 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.010181 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009007 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006213 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 ZN A 1 501 412 ZN ZN . 
F 3 MG A 1 502 413 MG MG . 
G 4 EDO A 1 503 414 EDO EDO . 
H 4 EDO A 1 504 415 EDO EDO . 
I 4 EDO A 1 505 416 EDO EDO . 
J 4 EDO A 1 506 417 EDO EDO . 
K 4 EDO A 1 507 418 EDO EDO . 
L 4 EDO A 1 508 419 EDO EDO . 
M 4 EDO A 1 509 420 EDO EDO . 
N 5 PEG A 1 510 421 PEG PEG . 
O 5 PEG A 1 511 422 PEG PEG . 
P 4 EDO A 1 512 423 EDO EDO . 
Q 4 EDO A 1 513 424 EDO EDO . 
R 4 EDO A 1 514 425 EDO EDO . 
S 4 EDO A 1 515 426 EDO EDO . 
T 5 PEG A 1 516 427 PEG PEG . 
U 5 PEG A 1 517 428 PEG PEG . 
V 5 PEG A 1 518 429 PEG PEG . 
W 5 PEG A 1 519 430 PEG PEG . 
X 6 D62 A 1 520 431 D62 D62 . 
Y 4 EDO A 1 521 434 EDO EDO . 
Z 4 EDO A 1 522 435 EDO EDO . 
AA 4 EDO A 1 523 436 EDO EDO . 
BA 7 EPE A 1 524 437 EPE EPE . 
CA 4 EDO A 1 525 438 EDO EDO . 
DA 2 ZN B 1 501 412 ZN ZN . 
EA 3 MG B 1 502 413 MG MG . 
FA 4 EDO B 1 503 414 EDO EDO . 
GA 4 EDO B 1 504 415 EDO EDO . 
HA 4 EDO B 1 505 416 EDO EDO . 
IA 4 EDO B 1 506 417 EDO EDO . 
JA 4 EDO B 1 507 418 EDO EDO . 
KA 5 PEG B 1 508 419 PEG PEG . 
LA 7 EPE B 1 509 420 EPE EPE . 
MA 4 EDO B 1 510 421 EDO EDO . 
NA 4 EDO B 1 511 422 EDO EDO . 
OA 4 EDO B 1 512 423 EDO EDO . 
PA 4 EDO B 1 513 424 EDO EDO . 
QA 4 EDO B 1 514 425 EDO EDO . 
RA 4 EDO B 1 515 426 EDO EDO . 
SA 6 D62 B 1 516 427 D62 D62 . 
TA 4 EDO B 1 517 428 EDO EDO . 
UA 4 EDO B 1 518 429 EDO EDO . 
VA 4 EDO B 1 519 430 EDO EDO . 
WA 4 EDO B 1 520 431 EDO EDO . 
XA 7 EPE B 1 521 432 EPE EPE . 
YA 4 EDO C 1 501 432 EDO EDO . 
ZA 8 PG4 C 1 502 433 PG4 PG4 . 
AB 4 EDO C 1 503 412 EDO EDO . 
BB 4 EDO C 1 504 413 EDO EDO . 
CB 2 ZN C 1 505 414 ZN ZN . 
DB 3 MG C 1 506 415 MG MG . 
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FB 4 EDO C 1 508 417 EDO EDO . 
GB 4 EDO C 1 509 418 EDO EDO . 
HB 4 EDO C 1 510 419 EDO EDO . 
IB 4 EDO C 1 511 420 EDO EDO . 
JB 4 EDO C 1 512 421 EDO EDO . 
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LB 7 EPE C 1 514 423 EPE EPE . 
MB 4 EDO C 1 515 424 EDO EDO . 
NB 4 EDO C 1 516 425 EDO EDO . 
OB 4 EDO C 1 517 426 EDO EDO . 
PB 4 EDO C 1 518 427 EDO EDO . 
QB 5 PEG C 1 519 428 PEG PEG . 
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SB 8 PG4 C 1 521 430 PG4 PG4 . 
TB 4 EDO C 1 522 431 EDO EDO . 
UB 4 EDO D 1 501 412 EDO EDO . 
VB 2 ZN D 1 502 413 ZN ZN . 
WB 3 MG D 1 503 414 MG MG . 
XB 4 EDO D 1 504 415 EDO EDO . 
YB 4 EDO D 1 505 416 EDO EDO . 
ZB 4 EDO D 1 506 417 EDO EDO . 
AC 4 EDO D 1 507 418 EDO EDO . 
BC 5 PEG D 1 508 419 PEG PEG . 
CC 5 PEG D 1 509 420 PEG PEG . 
DC 5 PEG D 1 510 421 PEG PEG . 
EC 4 EDO D 1 511 422 EDO EDO . 
FC 4 EDO D 1 512 423 EDO EDO . 
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IC 4 EDO D 1 515 426 EDO EDO . 
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RC 9 HOH A 1 601 486 HOH HOH . 
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RC 9 HOH A 172 772 519 HOH HOH . 
SC 9 HOH B 1 601 593 HOH HOH . 
SC 9 HOH B 2 602 584 HOH HOH . 
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SC 9 HOH B 4 604 601 HOH HOH . 
SC 9 HOH B 5 605 547 HOH HOH . 
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SC 9 HOH B 7 607 509 HOH HOH . 
SC 9 HOH B 8 608 607 HOH HOH . 
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SC 9 HOH B 101 701 439 HOH HOH . 
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SC 9 HOH B 108 708 465 HOH HOH . 
SC 9 HOH B 109 709 561 HOH HOH . 
SC 9 HOH B 110 710 595 HOH HOH . 
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SC 9 HOH B 112 712 498 HOH HOH . 
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