data_6FU4
#
_model_server_result.job_id            a6YAtxBJgosDIvA26W-DVA 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-01-10 10:52:35' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          6fu4 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":402}' 
#
_entry.id    6FU4 
#
_exptl.entry_id    6FU4 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              92.094 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            GLYCEROL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            6FU4 
_cell.length_a            81.616 
_cell.length_b            103.983 
_cell.length_c            147.452 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6FU4 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        18 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 2' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
? monomeric 1 author_defined_assembly 3 
? monomeric 1 author_defined_assembly 4 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,E,F,G,P 1 1 
B,H,I,Q 2 1 
C,J,K,L,M,R 3 1 
D,N,O,S 4 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 G N N 
? 4 I N N 
? 4 L N N 
? 4 O N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 180 A CYS 195 1_555 A SG CYS 188 A CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? 
disulf ? disulf2 B SG CYS 180 B CYS 195 1_555 B SG CYS 188 B CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? 
disulf ? disulf3 C SG CYS 180 C CYS 195 1_555 C SG CYS 188 C CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.05 ? 
disulf ? disulf4 D SG CYS 180 D CYS 195 1_555 D SG CYS 188 D CYS 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
covale ? covale1 A C GLN 33 A GLN 48 1_555 A N MSE 34 A MSE 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale2 A C MSE 34 A MSE 49 1_555 A N LEU 35 A LEU 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale3 A C PHE 58 A PHE 73 1_555 A N MSE 59 A MSE 74 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale4 A C PHE 58 A PHE 73 1_555 A N MSE 59 A MSE 74 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale5 A C MSE 59 A MSE 74 1_555 A N ASP 60 A ASP 75 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale6 A C MSE 59 A MSE 74 1_555 A N ASP 60 A ASP 75 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale7 A C SER 156 A SER 171 1_555 A N MSE 157 A MSE 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale8 A C MSE 157 A MSE 172 1_555 A N ILE 158 A ILE 173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale9 A C LEU 203 A LEU 218 1_555 A N MSE 204 A MSE 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale10 A C MSE 204 A MSE 219 1_555 A N THR 205 A THR 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale11 A C VAL 220 A VAL 235 1_555 A N MSE 221 A MSE 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale12 A C MSE 221 A MSE 236 1_555 A N GLY 222 A GLY 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? 
covale ? covale13 B C PHE 58 B PHE 73 1_555 B N MSE 59 B MSE 74 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale14 B C PHE 58 B PHE 73 1_555 B N MSE 59 B MSE 74 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale15 B C MSE 59 B MSE 74 1_555 B N ASP 60 B ASP 75 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale16 B C MSE 59 B MSE 74 1_555 B N ASP 60 B ASP 75 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? 
covale ? covale17 B C SER 156 B SER 171 1_555 B N MSE 157 B MSE 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale18 B C MSE 157 B MSE 172 1_555 B N ILE 158 B ILE 173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale19 B C LEU 203 B LEU 218 1_555 B N MSE 204 B MSE 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale20 B C MSE 204 B MSE 219 1_555 B N THR 205 B THR 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? 
covale ? covale21 B C VAL 220 B VAL 235 1_555 B N MSE 221 B MSE 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale22 B C MSE 221 B MSE 236 1_555 B N GLY 222 B GLY 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale23 C C GLN 33 C GLN 48 1_555 C N MSE 34 C MSE 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale24 C C MSE 34 C MSE 49 1_555 C N LEU 35 C LEU 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale25 C C PHE 58 C PHE 73 1_555 C N MSE 59 C MSE 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale26 C C MSE 59 C MSE 74 1_555 C N ASP 60 C ASP 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? 
covale ? covale27 C C SER 156 C SER 171 1_555 C N MSE 157 C MSE 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale28 C C MSE 157 C MSE 172 1_555 C N ILE 158 C ILE 173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale29 C C LEU 203 C LEU 218 1_555 C N MSE 204 C MSE 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale30 C C MSE 204 C MSE 219 1_555 C N THR 205 C THR 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale31 C C VAL 220 C VAL 235 1_555 C N MSE 221 C MSE 236 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale32 C C VAL 220 C VAL 235 1_555 C N MSE 221 C MSE 236 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? 
covale ? covale33 C C MSE 221 C MSE 236 1_555 C N GLY 222 C GLY 237 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale34 C C MSE 221 C MSE 236 1_555 C N GLY 222 C GLY 237 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
covale ? covale35 D C PHE 58 D PHE 73 1_555 D N MSE 59 D MSE 74 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? 
covale ? covale36 D C PHE 58 D PHE 73 1_555 D N MSE 59 D MSE 74 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? 
covale ? covale37 D C MSE 59 D MSE 74 1_555 D N ASP 60 D ASP 75 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? 
covale ? covale38 D C MSE 59 D MSE 74 1_555 D N ASP 60 D ASP 75 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? 
covale ? covale39 D C SER 156 D SER 171 1_555 D N MSE 157 D MSE 172 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? 
covale ? covale40 D C MSE 157 D MSE 172 1_555 D N ILE 158 D ILE 173 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? 
covale ? covale41 D C LEU 203 D LEU 218 1_555 D N MSE 204 D MSE 219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? 
covale ? covale42 D C MSE 204 D MSE 219 1_555 D N THR 205 D THR 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? 
covale ? covale43 D C VAL 220 D VAL 235 1_555 D N MSE 221 D MSE 236 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? 
covale ? covale44 D C MSE 221 D MSE 236 1_555 D N GLY 222 D GLY 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? 
#
_chem_comp.formula           'C3 H8 O3' 
_chem_comp.formula_weight    92.094 
_chem_comp.id                GOL 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              GLYCEROL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 GOL sing 135 n n 
C1 C2 GOL sing 136 n n 
C1 H11 GOL sing 137 n n 
C1 H12 GOL sing 138 n n 
O1 HO1 GOL sing 139 n n 
C2 O2 GOL sing 140 n n 
C2 C3 GOL sing 141 n n 
C2 H2 GOL sing 142 n n 
O2 HO2 GOL sing 143 n n 
C3 O3 GOL sing 144 n n 
C3 H31 GOL sing 145 n n 
C3 H32 GOL sing 146 n n 
O3 HO3 GOL sing 147 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     6FU4 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012252 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009617 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006782 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 HSM A 1 401 515 HSM HSM . 
F 3 PO4 A 1 402 516 PO4 PO4 . 
G 4 GOL A 1 403 517 GOL GOL . 
H 2 HSM B 1 401 515 HSM HSM . 
I 4 GOL B 1 402 516 GOL GOL . 
J 2 HSM C 1 401 515 HSM HSM . 
K 3 PO4 C 1 402 516 PO4 PO4 . 
L 4 GOL C 1 403 517 GOL GOL . 
M 5 ACT C 1 404 518 ACT ACT . 
N 2 HSM D 1 401 515 HSM HSM . 
O 4 GOL D 1 402 516 GOL GOL . 
P 6 HOH A 1 501 623 HOH HOH . 
P 6 HOH A 2 502 599 HOH HOH . 
P 6 HOH A 3 503 564 HOH HOH . 
P 6 HOH A 4 504 630 HOH HOH . 
P 6 HOH A 5 505 593 HOH HOH . 
P 6 HOH A 6 506 595 HOH HOH . 
P 6 HOH A 7 507 553 HOH HOH . 
P 6 HOH A 8 508 534 HOH HOH . 
P 6 HOH A 9 509 570 HOH HOH . 
P 6 HOH A 10 510 532 HOH HOH . 
P 6 HOH A 11 511 597 HOH HOH . 
P 6 HOH A 12 512 552 HOH HOH . 
P 6 HOH A 13 513 612 HOH HOH . 
P 6 HOH A 14 514 536 HOH HOH . 
P 6 HOH A 15 515 546 HOH HOH . 
P 6 HOH A 16 516 550 HOH HOH . 
P 6 HOH A 17 517 533 HOH HOH . 
P 6 HOH A 18 518 530 HOH HOH . 
P 6 HOH A 19 519 558 HOH HOH . 
P 6 HOH A 20 520 526 HOH HOH . 
P 6 HOH A 21 521 609 HOH HOH . 
P 6 HOH A 22 522 539 HOH HOH . 
P 6 HOH A 23 523 624 HOH HOH . 
P 6 HOH A 24 524 620 HOH HOH . 
P 6 HOH A 25 525 567 HOH HOH . 
P 6 HOH A 26 526 632 HOH HOH . 
P 6 HOH A 27 527 614 HOH HOH . 
P 6 HOH A 28 528 520 HOH HOH . 
P 6 HOH A 29 529 538 HOH HOH . 
P 6 HOH A 30 530 577 HOH HOH . 
P 6 HOH A 31 531 594 HOH HOH . 
P 6 HOH A 32 532 574 HOH HOH . 
P 6 HOH A 33 533 610 HOH HOH . 
P 6 HOH A 34 534 522 HOH HOH . 
P 6 HOH A 35 535 563 HOH HOH . 
P 6 HOH A 36 536 588 HOH HOH . 
P 6 HOH A 37 537 565 HOH HOH . 
P 6 HOH A 38 538 555 HOH HOH . 
P 6 HOH A 39 539 613 HOH HOH . 
P 6 HOH A 40 540 556 HOH HOH . 
P 6 HOH A 41 541 535 HOH HOH . 
P 6 HOH A 42 542 585 HOH HOH . 
P 6 HOH A 43 543 543 HOH HOH . 
P 6 HOH A 44 544 548 HOH HOH . 
P 6 HOH A 45 545 525 HOH HOH . 
P 6 HOH A 46 546 561 HOH HOH . 
P 6 HOH A 47 547 519 HOH HOH . 
P 6 HOH A 48 548 575 HOH HOH . 
P 6 HOH A 49 549 598 HOH HOH . 
P 6 HOH A 50 550 573 HOH HOH . 
P 6 HOH A 51 551 528 HOH HOH . 
P 6 HOH A 52 552 590 HOH HOH . 
P 6 HOH A 53 553 576 HOH HOH . 
P 6 HOH A 54 554 566 HOH HOH . 
P 6 HOH A 55 555 592 HOH HOH . 
P 6 HOH A 56 556 581 HOH HOH . 
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