data_6FZQ # _model_server_result.job_id SHkEZSlPZ3n-MtNyZXk21Q _model_server_result.datetime_utc '2025-08-05 02:54:30' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6fzq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"M","auth_seq_id":101}' # _entry.id 6FZQ # _exptl.entry_id 6FZQ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 257.189 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-deoxy-2-[(difluoroacetyl)amino]-alpha-D-galactopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6FZQ _cell.length_a 35.324 _cell.length_b 69.639 _cell.length_c 90.59 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6FZQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 4 _struct_asym.id M _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 22 H CYS 22 1_555 A SG CYS 98 H CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 156 H CYS 1029 1_555 A SG CYS 224 H CYS 1097 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? covale ? covale1 B OG1 THR 4 P THR 4 1_555 M C1 EEN . P EEN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.516 ? # _chem_comp.formula 'C8 H13 F2 N O6' _chem_comp.formula_weight 257.189 _chem_comp.id EEN _chem_comp.mon_nstd_flag n _chem_comp.name 2-deoxy-2-[(difluoroacetyl)amino]-alpha-D-galactopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, alpha linking' _chem_comp.pdbx_synonyms N-DIFLUOROACETYL-D-GALACTOSAMINE;2-deoxy-2-[(difluoroacetyl)amino]-alpha-D-galactose;2-deoxy-2-[(difluoroacetyl)amino]-D-galactose;2-deoxy-2-[(difluoroacetyl)amino]-galactose # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag O6 C6 EEN sing 92 n n C6 C5 EEN sing 93 n n O4 C4 EEN sing 94 n n O5 C5 EEN sing 95 n n O5 C1 EEN sing 96 n n C5 C4 EEN sing 97 n n C4 C3 EEN sing 98 n n C1 C2 EEN sing 99 n n C2 C3 EEN sing 100 n n C2 N2 EEN sing 101 n n O7 C7 EEN doub 102 n n C3 O3 EEN sing 103 n n C7 N2 EEN sing 104 n n C7 C8 EEN sing 105 n n C8 F20 EEN sing 106 n n C8 F23 EEN sing 107 n n C1 O1 EEN sing 108 n n C8 H81 EEN sing 109 n n N2 HN2 EEN sing 110 n n C2 H2 EEN sing 111 n n C1 H1 EEN sing 112 n n C5 H5 EEN sing 113 n n C6 H61 EEN sing 114 n n C6 H62 EEN sing 115 n n O6 HO6 EEN sing 116 n n C4 H4 EEN sing 117 n n O4 HO4 EEN sing 118 n n C3 H3 EEN sing 119 n n O3 HO3 EEN sing 120 n n O1 HO1 EEN sing 121 n n # _atom_sites.entry_id 6FZQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.028309 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.01436 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.011039 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 EDO H 1 1201 1 EDO EDO . D 3 EDO H 1 1202 2 EDO EDO . E 3 EDO H 1 1203 3 EDO EDO . F 3 EDO H 1 1204 4 EDO EDO . G 3 EDO H 1 1205 5 EDO EDO . H 3 EDO H 1 1206 6 EDO EDO . I 3 EDO H 1 1207 7 EDO EDO . J 3 EDO H 1 1208 8 EDO EDO . K 3 EDO H 1 1209 9 EDO EDO . L 3 EDO H 1 1210 10 EDO EDO . M 4 EEN P 1 101 1 EEN 0VA . N 5 HOH H 1 1301 15 HOH HOH . N 5 HOH H 2 1302 189 HOH HOH . N 5 HOH H 3 1303 34 HOH HOH . N 5 HOH H 4 1304 41 HOH HOH . N 5 HOH H 5 1305 38 HOH HOH . N 5 HOH H 6 1306 4 HOH HOH . N 5 HOH H 7 1307 161 HOH HOH . N 5 HOH H 8 1308 6 HOH HOH . N 5 HOH H 9 1309 52 HOH HOH . N 5 HOH H 10 1310 7 HOH HOH . N 5 HOH H 11 1311 35 HOH HOH . N 5 HOH H 12 1312 132 HOH HOH . N 5 HOH H 13 1313 100 HOH HOH . N 5 HOH H 14 1314 67 HOH HOH . N 5 HOH H 15 1315 79 HOH HOH . N 5 HOH H 16 1316 9 HOH HOH . N 5 HOH H 17 1317 104 HOH HOH . N 5 HOH H 18 1318 31 HOH HOH . N 5 HOH H 19 1319 14 HOH HOH . N 5 HOH H 20 1320 137 HOH HOH . N 5 HOH H 21 1321 33 HOH HOH . N 5 HOH H 22 1322 192 HOH HOH . N 5 HOH H 23 1323 30 HOH HOH . N 5 HOH H 24 1324 28 HOH HOH . N 5 HOH H 25 1325 62 HOH HOH . N 5 HOH H 26 1326 10 HOH HOH . N 5 HOH H 27 1327 109 HOH HOH . N 5 HOH H 28 1328 152 HOH HOH . N 5 HOH H 29 1329 25 HOH HOH . N 5 HOH H 30 1330 90 HOH HOH . N 5 HOH H 31 1331 65 HOH HOH . N 5 HOH H 32 1332 72 HOH HOH . N 5 HOH H 33 1333 66 HOH HOH . N 5 HOH H 34 1334 162 HOH HOH . N 5 HOH H 35 1335 50 HOH HOH . N 5 HOH H 36 1336 27 HOH HOH . N 5 HOH H 37 1337 91 HOH HOH . N 5 HOH H 38 1338 115 HOH HOH . N 5 HOH H 39 1339 43 HOH HOH . N 5 HOH H 40 1340 188 HOH HOH . N 5 HOH H 41 1341 44 HOH HOH . N 5 HOH H 42 1342 13 HOH HOH . N 5 HOH H 43 1343 102 HOH HOH . N 5 HOH H 44 1344 24 HOH HOH . N 5 HOH H 45 1345 45 HOH HOH . N 5 HOH H 46 1346 54 HOH HOH . N 5 HOH H 47 1347 1 HOH HOH . N 5 HOH H 48 1348 47 HOH HOH . N 5 HOH H 49 1349 40 HOH HOH . N 5 HOH H 50 1350 3 HOH HOH . N 5 HOH H 51 1351 187 HOH HOH . N 5 HOH H 52 1352 21 HOH HOH . N 5 HOH H 53 1353 199 HOH HOH . N 5 HOH H 54 1354 71 HOH HOH . N 5 HOH H 55 1355 57 HOH HOH . N 5 HOH H 56 1356 48 HOH HOH . N 5 HOH H 57 1357 114 HOH HOH . N 5 HOH H 58 1358 196 HOH HOH . N 5 HOH H 59 1359 58 HOH HOH . N 5 HOH H 60 1360 87 HOH HOH . N 5 HOH H 61 1361 63 HOH HOH . N 5 HOH H 62 1362 169 HOH HOH . N 5 HOH H 63 1363 70 HOH HOH . N 5 HOH H 64 1364 92 HOH HOH . N 5 HOH H 65 1365 22 HOH HOH . N 5 HOH H 66 1366 106 HOH HOH . N 5 HOH H 67 1367 120 HOH HOH . N 5 HOH H 68 1368 93 HOH HOH . N 5 HOH H 69 1369 131 HOH HOH . N 5 HOH H 70 1370 19 HOH HOH . N 5 HOH H 71 1371 198 HOH HOH . N 5 HOH H 72 1372 124 HOH HOH . N 5 HOH H 73 1373 32 HOH HOH . N 5 HOH H 74 1374 18 HOH HOH . N 5 HOH H 75 1375 200 HOH HOH . N 5 HOH H 76 1376 39 HOH HOH . N 5 HOH H 77 1377 36 HOH HOH . N 5 HOH H 78 1378 80 HOH HOH . N 5 HOH H 79 1379 76 HOH HOH . N 5 HOH H 80 1380 51 HOH HOH . N 5 HOH H 81 1381 12 HOH HOH . N 5 HOH H 82 1382 64 HOH HOH . N 5 HOH H 83 1383 60 HOH HOH . N 5 HOH H 84 1384 20 HOH HOH . N 5 HOH H 85 1385 53 HOH HOH . N 5 HOH H 86 1386 26 HOH HOH . N 5 HOH H 87 1387 118 HOH HOH . N 5 HOH H 88 1388 61 HOH HOH . N 5 HOH H 89 1389 130 HOH HOH . N 5 HOH H 90 1390 182 HOH HOH . N 5 HOH H 91 1391 86 HOH HOH . N 5 HOH H 92 1392 105 HOH HOH . N 5 HOH H 93 1393 75 HOH HOH . N 5 HOH H 94 1394 97 HOH HOH . N 5 HOH H 95 1395 95 HOH HOH . N 5 HOH H 96 1396 29 HOH HOH . N 5 HOH H 97 1397 195 HOH HOH . N 5 HOH H 98 1398 78 HOH HOH . N 5 HOH H 99 1399 193 HOH HOH . N 5 HOH H 100 1400 23 HOH HOH . N 5 HOH H 101 1401 185 HOH HOH . N 5 HOH H 102 1402 197 HOH HOH . N 5 HOH H 103 1403 191 HOH HOH . N 5 HOH H 104 1404 190 HOH HOH . N 5 HOH H 105 1405 186 HOH HOH . N 5 HOH H 106 1406 194 HOH HOH . N 5 HOH H 107 1407 69 HOH HOH . N 5 HOH H 108 1408 55 HOH HOH . N 5 HOH H 109 1409 146 HOH HOH . O 5 HOH P 1 201 2 HOH HOH . O 5 HOH P 2 202 81 HOH HOH . O 5 HOH P 3 203 11 HOH HOH . O 5 HOH P 4 204 74 HOH HOH . O 5 HOH P 5 205 1 HOH HOH . O 5 HOH P 6 206 122 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 F F20 EEN . . . M 4 22.903 13.044 4.277 1 68.52 ? F20 EEN 101 P 1 HETATM 2 C C8 EEN . . . M 4 22.919 14.33 3.758 1 64.55 ? C8 EEN 101 P 1 HETATM 3 F F23 EEN . . . M 4 22.263 15.189 4.627 1 67.95 ? F23 EEN 101 P 1 HETATM 4 C C7 EEN . . . M 4 22.215 14.342 2.4 1 64.15 ? C7 EEN 101 P 1 HETATM 5 O O7 EEN . . . M 4 22.853 14.48 1.357 1 63.43 ? O7 EEN 101 P 1 HETATM 6 N N2 EEN . . . M 4 20.884 14.193 2.45 1 61.36 ? N2 EEN 101 P 1 HETATM 7 C C2 EEN . . . M 4 20.056 14.183 1.236 1 60.33 ? C2 EEN 101 P 1 HETATM 8 C C1 EEN . . . M 4 19.532 12.777 0.991 1 61.02 ? C1 EEN 101 P 1 HETATM 9 O O5 EEN . . . M 4 18.72 12.769 -0.193 1 55.04 ? O5 EEN 101 P 1 HETATM 10 C C5 EEN . . . M 4 17.549 13.57 0.023 1 56.45 ? C5 EEN 101 P 1 HETATM 11 C C6 EEN . . . M 4 16.622 13.455 -1.188 1 56.63 ? C6 EEN 101 P 1 HETATM 12 O O6 EEN . . . M 4 16.386 12.076 -1.48 1 55.84 ? O6 EEN 101 P 1 HETATM 13 C C4 EEN . . . M 4 17.954 15.022 0.216 1 58.76 ? C4 EEN 101 P 1 HETATM 14 O O4 EEN . . . M 4 18.628 15.492 -0.961 1 56.48 ? O4 EEN 101 P 1 HETATM 15 C C3 EEN . . . M 4 18.885 15.136 1.413 1 59.5 ? C3 EEN 101 P 1 HETATM 16 O O3 EEN . . . M 4 19.373 16.481 1.515 1 60.52 ? O3 EEN 101 P 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 25 _model_server_stats.create_model_time_ms 23 _model_server_stats.query_time_ms 307 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 16 #