data_6GGV
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_model_server_result.job_id            H8_JdX3GgLCTZqgekP0Dig 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-23 16:45:25' 
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_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_result.entry_id          6ggv 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":304}' 
#
_entry.id    6GGV 
#
_exptl.entry_id    6GGV 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              112.411 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  nat 
_entity.type                        non-polymer 
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_entity.pdbx_number_of_molecules    22 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            6GGV 
_cell.length_a            30.7 
_cell.length_b            52.139 
_cell.length_c            221.343 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 6GGV 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        18 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 2 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,AA 1 1 
B,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,BA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 D N N 
? 3 E N N 
? 3 F N N 
? 3 G N N 
? 3 H N N 
? 3 I N N 
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 L N N 
? 3 M N N 
? 3 N N N 
? 3 O N N 
? 3 P N N 
? 3 R N N 
? 3 S N N 
? 3 T N N 
? 3 U N N 
? 3 V N N 
? 3 W N N 
? 3 X N N 
? 3 Y N N 
? 3 Z N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 3 A ASP 22 1_555 J CD CD . A CD 308 1_645 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? 
metalc ? metalc2 A OE2 GLU 27 A GLU 46 1_555 F CD CD . A CD 304 3_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 37 A ASP 56 1_555 O CD CD . A CD 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? 
metalc ? metalc4 A OE1 GLU 80 A GLU 99 1_555 K CD CD . A CD 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc5 A OE2 GLU 80 A GLU 99 1_555 K CD CD . A CD 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? 
metalc ? metalc6 A OE2 GLU 80 A GLU 99 1_555 L CD CD . A CD 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? 
metalc ? metalc7 A OD2 ASP 106 A ASP 125 1_555 J CD CD . A CD 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc8 A OD1 ASP 114 A ASP 133 1_555 P CD CD . A CD 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? 
metalc ? metalc9 A OD2 ASP 114 A ASP 133 1_555 P CD CD . A CD 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? 
metalc ? metalc10 A O LYS 134 A LYS 153 1_555 H CD CD . A CD 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? 
metalc ? metalc11 A OD1 ASP 144 A ASP 163 1_555 I CD CD . A CD 307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? 
metalc ? metalc12 A OD1 ASP 159 A ASP 178 1_555 D CD CD . A CD 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? 
metalc ? metalc13 A OD2 ASP 159 A ASP 178 1_555 D CD CD . A CD 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.596 ? 
metalc ? metalc14 A OD1 ASP 200 A ASP 219 1_555 E CD CD . A CD 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.642 ? 
metalc ? metalc15 A OD2 ASP 200 A ASP 219 1_555 E CD CD . A CD 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc16 D CD CD . A CD 302 1_555 AA O HOH . A HOH 406 1_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc17 D CD CD . A CD 302 1_555 AA O HOH . A HOH 409 1_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.813 ? 
metalc ? metalc18 D CD CD . A CD 302 1_555 AA O HOH . A HOH 509 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? 
metalc ? metalc19 H CD CD . A CD 306 1_555 BA O HOH . B HOH 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? 
metalc ? metalc20 I CD CD . A CD 307 1_555 AA O HOH . A HOH 460 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? 
metalc ? metalc21 I CD CD . A CD 307 1_555 AA O HOH . A HOH 489 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.617 ? 
metalc ? metalc22 K CD CD . A CD 309 1_565 B OE2 GLU 4 B GLU 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? 
metalc ? metalc23 P CD CD . A CD 314 1_555 AA O HOH . A HOH 434 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.238 ? 
metalc ? metalc24 P CD CD . A CD 314 1_555 AA O HOH . A HOH 517 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? 
metalc ? metalc25 P CD CD . A CD 314 1_555 B OE1 GLU 81 B GLU 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? 
metalc ? metalc26 P CD CD . A CD 314 1_555 BA O HOH . B HOH 468 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.448 ? 
metalc ? metalc27 B OD2 ASP 37 B ASP 56 1_555 U CD CD . B CD 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? 
metalc ? metalc28 B OD1 ASP 37 B ASP 56 1_555 U CD CD . B CD 305 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.694 ? 
metalc ? metalc29 B OD2 ASP 37 B ASP 56 1_555 U CD CD . B CD 305 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? 
metalc ? metalc30 B OE2 GLU 41 B GLU 60 1_555 Y CD CD . B CD 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? 
metalc ? metalc31 B OE2 GLU 41 B GLU 60 1_555 Y CD CD . B CD 309 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? 
metalc ? metalc32 B NE ARG 44 B ARG 63 1_555 Y CD CD . B CD 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? 
metalc ? metalc33 B NH2 ARG 44 B ARG 63 1_555 Y CD CD . B CD 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.605 ? 
metalc ? metalc34 B NE ARG 44 B ARG 63 1_555 Y CD CD . B CD 309 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? 
metalc ? metalc35 B NH2 ARG 44 B ARG 63 1_555 Y CD CD . B CD 309 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? 
metalc ? metalc36 B OE1 GLU 49 B GLU 68 1_555 S CD CD . B CD 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? 
metalc ? metalc37 B OD1 ASP 106 B ASP 125 1_555 T CD CD . B CD 304 1_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? 
metalc ? metalc38 B OD2 ASP 106 B ASP 125 1_555 W CD CD . B CD 307 1_545 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.16 ? 
metalc ? metalc39 B OE1 GLU 113 B GLU 132 1_555 Z CD CD . B CD 310 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? 
metalc ? metalc40 B OE2 GLU 113 B GLU 132 1_555 Z CD CD . B CD 310 1_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? 
metalc ? metalc41 B OD1 ASP 148 B ASP 167 1_555 Z CD CD . B CD 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.63 ? 
metalc ? metalc42 B OD2 ASP 148 B ASP 167 1_555 Z CD CD . B CD 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? 
metalc ? metalc43 B OD1 ASP 198 B ASP 217 1_555 X CD CD . B CD 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.67 ? 
metalc ? metalc44 B OE1 GLU 211 B GLU 230 1_555 V CD CD . B CD 306 1_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc45 T CD CD . B CD 304 1_555 BA O HOH . B HOH 429 1_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? 
metalc ? metalc46 U CD CD . B CD 305 1_555 BA O HOH . B HOH 450 2_655 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? 
metalc ? metalc47 W CD CD . B CD 307 1_555 BA O HOH . B HOH 429 1_565 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? 
metalc ? metalc48 W CD CD . B CD 307 1_555 BA O HOH . B HOH 452 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? 
#
_chem_comp.formula           'Cd 2' 
_chem_comp.formula_weight    112.411 
_chem_comp.id                CD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CADMIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     6GGV 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.032573 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.01918 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004518 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 ARG A 1 301 320 ARG ARG . 
D 3 CD A 1 302 401 CD CD . 
E 3 CD A 1 303 402 CD CD . 
F 3 CD A 1 304 403 CD CD . 
G 3 CD A 1 305 404 CD CD . 
H 3 CD A 1 306 405 CD CD . 
I 3 CD A 1 307 406 CD CD . 
J 3 CD A 1 308 407 CD CD . 
K 3 CD A 1 309 408 CD CD . 
L 3 CD A 1 310 409 CD CD . 
M 3 CD A 1 311 410 CD CD . 
N 3 CD A 1 312 411 CD CD . 
O 3 CD A 1 313 412 CD CD . 
P 3 CD A 1 314 421 CD CD . 
Q 2 ARG B 1 301 320 ARG ARG . 
R 3 CD B 1 302 413 CD CD . 
S 3 CD B 1 303 414 CD CD . 
T 3 CD B 1 304 415 CD CD . 
U 3 CD B 1 305 416 CD CD . 
V 3 CD B 1 306 417 CD CD . 
W 3 CD B 1 307 418 CD CD . 
X 3 CD B 1 308 419 CD CD . 
Y 3 CD B 1 309 420 CD CD . 
Z 3 CD B 1 310 422 CD CD . 
AA 4 HOH A 1 401 106 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 2 402 33 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 3 403 90 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 4 404 178 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 5 405 236 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 6 406 235 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 7 407 149 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 8 408 115 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 9 409 218 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 10 410 92 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 11 411 73 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 12 412 180 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 13 413 53 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 14 414 35 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 15 415 51 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 16 416 102 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 17 417 79 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 18 418 109 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 19 419 139 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 20 420 126 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 21 421 87 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 22 422 25 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 23 423 59 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 24 424 69 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 25 425 36 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 26 426 100 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 27 427 40 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 28 428 47 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 29 429 42 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 30 430 250 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 31 431 37 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 32 432 34 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 33 433 91 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 34 434 257 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 35 435 123 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 36 436 132 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 37 437 131 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 38 438 81 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 39 439 32 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 40 440 251 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 41 441 207 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 42 442 256 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 43 443 245 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 44 444 147 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 45 445 30 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 46 446 239 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 47 447 57 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 48 448 31 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 49 449 39 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 50 450 27 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 51 451 26 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 52 452 141 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 53 453 52 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 54 454 94 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 55 455 133 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 56 456 49 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 57 457 29 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 58 458 224 HOH HOH . 
AA 4 HOH A 59 459 137 HOH HOH . 
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