data_6GQY # _model_server_result.job_id aFEXOTUUBziLV_ANLOD6hw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-02 12:33:07' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6gqy # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":203}' # _entry.id 6GQY # _exptl.entry_id 6GQY _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 381.463 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description '[4-[[3-fluoranyl-2-methoxy-4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 6GQY _cell.length_a 63.531 _cell.length_b 118.678 _cell.length_c 156.996 _cell.Z_PDB 24 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6GQY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 ? monomeric 1 author_defined_assembly 4 ? monomeric 1 author_defined_assembly 5 ? monomeric 1 author_defined_assembly 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,G,H,I,W 1 1 B,J,K,L,X 2 1 C,M,N,O,Y 3 1 D,P,Q,R,Z 4 1 E,S,T,AA 5 1 F,U,V,BA 6 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 I N N ? 4 L N N ? 4 O N N ? 4 R N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OG SER 21 A SER 17 1_555 G MG MG . A MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? metalc ? metalc2 A OG1 THR 39 A THR 35 1_555 G MG MG . A MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc3 G MG MG . A MG 201 1_555 H O2B GNP . A GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc4 G MG MG . A MG 201 1_555 H O2G GNP . A GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc5 G MG MG . A MG 201 1_555 W O HOH . A HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.421 ? metalc ? metalc6 B OG SER 21 B SER 17 1_555 J MG MG . B MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.48 ? metalc ? metalc7 B OG1 THR 39 B THR 35 1_555 J MG MG . B MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? metalc ? metalc8 J MG MG . B MG 201 1_555 K O2B GNP . B GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc9 J MG MG . B MG 201 1_555 K O1A GNP . B GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.862 ? metalc ? metalc10 J MG MG . B MG 201 1_555 K O2G GNP . B GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc ? metalc11 J MG MG . B MG 201 1_555 X O HOH . B HOH 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.651 ? metalc ? metalc12 C OG SER 21 C SER 17 1_555 M MG MG . C MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? metalc ? metalc13 C OG1 THR 39 C THR 35 1_555 M MG MG . C MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc14 M MG MG . C MG 201 1_555 N O1G GNP . C GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? metalc ? metalc15 M MG MG . C MG 201 1_555 N O1B GNP . C GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? metalc ? metalc16 D OG SER 21 D SER 17 1_555 P MG MG . D MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? metalc ? metalc17 D OG1 THR 39 D THR 35 1_555 P MG MG . D MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc ? metalc18 P MG MG . D MG 201 1_555 Q O2G GNP . D GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc19 P MG MG . D MG 201 1_555 Q O2B GNP . D GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.547 ? metalc ? metalc20 E OG SER 21 E SER 17 1_555 S MG MG . E MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc21 E OG1 THR 39 E THR 35 1_555 S MG MG . E MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc ? metalc22 E O THR 62 E THR 58 1_555 S MG MG . E MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.962 ? metalc ? metalc23 S MG MG . E MG 201 1_555 T O1G GNP . E GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.277 ? metalc ? metalc24 S MG MG . E MG 201 1_555 T O1B GNP . E GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.752 ? metalc ? metalc25 F OG SER 21 F SER 17 1_555 U MG MG . F MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.12 ? metalc ? metalc26 F OG1 THR 39 F THR 35 1_555 U MG MG . F MG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? metalc ? metalc27 U MG MG . F MG 201 1_555 V O1B GNP . F GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.391 ? metalc ? metalc28 U MG MG . F MG 201 1_555 V O1G GNP . F GNP 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? # _chem_comp.formula 'C23 H26 F N2 O2 1' _chem_comp.formula_weight 381.463 _chem_comp.id F8Q _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name '[4-[[3-fluoranyl-2-methoxy-4-(3-methoxyphenyl)phenyl]amino]phenyl]methyl-dimethyl-azanium' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C14 O13 F8Q sing 83 n n C3 C2 F8Q doub 84 n y C3 C4 F8Q sing 85 n y O13 C4 F8Q sing 86 n n C2 C1 F8Q sing 87 n y C4 C5 F8Q doub 88 n y C1 C6 F8Q doub 89 n y C5 C6 F8Q sing 90 n y C6 C7 F8Q sing 91 n n C8 C7 F8Q doub 92 n y C8 C9 F8Q sing 93 n y C7 C12 F8Q sing 94 n y C9 C10 F8Q doub 95 n y C12 F17 F8Q sing 96 n n C12 C11 F8Q doub 97 n y C23 C24 F8Q doub 98 n y C23 C22 F8Q sing 99 n y C25 C22 F8Q sing 100 n n C25 N26 F8Q sing 101 n n C24 C19 F8Q sing 102 n y C10 C11 F8Q sing 103 n y C10 N18 F8Q sing 104 n n C22 C21 F8Q doub 105 n y C11 O15 F8Q sing 106 n n C28 N26 F8Q sing 107 n n N26 C27 F8Q sing 108 n n C19 N18 F8Q sing 109 n n C19 C20 F8Q doub 110 n y C21 C20 F8Q sing 111 n y O15 C16 F8Q sing 112 n n C5 H1 F8Q sing 113 n n C14 H2 F8Q sing 114 n n C14 H3 F8Q sing 115 n n C14 H4 F8Q sing 116 n n C3 H5 F8Q sing 117 n n C2 H6 F8Q sing 118 n n C1 H7 F8Q sing 119 n n C16 H8 F8Q sing 120 n n C16 H9 F8Q sing 121 n n C16 H10 F8Q sing 122 n n C9 H11 F8Q sing 123 n n C8 H12 F8Q sing 124 n n N18 H13 F8Q sing 125 n n C24 H14 F8Q sing 126 n n C23 H15 F8Q sing 127 n n C21 H16 F8Q sing 128 n n C20 H17 F8Q sing 129 n n C25 H18 F8Q sing 130 n n C25 H19 F8Q sing 131 n n N26 H20 F8Q sing 132 n n C28 H21 F8Q sing 133 n n C28 H22 F8Q sing 134 n n C28 H23 F8Q sing 135 n n C27 H24 F8Q sing 136 n n C27 H25 F8Q sing 137 n n C27 H26 F8Q sing 138 n n # _atom_sites.entry_id 6GQY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01574 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008426 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00637 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 2 MG A 1 201 202 MG MG . H 3 GNP A 1 202 201 GNP GNP . I 4 F8Q A 1 203 203 F8Q 902 . J 2 MG B 1 201 202 MG MG . K 3 GNP B 1 202 201 GNP GNP . L 4 F8Q B 1 203 203 F8Q 902 . M 2 MG C 1 201 202 MG MG . N 3 GNP C 1 202 201 GNP GNP . O 4 F8Q C 1 203 203 F8Q 902 . P 2 MG D 1 201 202 MG MG . Q 3 GNP D 1 202 201 GNP GNP . R 4 F8Q D 1 203 203 F8Q 902 . S 2 MG E 1 201 202 MG MG . T 3 GNP E 1 202 201 GNP GNP . U 2 MG F 1 201 202 MG MG . V 3 GNP F 1 202 201 GNP GNP . W 5 HOH A 1 301 218 HOH HOH . W 5 HOH A 2 302 119 HOH HOH . W 5 HOH A 3 303 120 HOH HOH . W 5 HOH A 4 304 213 HOH HOH . W 5 HOH A 5 305 1 HOH HOH . W 5 HOH A 6 306 124 HOH HOH . W 5 HOH A 7 307 45 HOH HOH . W 5 HOH A 8 308 18 HOH HOH . W 5 HOH A 9 309 40 HOH HOH . W 5 HOH A 10 310 56 HOH HOH . W 5 HOH A 11 311 29 HOH HOH . W 5 HOH A 12 312 214 HOH HOH . X 5 HOH B 1 301 116 HOH HOH . X 5 HOH B 2 302 24 HOH HOH . X 5 HOH B 3 303 219 HOH HOH . X 5 HOH B 4 304 115 HOH HOH . X 5 HOH B 5 305 122 HOH HOH . X 5 HOH B 6 306 129 HOH HOH . X 5 HOH B 7 307 25 HOH HOH . X 5 HOH B 8 308 112 HOH HOH . X 5 HOH B 9 309 7 HOH HOH . X 5 HOH B 10 310 79 HOH HOH . Y 5 HOH C 1 301 66 HOH HOH . Y 5 HOH C 2 302 125 HOH HOH . Y 5 HOH C 3 303 121 HOH HOH . Y 5 HOH C 4 304 11 HOH HOH . Y 5 HOH C 5 305 114 HOH HOH . Y 5 HOH C 6 306 123 HOH HOH . Y 5 HOH C 7 307 21 HOH HOH . Y 5 HOH C 8 308 13 HOH HOH . Y 5 HOH C 9 309 29 HOH HOH . Z 5 HOH D 1 301 128 HOH HOH . Z 5 HOH D 2 302 126 HOH HOH . Z 5 HOH D 3 303 120 HOH HOH . Z 5 HOH D 4 304 49 HOH HOH . Z 5 HOH D 5 305 217 HOH HOH . Z 5 HOH D 6 306 23 HOH HOH . Z 5 HOH D 7 307 4 HOH HOH . Z 5 HOH D 8 308 34 HOH HOH . AA 5 HOH E 1 301 127 HOH HOH . AA 5 HOH E 2 302 9 HOH HOH . AA 5 HOH E 3 303 117 HOH HOH . AA 5 HOH E 4 304 6 HOH HOH . AA 5 HOH E 5 305 27 HOH HOH . AA 5 HOH E 6 306 170 HOH HOH . BA 5 HOH F 1 301 216 HOH HOH . BA 5 HOH F 2 302 118 HOH HOH . BA 5 HOH F 3 303 42 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 F F17 F8Q . . . I 4 72.623 99.291 19.827 1 45.26 ? F17 F8Q 203 A 1 HETATM 2 C C12 F8Q . . . I 4 72.134 100.474 19.484 1 33.65 ? C12 F8Q 203 A 1 HETATM 3 C C7 F8Q . . . I 4 71.594 100.63 18.233 1 31.71 ? C7 F8Q 203 A 1 HETATM 4 C C6 F8Q . . . I 4 71.544 99.543 17.209 1 30.24 ? C6 F8Q 203 A 1 HETATM 5 C C5 F8Q . . . I 4 72.679 98.906 16.772 1 30.98 ? C5 F8Q 203 A 1 HETATM 6 C C4 F8Q . . . I 4 72.602 97.915 15.781 1 32.14 ? C4 F8Q 203 A 1 HETATM 7 O O13 F8Q . . . I 4 73.709 97.23 15.283 1 33.03 ? O13 F8Q 203 A 1 HETATM 8 C C14 F8Q . . . I 4 75.053 97.409 15.704 1 32.05 ? C14 F8Q 203 A 1 HETATM 9 C C3 F8Q . . . I 4 71.394 97.577 15.216 1 28.54 ? C3 F8Q 203 A 1 HETATM 10 C C2 F8Q . . . I 4 70.28 98.228 15.626 1 29.3 ? C2 F8Q 203 A 1 HETATM 11 C C1 F8Q . . . I 4 70.36 99.199 16.608 1 31.13 ? C1 F8Q 203 A 1 HETATM 12 C C11 F8Q . . . I 4 72.176 101.479 20.415 1 31.44 ? C11 F8Q 203 A 1 HETATM 13 O O15 F8Q . . . I 4 72.765 101.228 21.632 1 33.25 ? O15 F8Q 203 A 1 HETATM 14 C C16 F8Q . . . I 4 72.726 100.019 22.396 1 32.35 ? C16 F8Q 203 A 1 HETATM 15 C C10 F8Q . . . I 4 71.67 102.74 20.132 1 29.78 ? C10 F8Q 203 A 1 HETATM 16 C C9 F8Q . . . I 4 71.141 102.913 18.869 1 30.6 ? C9 F8Q 203 A 1 HETATM 17 C C8 F8Q . . . I 4 71.095 101.877 17.932 1 30.66 ? C8 F8Q 203 A 1 HETATM 18 N N18 F8Q . . . I 4 71.824 103.676 21.097 1 30.29 ? N18 F8Q 203 A 1 HETATM 19 C C19 F8Q . . . I 4 71.794 105.041 21.051 1 35.77 ? C19 F8Q 203 A 1 HETATM 20 C C24 F8Q . . . I 4 71.092 105.81 20.146 1 40.33 ? C24 F8Q 203 A 1 HETATM 21 C C23 F8Q . . . I 4 71.147 107.199 20.129 1 44.63 ? C23 F8Q 203 A 1 HETATM 22 C C22 F8Q . . . I 4 71.926 107.913 21.009 1 51.75 ? C22 F8Q 203 A 1 HETATM 23 C C21 F8Q . . . I 4 72.652 107.158 21.932 1 48.54 ? C21 F8Q 203 A 1 HETATM 24 C C20 F8Q . . . I 4 72.586 105.755 21.95 1 41.52 ? C20 F8Q 203 A 1 HETATM 25 C C25 F8Q . . . I 4 71.928 109.453 20.886 1 63.02 ? C25 F8Q 203 A 1 HETATM 26 N N26 F8Q . . . I 4 72.432 110.274 22.046 1 75.1 ? N26 F8Q 203 A 1 HETATM 27 C C28 F8Q . . . I 4 72.607 111.723 21.715 1 71.5 ? C28 F8Q 203 A 1 HETATM 28 C C27 F8Q . . . I 4 71.568 110.16 23.244 1 75.75 ? C27 F8Q 203 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 9 _model_server_stats.query_time_ms 212 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 28 #