data_6GYA # _model_server_result.job_id 7Ruw3DGbrUcs-W0KxF2L6w _model_server_result.datetime_utc '2024-11-10 01:22:43' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 6gya # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"Z","auth_seq_id":502}' # _entry.id 6GYA # _exptl.entry_id 6GYA _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 22.99 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'SODIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 6GYA _cell.length_a 212.18 _cell.length_b 212.18 _cell.length_c 172.22 _cell.Z_PDB 24 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6GYA _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 169 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 61' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 ? monomeric 1 author_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,E,F,M,N,O,P,Q,R,JA 1 1 B,G,H,S,T,U,V,W,X,KA 2 1 C,I,J,Y,Z,AA,BA,CA,DA,LA 3 1 D,K,L,EA,FA,GA,HA,IA,MA 4 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 N N N ? 5 T N N ? 5 Z N N ? 5 FA N N # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.details _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order 1 ? 2 2 1 GLC GLC C1 O1 . O4 HO4 . sing 2 ? 2 3 2 GLC GLC C1 O1 . O6 HO6 . sing 3 ? 3 2 1 GLC GLC C1 O1 . O4 HO4 . sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 2 n E GLC 1 E 1 GLC A 505 GLC 2 n E GLC 2 E 2 GLC A 506 GLC 2 n E GLC 3 E 3 GLC A 507 GLC 3 n F GLC 1 F 1 GLC A 509 GLC 3 n F GLC 2 F 2 GLC A 510 GLC 2 n G GLC 1 G 1 GLC B 505 GLC 2 n G GLC 2 G 2 GLC B 506 GLC 2 n G GLC 3 G 3 GLC B 507 GLC 3 n H GLC 1 H 1 GLC B 508 GLC 3 n H GLC 2 H 2 GLC B 509 GLC 2 n I GLC 1 I 1 GLC C 505 GLC 2 n I GLC 2 I 2 GLC C 506 GLC 2 n I GLC 3 I 3 GLC C 507 GLC 3 n J GLC 1 J 1 GLC C 508 GLC 3 n J GLC 2 J 2 GLC C 509 GLC 2 n K GLC 1 K 1 GLC D 505 GLC 2 n K GLC 2 K 2 GLC D 506 GLC 2 n K GLC 3 K 3 GLC D 507 GLC 3 n L GLC 1 L 1 GLC D 508 GLC 3 n L GLC 2 L 2 GLC D 509 GLC # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 E O4 GLC . E GLC 1 1_555 E C1 GLC . E GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? covale ? covale2 E O6 GLC . E GLC 2 1_555 E C1 GLC . E GLC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.478 ? covale ? covale3 F O4 GLC . F GLC 1 1_555 F C1 GLC . F GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.499 ? covale ? covale4 G O4 GLC . G GLC 1 1_555 G C1 GLC . G GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? covale ? covale5 G O6 GLC . G GLC 2 1_555 G C1 GLC . G GLC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? covale ? covale6 H O4 GLC . H GLC 1 1_555 H C1 GLC . H GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.501 ? covale ? covale7 I O4 GLC . I GLC 1 1_555 I C1 GLC . I GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? covale ? covale8 I O6 GLC . I GLC 2 1_555 I C1 GLC . I GLC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? covale ? covale9 J O4 GLC . J GLC 1 1_555 J C1 GLC . J GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? covale ? covale10 K O4 GLC . K GLC 1 1_555 K C1 GLC . K GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale11 K O6 GLC . K GLC 2 1_555 K C1 GLC . K GLC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? covale ? covale12 L O4 GLC . L GLC 1 1_555 L C1 GLC . L GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.48 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASN 106 A ASN 106 1_555 M CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 163 A ASP 163 1_555 N NA NA . A NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.734 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 163 A ASP 163 1_555 O CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 163 A ASP 163 1_555 O CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? metalc ? metalc5 A O ALA 184 A ALA 184 1_555 O CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 186 A ASP 186 1_555 N NA NA . A NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.745 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 186 A ASP 186 1_555 O CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? metalc ? metalc8 A O ASP 197 A ASP 197 1_555 M CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.165 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 197 A ASP 197 1_555 M CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.354 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 197 A ASP 197 1_555 N NA NA . A NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.008 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 197 A ASP 197 1_555 N NA NA . A NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.67 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 203 A ASP 203 1_555 M CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 203 A ASP 203 1_555 M CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 203 A ASP 203 1_555 N NA NA . A NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.078 ? metalc ? metalc15 A OD2 ASP 203 A ASP 203 1_555 N NA NA . A NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? metalc ? metalc16 A O ILE 204 A ILE 204 1_555 N NA NA . A NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc17 A OD1 ASP 205 A ASP 205 1_555 O CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc18 A OD2 ASP 207 A ASP 207 1_555 O CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? metalc ? metalc19 A O HIS 238 A HIS 238 1_555 M CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? metalc ? metalc20 A O GLY 304 A GLY 304 1_555 P CA CA . A CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.466 ? metalc ? metalc21 A O TYR 306 A TYR 306 1_555 P CA CA . A CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? metalc ? metalc22 A O GLN 407 A GLN 407 1_555 P CA CA . A CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? metalc ? metalc23 A OD1 ASP 408 A ASP 408 1_555 P CA CA . A CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc24 A OD1 ASP 431 A ASP 431 1_555 P CA CA . A CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc25 A OD2 ASP 431 A ASP 431 1_555 P CA CA . A CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.683 ? metalc ? metalc26 M CA CA . A CA 501 1_555 JA O HOH . A HOH 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc27 B OD1 ASN 106 B ASN 106 1_555 S CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc28 B OD2 ASP 163 B ASP 163 1_555 T NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.739 ? metalc ? metalc29 B OD1 ASP 163 B ASP 163 1_555 U CA CA . B CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.96 ? metalc ? metalc30 B OD2 ASP 163 B ASP 163 1_555 U CA CA . B CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? metalc ? metalc31 B O ALA 184 B ALA 184 1_555 U CA CA . B CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.657 ? metalc ? metalc32 B OD2 ASP 186 B ASP 186 1_555 T NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.029 ? metalc ? metalc33 B OD1 ASP 186 B ASP 186 1_555 U CA CA . B CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.735 ? metalc ? metalc34 B O ASP 197 B ASP 197 1_555 S CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? metalc ? metalc35 B OD1 ASP 197 B ASP 197 1_555 S CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc36 B OD1 ASP 197 B ASP 197 1_555 T NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.011 ? metalc ? metalc37 B OD2 ASP 197 B ASP 197 1_555 T NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.671 ? metalc ? metalc38 B OD1 ASP 203 B ASP 203 1_555 S CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc39 B OD2 ASP 203 B ASP 203 1_555 S CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? metalc ? metalc40 B OD1 ASP 203 B ASP 203 1_555 T NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.072 ? metalc ? metalc41 B OD2 ASP 203 B ASP 203 1_555 T NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.721 ? metalc ? metalc42 B O ILE 204 B ILE 204 1_555 T NA NA . B NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? metalc ? metalc43 B OD1 ASP 205 B ASP 205 1_555 U CA CA . B CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.915 ? metalc ? metalc44 B OD2 ASP 205 B ASP 205 1_555 U CA CA . B CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.13 ? metalc ? metalc45 B OD2 ASP 207 B ASP 207 1_555 U CA CA . B CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.123 ? metalc ? metalc46 B O HIS 238 B HIS 238 1_555 S CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc47 B O GLY 304 B GLY 304 1_555 V CA CA . B CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.433 ? metalc ? metalc48 B O TYR 306 B TYR 306 1_555 V CA CA . B CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? metalc ? metalc49 B O GLN 407 B GLN 407 1_555 V CA CA . B CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.529 ? metalc ? metalc50 B OD1 ASP 408 B ASP 408 1_555 V CA CA . B CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc51 B OD1 ASP 431 B ASP 431 1_555 V CA CA . B CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? metalc ? metalc52 B OD2 ASP 431 B ASP 431 1_555 V CA CA . B CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.698 ? metalc ? metalc53 C OD1 ASN 106 C ASN 106 1_555 Y CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc54 C OD2 ASP 163 C ASP 163 1_555 Z NA NA . C NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? metalc ? metalc55 C OD1 ASP 163 C ASP 163 1_555 AA CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc56 C OD2 ASP 163 C ASP 163 1_555 AA CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.71 ? metalc ? metalc57 C O ALA 184 C ALA 184 1_555 AA CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc58 C OD2 ASP 186 C ASP 186 1_555 Z NA NA . C NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.111 ? metalc ? metalc59 C OD1 ASP 186 C ASP 186 1_555 AA CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc60 C O ASP 197 C ASP 197 1_555 Y CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? metalc ? metalc61 C OD1 ASP 197 C ASP 197 1_555 Y CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc62 C OD1 ASP 197 C ASP 197 1_555 Z NA NA . C NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.024 ? metalc ? metalc63 C OD2 ASP 197 C ASP 197 1_555 Z NA NA . C NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.643 ? metalc ? metalc64 C OD1 ASP 203 C ASP 203 1_555 Y CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? metalc ? metalc65 C OD2 ASP 203 C ASP 203 1_555 Y CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.746 ? metalc ? metalc66 C OD2 ASP 203 C ASP 203 1_555 Z NA NA . C NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.68 ? metalc ? metalc67 C O ILE 204 C ILE 204 1_555 Z NA NA . C NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? metalc ? metalc68 C OD1 ASP 205 C ASP 205 1_555 AA CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? metalc ? metalc69 C OD2 ASP 207 C ASP 207 1_555 AA CA CA . C CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc70 C O HIS 238 C HIS 238 1_555 Y CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc71 C O GLY 304 C GLY 304 1_555 BA CA CA . C CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc72 C O TYR 306 C TYR 306 1_555 BA CA CA . C CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.164 ? metalc ? metalc73 C O GLN 407 C GLN 407 1_555 BA CA CA . C CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.55 ? metalc ? metalc74 C OD1 ASP 408 C ASP 408 1_555 BA CA CA . C CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc75 C OD1 ASP 431 C ASP 431 1_555 BA CA CA . C CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc76 C OD2 ASP 431 C ASP 431 1_555 BA CA CA . C CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? metalc ? metalc77 Y CA CA . C CA 501 1_555 LA O HOH . C HOH 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc78 D OD1 ASN 106 D ASN 106 1_555 EA CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc79 D OD2 ASP 163 D ASP 163 1_555 FA NA NA . D NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.701 ? metalc ? metalc80 D OD1 ASP 163 D ASP 163 1_555 GA CA CA . D CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? metalc ? metalc81 D OD2 ASP 163 D ASP 163 1_555 GA CA CA . D CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.707 ? metalc ? metalc82 D O ALA 184 D ALA 184 1_555 GA CA CA . D CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.262 ? metalc ? metalc83 D OD2 ASP 186 D ASP 186 1_555 FA NA NA . D NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.964 ? metalc ? metalc84 D OD1 ASP 186 D ASP 186 1_555 GA CA CA . D CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc85 D O ASP 197 D ASP 197 1_555 EA CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? metalc ? metalc86 D OD1 ASP 197 D ASP 197 1_555 EA CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc87 D OD1 ASP 197 D ASP 197 1_555 FA NA NA . D NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.016 ? metalc ? metalc88 D OD2 ASP 197 D ASP 197 1_555 FA NA NA . D NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.667 ? metalc ? metalc89 D OD1 ASP 203 D ASP 203 1_555 EA CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc90 D OD2 ASP 203 D ASP 203 1_555 EA CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? metalc ? metalc91 D OD2 ASP 203 D ASP 203 1_555 FA NA NA . D NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.69 ? metalc ? metalc92 D O ILE 204 D ILE 204 1_555 FA NA NA . D NA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? metalc ? metalc93 D OD1 ASP 205 D ASP 205 1_555 GA CA CA . D CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc94 D OD2 ASP 207 D ASP 207 1_555 GA CA CA . D CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.183 ? metalc ? metalc95 D O HIS 238 D HIS 238 1_555 EA CA CA . D CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc96 D O GLY 304 D GLY 304 1_555 HA CA CA . D CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? metalc ? metalc97 D O TYR 306 D TYR 306 1_555 HA CA CA . D CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? metalc ? metalc98 D O GLN 407 D GLN 407 1_555 HA CA CA . D CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.53 ? metalc ? metalc99 D OD1 ASP 408 D ASP 408 1_555 HA CA CA . D CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc100 D OD1 ASP 431 D ASP 431 1_555 HA CA CA . D CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc101 D OD2 ASP 431 D ASP 431 1_555 HA CA CA . D CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? metalc ? metalc102 EA CA CA . D CA 501 1_555 MA O HOH . D HOH 648 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc103 FA NA NA . D NA 502 1_555 MA O HOH . D HOH 648 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.199 ? # _chem_comp.formula 'Na 1' _chem_comp.formula_weight 22.99 _chem_comp.id NA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'SODIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 6GYA _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.004713 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.002721 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005442 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005807 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 4 CA A 1 501 501 CA CA . N 5 NA A 1 502 502 NA NA . O 4 CA A 1 503 503 CA CA . P 4 CA A 1 504 504 CA CA . Q 6 GLC A 1 508 508 GLC GLC . R 6 GLC A 1 511 511 GLC GLC . S 4 CA B 1 501 501 CA CA . T 5 NA B 1 502 502 NA NA . U 4 CA B 1 503 503 CA CA . V 4 CA B 1 504 504 CA CA . W 6 GLC B 1 510 510 GLC GLC . X 7 BGC B 1 511 511 BGC BGC . Y 4 CA C 1 501 501 CA CA . Z 5 NA C 1 502 502 NA NA . AA 4 CA C 1 503 503 CA CA . BA 4 CA C 1 504 504 CA CA . CA 6 GLC C 1 510 510 GLC GLC . DA 7 BGC C 1 511 511 BGC BGC . EA 4 CA D 1 501 501 CA CA . FA 5 NA D 1 502 502 NA NA . GA 4 CA D 1 503 503 CA CA . HA 4 CA D 1 504 504 CA CA . IA 7 BGC D 1 510 510 BGC BGC . JA 8 HOH A 1 601 602 HOH HOH . JA 8 HOH A 2 602 601 HOH HOH . JA 8 HOH A 3 603 634 HOH HOH . JA 8 HOH A 4 604 604 HOH HOH . JA 8 HOH A 5 605 607 HOH HOH . JA 8 HOH A 6 606 603 HOH HOH . JA 8 HOH A 7 607 618 HOH HOH . JA 8 HOH A 8 608 610 HOH HOH . JA 8 HOH A 9 609 608 HOH HOH . JA 8 HOH A 10 610 605 HOH HOH . JA 8 HOH A 11 611 606 HOH HOH . JA 8 HOH A 12 612 613 HOH HOH . JA 8 HOH A 13 613 611 HOH HOH . JA 8 HOH A 14 614 609 HOH HOH . JA 8 HOH A 15 615 617 HOH HOH . JA 8 HOH A 16 616 612 HOH HOH . JA 8 HOH A 17 617 622 HOH HOH . JA 8 HOH A 18 618 642 HOH HOH . JA 8 HOH A 19 619 616 HOH HOH . JA 8 HOH A 20 620 615 HOH HOH . JA 8 HOH A 21 621 623 HOH HOH . JA 8 HOH A 22 622 636 HOH HOH . JA 8 HOH A 23 623 631 HOH HOH . JA 8 HOH A 24 624 619 HOH HOH . JA 8 HOH A 25 625 625 HOH HOH . JA 8 HOH A 26 626 624 HOH HOH . JA 8 HOH A 27 627 614 HOH HOH . JA 8 HOH A 28 628 621 HOH HOH . JA 8 HOH A 29 629 620 HOH HOH . JA 8 HOH A 30 630 630 HOH HOH . JA 8 HOH A 31 631 626 HOH HOH . JA 8 HOH A 32 632 633 HOH HOH . JA 8 HOH A 33 633 627 HOH HOH . JA 8 HOH A 34 634 629 HOH HOH . JA 8 HOH A 35 635 635 HOH HOH . JA 8 HOH A 36 636 651 HOH HOH . JA 8 HOH A 37 637 641 HOH HOH . JA 8 HOH A 38 638 639 HOH HOH . JA 8 HOH A 39 639 638 HOH HOH . JA 8 HOH A 40 640 646 HOH HOH . JA 8 HOH A 41 641 645 HOH HOH . JA 8 HOH A 42 642 632 HOH HOH . JA 8 HOH A 43 643 628 HOH HOH . JA 8 HOH A 44 644 640 HOH HOH . JA 8 HOH A 45 645 648 HOH HOH . JA 8 HOH A 46 646 643 HOH HOH . JA 8 HOH A 47 647 637 HOH HOH . JA 8 HOH A 48 648 650 HOH HOH . JA 8 HOH A 49 649 644 HOH HOH . JA 8 HOH A 50 650 660 HOH HOH . JA 8 HOH A 51 651 655 HOH HOH . JA 8 HOH A 52 652 647 HOH HOH . JA 8 HOH A 53 653 649 HOH HOH . JA 8 HOH A 54 654 653 HOH HOH . JA 8 HOH A 55 655 652 HOH HOH . JA 8 HOH A 56 656 654 HOH HOH . JA 8 HOH A 57 657 658 HOH HOH . JA 8 HOH A 58 658 656 HOH HOH . JA 8 HOH A 59 659 662 HOH HOH . JA 8 HOH A 60 660 657 HOH HOH . JA 8 HOH A 61 661 661 HOH HOH . JA 8 HOH A 62 662 659 HOH HOH . KA 8 HOH B 1 601 628 HOH HOH . KA 8 HOH B 2 602 603 HOH HOH . KA 8 HOH B 3 603 605 HOH HOH . KA 8 HOH B 4 604 610 HOH HOH . KA 8 HOH B 5 605 602 HOH HOH . KA 8 HOH B 6 606 604 HOH HOH . KA 8 HOH B 7 607 607 HOH HOH . KA 8 HOH B 8 608 609 HOH HOH . KA 8 HOH B 9 609 606 HOH HOH . KA 8 HOH B 10 610 622 HOH HOH . KA 8 HOH B 11 611 601 HOH HOH . KA 8 HOH B 12 612 616 HOH HOH . KA 8 HOH B 13 613 615 HOH HOH . KA 8 HOH B 14 614 608 HOH HOH . KA 8 HOH B 15 615 613 HOH HOH . KA 8 HOH B 16 616 614 HOH HOH . KA 8 HOH B 17 617 612 HOH HOH . KA 8 HOH B 18 618 611 HOH HOH . KA 8 HOH B 19 619 618 HOH HOH . KA 8 HOH B 20 620 617 HOH HOH . KA 8 HOH B 21 621 623 HOH HOH . KA 8 HOH B 22 622 619 HOH HOH . KA 8 HOH B 23 623 621 HOH HOH . KA 8 HOH B 24 624 640 HOH HOH . KA 8 HOH B 25 625 620 HOH HOH . KA 8 HOH B 26 626 631 HOH HOH . KA 8 HOH B 27 627 625 HOH HOH . KA 8 HOH B 28 628 626 HOH HOH . KA 8 HOH B 29 629 627 HOH HOH . KA 8 HOH B 30 630 629 HOH HOH . KA 8 HOH B 31 631 635 HOH HOH . KA 8 HOH B 32 632 624 HOH HOH . KA 8 HOH B 33 633 634 HOH HOH . KA 8 HOH B 34 634 636 HOH HOH . KA 8 HOH B 35 635 633 HOH HOH . KA 8 HOH B 36 636 638 HOH HOH . KA 8 HOH B 37 637 637 HOH HOH . KA 8 HOH B 38 638 632 HOH HOH . KA 8 HOH B 39 639 639 HOH HOH . KA 8 HOH B 40 640 641 HOH HOH . KA 8 HOH B 41 641 644 HOH HOH . KA 8 HOH B 42 642 642 HOH HOH . KA 8 HOH B 43 643 643 HOH HOH . KA 8 HOH B 44 644 648 HOH HOH . KA 8 HOH B 45 645 630 HOH HOH . KA 8 HOH B 46 646 647 HOH HOH . KA 8 HOH B 47 647 645 HOH HOH . KA 8 HOH B 48 648 649 HOH HOH . KA 8 HOH B 49 649 646 HOH HOH . KA 8 HOH B 50 650 651 HOH HOH . KA 8 HOH B 51 651 652 HOH HOH . KA 8 HOH B 52 652 650 HOH HOH . LA 8 HOH C 1 601 601 HOH HOH . LA 8 HOH C 2 602 606 HOH HOH . LA 8 HOH C 3 603 605 HOH HOH . LA 8 HOH C 4 604 602 HOH HOH . LA 8 HOH C 5 605 607 HOH HOH . LA 8 HOH C 6 606 604 HOH HOH . LA 8 HOH C 7 607 608 HOH HOH . LA 8 HOH C 8 608 618 HOH HOH . LA 8 HOH C 9 609 612 HOH HOH . LA 8 HOH C 10 610 613 HOH HOH . LA 8 HOH C 11 611 630 HOH HOH . LA 8 HOH C 12 612 609 HOH HOH . LA 8 HOH C 13 613 622 HOH HOH . LA 8 HOH C 14 614 617 HOH HOH . LA 8 HOH C 15 615 614 HOH HOH . LA 8 HOH C 16 616 615 HOH HOH . LA 8 HOH C 17 617 603 HOH HOH . LA 8 HOH C 18 618 633 HOH HOH . LA 8 HOH C 19 619 625 HOH HOH . LA 8 HOH C 20 620 626 HOH HOH . LA 8 HOH C 21 621 620 HOH HOH . LA 8 HOH C 22 622 621 HOH HOH . LA 8 HOH C 23 623 611 HOH HOH . LA 8 HOH C 24 624 619 HOH HOH . LA 8 HOH C 25 625 628 HOH HOH . LA 8 HOH C 26 626 632 HOH HOH . LA 8 HOH C 27 627 629 HOH HOH . LA 8 HOH C 28 628 623 HOH HOH . LA 8 HOH C 29 629 631 HOH HOH . LA 8 HOH C 30 630 634 HOH HOH . LA 8 HOH C 31 631 640 HOH HOH . LA 8 HOH C 32 632 627 HOH HOH . LA 8 HOH C 33 633 624 HOH HOH . LA 8 HOH C 34 634 646 HOH HOH . LA 8 HOH C 35 635 643 HOH HOH . LA 8 HOH C 36 636 641 HOH HOH . LA 8 HOH C 37 637 639 HOH HOH . LA 8 HOH C 38 638 645 HOH HOH . LA 8 HOH C 39 639 636 HOH HOH . LA 8 HOH C 40 640 638 HOH HOH . LA 8 HOH C 41 641 642 HOH HOH . LA 8 HOH C 42 642 637 HOH HOH . LA 8 HOH C 43 643 635 HOH HOH . LA 8 HOH C 44 644 644 HOH HOH . LA 8 HOH C 45 645 650 HOH HOH . LA 8 HOH C 46 646 616 HOH HOH . LA 8 HOH C 47 647 649 HOH HOH . LA 8 HOH C 48 648 647 HOH HOH . LA 8 HOH C 49 649 651 HOH HOH . LA 8 HOH C 50 650 648 HOH HOH . MA 8 HOH D 1 601 601 HOH HOH . MA 8 HOH D 2 602 603 HOH HOH . MA 8 HOH D 3 603 606 HOH HOH . MA 8 HOH D 4 604 602 HOH HOH . MA 8 HOH D 5 605 604 HOH HOH . MA 8 HOH D 6 606 610 HOH HOH . MA 8 HOH D 7 607 605 HOH HOH . MA 8 HOH D 8 608 609 HOH HOH . MA 8 HOH D 9 609 607 HOH HOH . MA 8 HOH D 10 610 611 HOH HOH . MA 8 HOH D 11 611 636 HOH HOH . MA 8 HOH D 12 612 608 HOH HOH . MA 8 HOH D 13 613 619 HOH HOH . MA 8 HOH D 14 614 620 HOH HOH . MA 8 HOH D 15 615 614 HOH HOH . MA 8 HOH D 16 616 613 HOH HOH . MA 8 HOH D 17 617 615 HOH HOH . MA 8 HOH D 18 618 612 HOH HOH . MA 8 HOH D 19 619 621 HOH HOH . MA 8 HOH D 20 620 623 HOH HOH . MA 8 HOH D 21 621 616 HOH HOH . MA 8 HOH D 22 622 622 HOH HOH . MA 8 HOH D 23 623 627 HOH HOH . MA 8 HOH D 24 624 626 HOH HOH . MA 8 HOH D 25 625 618 HOH HOH . MA 8 HOH D 26 626 642 HOH HOH . MA 8 HOH D 27 627 624 HOH HOH . MA 8 HOH D 28 628 628 HOH HOH . MA 8 HOH D 29 629 632 HOH HOH . MA 8 HOH D 30 630 637 HOH HOH . MA 8 HOH D 31 631 625 HOH HOH . MA 8 HOH D 32 632 631 HOH HOH . MA 8 HOH D 33 633 630 HOH HOH . MA 8 HOH D 34 634 635 HOH HOH . MA 8 HOH D 35 635 641 HOH HOH . MA 8 HOH D 36 636 634 HOH HOH . MA 8 HOH D 37 637 638 HOH HOH . MA 8 HOH D 38 638 633 HOH HOH . MA 8 HOH D 39 639 645 HOH HOH . MA 8 HOH D 40 640 643 HOH HOH . MA 8 HOH D 41 641 646 HOH HOH . MA 8 HOH D 42 642 629 HOH HOH . MA 8 HOH D 43 643 644 HOH HOH . MA 8 HOH D 44 644 650 HOH HOH . MA 8 HOH D 45 645 649 HOH HOH . MA 8 HOH D 46 646 647 HOH HOH . MA 8 HOH D 47 647 640 HOH HOH . MA 8 HOH D 48 648 639 HOH HOH . MA 8 HOH D 49 649 651 HOH HOH . MA 8 HOH D 50 650 648 HOH HOH . MA 8 HOH D 51 651 653 HOH HOH . MA 8 HOH D 52 652 654 HOH HOH . MA 8 HOH D 53 653 652 HOH HOH . MA 8 HOH D 54 654 617 HOH HOH . MA 8 HOH D 55 655 656 HOH HOH . MA 8 HOH D 56 656 655 HOH HOH . MA 8 HOH D 57 657 657 HOH HOH . MA 8 HOH D 58 658 659 HOH HOH . MA 8 HOH D 59 659 658 HOH HOH . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol NA _atom_site.label_atom_id NA _atom_site.label_comp_id NA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id Z _atom_site.label_entity_id 5 _atom_site.Cartn_x 18.397 _atom_site.Cartn_y 76.205 _atom_site.Cartn_z -47.685 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 64.89 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id NA _atom_site.auth_comp_id NA _atom_site.auth_seq_id 502 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 14 _model_server_stats.parse_time_ms 30 _model_server_stats.create_model_time_ms 17 _model_server_stats.query_time_ms 322 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #